MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum str. Nichols

Total Repeats: 21924

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_021490	GCG	2	6	114070	114075	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512556186
2002	NC_021490	TGCG	2	8	114098	114105	0 %	25 %	50 %	25 %	512556186
2003	NC_021490	GAA	2	6	114111	114116	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512556186
2004	NC_021490	TGCA	2	8	114128	114135	25 %	25 %	25 %	25 %	512556186
2005	NC_021490	TGA	2	6	114197	114202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556186
2006	NC_021490	GATTT	2	10	114212	114221	20 %	60 %	20 %	0 %	512556186
2007	NC_021490	T	7	7	114219	114225	0 %	100 %	0 %	0 %	512556186
2008	NC_021490	TC	3	6	114300	114305	0 %	50 %	0 %	50 %	512556186
2009	NC_021490	TGC	2	6	114324	114329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556186
2010	NC_021490	TGA	2	6	114462	114467	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556186
2011	NC_021490	CGT	2	6	114481	114486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556186
2012	NC_021490	GCA	3	9	114501	114509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556186
2013	NC_021490	TAAA	2	8	114515	114522	75 %	25 %	0 %	0 %	512556186
2014	NC_021490	TCC	2	6	114527	114532	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512556186
2015	NC_021490	GAA	2	6	114552	114557	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512556186
2016	NC_021490	TAA	2	6	114779	114784	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512556186
2017	NC_021490	T	6	6	114807	114812	0 %	100 %	0 %	0 %	512556186
2018	NC_021490	A	8	8	114833	114840	100 %	0 %	0 %	0 %	512556186
2019	NC_021490	A	6	6	114852	114857	100 %	0 %	0 %	0 %	512556186
2020	NC_021490	GAG	2	6	114868	114873	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512556186
2021	NC_021490	GCT	2	6	114888	114893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556186
2022	NC_021490	GAA	2	6	114961	114966	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512556186
2023	NC_021490	AGG	2	6	114980	114985	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512556186
2024	NC_021490	GGT	2	6	115033	115038	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512556186
2025	NC_021490	CTC	2	6	115225	115230	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512556186
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2027	NC_021490	GC	3	6	115366	115371	0 %	0 %	50 %	50 %	512556186
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2029	NC_021490	GC	4	8	115452	115459	0 %	0 %	50 %	50 %	512556186
2030	NC_021490	GA	3	6	115520	115525	50 %	0 %	50 %	0 %	512556186
2031	NC_021490	CG	3	6	115535	115540	0 %	0 %	50 %	50 %	512556186
2032	NC_021490	TGCG	2	8	115589	115596	0 %	25 %	50 %	25 %	512556186
2033	NC_021490	TAG	2	6	115648	115653	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556186
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2036	NC_021490	TTAT	2	8	115860	115867	25 %	75 %	0 %	0 %	512556187
2037	NC_021490	CG	3	6	115885	115890	0 %	0 %	50 %	50 %	512556187
2038	NC_021490	T	7	7	115939	115945	0 %	100 %	0 %	0 %	512556187
2039	NC_021490	TTG	2	6	115989	115994	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512556187
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2041	NC_021490	GAA	2	6	116102	116107	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512556187
2042	NC_021490	TG	3	6	116112	116117	0 %	50 %	50 %	0 %	512556187
2043	NC_021490	GAC	2	6	116159	116164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556187
2044	NC_021490	TGT	2	6	116209	116214	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512556187
2045	NC_021490	TG	4	8	116248	116255	0 %	50 %	50 %	0 %	512556187
2046	NC_021490	CGTA	2	8	116313	116320	25 %	25 %	25 %	25 %	512556187
2047	NC_021490	TC	4	8	116364	116371	0 %	50 %	0 %	50 %	512556187
2048	NC_021490	TCC	2	6	116381	116386	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512556187
2049	NC_021490	TCT	2	6	116434	116439	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512556187
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2052	NC_021490	GAA	2	6	116521	116526	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512556187
2053	NC_021490	T	7	7	116534	116540	0 %	100 %	0 %	0 %	512556187
2054	NC_021490	T	6	6	116580	116585	0 %	100 %	0 %	0 %	512556187
2055	NC_021490	TGT	2	6	116600	116605	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512556187
2056	NC_021490	CTG	2	6	116625	116630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556187
2057	NC_021490	CAA	2	6	116669	116674	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512556187
2058	NC_021490	TG	3	6	116684	116689	0 %	50 %	50 %	0 %	512556187
2059	NC_021490	CAA	2	6	116709	116714	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512556187
2060	NC_021490	TCT	2	6	116738	116743	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512556187
2061	NC_021490	AGGG	2	8	116794	116801	25 %	0 %	75 %	0 %	512556187
2062	NC_021490	GTG	2	6	116931	116936	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512556187
2063	NC_021490	TAT	2	6	116962	116967	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512556187
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2065	NC_021490	ATCTGC	2	12	117196	117207	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	512556187
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2083	NC_021490	ATCT	2	8	118170	118177	25 %	50 %	0 %	25 %	512556187
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2091	NC_021490	GC	4	8	118528	118535	0 %	0 %	50 %	50 %	512556187
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2094	NC_021490	GC	3	6	118625	118630	0 %	0 %	50 %	50 %	512556187
2095	NC_021490	TTG	2	6	118649	118654	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512556187
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2106	NC_021490	CG	3	6	119202	119207	0 %	0 %	50 %	50 %	512556188
2107	NC_021490	AGGA	2	8	119223	119230	50 %	0 %	50 %	0 %	512556188
2108	NC_021490	GGT	2	6	119231	119236	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512556188
2109	NC_021490	CGTA	2	8	119282	119289	25 %	25 %	25 %	25 %	512556188
2110	NC_021490	CAG	2	6	119302	119307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556188
2111	NC_021490	CGA	2	6	119315	119320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556188
2112	NC_021490	GAA	2	6	119361	119366	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512556188
2113	NC_021490	ATCC	2	8	119472	119479	25 %	25 %	0 %	50 %	512556188
2114	NC_021490	AAGA	2	8	119490	119497	75 %	0 %	25 %	0 %	512556188
2115	NC_021490	CA	3	6	119561	119566	50 %	0 %	0 %	50 %	512556188
2116	NC_021490	AGA	2	6	119567	119572	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512556188
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2122	NC_021490	ACAGA	2	10	119794	119803	60 %	0 %	20 %	20 %	512556188
2123	NC_021490	TAT	2	6	119820	119825	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512556188
2124	NC_021490	TACG	2	8	119832	119839	25 %	25 %	25 %	25 %	512556188
2125	NC_021490	CAG	2	6	119844	119849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556188
2126	NC_021490	GAC	2	6	119852	119857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556188
2127	NC_021490	TG	5	10	119873	119882	0 %	50 %	50 %	0 %	512556188
2128	NC_021490	CTT	2	6	119886	119891	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512556188
2129	NC_021490	GAA	2	6	119924	119929	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512556188
2130	NC_021490	ATG	2	6	119947	119952	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556188
2131	NC_021490	GCC	2	6	119977	119982	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512556188
2132	NC_021490	GGGAG	2	10	120000	120009	20 %	0 %	80 %	0 %	512556188
2133	NC_021490	AGT	2	6	120038	120043	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556188
2134	NC_021490	CCG	2	6	120077	120082	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512556188
2135	NC_021490	TGG	2	6	120086	120091	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512556188
2136	NC_021490	GTGCG	2	10	120131	120140	0 %	20 %	60 %	20 %	512556188
2137	NC_021490	GTA	2	6	120142	120147	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556188
2138	NC_021490	CGT	2	6	120189	120194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556188
2139	NC_021490	A	8	8	120199	120206	100 %	0 %	0 %	0 %	512556188
2140	NC_021490	GTTT	2	8	120236	120243	0 %	75 %	25 %	0 %	512556188
2141	NC_021490	AGGAA	2	10	120288	120297	60 %	0 %	40 %	0 %	512556188
2142	NC_021490	GA	4	8	120339	120346	50 %	0 %	50 %	0 %	512556188
2143	NC_021490	TTTC	2	8	120362	120369	0 %	75 %	0 %	25 %	512556188
2144	NC_021490	TCT	2	6	120548	120553	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512556189
2145	NC_021490	TCT	2	6	120590	120595	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512556189
2146	NC_021490	CA	3	6	120654	120659	50 %	0 %	0 %	50 %	512556189
2147	NC_021490	T	6	6	120789	120794	0 %	100 %	0 %	0 %	512556189
2148	NC_021490	TACTG	2	10	120825	120834	20 %	40 %	20 %	20 %	512556189
2149	NC_021490	TGAT	2	8	120904	120911	25 %	50 %	25 %	0 %	512556189
2150	NC_021490	GC	3	6	120919	120924	0 %	0 %	50 %	50 %	512556189
2151	NC_021490	CTT	2	6	121077	121082	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512556189
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2153	NC_021490	TGTT	2	8	121337	121344	0 %	75 %	25 %	0 %	512556189
2154	NC_021490	CG	3	6	121399	121404	0 %	0 %	50 %	50 %	512556189
2155	NC_021490	GAT	2	6	121441	121446	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556189
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2157	NC_021490	CCA	2	6	121505	121510	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512556189
2158	NC_021490	CGG	2	6	121518	121523	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512556189
2159	NC_021490	GTT	2	6	121702	121707	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512556189
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2161	NC_021490	CGA	2	6	121755	121760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556189
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2166	NC_021490	TCA	2	6	122300	122305	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512556190
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2183	NC_021490	CTG	2	6	123818	123823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556191
2184	NC_021490	GTGC	2	8	123920	123927	0 %	25 %	50 %	25 %	512556191
2185	NC_021490	GCA	2	6	123928	123933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556191
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2192	NC_021490	T	7	7	124325	124331	0 %	100 %	0 %	0 %	512556191
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2234	NC_021490	A	6	6	126415	126420	100 %	0 %	0 %	0 %	512556192
2235	NC_021490	GC	3	6	126440	126445	0 %	0 %	50 %	50 %	512556192
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2239	NC_021490	CTTG	2	8	126700	126707	0 %	50 %	25 %	25 %	512556192
2240	NC_021490	CATTG	2	10	126728	126737	20 %	40 %	20 %	20 %	512556192
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2245	NC_021490	CCGTG	2	10	127089	127098	0 %	20 %	40 %	40 %	512556193
2246	NC_021490	TCG	2	6	127137	127142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556193
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2369	NC_021490	A	8	8	134229	134236	100 %	0 %	0 %	0 %	512556198
2370	NC_021490	ATT	2	6	134255	134260	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512556198
2371	NC_021490	TGCG	2	8	134339	134346	0 %	25 %	50 %	25 %	512556198
2372	NC_021490	TTA	2	6	134377	134382	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512556198
2373	NC_021490	CATT	2	8	134411	134418	25 %	50 %	0 %	25 %	512556198
2374	NC_021490	T	6	6	134445	134450	0 %	100 %	0 %	0 %	512556198
2375	NC_021490	CGA	3	9	134456	134464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556198
2376	NC_021490	ATT	2	6	134476	134481	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512556198
2377	NC_021490	AGC	2	6	134487	134492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556198
2378	NC_021490	GCGAT	2	10	134537	134546	20 %	20 %	40 %	20 %	512556198
2379	NC_021490	A	7	7	134673	134679	100 %	0 %	0 %	0 %	512556198
2380	NC_021490	GC	3	6	134712	134717	0 %	0 %	50 %	50 %	512556198
2381	NC_021490	GCAGAC	2	12	134719	134730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556198
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2383	NC_021490	TGC	2	6	134742	134747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556198
2384	NC_021490	A	7	7	134752	134758	100 %	0 %	0 %	0 %	512556198
2385	NC_021490	AGCA	2	8	134999	135006	50 %	0 %	25 %	25 %	512556199
2386	NC_021490	TTCA	2	8	135086	135093	25 %	50 %	0 %	25 %	512556199
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2391	NC_021490	AGT	2	6	135400	135405	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556199
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2394	NC_021490	GC	3	6	135649	135654	0 %	0 %	50 %	50 %	512556199
2395	NC_021490	AGC	2	6	135707	135712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556199
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2399	NC_021490	CCT	2	6	135936	135941	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512556199
2400	NC_021490	TGTTT	2	10	135959	135968	0 %	80 %	20 %	0 %	512556199
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2403	NC_021490	AGGA	2	8	136140	136147	50 %	0 %	50 %	0 %	512556199
2404	NC_021490	CCGGAG	2	12	136215	136226	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	512556199
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2406	NC_021490	GGAA	2	8	136363	136370	50 %	0 %	50 %	0 %	512556199
2407	NC_021490	AGA	2	6	136409	136414	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512556199
2408	NC_021490	CAGCTG	2	12	136439	136450	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	512556199
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2478	NC_021490	CG	4	8	139271	139278	0 %	0 %	50 %	50 %	512556202
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2482	NC_021490	GTG	2	6	139432	139437	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512556202
2483	NC_021490	A	6	6	139442	139447	100 %	0 %	0 %	0 %	512556202
2484	NC_021490	ATG	2	6	139480	139485	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556202
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2486	NC_021490	GAT	2	6	139521	139526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556202
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2488	NC_021490	TGA	2	6	139805	139810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556203
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2490	NC_021490	GT	3	6	140044	140049	0 %	50 %	50 %	0 %	512556203
2491	NC_021490	CGC	2	6	140097	140102	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512556203
2492	NC_021490	ATT	2	6	140154	140159	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512556203
2493	NC_021490	GGT	2	6	140205	140210	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512556203
2494	NC_021490	CACT	2	8	140215	140222	25 %	25 %	0 %	50 %	512556203
2495	NC_021490	ATT	2	6	140283	140288	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512556203
2496	NC_021490	GC	3	6	140420	140425	0 %	0 %	50 %	50 %	512556203
2497	NC_021490	GGA	2	6	140700	140705	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512556203
2498	NC_021490	GCA	2	6	140732	140737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556203
2499	NC_021490	GCT	2	6	141113	141118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556204
2500	NC_021490	CG	3	6	141127	141132	0 %	0 %	50 %	50 %	512556204

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