MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum SS14

Total Repeats: 21822

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_021508	AGA	2	6	581999	582004	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512443999
11002	NC_021508	CAC	2	6	582013	582018	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512443999
11003	NC_021508	CCA	2	6	582028	582033	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512443999
11004	NC_021508	ACC	2	6	582129	582134	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512443999
11005	NC_021508	CAT	2	6	582169	582174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512443999
11006	NC_021508	CTT	2	6	582359	582364	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512443999
11007	NC_021508	AATG	2	8	582407	582414	50 %	25 %	25 %	0 %	512443999
11008	NC_021508	TCTT	2	8	582438	582445	0 %	75 %	0 %	25 %	512443999
11009	NC_021508	GAT	2	6	582527	582532	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512443999
11010	NC_021508	CTG	2	6	582550	582555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443999
11011	NC_021508	CG	3	6	582562	582567	0 %	0 %	50 %	50 %	512443999
11012	NC_021508	GTC	2	6	582569	582574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443999
11013	NC_021508	ACCAT	2	10	582579	582588	40 %	20 %	0 %	40 %	512443999
11014	NC_021508	ACA	2	6	582621	582626	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512443999
11015	NC_021508	CAT	2	6	582665	582670	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512443999
11016	NC_021508	CTC	2	6	582671	582676	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512444000
11017	NC_021508	A	7	7	582737	582743	100 %	0 %	0 %	0 %	512444000
11018	NC_021508	TCGG	2	8	582759	582766	0 %	25 %	50 %	25 %	512444000
11019	NC_021508	CCTG	2	8	582787	582794	0 %	25 %	25 %	50 %	512444000
11020	NC_021508	TTG	2	6	582838	582843	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512444000
11021	NC_021508	GTT	2	6	583251	583256	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512444001
11022	NC_021508	ATCT	2	8	583333	583340	25 %	50 %	0 %	25 %	512444001
11023	NC_021508	CTT	2	6	583371	583376	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512444001
11024	NC_021508	AAAG	2	8	583401	583408	75 %	0 %	25 %	0 %	512444001
11025	NC_021508	GCT	2	6	583425	583430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444001
11026	NC_021508	ATT	2	6	583433	583438	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512444001
11027	NC_021508	CCG	2	6	583492	583497	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512444001
11028	NC_021508	ACGG	2	8	583651	583658	25 %	0 %	50 %	25 %	512444002
11029	NC_021508	AAG	2	6	583668	583673	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512444002
11030	NC_021508	TGT	2	6	583922	583927	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512444002
11031	NC_021508	TAG	2	6	583931	583936	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512444002
11032	NC_021508	GAA	3	9	583957	583965	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512444002
11033	NC_021508	TTGC	2	8	583981	583988	0 %	50 %	25 %	25 %	512444002
11034	NC_021508	A	6	6	583997	584002	100 %	0 %	0 %	0 %	512444002
11035	NC_021508	CG	3	6	584003	584008	0 %	0 %	50 %	50 %	512444002
11036	NC_021508	TTGC	2	8	584011	584018	0 %	50 %	25 %	25 %	512444002
11037	NC_021508	CGA	2	6	584058	584063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444002
11038	NC_021508	AGGCA	2	10	584080	584089	40 %	0 %	40 %	20 %	512444002
11039	NC_021508	TGC	2	6	584093	584098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444002
11040	NC_021508	CGC	2	6	584127	584132	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512444002
11041	NC_021508	CTG	2	6	584147	584152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444002
11042	NC_021508	GA	3	6	584214	584219	50 %	0 %	50 %	0 %	512444002
11043	NC_021508	GCG	2	6	584233	584238	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512444002
11044	NC_021508	CGCA	2	8	584339	584346	25 %	0 %	25 %	50 %	512444002
11045	NC_021508	GAA	2	6	584454	584459	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512444002
11046	NC_021508	CG	3	6	584497	584502	0 %	0 %	50 %	50 %	512444002
11047	NC_021508	CTC	2	6	584512	584517	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512444002
11048	NC_021508	CA	3	6	584578	584583	50 %	0 %	0 %	50 %	512444002
11049	NC_021508	CGC	2	6	584631	584636	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512444003
11050	NC_021508	GGGC	2	8	584639	584646	0 %	0 %	75 %	25 %	512444003
11051	NC_021508	CA	4	8	584678	584685	50 %	0 %	0 %	50 %	512444003
11052	NC_021508	ATA	2	6	584697	584702	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512444003
11053	NC_021508	CGA	2	6	584755	584760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444003
11054	NC_021508	GA	3	6	584759	584764	50 %	0 %	50 %	0 %	512444003
11055	NC_021508	T	6	6	584803	584808	0 %	100 %	0 %	0 %	512444003
11056	NC_021508	AGA	2	6	584892	584897	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512444003
11057	NC_021508	AGA	2	6	584947	584952	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512444003
11058	NC_021508	AAT	2	6	584978	584983	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512444003
11059	NC_021508	A	7	7	585027	585033	100 %	0 %	0 %	0 %	512444003
11060	NC_021508	A	6	6	585047	585052	100 %	0 %	0 %	0 %	512444003
11061	NC_021508	GTAC	2	8	585060	585067	25 %	25 %	25 %	25 %	512444003
11062	NC_021508	TG	3	6	585178	585183	0 %	50 %	50 %	0 %	512444003
11063	NC_021508	CAG	2	6	585191	585196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444003
11064	NC_021508	AGCAGA	2	12	585219	585230	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	512444003
11065	NC_021508	GC	3	6	585290	585295	0 %	0 %	50 %	50 %	512444003
11066	NC_021508	GC	3	6	585403	585408	0 %	0 %	50 %	50 %	512444003
11067	NC_021508	CA	3	6	585422	585427	50 %	0 %	0 %	50 %	512444003
11068	NC_021508	CTT	2	6	585470	585475	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512444003
11069	NC_021508	GACA	2	8	585485	585492	50 %	0 %	25 %	25 %	512444003
11070	NC_021508	GC	3	6	585509	585514	0 %	0 %	50 %	50 %	512444003
11071	NC_021508	TAA	2	6	585554	585559	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512444003
11072	NC_021508	CG	3	6	585590	585595	0 %	0 %	50 %	50 %	512444003
11073	NC_021508	TCA	2	6	585769	585774	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512444003
11074	NC_021508	CCT	2	6	585775	585780	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512444003
11075	NC_021508	CGG	2	6	585827	585832	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512444003
11076	NC_021508	ACC	2	6	586038	586043	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512444003
11077	NC_021508	AG	3	6	586180	586185	50 %	0 %	50 %	0 %	512444003
11078	NC_021508	GTG	2	6	586213	586218	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512444003
11079	NC_021508	C	6	6	586253	586258	0 %	0 %	0 %	100 %	512444003
11080	NC_021508	GAA	2	6	586259	586264	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512444003
11081	NC_021508	AG	3	6	586307	586312	50 %	0 %	50 %	0 %	512444003
11082	NC_021508	ACTC	2	8	586380	586387	25 %	25 %	0 %	50 %	512444004
11083	NC_021508	GCA	2	6	586389	586394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444004
11084	NC_021508	CTT	3	9	586456	586464	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512444004
11085	NC_021508	CCG	2	6	586519	586524	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512444004
11086	NC_021508	GCA	2	6	586617	586622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444004
11087	NC_021508	ATC	2	6	586625	586630	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512444004
11088	NC_021508	T	6	6	586710	586715	0 %	100 %	0 %	0 %	512444004
11089	NC_021508	CA	3	6	586768	586773	50 %	0 %	0 %	50 %	512444004
11090	NC_021508	GCA	2	6	586956	586961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444004
11091	NC_021508	GCGCTC	2	12	587018	587029	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	512444004
11092	NC_021508	GCT	2	6	587163	587168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444005
11093	NC_021508	CAG	2	6	587190	587195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444005
11094	NC_021508	GC	3	6	587203	587208	0 %	0 %	50 %	50 %	512444005
11095	NC_021508	ACAG	2	8	587213	587220	50 %	0 %	25 %	25 %	512444005
11096	NC_021508	CCA	3	9	587364	587372	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512444005
11097	NC_021508	GCA	2	6	587402	587407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444005
11098	NC_021508	GCC	2	6	587426	587431	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512444005
11099	NC_021508	GAA	2	6	587507	587512	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512444005
11100	NC_021508	CAA	2	6	587529	587534	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512444005
11101	NC_021508	CCA	2	6	587577	587582	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512444005
11102	NC_021508	GT	3	6	587592	587597	0 %	50 %	50 %	0 %	512444005
11103	NC_021508	GC	3	6	587626	587631	0 %	0 %	50 %	50 %	512444005
11104	NC_021508	T	6	6	587636	587641	0 %	100 %	0 %	0 %	512444005
11105	NC_021508	TGTTCC	2	12	587686	587697	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	512444005
11106	NC_021508	CGGTA	2	10	587736	587745	20 %	20 %	40 %	20 %	512444005
11107	NC_021508	AAC	2	6	587751	587756	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512444005
11108	NC_021508	TCC	2	6	587767	587772	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512444005
11109	NC_021508	TGA	2	6	587918	587923	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512444005
11110	NC_021508	T	7	7	587926	587932	0 %	100 %	0 %	0 %	512444005
11111	NC_021508	CAA	2	6	587955	587960	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512444005
11112	NC_021508	CG	3	6	588012	588017	0 %	0 %	50 %	50 %	512444005
11113	NC_021508	AGA	2	6	588175	588180	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512444005
11114	NC_021508	CAC	2	6	588199	588204	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512444005
11115	NC_021508	AGG	2	6	588232	588237	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512444005
11116	NC_021508	AGGAC	2	10	588293	588302	40 %	0 %	40 %	20 %	512444005
11117	NC_021508	TCC	2	6	588328	588333	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512444005
11118	NC_021508	AGG	2	6	588371	588376	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512444005
11119	NC_021508	CAG	2	6	588399	588404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444005
11120	NC_021508	GC	4	8	588585	588592	0 %	0 %	50 %	50 %	512444005
11121	NC_021508	CCACG	2	10	588816	588825	20 %	0 %	20 %	60 %	512444005
11122	NC_021508	CACG	2	8	588831	588838	25 %	0 %	25 %	50 %	512444005
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11232	NC_021508	CGG	2	6	594241	594246	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512444009
11233	NC_021508	GCG	2	6	594313	594318	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512444009
11234	NC_021508	AAG	2	6	594324	594329	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512444009
11235	NC_021508	GCT	2	6	594380	594385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444009
11236	NC_021508	GC	3	6	594397	594402	0 %	0 %	50 %	50 %	512444009
11237	NC_021508	ACG	2	6	594403	594408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444009
11238	NC_021508	TC	3	6	594434	594439	0 %	50 %	0 %	50 %	512444009
11239	NC_021508	GCA	2	6	594834	594839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444010
11240	NC_021508	GAG	2	6	594906	594911	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512444010
11241	NC_021508	CT	3	6	594919	594924	0 %	50 %	0 %	50 %	512444010
11242	NC_021508	CTCG	2	8	594950	594957	0 %	25 %	25 %	50 %	512444010
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11478	NC_021508	GCTC	2	8	605219	605226	0 %	25 %	25 %	50 %	512444018
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11481	NC_021508	GCA	2	6	605257	605262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444018
11482	NC_021508	GTCA	2	8	605270	605277	25 %	25 %	25 %	25 %	512444018
11483	NC_021508	TG	3	6	605437	605442	0 %	50 %	50 %	0 %	512444018
11484	NC_021508	GC	3	6	605450	605455	0 %	0 %	50 %	50 %	512444018
11485	NC_021508	TTG	2	6	605475	605480	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512444018
11486	NC_021508	AACCG	2	10	605483	605492	40 %	0 %	20 %	40 %	512444018
11487	NC_021508	TAC	2	6	605501	605506	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512444018
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11491	NC_021508	GC	3	6	605681	605686	0 %	0 %	50 %	50 %	512444019
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