MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum SS14

Total Repeats: 21822

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8501	NC_021508	T	6	6	456409	456414	0 %	100 %	0 %	0 %	512443895
8502	NC_021508	CTG	2	6	456441	456446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443895
8503	NC_021508	TGCAA	2	10	456455	456464	40 %	20 %	20 %	20 %	512443895
8504	NC_021508	ATT	2	6	456726	456731	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512443895
8505	NC_021508	CAGC	2	8	456776	456783	25 %	0 %	25 %	50 %	512443895
8506	NC_021508	TGA	2	6	456815	456820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512443895
8507	NC_021508	ACC	2	6	456849	456854	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512443895
8508	NC_021508	GAT	2	6	456864	456869	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512443895
8509	NC_021508	GAA	2	6	456926	456931	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512443895
8510	NC_021508	ATC	2	6	457000	457005	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512443895
8511	NC_021508	GC	3	6	457006	457011	0 %	0 %	50 %	50 %	512443895
8512	NC_021508	ATA	2	6	457018	457023	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512443895
8513	NC_021508	GCC	2	6	457038	457043	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512443895
8514	NC_021508	TGATT	2	10	457238	457247	20 %	60 %	20 %	0 %	512443895
8515	NC_021508	AGC	2	6	457371	457376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512443896
8516	NC_021508	GC	4	8	457406	457413	0 %	0 %	50 %	50 %	512443896
8517	NC_021508	CAG	2	6	457457	457462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512443896
8518	NC_021508	T	6	6	457473	457478	0 %	100 %	0 %	0 %	512443896
8519	NC_021508	GT	3	6	457488	457493	0 %	50 %	50 %	0 %	512443896
8520	NC_021508	CG	3	6	457498	457503	0 %	0 %	50 %	50 %	512443896
8521	NC_021508	TCC	2	6	457591	457596	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512443896
8522	NC_021508	GTGG	2	8	457621	457628	0 %	25 %	75 %	0 %	512443896
8523	NC_021508	CGA	2	6	457687	457692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512443896
8524	NC_021508	GCAT	2	8	457778	457785	25 %	25 %	25 %	25 %	512443896
8525	NC_021508	CAG	2	6	457814	457819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512443896
8526	NC_021508	TGC	2	6	457822	457827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443896
8527	NC_021508	AGT	2	6	457828	457833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512443896
8528	NC_021508	AAG	2	6	457850	457855	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512443896
8529	NC_021508	GCGTT	2	10	457963	457972	0 %	40 %	40 %	20 %	512443897
8530	NC_021508	TGTGCA	2	12	457983	457994	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	512443897
8531	NC_021508	GTGC	2	8	458049	458056	0 %	25 %	50 %	25 %	512443897
8532	NC_021508	GAG	2	6	458102	458107	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512443897
8533	NC_021508	CAGGT	2	10	458123	458132	20 %	20 %	40 %	20 %	512443897
8534	NC_021508	AGC	2	6	458139	458144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512443897
8535	NC_021508	CGTA	2	8	458163	458170	25 %	25 %	25 %	25 %	512443897
8536	NC_021508	G	6	6	458243	458248	0 %	0 %	100 %	0 %	512443897
8537	NC_021508	GCT	2	6	458330	458335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443897
8538	NC_021508	TCG	2	6	458367	458372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443897
8539	NC_021508	TG	3	6	458389	458394	0 %	50 %	50 %	0 %	512443897
8540	NC_021508	GCC	2	6	458418	458423	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512443897
8541	NC_021508	GC	5	10	458440	458449	0 %	0 %	50 %	50 %	512443897
8542	NC_021508	GAG	2	6	458506	458511	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512443897
8543	NC_021508	CTT	2	6	458533	458538	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512443897
8544	NC_021508	AGA	2	6	458579	458584	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512443897
8545	NC_021508	GTCA	2	8	458638	458645	25 %	25 %	25 %	25 %	512443897
8546	NC_021508	GA	3	6	458660	458665	50 %	0 %	50 %	0 %	512443897
8547	NC_021508	CCTG	2	8	458694	458701	0 %	25 %	25 %	50 %	512443897
8548	NC_021508	GTGC	2	8	458710	458717	0 %	25 %	50 %	25 %	512443897
8549	NC_021508	GGAA	2	8	458735	458742	50 %	0 %	50 %	0 %	512443897
8550	NC_021508	TGA	2	6	458834	458839	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512443897
8551	NC_021508	CTT	2	6	458886	458891	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512443897
8552	NC_021508	T	6	6	458899	458904	0 %	100 %	0 %	0 %	512443897
8553	NC_021508	TTC	2	6	458911	458916	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512443897
8554	NC_021508	ATC	2	6	458920	458925	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512443897
8555	NC_021508	GGGA	2	8	458970	458977	25 %	0 %	75 %	0 %	512443897
8556	NC_021508	GTG	2	6	459004	459009	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512443897
8557	NC_021508	GT	3	6	459070	459075	0 %	50 %	50 %	0 %	512443897
8558	NC_021508	TCGC	2	8	459112	459119	0 %	25 %	25 %	50 %	512443897
8559	NC_021508	GCC	2	6	459157	459162	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512443897
8560	NC_021508	GT	3	6	459187	459192	0 %	50 %	50 %	0 %	512443897
8561	NC_021508	TTCT	2	8	459193	459200	0 %	75 %	0 %	25 %	512443897
8562	NC_021508	TCG	2	6	459233	459238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443897
8563	NC_021508	GCG	2	6	459240	459245	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512443897
8564	NC_021508	TTCTC	2	10	459282	459291	0 %	60 %	0 %	40 %	512443897
8565	NC_021508	GGT	2	6	459298	459303	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512443897
8566	NC_021508	TTG	2	6	459329	459334	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512443897
8567	NC_021508	TAAT	2	8	459461	459468	50 %	50 %	0 %	0 %	512443897
8568	NC_021508	AATGA	2	10	459565	459574	60 %	20 %	20 %	0 %	512443897
8569	NC_021508	CTG	2	6	459622	459627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443897
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8571	NC_021508	GGCTT	2	10	459865	459874	0 %	40 %	40 %	20 %	512443898
8572	NC_021508	GGCAG	2	10	459876	459885	20 %	0 %	60 %	20 %	512443898
8573	NC_021508	AAT	2	6	459919	459924	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512443898
8574	NC_021508	CTTG	2	8	459942	459949	0 %	50 %	25 %	25 %	512443898
8575	NC_021508	T	6	6	459987	459992	0 %	100 %	0 %	0 %	512443898
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8578	NC_021508	GGGC	2	8	460093	460100	0 %	0 %	75 %	25 %	512443898
8579	NC_021508	TG	3	6	460172	460177	0 %	50 %	50 %	0 %	512443898
8580	NC_021508	TAT	2	6	460209	460214	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512443898
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8583	NC_021508	GCGT	2	8	460328	460335	0 %	25 %	50 %	25 %	512443899
8584	NC_021508	GTT	2	6	460338	460343	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512443899
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8586	NC_021508	TC	3	6	460432	460437	0 %	50 %	0 %	50 %	512443899
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8588	NC_021508	GCG	2	6	460508	460513	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512443899
8589	NC_021508	GC	3	6	460578	460583	0 %	0 %	50 %	50 %	512443899
8590	NC_021508	GGC	2	6	460617	460622	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512443899
8591	NC_021508	CGG	2	6	460682	460687	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512443899
8592	NC_021508	TC	3	6	460750	460755	0 %	50 %	0 %	50 %	512443899
8593	NC_021508	CCTG	2	8	460794	460801	0 %	25 %	25 %	50 %	512443899
8594	NC_021508	TAC	2	6	460821	460826	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512443899
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8596	NC_021508	G	7	7	460932	460938	0 %	0 %	100 %	0 %	512443899
8597	NC_021508	TCC	2	6	460971	460976	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512443899
8598	NC_021508	TC	3	6	461035	461040	0 %	50 %	0 %	50 %	512443899
8599	NC_021508	G	6	6	461127	461132	0 %	0 %	100 %	0 %	512443900
8600	NC_021508	GC	3	6	461175	461180	0 %	0 %	50 %	50 %	512443900
8601	NC_021508	CAG	2	6	461267	461272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512443900
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8603	NC_021508	CGA	2	6	461301	461306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512443900
8604	NC_021508	TGG	2	6	461312	461317	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512443900
8605	NC_021508	CCG	2	6	461329	461334	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512443900
8606	NC_021508	ACG	2	6	461342	461347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512443900
8607	NC_021508	TGC	2	6	461367	461372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443900
8608	NC_021508	GTT	2	6	461400	461405	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512443900
8609	NC_021508	TGG	2	6	461433	461438	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512443900
8610	NC_021508	AG	3	6	461478	461483	50 %	0 %	50 %	0 %	512443900
8611	NC_021508	TG	3	6	461493	461498	0 %	50 %	50 %	0 %	512443900
8612	NC_021508	GC	3	6	461523	461528	0 %	0 %	50 %	50 %	512443900
8613	NC_021508	GT	3	6	461529	461534	0 %	50 %	50 %	0 %	512443900
8614	NC_021508	GT	3	6	461541	461546	0 %	50 %	50 %	0 %	512443900
8615	NC_021508	GT	3	6	461580	461585	0 %	50 %	50 %	0 %	512443900
8616	NC_021508	CGT	2	6	461589	461594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443900
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8619	NC_021508	CTG	2	6	461930	461935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443901
8620	NC_021508	TCT	2	6	462006	462011	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512443901
8621	NC_021508	GCT	2	6	462028	462033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443901
8622	NC_021508	GCA	2	6	462034	462039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512443901
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8997	NC_021508	TG	3	6	478272	478277	0 %	50 %	50 %	0 %	512443917
8998	NC_021508	CAGA	2	8	478298	478305	50 %	0 %	25 %	25 %	512443917
8999	NC_021508	GTTT	2	8	478346	478353	0 %	75 %	25 %	0 %	512443917
9000	NC_021508	GGATC	2	10	478366	478375	20 %	20 %	40 %	20 %	512443917

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