MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum str. Nichols

Total Repeats: 21924

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
19501	NC_021490	AC	3	6	1012671	1012676	50 %	0 %	0 %	50 %	512556959
19502	NC_021490	CGT	2	6	1012733	1012738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556959
19503	NC_021490	CGC	2	6	1012775	1012780	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512556959
19504	NC_021490	A	6	6	1012805	1012810	100 %	0 %	0 %	0 %	512556959
19505	NC_021490	AAG	2	6	1013074	1013079	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512556959
19506	NC_021490	CA	4	8	1013098	1013105	50 %	0 %	0 %	50 %	512556959
19507	NC_021490	CGCA	2	8	1013110	1013117	25 %	0 %	25 %	50 %	512556959
19508	NC_021490	ATC	2	6	1013130	1013135	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512556959
19509	NC_021490	CTG	2	6	1013141	1013146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556959
19510	NC_021490	CA	4	8	1013181	1013188	50 %	0 %	0 %	50 %	512556959
19511	NC_021490	GC	3	6	1013270	1013275	0 %	0 %	50 %	50 %	512556959
19512	NC_021490	CAC	2	6	1013303	1013308	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512556959
19513	NC_021490	CG	3	6	1013337	1013342	0 %	0 %	50 %	50 %	512556959
19514	NC_021490	GC	3	6	1013390	1013395	0 %	0 %	50 %	50 %	512556959
19515	NC_021490	TTTC	2	8	1013444	1013451	0 %	75 %	0 %	25 %	512556959
19516	NC_021490	CTC	2	6	1013457	1013462	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512556959
19517	NC_021490	TCT	2	6	1013475	1013480	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512556959
19518	NC_021490	CGA	2	6	1013584	1013589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556960
19519	NC_021490	TCT	2	6	1013623	1013628	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512556960
19520	NC_021490	AG	3	6	1013711	1013716	50 %	0 %	50 %	0 %	512556960
19521	NC_021490	TAG	2	6	1013848	1013853	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556960
19522	NC_021490	CTT	2	6	1013893	1013898	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512556960
19523	NC_021490	TTTG	2	8	1013961	1013968	0 %	75 %	25 %	0 %	512556960
19524	NC_021490	ATA	2	6	1013996	1014001	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512556960
19525	NC_021490	CAC	2	6	1014065	1014070	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512556960
19526	NC_021490	AGGG	2	8	1014079	1014086	25 %	0 %	75 %	0 %	512556960
19527	NC_021490	TCA	2	6	1014117	1014122	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512556960
19528	NC_021490	GCT	2	6	1014274	1014279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556960
19529	NC_021490	ATT	2	6	1014332	1014337	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512556960
19530	NC_021490	AGCTC	2	10	1014379	1014388	20 %	20 %	20 %	40 %	512556960
19531	NC_021490	ATA	2	6	1014399	1014404	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512556960
19532	NC_021490	T	6	6	1014473	1014478	0 %	100 %	0 %	0 %	512556960
19533	NC_021490	AGC	2	6	1014503	1014508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556960
19534	NC_021490	T	6	6	1014602	1014607	0 %	100 %	0 %	0 %	512556960
19535	NC_021490	GAT	2	6	1014709	1014714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556960
19536	NC_021490	CTC	2	6	1014737	1014742	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512556960
19537	NC_021490	TGCAT	2	10	1014744	1014753	20 %	40 %	20 %	20 %	512556960
19538	NC_021490	A	6	6	1014756	1014761	100 %	0 %	0 %	0 %	512556960
19539	NC_021490	GAA	2	6	1014803	1014808	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512556960
19540	NC_021490	CTGA	2	8	1014833	1014840	25 %	25 %	25 %	25 %	512556960
19541	NC_021490	TAAT	2	8	1014841	1014848	50 %	50 %	0 %	0 %	512556960
19542	NC_021490	A	6	6	1014869	1014874	100 %	0 %	0 %	0 %	512556960
19543	NC_021490	CAA	2	6	1014952	1014957	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512556960
19544	NC_021490	TAA	2	6	1015151	1015156	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512556961
19545	NC_021490	TTC	2	6	1015172	1015177	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512556961
19546	NC_021490	ATAA	2	8	1015202	1015209	75 %	25 %	0 %	0 %	512556961
19547	NC_021490	CAG	3	9	1015232	1015240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556961
19548	NC_021490	AG	3	6	1015263	1015268	50 %	0 %	50 %	0 %	512556961
19549	NC_021490	AGC	2	6	1015283	1015288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556961
19550	NC_021490	TCCTC	2	10	1015374	1015383	0 %	40 %	0 %	60 %	512556961
19551	NC_021490	TTGCA	2	10	1015439	1015448	20 %	40 %	20 %	20 %	512556961
19552	NC_021490	GCCGA	2	10	1015473	1015482	20 %	0 %	40 %	40 %	512556961
19553	NC_021490	CG	4	8	1015506	1015513	0 %	0 %	50 %	50 %	512556961
19554	NC_021490	GAAG	2	8	1015547	1015554	50 %	0 %	50 %	0 %	512556961
19555	NC_021490	GCT	2	6	1015704	1015709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556961
19556	NC_021490	CAT	2	6	1015750	1015755	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512556961
19557	NC_021490	ACA	2	6	1015798	1015803	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512556961
19558	NC_021490	CAGG	2	8	1015877	1015884	25 %	0 %	50 %	25 %	512556961
19559	NC_021490	CTG	2	6	1015885	1015890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556961
19560	NC_021490	CT	3	6	1015912	1015917	0 %	50 %	0 %	50 %	512556961
19561	NC_021490	A	6	6	1015923	1015928	100 %	0 %	0 %	0 %	512556961
19562	NC_021490	AAG	2	6	1015993	1015998	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512556961
19563	NC_021490	CCGT	2	8	1016006	1016013	0 %	25 %	25 %	50 %	512556961
19564	NC_021490	CATA	2	8	1016117	1016124	50 %	25 %	0 %	25 %	512556961
19565	NC_021490	GAC	2	6	1016181	1016186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556961
19566	NC_021490	GAG	2	6	1016231	1016236	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512556961
19567	NC_021490	ATC	2	6	1016291	1016296	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512556961
19568	NC_021490	TGC	2	6	1016377	1016382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556961
19569	NC_021490	GCA	3	9	1016448	1016456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556961
19570	NC_021490	CGA	2	6	1016503	1016508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556961
19571	NC_021490	TGC	2	6	1016561	1016566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556961
19572	NC_021490	GC	3	6	1016578	1016583	0 %	0 %	50 %	50 %	512556961
19573	NC_021490	ACGCA	2	10	1016600	1016609	40 %	0 %	20 %	40 %	512556961
19574	NC_021490	A	8	8	1016609	1016616	100 %	0 %	0 %	0 %	512556961
19575	NC_021490	GAA	2	6	1016655	1016660	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512556961
19576	NC_021490	CGCA	2	8	1016665	1016672	25 %	0 %	25 %	50 %	512556961
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19578	NC_021490	AGAC	2	8	1016706	1016713	50 %	0 %	25 %	25 %	512556961
19579	NC_021490	T	6	6	1016891	1016896	0 %	100 %	0 %	0 %	512556962
19580	NC_021490	GC	3	6	1016949	1016954	0 %	0 %	50 %	50 %	512556962
19581	NC_021490	T	8	8	1017018	1017025	0 %	100 %	0 %	0 %	512556962
19582	NC_021490	TAC	2	6	1017076	1017081	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512556962
19583	NC_021490	CTTT	2	8	1017122	1017129	0 %	75 %	0 %	25 %	512556962
19584	NC_021490	CGC	2	6	1017192	1017197	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512556962
19585	NC_021490	T	8	8	1017224	1017231	0 %	100 %	0 %	0 %	512556962
19586	NC_021490	AGT	2	6	1017248	1017253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556962
19587	NC_021490	TCT	2	6	1017280	1017285	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512556962
19588	NC_021490	CT	3	6	1017288	1017293	0 %	50 %	0 %	50 %	512556962
19589	NC_021490	TCG	2	6	1017309	1017314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556962
19590	NC_021490	CG	3	6	1017378	1017383	0 %	0 %	50 %	50 %	512556962
19591	NC_021490	CA	3	6	1017387	1017392	50 %	0 %	0 %	50 %	512556962
19592	NC_021490	TCT	2	6	1017402	1017407	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512556962
19593	NC_021490	ACTGAC	2	12	1017511	1017522	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	512556962
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19595	NC_021490	GCA	2	6	1017605	1017610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556962
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19598	NC_021490	CTG	2	6	1017849	1017854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556962
19599	NC_021490	CAT	2	6	1017855	1017860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512556962
19600	NC_021490	TC	3	6	1017862	1017867	0 %	50 %	0 %	50 %	512556962
19601	NC_021490	AGG	2	6	1017892	1017897	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512556962
19602	NC_021490	CTG	2	6	1017972	1017977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556962
19603	NC_021490	T	6	6	1017980	1017985	0 %	100 %	0 %	0 %	512556962
19604	NC_021490	CG	3	6	1018073	1018078	0 %	0 %	50 %	50 %	512556962
19605	NC_021490	AC	3	6	1018187	1018192	50 %	0 %	0 %	50 %	512556963
19606	NC_021490	TG	3	6	1018290	1018295	0 %	50 %	50 %	0 %	512556963
19607	NC_021490	AAC	2	6	1018297	1018302	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512556963
19608	NC_021490	G	6	6	1018358	1018363	0 %	0 %	100 %	0 %	512556963
19609	NC_021490	CG	3	6	1018427	1018432	0 %	0 %	50 %	50 %	512556963
19610	NC_021490	TTCT	2	8	1018443	1018450	0 %	75 %	0 %	25 %	512556963
19611	NC_021490	CTCC	2	8	1018457	1018464	0 %	25 %	0 %	75 %	512556963
19612	NC_021490	GC	3	6	1018516	1018521	0 %	0 %	50 %	50 %	512556963
19613	NC_021490	AC	3	6	1018524	1018529	50 %	0 %	0 %	50 %	512556963
19614	NC_021490	ATA	2	6	1018600	1018605	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512556963
19615	NC_021490	TCT	2	6	1018622	1018627	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512556963
19616	NC_021490	CAT	2	6	1018649	1018654	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512556963
19617	NC_021490	GCA	2	6	1018669	1018674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556963
19618	NC_021490	A	6	6	1018785	1018790	100 %	0 %	0 %	0 %	512556963
19619	NC_021490	CCA	2	6	1018792	1018797	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512556963
19620	NC_021490	ACA	2	6	1018805	1018810	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512556963
19621	NC_021490	A	7	7	1018913	1018919	100 %	0 %	0 %	0 %	512556963
19622	NC_021490	TCA	2	6	1018921	1018926	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512556963
19623	NC_021490	CGCA	2	8	1018932	1018939	25 %	0 %	25 %	50 %	512556963
19624	NC_021490	TCT	2	6	1018973	1018978	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512556963
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19626	NC_021490	GC	3	6	1019011	1019016	0 %	0 %	50 %	50 %	512556963
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19628	NC_021490	T	6	6	1019240	1019245	0 %	100 %	0 %	0 %	512556964
19629	NC_021490	G	6	6	1019262	1019267	0 %	0 %	100 %	0 %	512556964
19630	NC_021490	CCCT	2	8	1019296	1019303	0 %	25 %	0 %	75 %	512556964
19631	NC_021490	CGAT	2	8	1019360	1019367	25 %	25 %	25 %	25 %	512556964
19632	NC_021490	GT	3	6	1019486	1019491	0 %	50 %	50 %	0 %	512556964
19633	NC_021490	CGT	2	6	1019497	1019502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556964
19634	NC_021490	CATC	2	8	1019542	1019549	25 %	25 %	0 %	50 %	512556964
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19648	NC_021490	TAA	2	6	1020255	1020260	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512556964
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19651	NC_021490	TG	4	8	1020538	1020545	0 %	50 %	50 %	0 %	512556965
19652	NC_021490	TGCG	2	8	1020577	1020584	0 %	25 %	50 %	25 %	512556965
19653	NC_021490	GATT	2	8	1020615	1020622	25 %	50 %	25 %	0 %	512556965
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19731	NC_021490	AG	3	6	1024524	1024529	50 %	0 %	50 %	0 %	512556967
19732	NC_021490	TCGA	2	8	1024558	1024565	25 %	25 %	25 %	25 %	512556967
19733	NC_021490	TCC	2	6	1024660	1024665	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512556967
19734	NC_021490	GTA	2	6	1024753	1024758	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556967
19735	NC_021490	CTGTG	2	10	1024885	1024894	0 %	40 %	40 %	20 %	512556967
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19738	NC_021490	CTT	2	6	1024989	1024994	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512556967
19739	NC_021490	A	7	7	1025032	1025038	100 %	0 %	0 %	0 %	512556967
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19853	NC_021490	GCT	2	6	1031685	1031690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556976
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19967	NC_021490	A	7	7	1036904	1036910	100 %	0 %	0 %	0 %	512556982
19968	NC_021490	ACAA	2	8	1036999	1037006	75 %	0 %	0 %	25 %	512556982
19969	NC_021490	A	6	6	1037014	1037019	100 %	0 %	0 %	0 %	512556982
19970	NC_021490	TCTA	2	8	1037040	1037047	25 %	50 %	0 %	25 %	512556982
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19972	NC_021490	TG	3	6	1037084	1037089	0 %	50 %	50 %	0 %	512556982
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19974	NC_021490	GAAA	2	8	1037229	1037236	75 %	0 %	25 %	0 %	512556982
19975	NC_021490	CG	3	6	1037262	1037267	0 %	0 %	50 %	50 %	512556982
19976	NC_021490	TCG	2	6	1037305	1037310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556982
19977	NC_021490	C	6	6	1037317	1037322	0 %	0 %	0 %	100 %	512556982
19978	NC_021490	CAG	2	6	1037348	1037353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556982
19979	NC_021490	GC	3	6	1037365	1037370	0 %	0 %	50 %	50 %	512556982
19980	NC_021490	CGC	2	6	1037376	1037381	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512556982
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19983	NC_021490	GC	4	8	1037537	1037544	0 %	0 %	50 %	50 %	512556982
19984	NC_021490	TGCCTC	2	12	1037583	1037594	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	512556982
19985	NC_021490	CG	3	6	1037638	1037643	0 %	0 %	50 %	50 %	512556982
19986	NC_021490	GC	4	8	1037669	1037676	0 %	0 %	50 %	50 %	512556982
19987	NC_021490	A	6	6	1037716	1037721	100 %	0 %	0 %	0 %	512556982
19988	NC_021490	TCAG	2	8	1037734	1037741	25 %	25 %	25 %	25 %	512556982
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19991	NC_021490	GCT	2	6	1038020	1038025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556982
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19993	NC_021490	CTGAG	2	10	1038040	1038049	20 %	20 %	40 %	20 %	512556982
19994	NC_021490	CGCT	2	8	1038094	1038101	0 %	25 %	25 %	50 %	512556982
19995	NC_021490	TTTA	2	8	1038262	1038269	25 %	75 %	0 %	0 %	512556983
19996	NC_021490	CCG	2	6	1038347	1038352	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512556983
19997	NC_021490	GAA	2	6	1038404	1038409	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512556983
19998	NC_021490	GC	3	6	1038414	1038419	0 %	0 %	50 %	50 %	512556983
19999	NC_021490	ATGG	2	8	1038494	1038501	25 %	25 %	50 %	0 %	512556983
20000	NC_021490	AAT	2	6	1038503	1038508	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512556983

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