MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum SS14

Total Repeats: 21822

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5502	NC_021508	CTTT	2	8	309172	309179	0 %	75 %	0 %	25 %	512443772
5503	NC_021508	TGA	2	6	309203	309208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512443772
5504	NC_021508	TC	3	6	309229	309234	0 %	50 %	0 %	50 %	512443772
5505	NC_021508	ATT	2	6	309237	309242	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512443772
5506	NC_021508	CA	4	8	309261	309268	50 %	0 %	0 %	50 %	512443772
5507	NC_021508	GTT	2	6	309311	309316	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512443772
5508	NC_021508	CG	4	8	309317	309324	0 %	0 %	50 %	50 %	512443772
5509	NC_021508	CG	3	6	309329	309334	0 %	0 %	50 %	50 %	512443772
5510	NC_021508	TCA	2	6	309338	309343	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512443772
5511	NC_021508	AATC	2	8	309345	309352	50 %	25 %	0 %	25 %	512443772
5512	NC_021508	GAT	2	6	309369	309374	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512443772
5513	NC_021508	ATC	2	6	309381	309386	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512443772
5514	NC_021508	CGCT	2	8	309401	309408	0 %	25 %	25 %	50 %	512443772
5515	NC_021508	CG	3	6	309427	309432	0 %	0 %	50 %	50 %	512443772
5516	NC_021508	GCG	2	6	309504	309509	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512443773
5517	NC_021508	ATT	2	6	309510	309515	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512443773
5518	NC_021508	T	6	6	309594	309599	0 %	100 %	0 %	0 %	512443773
5519	NC_021508	CGTGC	2	10	309618	309627	0 %	20 %	40 %	40 %	512443773
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5521	NC_021508	AAG	2	6	309684	309689	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512443773
5522	NC_021508	CGGTG	2	10	309744	309753	0 %	20 %	60 %	20 %	512443773
5523	NC_021508	T	7	7	309760	309766	0 %	100 %	0 %	0 %	512443773
5524	NC_021508	T	6	6	309822	309827	0 %	100 %	0 %	0 %	512443773
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5531	NC_021508	GCA	2	6	310038	310043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512443773
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5533	NC_021508	CCT	2	6	310128	310133	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512443773
5534	NC_021508	GCG	2	6	310244	310249	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512443773
5535	NC_021508	ATG	2	6	310312	310317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512443773
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5538	NC_021508	GT	3	6	310377	310382	0 %	50 %	50 %	0 %	512443773
5539	NC_021508	GTTG	2	8	310462	310469	0 %	50 %	50 %	0 %	512443773
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5542	NC_021508	CAG	2	6	310588	310593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512443773
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5544	NC_021508	TGC	2	6	310676	310681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443773
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5548	NC_021508	TAG	2	6	310934	310939	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512443774
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5551	NC_021508	GGC	2	6	310993	310998	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512443774
5552	NC_021508	GT	3	6	311018	311023	0 %	50 %	50 %	0 %	512443774
5553	NC_021508	ACT	2	6	311043	311048	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512443774
5554	NC_021508	GCA	3	9	311049	311057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512443774
5555	NC_021508	TG	3	6	311093	311098	0 %	50 %	50 %	0 %	512443774
5556	NC_021508	GC	5	10	311107	311116	0 %	0 %	50 %	50 %	512443774
5557	NC_021508	GTTTT	2	10	311189	311198	0 %	80 %	20 %	0 %	512443774
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5591	NC_021508	CGCTG	2	10	313174	313183	0 %	20 %	40 %	40 %	512443776
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5595	NC_021508	GC	3	6	313391	313396	0 %	0 %	50 %	50 %	512443777
5596	NC_021508	CG	3	6	313434	313439	0 %	0 %	50 %	50 %	512443777
5597	NC_021508	GC	3	6	313492	313497	0 %	0 %	50 %	50 %	512443777
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5600	NC_021508	GC	3	6	313536	313541	0 %	0 %	50 %	50 %	512443777
5601	NC_021508	GACG	2	8	313546	313553	25 %	0 %	50 %	25 %	512443777
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5603	NC_021508	GTT	2	6	313615	313620	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512443777
5604	NC_021508	A	6	6	313624	313629	100 %	0 %	0 %	0 %	512443777
5605	NC_021508	TGGA	2	8	313701	313708	25 %	25 %	50 %	0 %	512443777
5606	NC_021508	AGC	2	6	313713	313718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512443777
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5608	NC_021508	GGTG	2	8	313845	313852	0 %	25 %	75 %	0 %	512443777
5609	NC_021508	GA	3	6	313867	313872	50 %	0 %	50 %	0 %	512443777
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5611	NC_021508	GAA	2	6	313919	313924	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512443777
5612	NC_021508	T	6	6	313955	313960	0 %	100 %	0 %	0 %	512443777
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5615	NC_021508	T	6	6	314069	314074	0 %	100 %	0 %	0 %	512443777
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5751	NC_021508	CTC	2	6	320350	320355	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512443781
5752	NC_021508	CGC	2	6	320390	320395	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512443781
5753	NC_021508	CTG	2	6	320499	320504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443781
5754	NC_021508	GCA	2	6	320522	320527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512443781
5755	NC_021508	ACC	2	6	320543	320548	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512443781
5756	NC_021508	C	7	7	320559	320565	0 %	0 %	0 %	100 %	512443781
5757	NC_021508	CGT	2	6	320607	320612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443781
5758	NC_021508	GA	3	6	320625	320630	50 %	0 %	50 %	0 %	512443781
5759	NC_021508	CG	3	6	320721	320726	0 %	0 %	50 %	50 %	512443781
5760	NC_021508	CAT	2	6	320734	320739	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512443781
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5763	NC_021508	ACA	2	6	320871	320876	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512443781
5764	NC_021508	AAGC	2	8	320972	320979	50 %	0 %	25 %	25 %	512443781
5765	NC_021508	GT	4	8	321022	321029	0 %	50 %	50 %	0 %	512443781
5766	NC_021508	GTGC	2	8	321046	321053	0 %	25 %	50 %	25 %	512443781
5767	NC_021508	GCTC	2	8	321054	321061	0 %	25 %	25 %	50 %	512443781
5768	NC_021508	CGTC	2	8	321095	321102	0 %	25 %	25 %	50 %	512443781
5769	NC_021508	GAT	2	6	321117	321122	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512443781
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5771	NC_021508	ACGGTC	2	12	321190	321201	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	512443781
5772	NC_021508	ATA	2	6	321202	321207	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512443781
5773	NC_021508	CCTC	2	8	321507	321514	0 %	25 %	0 %	75 %	512443781
5774	NC_021508	AGG	2	6	321516	321521	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512443781
5775	NC_021508	CGT	2	6	321594	321599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443781
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5777	NC_021508	GAA	2	6	321655	321660	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512443781
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5779	NC_021508	A	6	6	321693	321698	100 %	0 %	0 %	0 %	512443781
5780	NC_021508	CAG	2	6	321703	321708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512443781
5781	NC_021508	CG	3	6	321744	321749	0 %	0 %	50 %	50 %	512443781
5782	NC_021508	TGA	2	6	321756	321761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512443781
5783	NC_021508	TG	4	8	321806	321813	0 %	50 %	50 %	0 %	512443781
5784	NC_021508	GAC	2	6	321823	321828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512443781
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5788	NC_021508	TTC	2	6	321979	321984	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512443781
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5795	NC_021508	GGA	2	6	322484	322489	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512443782
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5808	NC_021508	CTG	2	6	322981	322986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443782
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5821	NC_021508	GC	3	6	323468	323473	0 %	0 %	50 %	50 %	512443782
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5824	NC_021508	G	6	6	323646	323651	0 %	0 %	100 %	0 %	512443782
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5832	NC_021508	AGC	2	6	324221	324226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512443783
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5841	NC_021508	TAC	2	6	324667	324672	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512443783
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5846	NC_021508	TGA	2	6	324880	324885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512443784
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5853	NC_021508	TCTG	2	8	325244	325251	0 %	50 %	25 %	25 %	512443784
5854	NC_021508	GTC	2	6	325272	325277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443784
5855	NC_021508	GA	3	6	325410	325415	50 %	0 %	50 %	0 %	512443784
5856	NC_021508	GAA	2	6	325435	325440	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512443784
5857	NC_021508	CG	3	6	325463	325468	0 %	0 %	50 %	50 %	512443784
5858	NC_021508	CG	3	6	325498	325503	0 %	0 %	50 %	50 %	512443784
5859	NC_021508	TGCAGG	2	12	325522	325533	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	512443784
5860	NC_021508	TG	3	6	325617	325622	0 %	50 %	50 %	0 %	512443784
5861	NC_021508	G	7	7	325641	325647	0 %	0 %	100 %	0 %	512443784
5862	NC_021508	G	6	6	325679	325684	0 %	0 %	100 %	0 %	512443784
5863	NC_021508	G	7	7	325739	325745	0 %	0 %	100 %	0 %	512443784
5864	NC_021508	GGTG	2	8	325766	325773	0 %	25 %	75 %	0 %	512443784
5865	NC_021508	GT	3	6	325855	325860	0 %	50 %	50 %	0 %	512443785
5866	NC_021508	CTG	2	6	325867	325872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443785
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5868	NC_021508	CGC	2	6	325991	325996	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512443785
5869	NC_021508	TTG	2	6	326027	326032	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512443785
5870	NC_021508	GC	4	8	326050	326057	0 %	0 %	50 %	50 %	512443785
5871	NC_021508	TGCGC	2	10	326121	326130	0 %	20 %	40 %	40 %	512443785
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5873	NC_021508	TCG	2	6	326347	326352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443785
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5997	NC_021508	TCT	2	6	333709	333714	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512443791
5998	NC_021508	TTAG	2	8	333762	333769	25 %	50 %	25 %	0 %	512443791
5999	NC_021508	GCA	2	6	333795	333800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512443791
6000	NC_021508	CAC	2	6	333905	333910	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512443791

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