MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum str. Nichols

Total Repeats: 21924

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20120	NC_021490	A	7	7	1044480	1044486	100 %	0 %	0 %	0 %	512556989
20121	NC_021490	GTTT	2	8	1044523	1044530	0 %	75 %	25 %	0 %	512556989
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20237	NC_021490	GCA	2	6	1050476	1050481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556994
20238	NC_021490	GCT	2	6	1050482	1050487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556994
20239	NC_021490	GCT	2	6	1050578	1050583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556994
20240	NC_021490	AGG	2	6	1050609	1050614	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512556994
20241	NC_021490	GT	3	6	1050631	1050636	0 %	50 %	50 %	0 %	512556994
20242	NC_021490	GAG	2	6	1050641	1050646	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512556994
20243	NC_021490	CTG	2	6	1050689	1050694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556994
20244	NC_021490	GGC	2	6	1050702	1050707	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512556994
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20249	NC_021490	TGCG	2	8	1050770	1050777	0 %	25 %	50 %	25 %	512556994
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20351	NC_021490	GC	3	6	1054986	1054991	0 %	0 %	50 %	50 %	512556997
20352	NC_021490	GGA	2	6	1055138	1055143	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512556997
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20354	NC_021490	CAA	2	6	1055212	1055217	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512556997
20355	NC_021490	GCG	2	6	1055263	1055268	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512556997
20356	NC_021490	TTC	2	6	1055304	1055309	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512556997
20357	NC_021490	TTG	2	6	1055310	1055315	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512556997
20358	NC_021490	CCG	2	6	1055350	1055355	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512556997
20359	NC_021490	GAG	2	6	1055447	1055452	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512556997
20360	NC_021490	TTG	2	6	1055453	1055458	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512556997
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20373	NC_021490	TCA	2	6	1056221	1056226	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512556998
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20389	NC_021490	CCA	2	6	1056824	1056829	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512556999
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20391	NC_021490	GCC	2	6	1056869	1056874	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512556999
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20458	NC_021490	CA	3	6	1060092	1060097	50 %	0 %	0 %	50 %	512557002
20459	NC_021490	CTC	2	6	1060101	1060106	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512557002
20460	NC_021490	CAC	2	6	1060134	1060139	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512557002
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20462	NC_021490	GC	3	6	1060226	1060231	0 %	0 %	50 %	50 %	512557002
20463	NC_021490	GC	3	6	1060245	1060250	0 %	0 %	50 %	50 %	512557002
20464	NC_021490	GGTGA	2	10	1060265	1060274	20 %	20 %	60 %	0 %	512557002
20465	NC_021490	AGT	2	6	1060329	1060334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512557002
20466	NC_021490	ACC	2	6	1060360	1060365	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512557002
20467	NC_021490	CG	3	6	1060386	1060391	0 %	0 %	50 %	50 %	512557002
20468	NC_021490	TGCG	2	8	1060455	1060462	0 %	25 %	50 %	25 %	512557002
20469	NC_021490	CA	3	6	1060469	1060474	50 %	0 %	0 %	50 %	512557002
20470	NC_021490	GCAGC	2	10	1060508	1060517	20 %	0 %	40 %	40 %	512557002
20471	NC_021490	CG	3	6	1060555	1060560	0 %	0 %	50 %	50 %	512557002
20472	NC_021490	CTGC	2	8	1060563	1060570	0 %	25 %	25 %	50 %	512557002
20473	NC_021490	GA	4	8	1060586	1060593	50 %	0 %	50 %	0 %	512557002
20474	NC_021490	A	6	6	1060615	1060620	100 %	0 %	0 %	0 %	512557002
20475	NC_021490	CGC	2	6	1060635	1060640	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512557002
20476	NC_021490	TG	3	6	1060652	1060657	0 %	50 %	50 %	0 %	512557002
20477	NC_021490	GGT	2	6	1060872	1060877	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512557003
20478	NC_021490	CTCA	2	8	1060879	1060886	25 %	25 %	0 %	50 %	512557003
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20480	NC_021490	CTG	2	6	1061035	1061040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512557003
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20497	NC_021490	GC	3	6	1061905	1061910	0 %	0 %	50 %	50 %	512557003
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20499	NC_021490	CTG	2	6	1061975	1061980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512557003
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