MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum SS14

Total Repeats: 21822

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_021508	CCT	2	6	654580	654585	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512444057
12502	NC_021508	TGC	2	6	654590	654595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444057
12503	NC_021508	ACGC	2	8	654613	654620	25 %	0 %	25 %	50 %	512444057
12504	NC_021508	AGG	2	6	654731	654736	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512444057
12505	NC_021508	CAC	3	9	654854	654862	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512444057
12506	NC_021508	A	6	6	654887	654892	100 %	0 %	0 %	0 %	512444057
12507	NC_021508	TCT	2	6	654952	654957	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512444057
12508	NC_021508	ACC	2	6	655040	655045	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512444057
12509	NC_021508	GC	3	6	655078	655083	0 %	0 %	50 %	50 %	512444057
12510	NC_021508	AGC	2	6	655109	655114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444057
12511	NC_021508	TTG	2	6	655138	655143	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512444057
12512	NC_021508	GCA	2	6	655161	655166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444057
12513	NC_021508	CTTT	2	8	655194	655201	0 %	75 %	0 %	25 %	512444057
12514	NC_021508	AG	3	6	655242	655247	50 %	0 %	50 %	0 %	512444057
12515	NC_021508	CAG	2	6	655258	655263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444057
12516	NC_021508	ACC	3	9	655281	655289	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512444057
12517	NC_021508	GAA	2	6	655302	655307	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512444057
12518	NC_021508	TGCG	2	8	655321	655328	0 %	25 %	50 %	25 %	512444057
12519	NC_021508	CTT	2	6	655333	655338	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512444057
12520	NC_021508	CG	3	6	655384	655389	0 %	0 %	50 %	50 %	512444057
12521	NC_021508	CG	3	6	655398	655403	0 %	0 %	50 %	50 %	512444057
12522	NC_021508	CCA	2	6	655432	655437	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512444057
12523	NC_021508	TGC	2	6	655475	655480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444057
12524	NC_021508	CCGCC	2	10	655613	655622	0 %	0 %	20 %	80 %	512444058
12525	NC_021508	A	6	6	655630	655635	100 %	0 %	0 %	0 %	512444058
12526	NC_021508	TCA	2	6	655665	655670	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512444058
12527	NC_021508	CGACT	2	10	655672	655681	20 %	20 %	20 %	40 %	512444058
12528	NC_021508	CAGT	2	8	655698	655705	25 %	25 %	25 %	25 %	512444058
12529	NC_021508	AG	3	6	655741	655746	50 %	0 %	50 %	0 %	512444058
12530	NC_021508	TGT	2	6	655860	655865	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512444058
12531	NC_021508	A	8	8	655924	655931	100 %	0 %	0 %	0 %	512444058
12532	NC_021508	A	9	9	655974	655982	100 %	0 %	0 %	0 %	512444058
12533	NC_021508	AAG	2	6	656049	656054	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512444058
12534	NC_021508	A	7	7	656081	656087	100 %	0 %	0 %	0 %	512444058
12535	NC_021508	AGC	2	6	656096	656101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444058
12536	NC_021508	CAA	2	6	656200	656205	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512444058
12537	NC_021508	GCAT	2	8	656243	656250	25 %	25 %	25 %	25 %	512444058
12538	NC_021508	A	8	8	656354	656361	100 %	0 %	0 %	0 %	512444058
12539	NC_021508	GC	3	6	656437	656442	0 %	0 %	50 %	50 %	512444059
12540	NC_021508	TCT	2	6	656449	656454	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512444059
12541	NC_021508	A	6	6	656518	656523	100 %	0 %	0 %	0 %	512444059
12542	NC_021508	TGA	2	6	656552	656557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512444059
12543	NC_021508	GCG	2	6	656579	656584	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512444059
12544	NC_021508	CTT	2	6	656606	656611	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512444059
12545	NC_021508	TGC	2	6	656642	656647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444059
12546	NC_021508	T	6	6	656656	656661	0 %	100 %	0 %	0 %	512444059
12547	NC_021508	AGT	2	6	656712	656717	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512444059
12548	NC_021508	ACC	2	6	656852	656857	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512444059
12549	NC_021508	TCA	2	6	656867	656872	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512444059
12550	NC_021508	TC	3	6	656969	656974	0 %	50 %	0 %	50 %	512444059
12551	NC_021508	CCG	2	6	656991	656996	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512444059
12552	NC_021508	TCCA	2	8	657045	657052	25 %	25 %	0 %	50 %	512444059
12553	NC_021508	TGA	2	6	657053	657058	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512444059
12554	NC_021508	TGC	2	6	657067	657072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444059
12555	NC_021508	CTG	2	6	657169	657174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444060
12556	NC_021508	CCT	2	6	657202	657207	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512444060
12557	NC_021508	CG	3	6	657262	657267	0 %	0 %	50 %	50 %	512444060
12558	NC_021508	CG	4	8	657281	657288	0 %	0 %	50 %	50 %	512444060
12559	NC_021508	CCTG	2	8	657289	657296	0 %	25 %	25 %	50 %	512444060
12560	NC_021508	TCCT	2	8	657303	657310	0 %	50 %	0 %	50 %	512444060
12561	NC_021508	GGA	2	6	657327	657332	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512444060
12562	NC_021508	CGT	2	6	657355	657360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444060
12563	NC_021508	GGTT	2	8	657491	657498	0 %	50 %	50 %	0 %	512444060
12564	NC_021508	TAG	2	6	657504	657509	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512444060
12565	NC_021508	CCT	2	6	657571	657576	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512444060
12566	NC_021508	CTT	2	6	657593	657598	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512444060
12567	NC_021508	TCT	2	6	657601	657606	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512444060
12568	NC_021508	CACT	2	8	657732	657739	25 %	25 %	0 %	50 %	512444061
12569	NC_021508	T	7	7	657814	657820	0 %	100 %	0 %	0 %	512444061
12570	NC_021508	GTC	2	6	657834	657839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444061
12571	NC_021508	GCT	2	6	657851	657856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444061
12572	NC_021508	GA	3	6	657933	657938	50 %	0 %	50 %	0 %	512444061
12573	NC_021508	GCT	2	6	657965	657970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444061
12574	NC_021508	CAG	2	6	657983	657988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444061
12575	NC_021508	GC	3	6	658000	658005	0 %	0 %	50 %	50 %	512444061
12576	NC_021508	GCC	2	6	658024	658029	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512444061
12577	NC_021508	CAG	2	6	658039	658044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444061
12578	NC_021508	GGA	2	6	658095	658100	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512444061
12579	NC_021508	T	7	7	658121	658127	0 %	100 %	0 %	0 %	512444061
12580	NC_021508	CG	3	6	658220	658225	0 %	0 %	50 %	50 %	512444061
12581	NC_021508	CCA	3	9	658235	658243	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512444061
12582	NC_021508	GCA	2	6	658250	658255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444061
12583	NC_021508	TAA	2	6	658418	658423	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512444061
12584	NC_021508	CAG	2	6	658436	658441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444061
12585	NC_021508	CACGCC	2	12	658445	658456	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	512444061
12586	NC_021508	GCA	2	6	658468	658473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444061
12587	NC_021508	CA	3	6	658502	658507	50 %	0 %	0 %	50 %	512444061
12588	NC_021508	CAT	2	6	658548	658553	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512444061
12589	NC_021508	AGC	2	6	658593	658598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444061
12590	NC_021508	CTCATC	2	12	658719	658730	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	512444062
12591	NC_021508	CTC	2	6	658767	658772	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512444062
12592	NC_021508	AGG	2	6	658773	658778	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512444062
12593	NC_021508	CTC	2	6	658854	658859	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512444062
12594	NC_021508	CCA	2	6	659012	659017	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512444062
12595	NC_021508	CAA	2	6	659021	659026	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512444062
12596	NC_021508	CTCGC	2	10	659039	659048	0 %	20 %	20 %	60 %	512444062
12597	NC_021508	GCC	2	6	659124	659129	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512444062
12598	NC_021508	CCT	2	6	659174	659179	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512444062
12599	NC_021508	AG	3	6	659184	659189	50 %	0 %	50 %	0 %	512444062
12600	NC_021508	TCT	2	6	659225	659230	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512444062
12601	NC_021508	TGG	2	6	659255	659260	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512444062
12602	NC_021508	GCC	2	6	659277	659282	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512444062
12603	NC_021508	GCGCT	2	10	659316	659325	0 %	20 %	40 %	40 %	512444062
12604	NC_021508	TGC	2	6	659341	659346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444062
12605	NC_021508	CTT	2	6	659352	659357	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512444062
12606	NC_021508	CAAA	2	8	659366	659373	75 %	0 %	0 %	25 %	512444062
12607	NC_021508	ATG	2	6	659452	659457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512444062
12608	NC_021508	CCTGA	2	10	659511	659520	20 %	20 %	20 %	40 %	512444062
12609	NC_021508	CAC	2	6	659562	659567	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512444062
12610	NC_021508	GCC	2	6	659945	659950	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512444063
12611	NC_021508	CAC	2	6	659966	659971	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512444063
12612	NC_021508	GC	3	6	659977	659982	0 %	0 %	50 %	50 %	512444063
12613	NC_021508	GC	3	6	659985	659990	0 %	0 %	50 %	50 %	512444063
12614	NC_021508	CCA	2	6	660037	660042	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512444063
12615	NC_021508	GC	3	6	660045	660050	0 %	0 %	50 %	50 %	512444063
12616	NC_021508	GA	3	6	660104	660109	50 %	0 %	50 %	0 %	512444063
12617	NC_021508	CCG	2	6	660208	660213	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512444063
12618	NC_021508	CAC	2	6	660218	660223	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512444063
12619	NC_021508	CA	3	6	660241	660246	50 %	0 %	0 %	50 %	512444063
12620	NC_021508	CAG	2	6	660373	660378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444063
12621	NC_021508	CCT	2	6	660397	660402	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512444063
12622	NC_021508	TCA	2	6	660408	660413	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512444063
12623	NC_021508	CCT	2	6	660436	660441	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512444063
12624	NC_021508	CAC	2	6	660503	660508	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512444063
12625	NC_021508	TCA	2	6	660544	660549	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512444063
12626	NC_021508	CTG	2	6	660599	660604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444063
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12628	NC_021508	AAG	3	9	660648	660656	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512444063
12629	NC_021508	GCT	2	6	660658	660663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444063
12630	NC_021508	TCC	2	6	660676	660681	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512444063
12631	NC_021508	GCACG	2	10	660725	660734	20 %	0 %	40 %	40 %	512444063
12632	NC_021508	CG	3	6	660733	660738	0 %	0 %	50 %	50 %	512444063
12633	NC_021508	CAC	2	6	660762	660767	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512444063
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12635	NC_021508	GTGC	2	8	661147	661154	0 %	25 %	50 %	25 %	512444064
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12637	NC_021508	TCC	2	6	661382	661387	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512444064
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12639	NC_021508	TAC	2	6	661422	661427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512444064
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12641	NC_021508	GC	3	6	661494	661499	0 %	0 %	50 %	50 %	512444064
12642	NC_021508	CTG	2	6	661529	661534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444064
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12645	NC_021508	GC	5	10	661596	661605	0 %	0 %	50 %	50 %	512444064
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12652	NC_021508	GC	3	6	661855	661860	0 %	0 %	50 %	50 %	512444064
12653	NC_021508	GCC	2	6	661961	661966	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512444064
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12658	NC_021508	CCTT	2	8	662096	662103	0 %	50 %	0 %	50 %	512444064
12659	NC_021508	GC	3	6	662109	662114	0 %	0 %	50 %	50 %	512444064
12660	NC_021508	GCA	2	6	662118	662123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444064
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12663	NC_021508	CG	3	6	662157	662162	0 %	0 %	50 %	50 %	512444064
12664	NC_021508	GC	3	6	662170	662175	0 %	0 %	50 %	50 %	512444064
12665	NC_021508	CG	3	6	662230	662235	0 %	0 %	50 %	50 %	512444064
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12703	NC_021508	AGTT	2	8	664122	664129	25 %	50 %	25 %	0 %	512444065
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12707	NC_021508	CA	4	8	664299	664306	50 %	0 %	0 %	50 %	512444065
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12726	NC_021508	CG	3	6	665363	665368	0 %	0 %	50 %	50 %	512444066
12727	NC_021508	GA	3	6	665393	665398	50 %	0 %	50 %	0 %	512444066
12728	NC_021508	A	8	8	665398	665405	100 %	0 %	0 %	0 %	512444066
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12731	NC_021508	TCG	2	6	665603	665608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444066
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12734	NC_021508	ACCTAC	2	12	665907	665918	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	512444067
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12739	NC_021508	CG	3	6	666324	666329	0 %	0 %	50 %	50 %	512444067
12740	NC_021508	TGC	2	6	666368	666373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444067
12741	NC_021508	TCGT	2	8	666402	666409	0 %	50 %	25 %	25 %	512444067
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12988	NC_021508	TCCT	2	8	678859	678866	0 %	50 %	0 %	50 %	512444078
12989	NC_021508	G	6	6	678905	678910	0 %	0 %	100 %	0 %	512444078
12990	NC_021508	CAC	2	6	678922	678927	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512444078
12991	NC_021508	GC	3	6	678933	678938	0 %	0 %	50 %	50 %	512444078
12992	NC_021508	GC	4	8	678966	678973	0 %	0 %	50 %	50 %	512444078
12993	NC_021508	CCG	2	6	679006	679011	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512444078
12994	NC_021508	GC	3	6	679040	679045	0 %	0 %	50 %	50 %	512444078
12995	NC_021508	CT	3	6	679060	679065	0 %	50 %	0 %	50 %	512444078
12996	NC_021508	GC	3	6	679082	679087	0 %	0 %	50 %	50 %	512444078
12997	NC_021508	CTG	2	6	679111	679116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444078
12998	NC_021508	GCT	2	6	679140	679145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444078
12999	NC_021508	GTGA	2	8	679255	679262	25 %	25 %	50 %	0 %	512444078
13000	NC_021508	CGC	2	6	679302	679307	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512444078

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