MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum SS14

Total Repeats: 21822

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
9001	NC_021508	TTGAT	2	10	478482	478491	20 %	60 %	20 %	0 %	512443917
9002	NC_021508	AGT	2	6	478523	478528	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512443917
9003	NC_021508	GC	3	6	478577	478582	0 %	0 %	50 %	50 %	512443917
9004	NC_021508	A	6	6	478593	478598	100 %	0 %	0 %	0 %	512443917
9005	NC_021508	AT	3	6	478616	478621	50 %	50 %	0 %	0 %	512443917
9006	NC_021508	GT	3	6	478639	478644	0 %	50 %	50 %	0 %	512443917
9007	NC_021508	GCG	2	6	478708	478713	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512443917
9008	NC_021508	T	6	6	478723	478728	0 %	100 %	0 %	0 %	512443917
9009	NC_021508	TTC	2	6	478735	478740	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512443917
9010	NC_021508	CTG	2	6	478866	478871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443917
9011	NC_021508	CAT	2	6	479205	479210	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512443917
9012	NC_021508	CG	3	6	479211	479216	0 %	0 %	50 %	50 %	512443917
9013	NC_021508	CAC	2	6	479338	479343	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512443917
9014	NC_021508	AT	3	6	479467	479472	50 %	50 %	0 %	0 %	512443917
9015	NC_021508	GTG	2	6	479508	479513	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512443917
9016	NC_021508	T	7	7	479525	479531	0 %	100 %	0 %	0 %	512443917
9017	NC_021508	GT	3	6	479653	479658	0 %	50 %	50 %	0 %	512443917
9018	NC_021508	GT	3	6	479755	479760	0 %	50 %	50 %	0 %	512443917
9019	NC_021508	TGA	2	6	479835	479840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512443917
9020	NC_021508	G	7	7	479856	479862	0 %	0 %	100 %	0 %	512443917
9021	NC_021508	AAT	2	6	479863	479868	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512443917
9022	NC_021508	ACGG	2	8	479889	479896	25 %	0 %	50 %	25 %	512443917
9023	NC_021508	TGCA	2	8	479904	479911	25 %	25 %	25 %	25 %	512443917
9024	NC_021508	GAA	2	6	479923	479928	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512443917
9025	NC_021508	GTG	2	6	479967	479972	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512443917
9026	NC_021508	T	6	6	480031	480036	0 %	100 %	0 %	0 %	512443918
9027	NC_021508	GCG	2	6	480070	480075	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512443918
9028	NC_021508	ATGG	2	8	480103	480110	25 %	25 %	50 %	0 %	512443918
9029	NC_021508	ACTGCA	2	12	480123	480134	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	512443918
9030	NC_021508	TCG	2	6	480228	480233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443919
9031	NC_021508	TGA	2	6	480240	480245	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512443919
9032	NC_021508	ATT	2	6	480287	480292	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512443919
9033	NC_021508	TGTA	2	8	480466	480473	25 %	50 %	25 %	0 %	512443920
9034	NC_021508	GCG	2	6	480513	480518	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512443920
9035	NC_021508	ATT	2	6	480667	480672	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512443920
9036	NC_021508	GTG	2	6	480692	480697	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512443920
9037	NC_021508	TGC	2	6	480839	480844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443920
9038	NC_021508	GTG	2	6	480945	480950	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512443920
9039	NC_021508	CTG	2	6	480979	480984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443920
9040	NC_021508	GAATT	2	10	481045	481054	40 %	40 %	20 %	0 %	512443920
9041	NC_021508	TGT	2	6	481113	481118	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512443920
9042	NC_021508	CTG	2	6	481130	481135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443920
9043	NC_021508	ACC	2	6	481207	481212	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512443920
9044	NC_021508	ATG	2	6	481286	481291	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512443920
9045	NC_021508	TAT	2	6	481327	481332	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512443920
9046	NC_021508	A	6	6	481364	481369	100 %	0 %	0 %	0 %	512443920
9047	NC_021508	T	6	6	481406	481411	0 %	100 %	0 %	0 %	512443920
9048	NC_021508	AGG	2	6	481463	481468	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512443920
9049	NC_021508	GAT	2	6	481552	481557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512443920
9050	NC_021508	GCT	2	6	481660	481665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443920
9051	NC_021508	TAT	2	6	481674	481679	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512443920
9052	NC_021508	CGCA	2	8	481727	481734	25 %	0 %	25 %	50 %	512443920
9053	NC_021508	TTG	2	6	481793	481798	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512443920
9054	NC_021508	GCG	2	6	481828	481833	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512443920
9055	NC_021508	TG	4	8	481893	481900	0 %	50 %	50 %	0 %	512443920
9056	NC_021508	GT	3	6	481959	481964	0 %	50 %	50 %	0 %	512443920
9057	NC_021508	TTG	2	6	482118	482123	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512443920
9058	NC_021508	GCA	3	9	482151	482159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512443920
9059	NC_021508	GGT	2	6	482240	482245	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512443920
9060	NC_021508	AGA	2	6	482339	482344	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512443920
9061	NC_021508	GTTC	2	8	482425	482432	0 %	50 %	25 %	25 %	512443920
9062	NC_021508	GAT	2	6	482449	482454	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512443920
9063	NC_021508	TACGT	2	10	482530	482539	20 %	40 %	20 %	20 %	512443920
9064	NC_021508	TCC	2	6	482562	482567	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512443920
9065	NC_021508	AAC	2	6	482752	482757	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512443920
9066	NC_021508	CCG	2	6	482766	482771	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512443920
9067	NC_021508	ACA	2	6	482825	482830	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512443920
9068	NC_021508	TG	3	6	482854	482859	0 %	50 %	50 %	0 %	512443920
9069	NC_021508	GTG	2	6	482875	482880	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512443920
9070	NC_021508	TCA	2	6	482885	482890	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512443920
9071	NC_021508	CCGCG	2	10	482913	482922	0 %	0 %	40 %	60 %	512443920
9072	NC_021508	GAT	2	6	482923	482928	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512443920
9073	NC_021508	GTT	2	6	483019	483024	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512443920
9074	NC_021508	GCCA	2	8	483068	483075	25 %	0 %	25 %	50 %	512443920
9075	NC_021508	TTA	2	6	483092	483097	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512443920
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9080	NC_021508	TAG	2	6	483200	483205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512443920
9081	NC_021508	TCT	2	6	483292	483297	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512443920
9082	NC_021508	GAC	2	6	483324	483329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512443920
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9086	NC_021508	AT	3	6	483624	483629	50 %	50 %	0 %	0 %	512443920
9087	NC_021508	TAT	2	6	483913	483918	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512443921
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9089	NC_021508	T	7	7	483985	483991	0 %	100 %	0 %	0 %	512443921
9090	NC_021508	T	6	6	484056	484061	0 %	100 %	0 %	0 %	512443921
9091	NC_021508	TG	3	6	484160	484165	0 %	50 %	50 %	0 %	512443921
9092	NC_021508	TCC	2	6	484175	484180	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512443921
9093	NC_021508	TA	3	6	484298	484303	50 %	50 %	0 %	0 %	512443921
9094	NC_021508	A	6	6	484303	484308	100 %	0 %	0 %	0 %	512443921
9095	NC_021508	TTA	2	6	484320	484325	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512443921
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9097	NC_021508	TC	3	6	484467	484472	0 %	50 %	0 %	50 %	512443921
9098	NC_021508	ATT	2	6	484514	484519	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512443921
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9106	NC_021508	CG	3	6	485362	485367	0 %	0 %	50 %	50 %	512443922
9107	NC_021508	GA	3	6	485370	485375	50 %	0 %	50 %	0 %	512443922
9108	NC_021508	GGA	2	6	485376	485381	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512443922
9109	NC_021508	CG	3	6	485405	485410	0 %	0 %	50 %	50 %	512443922
9110	NC_021508	TGAG	2	8	485440	485447	25 %	25 %	50 %	0 %	512443922
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9112	NC_021508	AGC	2	6	485488	485493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512443922
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9120	NC_021508	TGT	2	6	485872	485877	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512443923
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9122	NC_021508	A	6	6	485960	485965	100 %	0 %	0 %	0 %	512443923
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