MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum SS14

Total Repeats: 21822

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7501	NC_021508	CCTG	2	8	409490	409497	0 %	25 %	25 %	50 %	512443851
7502	NC_021508	TTC	2	6	409530	409535	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512443851
7503	NC_021508	TGC	2	6	409583	409588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443851
7504	NC_021508	AGG	2	6	409610	409615	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512443851
7505	NC_021508	CG	3	6	409627	409632	0 %	0 %	50 %	50 %	512443851
7506	NC_021508	CCTT	2	8	409651	409658	0 %	50 %	0 %	50 %	512443851
7507	NC_021508	GCC	2	6	409669	409674	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512443851
7508	NC_021508	CG	4	8	409729	409736	0 %	0 %	50 %	50 %	512443851
7509	NC_021508	CA	3	6	409830	409835	50 %	0 %	0 %	50 %	512443852
7510	NC_021508	AGG	2	6	409840	409845	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512443852
7511	NC_021508	GTT	2	6	409925	409930	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512443852
7512	NC_021508	GA	3	6	409973	409978	50 %	0 %	50 %	0 %	512443852
7513	NC_021508	GGGGCG	2	12	409980	409991	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	512443852
7514	NC_021508	T	6	6	409992	409997	0 %	100 %	0 %	0 %	512443852
7515	NC_021508	AC	4	8	410024	410031	50 %	0 %	0 %	50 %	512443852
7516	NC_021508	GC	3	6	410109	410114	0 %	0 %	50 %	50 %	512443852
7517	NC_021508	GGT	2	6	410152	410157	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512443852
7518	NC_021508	T	6	6	410166	410171	0 %	100 %	0 %	0 %	512443852
7519	NC_021508	GCAG	2	8	410261	410268	25 %	0 %	50 %	25 %	512443852
7520	NC_021508	T	6	6	410291	410296	0 %	100 %	0 %	0 %	512443852
7521	NC_021508	G	6	6	410305	410310	0 %	0 %	100 %	0 %	512443852
7522	NC_021508	AGA	2	6	410333	410338	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512443852
7523	NC_021508	CCT	2	6	410390	410395	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512443852
7524	NC_021508	T	6	6	410430	410435	0 %	100 %	0 %	0 %	512443852
7525	NC_021508	CG	3	6	410456	410461	0 %	0 %	50 %	50 %	512443852
7526	NC_021508	GC	3	6	410482	410487	0 %	0 %	50 %	50 %	512443852
7527	NC_021508	GC	4	8	410514	410521	0 %	0 %	50 %	50 %	512443852
7528	NC_021508	GC	3	6	410538	410543	0 %	0 %	50 %	50 %	512443852
7529	NC_021508	GTG	2	6	410544	410549	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512443852
7530	NC_021508	CCG	2	6	410550	410555	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512443852
7531	NC_021508	GCG	2	6	410579	410584	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512443852
7532	NC_021508	CTT	2	6	410682	410687	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512443852
7533	NC_021508	TTA	2	6	410731	410736	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512443852
7534	NC_021508	AGGAT	2	10	410752	410761	40 %	20 %	40 %	0 %	512443852
7535	NC_021508	GCG	2	6	410830	410835	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512443852
7536	NC_021508	AAG	2	6	410862	410867	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512443852
7537	NC_021508	GT	3	6	410882	410887	0 %	50 %	50 %	0 %	512443852
7538	NC_021508	TGC	2	6	410894	410899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443852
7539	NC_021508	GA	3	6	410981	410986	50 %	0 %	50 %	0 %	512443853
7540	NC_021508	AGC	2	6	410989	410994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512443853
7541	NC_021508	GTT	2	6	411047	411052	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512443853
7542	NC_021508	TG	3	6	411079	411084	0 %	50 %	50 %	0 %	512443853
7543	NC_021508	GTG	2	6	411126	411131	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512443853
7544	NC_021508	ACG	2	6	411139	411144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512443853
7545	NC_021508	TAT	2	6	411158	411163	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512443853
7546	NC_021508	CTC	2	6	411308	411313	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512443853
7547	NC_021508	TGA	2	6	411333	411338	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512443853
7548	NC_021508	GC	3	6	411385	411390	0 %	0 %	50 %	50 %	512443854
7549	NC_021508	GTG	2	6	411455	411460	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512443854
7550	NC_021508	GAA	2	6	411487	411492	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512443854
7551	NC_021508	CCT	2	6	411629	411634	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512443854
7552	NC_021508	TTA	2	6	411659	411664	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512443854
7553	NC_021508	CG	3	6	411715	411720	0 %	0 %	50 %	50 %	512443854
7554	NC_021508	GGT	2	6	411741	411746	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512443854
7555	NC_021508	T	6	6	411796	411801	0 %	100 %	0 %	0 %	512443854
7556	NC_021508	GTGC	2	8	411802	411809	0 %	25 %	50 %	25 %	512443854
7557	NC_021508	TCG	2	6	411846	411851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443854
7558	NC_021508	G	6	6	411851	411856	0 %	0 %	100 %	0 %	512443854
7559	NC_021508	CGCT	2	8	411866	411873	0 %	25 %	25 %	50 %	512443854
7560	NC_021508	GCA	2	6	411942	411947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512443854
7561	NC_021508	A	6	6	411964	411969	100 %	0 %	0 %	0 %	512443854
7562	NC_021508	T	6	6	411974	411979	0 %	100 %	0 %	0 %	512443854
7563	NC_021508	CGA	2	6	412014	412019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512443854
7564	NC_021508	G	7	7	412077	412083	0 %	0 %	100 %	0 %	512443854
7565	NC_021508	CTG	2	6	412232	412237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443854
7566	NC_021508	GT	3	6	412294	412299	0 %	50 %	50 %	0 %	512443854
7567	NC_021508	GCG	2	6	412354	412359	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512443854
7568	NC_021508	TG	3	6	412367	412372	0 %	50 %	50 %	0 %	512443854
7569	NC_021508	GT	4	8	412456	412463	0 %	50 %	50 %	0 %	512443854
7570	NC_021508	CG	3	6	412482	412487	0 %	0 %	50 %	50 %	512443854
7571	NC_021508	GGA	2	6	412544	412549	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512443854
7572	NC_021508	CGG	2	6	412615	412620	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512443854
7573	NC_021508	GAT	2	6	412703	412708	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512443855
7574	NC_021508	T	6	6	412830	412835	0 %	100 %	0 %	0 %	512443855
7575	NC_021508	T	6	6	412850	412855	0 %	100 %	0 %	0 %	512443855
7576	NC_021508	GAGT	2	8	412867	412874	25 %	25 %	50 %	0 %	512443855
7577	NC_021508	TG	3	6	412889	412894	0 %	50 %	50 %	0 %	512443855
7578	NC_021508	T	6	6	412902	412907	0 %	100 %	0 %	0 %	512443855
7579	NC_021508	CTT	2	6	412924	412929	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512443855
7580	NC_021508	TG	4	8	412974	412981	0 %	50 %	50 %	0 %	512443855
7581	NC_021508	T	6	6	413103	413108	0 %	100 %	0 %	0 %	512443855
7582	NC_021508	TCC	2	6	413153	413158	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512443855
7583	NC_021508	TGT	2	6	413162	413167	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512443855
7584	NC_021508	AGT	2	6	413186	413191	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512443855
7585	NC_021508	T	8	8	413191	413198	0 %	100 %	0 %	0 %	512443855
7586	NC_021508	TTC	2	6	413250	413255	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512443855
7587	NC_021508	TGG	2	6	413274	413279	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512443855
7588	NC_021508	CCA	2	6	413335	413340	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512443855
7589	NC_021508	GATG	2	8	413429	413436	25 %	25 %	50 %	0 %	512443855
7590	NC_021508	ATTTT	2	10	413506	413515	20 %	80 %	0 %	0 %	512443855
7591	NC_021508	GT	4	8	413548	413555	0 %	50 %	50 %	0 %	512443855
7592	NC_021508	TGT	3	9	413566	413574	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512443855
7593	NC_021508	T	6	6	413633	413638	0 %	100 %	0 %	0 %	512443855
7594	NC_021508	CGG	2	6	413653	413658	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512443855
7595	NC_021508	GTG	2	6	413691	413696	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512443855
7596	NC_021508	T	7	7	413733	413739	0 %	100 %	0 %	0 %	512443855
7597	NC_021508	AGG	2	6	413744	413749	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512443855
7598	NC_021508	CTTT	2	8	413769	413776	0 %	75 %	0 %	25 %	512443855
7599	NC_021508	ATC	2	6	413787	413792	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512443855
7600	NC_021508	AGG	2	6	413817	413822	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512443855
7601	NC_021508	GAA	2	6	413829	413834	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512443855
7602	NC_021508	GGT	2	6	413919	413924	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512443856
7603	NC_021508	TGC	2	6	413936	413941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443856
7604	NC_021508	TG	4	8	413948	413955	0 %	50 %	50 %	0 %	512443856
7605	NC_021508	TGT	2	6	413976	413981	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512443856
7606	NC_021508	CTT	2	6	413990	413995	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512443856
7607	NC_021508	TGA	2	6	414044	414049	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512443856
7608	NC_021508	GTA	2	6	414310	414315	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512443856
7609	NC_021508	CG	3	6	414338	414343	0 %	0 %	50 %	50 %	512443856
7610	NC_021508	A	6	6	414452	414457	100 %	0 %	0 %	0 %	512443856
7611	NC_021508	GTGC	2	8	414490	414497	0 %	25 %	50 %	25 %	512443856
7612	NC_021508	GAA	2	6	414532	414537	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512443856
7613	NC_021508	CGG	2	6	414626	414631	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512443856
7614	NC_021508	AGA	2	6	414641	414646	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512443856
7615	NC_021508	GGT	2	6	414727	414732	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512443857
7616	NC_021508	TGTAGG	2	12	414744	414755	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	512443857
7617	NC_021508	GTA	2	6	414787	414792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512443857
7618	NC_021508	CCA	2	6	414822	414827	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512443857
7619	NC_021508	GAT	2	6	414846	414851	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512443857
7620	NC_021508	AAGGGG	2	12	414943	414954	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512443857
7621	NC_021508	TCC	2	6	415017	415022	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512443857
7622	NC_021508	TTC	2	6	415034	415039	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512443857
7623	NC_021508	GAT	2	6	415066	415071	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512443857
7624	NC_021508	T	6	6	415203	415208	0 %	100 %	0 %	0 %	512443857
7625	NC_021508	GCT	2	6	415225	415230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443857
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7997	NC_021508	TAC	2	6	433849	433854	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512443876
7998	NC_021508	GTGC	2	8	433868	433875	0 %	25 %	50 %	25 %	512443876
7999	NC_021508	CAG	2	6	434003	434008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512443876
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