MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum SS14

Total Repeats: 21822

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
9501	NC_021508	AGC	2	6	502954	502959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512443938
9502	NC_021508	GTGTT	2	10	502971	502980	0 %	60 %	40 %	0 %	512443938
9503	NC_021508	GCG	2	6	502999	503004	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512443938
9504	NC_021508	CG	3	6	503003	503008	0 %	0 %	50 %	50 %	512443938
9505	NC_021508	AAG	2	6	503051	503056	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512443938
9506	NC_021508	GA	3	6	503178	503183	50 %	0 %	50 %	0 %	512443938
9507	NC_021508	AAG	2	6	503298	503303	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512443939
9508	NC_021508	A	6	6	503370	503375	100 %	0 %	0 %	0 %	512443939
9509	NC_021508	GAG	2	6	503411	503416	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512443939
9510	NC_021508	GAG	2	6	503444	503449	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512443939
9511	NC_021508	GCA	2	6	503494	503499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512443939
9512	NC_021508	ACG	2	6	503584	503589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512443939
9513	NC_021508	GGCA	2	8	503667	503674	25 %	0 %	50 %	25 %	512443939
9514	NC_021508	A	6	6	503702	503707	100 %	0 %	0 %	0 %	512443939
9515	NC_021508	CGG	2	6	503741	503746	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512443939
9516	NC_021508	A	6	6	503759	503764	100 %	0 %	0 %	0 %	512443939
9517	NC_021508	AGG	2	6	503775	503780	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512443939
9518	NC_021508	AGCA	2	8	503789	503796	50 %	0 %	25 %	25 %	512443939
9519	NC_021508	AAT	2	6	503879	503884	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512443939
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9521	NC_021508	ATC	2	6	504058	504063	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512443940
9522	NC_021508	TCA	2	6	504088	504093	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512443940
9523	NC_021508	GTG	2	6	504196	504201	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512443940
9524	NC_021508	ACC	2	6	504213	504218	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512443940
9525	NC_021508	CG	3	6	504393	504398	0 %	0 %	50 %	50 %	512443940
9526	NC_021508	CTC	2	6	504468	504473	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512443940
9527	NC_021508	CTT	2	6	504504	504509	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512443940
9528	NC_021508	GCA	2	6	504613	504618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512443940
9529	NC_021508	AAC	2	6	504646	504651	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512443940
9530	NC_021508	GC	3	6	504903	504908	0 %	0 %	50 %	50 %	512443941
9531	NC_021508	TGT	2	6	504939	504944	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512443941
9532	NC_021508	CTT	2	6	504970	504975	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512443941
9533	NC_021508	AAG	2	6	505037	505042	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512443941
9534	NC_021508	TGGA	2	8	505087	505094	25 %	25 %	50 %	0 %	512443941
9535	NC_021508	CGA	2	6	505162	505167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512443941
9536	NC_021508	CTG	2	6	505184	505189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443941
9537	NC_021508	CAC	2	6	505259	505264	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512443941
9538	NC_021508	GTT	2	6	505402	505407	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512443941
9539	NC_021508	AC	3	6	505489	505494	50 %	0 %	0 %	50 %	512443941
9540	NC_021508	AAG	2	6	505508	505513	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512443941
9541	NC_021508	TGC	2	6	505514	505519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443941
9542	NC_021508	TGC	2	6	505544	505549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443941
9543	NC_021508	CAGA	2	8	505629	505636	50 %	0 %	25 %	25 %	512443941
9544	NC_021508	ATC	2	6	505664	505669	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512443941
9545	NC_021508	GAAG	2	8	505676	505683	50 %	0 %	50 %	0 %	512443941
9546	NC_021508	ATT	2	6	505697	505702	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512443941
9547	NC_021508	TG	4	8	505740	505747	0 %	50 %	50 %	0 %	512443941
9548	NC_021508	CGA	2	6	505780	505785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512443941
9549	NC_021508	CGT	2	6	505811	505816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443941
9550	NC_021508	CGT	2	6	505882	505887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443941
9551	NC_021508	TG	3	6	505911	505916	0 %	50 %	50 %	0 %	512443941
9552	NC_021508	CCA	2	6	505992	505997	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512443941
9553	NC_021508	C	6	6	506048	506053	0 %	0 %	0 %	100 %	512443941
9554	NC_021508	GCA	2	6	506182	506187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512443941
9555	NC_021508	GC	3	6	506223	506228	0 %	0 %	50 %	50 %	512443941
9556	NC_021508	CGT	2	6	506233	506238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443941
9557	NC_021508	AGC	2	6	506270	506275	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512443941
9558	NC_021508	TTCA	2	8	506294	506301	25 %	50 %	0 %	25 %	512443941
9559	NC_021508	CAGCC	2	10	506327	506336	20 %	0 %	20 %	60 %	512443941
9560	NC_021508	GGCG	2	8	506425	506432	0 %	0 %	75 %	25 %	512443941
9561	NC_021508	TCG	2	6	506557	506562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443942
9562	NC_021508	CTG	2	6	506599	506604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443942
9563	NC_021508	CGT	2	6	506662	506667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443942
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9565	NC_021508	T	6	6	506799	506804	0 %	100 %	0 %	0 %	512443942
9566	NC_021508	GCT	2	6	506847	506852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443942
9567	NC_021508	TC	3	6	506872	506877	0 %	50 %	0 %	50 %	512443942
9568	NC_021508	AAGGC	2	10	506973	506982	40 %	0 %	40 %	20 %	512443942
9569	NC_021508	GCA	2	6	507009	507014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512443942
9570	NC_021508	CA	4	8	507013	507020	50 %	0 %	0 %	50 %	512443942
9571	NC_021508	GTG	2	6	507078	507083	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512443942
9572	NC_021508	GACA	2	8	507095	507102	50 %	0 %	25 %	25 %	512443942
9573	NC_021508	ACACA	2	10	507225	507234	60 %	0 %	0 %	40 %	512443942
9574	NC_021508	T	7	7	507286	507292	0 %	100 %	0 %	0 %	512443942
9575	NC_021508	GC	3	6	507306	507311	0 %	0 %	50 %	50 %	512443942
9576	NC_021508	TTC	2	6	507365	507370	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512443942
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9578	NC_021508	CTG	2	6	507589	507594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443942
9579	NC_021508	TGA	2	6	507673	507678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512443942
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9581	NC_021508	CCTG	2	8	507765	507772	0 %	25 %	25 %	50 %	512443942
9582	NC_021508	ATA	2	6	507876	507881	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512443942
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9584	NC_021508	CAG	2	6	507999	508004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512443943
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9587	NC_021508	ACG	2	6	508186	508191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512443943
9588	NC_021508	GT	3	6	508243	508248	0 %	50 %	50 %	0 %	512443943
9589	NC_021508	GCACG	2	10	508284	508293	20 %	0 %	40 %	40 %	512443943
9590	NC_021508	GCG	2	6	508336	508341	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512443943
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9592	NC_021508	ATTT	2	8	508392	508399	25 %	75 %	0 %	0 %	512443943
9593	NC_021508	G	6	6	508455	508460	0 %	0 %	100 %	0 %	512443943
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9596	NC_021508	C	6	6	508561	508566	0 %	0 %	0 %	100 %	512443943
9597	NC_021508	CGC	2	6	508629	508634	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512443943
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9602	NC_021508	AGA	2	6	508767	508772	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512443944
9603	NC_021508	GTC	2	6	508809	508814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443944
9604	NC_021508	TCG	2	6	509095	509100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443944
9605	NC_021508	TCCA	2	8	509251	509258	25 %	25 %	0 %	50 %	512443944
9606	NC_021508	CGAG	2	8	509307	509314	25 %	0 %	50 %	25 %	512443944
9607	NC_021508	CTC	2	6	509328	509333	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512443944
9608	NC_021508	GCAC	2	8	509383	509390	25 %	0 %	25 %	50 %	512443944
9609	NC_021508	TGC	2	6	509395	509400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443944
9610	NC_021508	GCAG	2	8	509426	509433	25 %	0 %	50 %	25 %	512443944
9611	NC_021508	GAC	2	6	509462	509467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512443944
9612	NC_021508	ACG	2	6	509476	509481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512443944
9613	NC_021508	ATA	2	6	509500	509505	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512443944
9614	NC_021508	GTA	2	6	509562	509567	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512443944
9615	NC_021508	CCG	2	6	509569	509574	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512443944
9616	NC_021508	GGTTT	2	10	509724	509733	0 %	60 %	40 %	0 %	512443944
9617	NC_021508	TGC	2	6	509767	509772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443944
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9620	NC_021508	ACGT	2	8	509950	509957	25 %	25 %	25 %	25 %	512443944
9621	NC_021508	AGT	2	6	510002	510007	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512443944
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9623	NC_021508	GC	3	6	510033	510038	0 %	0 %	50 %	50 %	512443944
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9871	NC_021508	GAAG	2	8	523040	523047	50 %	0 %	50 %	0 %	512443953
9872	NC_021508	T	6	6	523050	523055	0 %	100 %	0 %	0 %	512443953
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9874	NC_021508	GGT	2	6	523079	523084	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512443953
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