MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum SS14

Total Repeats: 21822

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8001	NC_021508	GATG	2	8	434020	434027	25 %	25 %	50 %	0 %	512443876
8002	NC_021508	AG	3	6	434048	434053	50 %	0 %	50 %	0 %	512443876
8003	NC_021508	ACAGA	2	10	434105	434114	60 %	0 %	20 %	20 %	512443876
8004	NC_021508	GAA	2	6	434123	434128	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512443876
8005	NC_021508	GCA	2	6	434185	434190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512443876
8006	NC_021508	AGC	2	6	434220	434225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512443876
8007	NC_021508	GGA	2	6	434293	434298	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512443876
8008	NC_021508	T	6	6	434303	434308	0 %	100 %	0 %	0 %	512443876
8009	NC_021508	CG	3	6	434341	434346	0 %	0 %	50 %	50 %	512443876
8010	NC_021508	GAGTG	2	10	434354	434363	20 %	20 %	60 %	0 %	512443876
8011	NC_021508	AG	3	6	434398	434403	50 %	0 %	50 %	0 %	512443876
8012	NC_021508	GAA	2	6	434474	434479	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512443876
8013	NC_021508	AGC	2	6	434538	434543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512443876
8014	NC_021508	GC	3	6	434548	434553	0 %	0 %	50 %	50 %	512443876
8015	NC_021508	GA	4	8	434636	434643	50 %	0 %	50 %	0 %	512443876
8016	NC_021508	AGG	2	6	434748	434753	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512443876
8017	NC_021508	G	6	6	434758	434763	0 %	0 %	100 %	0 %	512443876
8018	NC_021508	GGTC	2	8	434769	434776	0 %	25 %	50 %	25 %	512443876
8019	NC_021508	CA	3	6	434802	434807	50 %	0 %	0 %	50 %	512443876
8020	NC_021508	GTT	2	6	434836	434841	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512443876
8021	NC_021508	GC	3	6	434900	434905	0 %	0 %	50 %	50 %	512443876
8022	NC_021508	AGA	2	6	434934	434939	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512443876
8023	NC_021508	TGA	2	6	434965	434970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512443876
8024	NC_021508	TG	3	6	434982	434987	0 %	50 %	50 %	0 %	512443876
8025	NC_021508	GACAG	2	10	435037	435046	40 %	0 %	40 %	20 %	512443876
8026	NC_021508	AAG	2	6	435096	435101	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512443876
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8028	NC_021508	AGGT	2	8	435180	435187	25 %	25 %	50 %	0 %	512443876
8029	NC_021508	TGC	2	6	435231	435236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443876
8030	NC_021508	CTGA	2	8	435335	435342	25 %	25 %	25 %	25 %	512443876
8031	NC_021508	GAG	2	6	435422	435427	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512443876
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8033	NC_021508	GGAG	2	8	435481	435488	25 %	0 %	75 %	0 %	512443876
8034	NC_021508	TGC	2	6	435502	435507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443876
8035	NC_021508	AAG	2	6	435527	435532	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512443876
8036	NC_021508	TTG	2	6	435534	435539	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512443876
8037	NC_021508	AAG	2	6	435597	435602	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512443876
8038	NC_021508	GTGC	2	8	435770	435777	0 %	25 %	50 %	25 %	512443876
8039	NC_021508	TTG	2	6	435791	435796	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512443876
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8041	NC_021508	GCA	2	6	435886	435891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512443876
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8043	NC_021508	GCC	2	6	436021	436026	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512443876
8044	NC_021508	GAC	2	6	436076	436081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512443876
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8046	NC_021508	T	6	6	436219	436224	0 %	100 %	0 %	0 %	512443877
8047	NC_021508	GC	3	6	436239	436244	0 %	0 %	50 %	50 %	512443877
8048	NC_021508	GT	3	6	436247	436252	0 %	50 %	50 %	0 %	512443877
8049	NC_021508	GC	3	6	436256	436261	0 %	0 %	50 %	50 %	512443877
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8058	NC_021508	GC	3	6	436553	436558	0 %	0 %	50 %	50 %	512443878
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8061	NC_021508	TGC	2	6	436692	436697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443879
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8065	NC_021508	TCTT	2	8	436911	436918	0 %	75 %	0 %	25 %	512443879
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8070	NC_021508	AGCGA	2	10	437182	437191	40 %	0 %	40 %	20 %	512443879
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8077	NC_021508	CG	3	6	437596	437601	0 %	0 %	50 %	50 %	512443879
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8082	NC_021508	CG	4	8	437897	437904	0 %	0 %	50 %	50 %	512443879
8083	NC_021508	TTAT	2	8	437932	437939	25 %	75 %	0 %	0 %	512443879
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8106	NC_021508	GC	3	6	438920	438925	0 %	0 %	50 %	50 %	512443880
8107	NC_021508	TCC	2	6	438972	438977	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512443880
8108	NC_021508	GGA	2	6	438993	438998	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512443880
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8110	NC_021508	GC	3	6	439079	439084	0 %	0 %	50 %	50 %	512443880
8111	NC_021508	GTT	3	9	439163	439171	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512443880
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8116	NC_021508	TGGTT	2	10	439293	439302	0 %	60 %	40 %	0 %	512443880
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8245	NC_021508	CAG	2	6	444649	444654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512443885
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8492	NC_021508	GAAA	2	8	455885	455892	75 %	0 %	25 %	0 %	512443894
8493	NC_021508	CGA	2	6	455923	455928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512443894
8494	NC_021508	TCA	2	6	456019	456024	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512443895
8495	NC_021508	ATT	2	6	456214	456219	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512443895
8496	NC_021508	GGT	2	6	456261	456266	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512443895
8497	NC_021508	AGGG	2	8	456281	456288	25 %	0 %	75 %	0 %	512443895
8498	NC_021508	CG	3	6	456332	456337	0 %	0 %	50 %	50 %	512443895
8499	NC_021508	TGAT	2	8	456364	456371	25 %	50 %	25 %	0 %	512443895
8500	NC_021508	GTT	2	6	456387	456392	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512443895

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