MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum str. Nichols

Total Repeats: 21924

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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20502	NC_021490	GGGA	2	8	1062228	1062235	25 %	0 %	75 %	0 %	512557003
20503	NC_021490	T	6	6	1062274	1062279	0 %	100 %	0 %	0 %	512557004
20504	NC_021490	GCC	2	6	1062401	1062406	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512557004
20505	NC_021490	T	6	6	1062444	1062449	0 %	100 %	0 %	0 %	512557004
20506	NC_021490	TGC	2	6	1062580	1062585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512557004
20507	NC_021490	GGT	2	6	1062605	1062610	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512557004
20508	NC_021490	ACC	2	6	1062668	1062673	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512557004
20509	NC_021490	AGG	2	6	1062681	1062686	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512557004
20510	NC_021490	GCA	3	9	1062691	1062699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512557004
20511	NC_021490	TC	3	6	1062770	1062775	0 %	50 %	0 %	50 %	512557004
20512	NC_021490	CAA	2	6	1062776	1062781	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512557004
20513	NC_021490	GTA	2	6	1062782	1062787	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512557004
20514	NC_021490	AGA	2	6	1062805	1062810	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512557004
20515	NC_021490	TTA	2	6	1062924	1062929	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512557004
20516	NC_021490	CG	4	8	1062961	1062968	0 %	0 %	50 %	50 %	512557004
20517	NC_021490	TGG	2	6	1063029	1063034	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512557004
20518	NC_021490	AGAA	2	8	1063148	1063155	75 %	0 %	25 %	0 %	512557005
20519	NC_021490	GTT	3	9	1063186	1063194	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512557005
20520	NC_021490	TTG	2	6	1063213	1063218	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512557005
20521	NC_021490	GGGA	2	8	1063458	1063465	25 %	0 %	75 %	0 %	512557005
20522	NC_021490	ATCG	2	8	1063477	1063484	25 %	25 %	25 %	25 %	512557005
20523	NC_021490	TCA	2	6	1063583	1063588	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512557005
20524	NC_021490	CCT	2	6	1063652	1063657	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512557005
20525	NC_021490	G	6	6	1063668	1063673	0 %	0 %	100 %	0 %	512557005
20526	NC_021490	GTA	2	6	1063925	1063930	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512557006
20527	NC_021490	ACG	2	6	1063939	1063944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512557006
20528	NC_021490	CAT	2	6	1063960	1063965	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512557006
20529	NC_021490	GCC	2	6	1063994	1063999	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512557006
20530	NC_021490	GATA	2	8	1064086	1064093	50 %	25 %	25 %	0 %	512557006
20531	NC_021490	A	6	6	1064100	1064105	100 %	0 %	0 %	0 %	512557006
20532	NC_021490	ACT	2	6	1064151	1064156	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512557006
20533	NC_021490	A	7	7	1064227	1064233	100 %	0 %	0 %	0 %	512557006
20534	NC_021490	ATC	2	6	1064240	1064245	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512557006
20535	NC_021490	GTG	2	6	1064253	1064258	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512557006
20536	NC_021490	AGCG	2	8	1064285	1064292	25 %	0 %	50 %	25 %	512557006
20537	NC_021490	GT	3	6	1064310	1064315	0 %	50 %	50 %	0 %	512557006
20538	NC_021490	TTTC	2	8	1064376	1064383	0 %	75 %	0 %	25 %	512557006
20539	NC_021490	CAA	2	6	1064500	1064505	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512557006
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20541	NC_021490	CA	3	6	1064522	1064527	50 %	0 %	0 %	50 %	512557006
20542	NC_021490	TGAG	2	8	1064626	1064633	25 %	25 %	50 %	0 %	512557006
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20544	NC_021490	ATC	2	6	1064659	1064664	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512557007
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20546	NC_021490	T	6	6	1064703	1064708	0 %	100 %	0 %	0 %	512557007
20547	NC_021490	AAGC	2	8	1064764	1064771	50 %	0 %	25 %	25 %	512557007
20548	NC_021490	GC	3	6	1064843	1064848	0 %	0 %	50 %	50 %	512557007
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20551	NC_021490	GGAGCC	2	12	1064994	1065005	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	512557007
20552	NC_021490	CG	3	6	1065077	1065082	0 %	0 %	50 %	50 %	512557007
20553	NC_021490	TGGG	2	8	1065110	1065117	0 %	25 %	75 %	0 %	512557007
20554	NC_021490	GGAA	2	8	1065136	1065143	50 %	0 %	50 %	0 %	512557007
20555	NC_021490	GC	3	6	1065202	1065207	0 %	0 %	50 %	50 %	512557007
20556	NC_021490	GC	3	6	1065259	1065264	0 %	0 %	50 %	50 %	512557007
20557	NC_021490	GTGG	2	8	1065265	1065272	0 %	25 %	75 %	0 %	512557007
20558	NC_021490	AC	3	6	1065338	1065343	50 %	0 %	0 %	50 %	512557007
20559	NC_021490	TAC	2	6	1065429	1065434	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512557007
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20561	NC_021490	CTTC	2	8	1065604	1065611	0 %	50 %	0 %	50 %	512557007
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20603	NC_021490	CG	3	6	1067584	1067589	0 %	0 %	50 %	50 %	512557010
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20606	NC_021490	GC	3	6	1067807	1067812	0 %	0 %	50 %	50 %	512557010
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20608	NC_021490	AGAGGA	2	12	1067997	1068008	50 %	0 %	50 %	0 %	512557010
20609	NC_021490	CG	3	6	1068051	1068056	0 %	0 %	50 %	50 %	512557010
20610	NC_021490	AAG	2	6	1068109	1068114	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512557010
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20617	NC_021490	CTTC	2	8	1068562	1068569	0 %	50 %	0 %	50 %	512557011
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