MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum SS14

Total Repeats: 21822

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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7002	NC_021508	TTG	2	6	384041	384046	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512443831
7003	NC_021508	GAA	2	6	384060	384065	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512443831
7004	NC_021508	GC	3	6	384136	384141	0 %	0 %	50 %	50 %	512443832
7005	NC_021508	GGT	2	6	384165	384170	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512443832
7006	NC_021508	AGG	2	6	384223	384228	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512443832
7007	NC_021508	TGT	2	6	384245	384250	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512443832
7008	NC_021508	GCCGT	2	10	384377	384386	0 %	20 %	40 %	40 %	512443832
7009	NC_021508	GCG	2	6	384403	384408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512443832
7010	NC_021508	GTG	2	6	384486	384491	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512443832
7011	NC_021508	CTGA	2	8	384527	384534	25 %	25 %	25 %	25 %	512443832
7012	NC_021508	TGG	2	6	384572	384577	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512443832
7013	NC_021508	GC	3	6	384594	384599	0 %	0 %	50 %	50 %	512443832
7014	NC_021508	TGA	2	6	384685	384690	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512443832
7015	NC_021508	ACG	2	6	384898	384903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512443832
7016	NC_021508	GA	3	6	384907	384912	50 %	0 %	50 %	0 %	512443832
7017	NC_021508	GTTG	2	8	384941	384948	0 %	50 %	50 %	0 %	512443832
7018	NC_021508	ACC	2	6	384949	384954	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512443832
7019	NC_021508	AAG	2	6	385049	385054	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512443833
7020	NC_021508	TG	3	6	385063	385068	0 %	50 %	50 %	0 %	512443833
7021	NC_021508	CAC	2	6	385110	385115	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512443833
7022	NC_021508	AGT	2	6	385154	385159	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512443833
7023	NC_021508	GC	4	8	385192	385199	0 %	0 %	50 %	50 %	512443833
7024	NC_021508	GCA	2	6	385207	385212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512443833
7025	NC_021508	CGC	2	6	385249	385254	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512443833
7026	NC_021508	GCG	3	9	385260	385268	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512443833
7027	NC_021508	T	6	6	385822	385827	0 %	100 %	0 %	0 %	512443834
7028	NC_021508	AGC	2	6	385851	385856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512443834
7029	NC_021508	CCA	2	6	385890	385895	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512443834
7030	NC_021508	GCG	2	6	385925	385930	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512443834
7031	NC_021508	G	6	6	385942	385947	0 %	0 %	100 %	0 %	512443834
7032	NC_021508	TGC	2	6	385948	385953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443834
7033	NC_021508	GGA	2	6	385996	386001	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512443834
7034	NC_021508	CTG	2	6	386003	386008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443834
7035	NC_021508	CGT	2	6	386067	386072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443834
7036	NC_021508	GCGG	2	8	386105	386112	0 %	0 %	75 %	25 %	512443834
7037	NC_021508	GGA	2	6	386125	386130	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512443834
7038	NC_021508	CTGC	2	8	386165	386172	0 %	25 %	25 %	50 %	512443834
7039	NC_021508	GCG	2	6	386192	386197	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512443834
7040	NC_021508	GCC	2	6	386293	386298	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512443834
7041	NC_021508	TCT	2	6	386305	386310	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512443834
7042	NC_021508	TGA	2	6	386386	386391	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512443834
7043	NC_021508	TGA	2	6	386400	386405	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512443834
7044	NC_021508	CGG	2	6	386413	386418	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512443834
7045	NC_021508	TGT	2	6	386512	386517	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512443834
7046	NC_021508	TG	3	6	386549	386554	0 %	50 %	50 %	0 %	512443834
7047	NC_021508	CT	3	6	386633	386638	0 %	50 %	0 %	50 %	512443834
7048	NC_021508	GGT	2	6	386678	386683	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512443834
7049	NC_021508	GT	3	6	386682	386687	0 %	50 %	50 %	0 %	512443834
7050	NC_021508	GCG	2	6	386697	386702	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512443834
7051	NC_021508	TCA	2	6	386786	386791	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512443834
7052	NC_021508	TCT	2	6	386857	386862	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512443834
7053	NC_021508	T	6	6	386984	386989	0 %	100 %	0 %	0 %	512443834
7054	NC_021508	CTTA	2	8	387003	387010	25 %	50 %	0 %	25 %	512443834
7055	NC_021508	GAT	2	6	387055	387060	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512443834
7056	NC_021508	T	6	6	387087	387092	0 %	100 %	0 %	0 %	512443834
7057	NC_021508	TCT	2	6	387137	387142	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512443834
7058	NC_021508	AAG	2	6	387177	387182	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512443834
7059	NC_021508	TGA	2	6	387186	387191	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512443834
7060	NC_021508	GTG	2	6	387239	387244	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512443834
7061	NC_021508	TC	3	6	387250	387255	0 %	50 %	0 %	50 %	512443834
7062	NC_021508	AGGAG	2	10	387292	387301	40 %	0 %	60 %	0 %	512443834
7063	NC_021508	TGCG	2	8	387353	387360	0 %	25 %	50 %	25 %	512443834
7064	NC_021508	TC	3	6	387365	387370	0 %	50 %	0 %	50 %	512443834
7065	NC_021508	CG	4	8	387398	387405	0 %	0 %	50 %	50 %	512443834
7066	NC_021508	GC	3	6	387439	387444	0 %	0 %	50 %	50 %	512443834
7067	NC_021508	GT	3	6	387537	387542	0 %	50 %	50 %	0 %	512443834
7068	NC_021508	TCGG	2	8	387613	387620	0 %	25 %	50 %	25 %	512443834
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7071	NC_021508	TGC	2	6	387906	387911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443834
7072	NC_021508	GAT	2	6	387941	387946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512443834
7073	NC_021508	TGG	2	6	388011	388016	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512443834
7074	NC_021508	GAG	2	6	388031	388036	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512443834
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7080	NC_021508	GTA	2	6	388576	388581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512443835
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7092	NC_021508	CAGTG	2	10	388887	388896	20 %	20 %	40 %	20 %	512443835
7093	NC_021508	GTTG	2	8	388904	388911	0 %	50 %	50 %	0 %	512443835
7094	NC_021508	TG	3	6	388926	388931	0 %	50 %	50 %	0 %	512443835
7095	NC_021508	GAG	2	6	388972	388977	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512443835
7096	NC_021508	TTCC	2	8	389003	389010	0 %	50 %	0 %	50 %	512443835
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7100	NC_021508	GGT	2	6	389088	389093	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512443835
7101	NC_021508	TGCGG	2	10	389113	389122	0 %	20 %	60 %	20 %	512443835
7102	NC_021508	GGT	2	6	389175	389180	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512443835
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7121	NC_021508	GT	3	6	390804	390809	0 %	50 %	50 %	0 %	512443838
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7123	NC_021508	CGT	2	6	391024	391029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443838
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7239	NC_021508	TGC	2	6	396551	396556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443842
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7241	NC_021508	T	6	6	396633	396638	0 %	100 %	0 %	0 %	512443842
7242	NC_021508	GTGC	2	8	396712	396719	0 %	25 %	50 %	25 %	512443842
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7245	NC_021508	GCT	2	6	396797	396802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443842
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7368	NC_021508	AC	3	6	403151	403156	50 %	0 %	0 %	50 %	512443847
7369	NC_021508	GC	4	8	403249	403256	0 %	0 %	50 %	50 %	512443847
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7371	NC_021508	TCA	2	6	403284	403289	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512443847
7372	NC_021508	GAG	2	6	403334	403339	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512443847
7373	NC_021508	A	6	6	403349	403354	100 %	0 %	0 %	0 %	512443847
7374	NC_021508	AAC	2	6	403356	403361	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512443847
7375	NC_021508	GTG	2	6	403381	403386	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512443847
7376	NC_021508	GCACA	2	10	403388	403397	40 %	0 %	20 %	40 %	512443847
7377	NC_021508	AGC	2	6	403428	403433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512443847
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7379	NC_021508	TCTT	2	8	403494	403501	0 %	75 %	0 %	25 %	512443847
7380	NC_021508	GAA	2	6	403502	403507	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512443847
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7382	NC_021508	CAGGGG	2	12	403640	403651	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	512443848
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7384	NC_021508	GTG	2	6	403761	403766	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512443848
7385	NC_021508	GCT	2	6	403779	403784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443848
7386	NC_021508	GTC	2	6	403837	403842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443848
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7388	NC_021508	T	6	6	403966	403971	0 %	100 %	0 %	0 %	512443848
7389	NC_021508	ATCG	2	8	403972	403979	25 %	25 %	25 %	25 %	512443848
7390	NC_021508	T	6	6	404054	404059	0 %	100 %	0 %	0 %	512443848
7391	NC_021508	CCAG	2	8	404107	404114	25 %	0 %	25 %	50 %	512443848
7392	NC_021508	TTG	2	6	404161	404166	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512443848
7393	NC_021508	GCC	2	6	404184	404189	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512443848
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7398	NC_021508	GC	4	8	404394	404401	0 %	0 %	50 %	50 %	512443848
7399	NC_021508	C	7	7	404484	404490	0 %	0 %	0 %	100 %	512443848
7400	NC_021508	ATC	3	9	404506	404514	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512443848
7401	NC_021508	AG	4	8	404516	404523	50 %	0 %	50 %	0 %	512443848
7402	NC_021508	A	6	6	404524	404529	100 %	0 %	0 %	0 %	512443848
7403	NC_021508	ACC	2	6	404626	404631	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512443848
7404	NC_021508	GCT	2	6	404634	404639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443848
7405	NC_021508	GC	3	6	404657	404662	0 %	0 %	50 %	50 %	512443848
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7410	NC_021508	CAG	2	6	404923	404928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512443848
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7412	NC_021508	GT	4	8	404988	404995	0 %	50 %	50 %	0 %	512443848
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7425	NC_021508	GCA	2	6	405483	405488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512443848
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7453	NC_021508	CTG	2	6	406829	406834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443849
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7458	NC_021508	CGCAC	2	10	407002	407011	20 %	0 %	20 %	60 %	512443849
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7486	NC_021508	A	7	7	408522	408528	100 %	0 %	0 %	0 %	512443850
7487	NC_021508	TGC	2	6	408615	408620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443850
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7490	NC_021508	CGG	2	6	408838	408843	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512443850
7491	NC_021508	TGA	2	6	408845	408850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512443850
7492	NC_021508	CA	3	6	408935	408940	50 %	0 %	0 %	50 %	512443850
7493	NC_021508	A	7	7	408958	408964	100 %	0 %	0 %	0 %	512443850
7494	NC_021508	CG	4	8	408978	408985	0 %	0 %	50 %	50 %	512443850
7495	NC_021508	AGC	2	6	409003	409008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512443850
7496	NC_021508	AGC	2	6	409027	409032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512443850
7497	NC_021508	GAA	2	6	409049	409054	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512443850
7498	NC_021508	CGAC	2	8	409058	409065	25 %	0 %	25 %	50 %	512443850
7499	NC_021508	GGA	2	6	409365	409370	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512443851
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