MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum SS14

Total Repeats: 21822

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_021508	AGC	2	6	530078	530083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512443958
10002	NC_021508	CG	3	6	530166	530171	0 %	0 %	50 %	50 %	512443958
10003	NC_021508	GCG	2	6	530190	530195	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512443958
10004	NC_021508	TG	3	6	530234	530239	0 %	50 %	50 %	0 %	512443958
10005	NC_021508	GTCAT	2	10	530438	530447	20 %	40 %	20 %	20 %	512443958
10006	NC_021508	AAG	2	6	530452	530457	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512443958
10007	NC_021508	AAG	2	6	530509	530514	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512443958
10008	NC_021508	T	8	8	530534	530541	0 %	100 %	0 %	0 %	512443958
10009	NC_021508	GTG	2	6	530631	530636	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512443958
10010	NC_021508	GC	3	6	530674	530679	0 %	0 %	50 %	50 %	512443958
10011	NC_021508	ATAA	2	8	530713	530720	75 %	25 %	0 %	0 %	512443958
10012	NC_021508	GTT	2	6	530742	530747	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512443958
10013	NC_021508	TGA	2	6	530772	530777	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512443958
10014	NC_021508	GCA	2	6	530787	530792	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512443958
10015	NC_021508	GC	3	6	530836	530841	0 %	0 %	50 %	50 %	512443958
10016	NC_021508	TC	3	6	530849	530854	0 %	50 %	0 %	50 %	512443958
10017	NC_021508	GAG	3	9	530872	530880	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512443958
10018	NC_021508	CTGACG	2	12	530906	530917	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	512443958
10019	NC_021508	ACT	2	6	531038	531043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512443958
10020	NC_021508	CAG	2	6	531144	531149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512443958
10021	NC_021508	GGT	2	6	531228	531233	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512443959
10022	NC_021508	AGA	2	6	531242	531247	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512443959
10023	NC_021508	AAAG	2	8	531319	531326	75 %	0 %	25 %	0 %	512443959
10024	NC_021508	GAA	2	6	531364	531369	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512443959
10025	NC_021508	ACC	2	6	531382	531387	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512443959
10026	NC_021508	GCG	2	6	531408	531413	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512443959
10027	NC_021508	ACA	2	6	531437	531442	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512443959
10028	NC_021508	AGG	2	6	531485	531490	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512443959
10029	NC_021508	AGG	2	6	531500	531505	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512443959
10030	NC_021508	GC	3	6	531526	531531	0 %	0 %	50 %	50 %	512443959
10031	NC_021508	AGA	2	6	531558	531563	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512443959
10032	NC_021508	AAG	2	6	531578	531583	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512443959
10033	NC_021508	GCA	2	6	531591	531596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512443959
10034	NC_021508	AGG	2	6	531674	531679	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512443959
10035	NC_021508	GCG	2	6	531684	531689	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512443959
10036	NC_021508	TAT	2	6	531735	531740	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512443959
10037	NC_021508	GT	3	6	531784	531789	0 %	50 %	50 %	0 %	512443959
10038	NC_021508	GAG	2	6	531889	531894	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512443959
10039	NC_021508	CTT	2	6	531915	531920	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512443959
10040	NC_021508	TGA	2	6	531921	531926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512443959
10041	NC_021508	AGA	2	6	531963	531968	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512443959
10042	NC_021508	GGA	2	6	531973	531978	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512443959
10043	NC_021508	AG	3	6	532007	532012	50 %	0 %	50 %	0 %	512443959
10044	NC_021508	T	7	7	532367	532373	0 %	100 %	0 %	0 %	512443960
10045	NC_021508	CTA	2	6	532392	532397	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512443960
10046	NC_021508	TTC	2	6	532419	532424	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512443960
10047	NC_021508	GGA	2	6	532432	532437	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512443960
10048	NC_021508	TAC	2	6	532521	532526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512443960
10049	NC_021508	GC	4	8	532540	532547	0 %	0 %	50 %	50 %	512443960
10050	NC_021508	GAA	2	6	532565	532570	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512443960
10051	NC_021508	GGC	2	6	532598	532603	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512443960
10052	NC_021508	TGC	2	6	532658	532663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443960
10053	NC_021508	CTA	2	6	532664	532669	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512443960
10054	NC_021508	CG	3	6	532740	532745	0 %	0 %	50 %	50 %	512443960
10055	NC_021508	CTA	2	6	532802	532807	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512443960
10056	NC_021508	TAC	2	6	532821	532826	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512443960
10057	NC_021508	CTGTAT	2	12	533043	533054	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	512443960
10058	NC_021508	TGC	2	6	533111	533116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443960
10059	NC_021508	ATC	2	6	533206	533211	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512443960
10060	NC_021508	GCGG	2	8	533252	533259	0 %	0 %	75 %	25 %	512443960
10061	NC_021508	GGC	2	6	533263	533268	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512443960
10062	NC_021508	T	6	6	533343	533348	0 %	100 %	0 %	0 %	512443961
10063	NC_021508	CTG	2	6	533362	533367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443961
10064	NC_021508	GGAA	2	8	533411	533418	50 %	0 %	50 %	0 %	512443961
10065	NC_021508	GTC	2	6	533427	533432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443961
10066	NC_021508	TGG	2	6	533446	533451	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512443961
10067	NC_021508	AGT	2	6	533474	533479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512443961
10068	NC_021508	TGT	2	6	533506	533511	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512443961
10069	NC_021508	TAC	2	6	533576	533581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512443961
10070	NC_021508	GAT	2	6	533588	533593	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512443961
10071	NC_021508	GAG	2	6	533742	533747	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512443961
10072	NC_021508	TGC	2	6	533753	533758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443961
10073	NC_021508	AGA	2	6	533783	533788	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512443961
10074	NC_021508	GT	3	6	533805	533810	0 %	50 %	50 %	0 %	512443961
10075	NC_021508	G	8	8	533817	533824	0 %	0 %	100 %	0 %	512443961
10076	NC_021508	TGG	2	6	533860	533865	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512443961
10077	NC_021508	ATT	2	6	533943	533948	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512443961
10078	NC_021508	GAA	2	6	534123	534128	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512443961
10079	NC_021508	CCT	2	6	534153	534158	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512443961
10080	NC_021508	TCG	2	6	534175	534180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443961
10081	NC_021508	CT	3	6	534209	534214	0 %	50 %	0 %	50 %	512443961
10082	NC_021508	T	10	10	534390	534399	0 %	100 %	0 %	0 %	512443962
10083	NC_021508	TCT	2	6	534461	534466	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512443962
10084	NC_021508	AGG	2	6	534468	534473	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512443962
10085	NC_021508	T	7	7	534549	534555	0 %	100 %	0 %	0 %	512443962
10086	NC_021508	AAC	2	6	534623	534628	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512443962
10087	NC_021508	TTG	2	6	534782	534787	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512443962
10088	NC_021508	TGT	2	6	534828	534833	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512443962
10089	NC_021508	GTTG	2	8	534858	534865	0 %	50 %	50 %	0 %	512443962
10090	NC_021508	GTG	2	6	534871	534876	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512443962
10091	NC_021508	GATT	2	8	534965	534972	25 %	50 %	25 %	0 %	512443962
10092	NC_021508	G	6	6	534981	534986	0 %	0 %	100 %	0 %	512443962
10093	NC_021508	GAA	2	6	535017	535022	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512443962
10094	NC_021508	AAG	2	6	535223	535228	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512443962
10095	NC_021508	GAT	2	6	535238	535243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512443962
10096	NC_021508	CTTTT	2	10	535273	535282	0 %	80 %	0 %	20 %	512443963
10097	NC_021508	GTA	2	6	535353	535358	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512443963
10098	NC_021508	GTG	2	6	535383	535388	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512443963
10099	NC_021508	ATT	2	6	535419	535424	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512443963
10100	NC_021508	TC	3	6	535441	535446	0 %	50 %	0 %	50 %	512443963
10101	NC_021508	TTCG	2	8	535460	535467	0 %	50 %	25 %	25 %	512443963
10102	NC_021508	CAC	2	6	535472	535477	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512443963
10103	NC_021508	ATATC	2	10	535511	535520	40 %	40 %	0 %	20 %	512443963
10104	NC_021508	GAG	2	6	535594	535599	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512443963
10105	NC_021508	TTC	2	6	535736	535741	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512443963
10106	NC_021508	TC	3	6	535758	535763	0 %	50 %	0 %	50 %	512443964
10107	NC_021508	TCG	2	6	535810	535815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443964
10108	NC_021508	TGT	2	6	535828	535833	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512443964
10109	NC_021508	G	6	6	535867	535872	0 %	0 %	100 %	0 %	512443964
10110	NC_021508	A	9	9	535881	535889	100 %	0 %	0 %	0 %	512443964
10111	NC_021508	GTA	2	6	535909	535914	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512443964
10112	NC_021508	G	6	6	535933	535938	0 %	0 %	100 %	0 %	512443964
10113	NC_021508	CAA	2	6	536045	536050	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512443964
10114	NC_021508	GAAA	2	8	536089	536096	75 %	0 %	25 %	0 %	512443964
10115	NC_021508	CCG	2	6	536111	536116	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512443964
10116	NC_021508	TGA	2	6	536186	536191	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512443964
10117	NC_021508	AGA	2	6	536288	536293	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512443964
10118	NC_021508	ACG	2	6	536365	536370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512443964
10119	NC_021508	CTC	2	6	536455	536460	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512443964
10120	NC_021508	TAA	2	6	536468	536473	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512443964
10121	NC_021508	ATCG	2	8	536487	536494	25 %	25 %	25 %	25 %	512443964
10122	NC_021508	AGA	2	6	536513	536518	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512443964
10123	NC_021508	TGTCA	2	10	536729	536738	20 %	40 %	20 %	20 %	512443964
10124	NC_021508	GA	3	6	536794	536799	50 %	0 %	50 %	0 %	512443964
10125	NC_021508	CGT	2	6	536865	536870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443964
10126	NC_021508	TTA	2	6	536894	536899	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512443964
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10129	NC_021508	GC	3	6	537278	537283	0 %	0 %	50 %	50 %	512443964
10130	NC_021508	CTC	2	6	537311	537316	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512443964
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10135	NC_021508	TTC	2	6	537703	537708	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512443965
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10153	NC_021508	TTCT	2	8	538623	538630	0 %	75 %	0 %	25 %	512443965
10154	NC_021508	TTG	2	6	538644	538649	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512443965
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10228	NC_021508	CGGA	2	8	541765	541772	25 %	0 %	50 %	25 %	512443968
10229	NC_021508	A	6	6	541803	541808	100 %	0 %	0 %	0 %	512443968
10230	NC_021508	CGTGTA	2	12	541825	541836	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	512443968
10231	NC_021508	A	8	8	542592	542599	100 %	0 %	0 %	0 %	512443969
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10233	NC_021508	CG	4	8	542644	542651	0 %	0 %	50 %	50 %	512443969
10234	NC_021508	TTG	2	6	542679	542684	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512443969
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10238	NC_021508	TTCC	2	8	542937	542944	0 %	50 %	0 %	50 %	512443969
10239	NC_021508	AGA	2	6	543001	543006	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512443969
10240	NC_021508	TC	3	6	543012	543017	0 %	50 %	0 %	50 %	512443969
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10242	NC_021508	GGA	2	6	543184	543189	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512443969
10243	NC_021508	AT	3	6	543213	543218	50 %	50 %	0 %	0 %	512443969
10244	NC_021508	AGC	2	6	543315	543320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512443969
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10246	NC_021508	GGC	2	6	543453	543458	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512443969
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10248	NC_021508	CAG	2	6	543605	543610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512443969
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10251	NC_021508	CTT	2	6	543662	543667	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512443969
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10253	NC_021508	CTG	2	6	543690	543695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443969
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10275	NC_021508	GGA	2	6	544415	544420	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512443970
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10480	NC_021508	TGTA	2	8	555867	555874	25 %	50 %	25 %	0 %	512443978
10481	NC_021508	ATGTGC	2	12	555876	555887	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	512443978
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10483	NC_021508	T	6	6	555919	555924	0 %	100 %	0 %	0 %	512443978
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10485	NC_021508	AGC	2	6	556004	556009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512443978
10486	NC_021508	A	8	8	556130	556137	100 %	0 %	0 %	0 %	512443978
10487	NC_021508	CTT	2	6	556159	556164	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512443978
10488	NC_021508	TC	3	6	556218	556223	0 %	50 %	0 %	50 %	512443978
10489	NC_021508	TG	3	6	556225	556230	0 %	50 %	50 %	0 %	512443978
10490	NC_021508	CAA	2	6	556247	556252	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512443978
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