MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum str. Nichols

Total Repeats: 21924

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
19001	NC_021490	GGGA	2	8	988762	988769	25 %	0 %	75 %	0 %	512556937
19002	NC_021490	GC	4	8	988839	988846	0 %	0 %	50 %	50 %	512556937
19003	NC_021490	TCTGCG	2	12	988863	988874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556937
19004	NC_021490	ATC	2	6	988905	988910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512556937
19005	NC_021490	CTC	2	6	989085	989090	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512556938
19006	NC_021490	GCT	2	6	989182	989187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556938
19007	NC_021490	CGG	2	6	989334	989339	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512556938
19008	NC_021490	TGG	2	6	989404	989409	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512556938
19009	NC_021490	GGACGT	2	12	989446	989457	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	512556938
19010	NC_021490	A	8	8	989464	989471	100 %	0 %	0 %	0 %	512556938
19011	NC_021490	GTT	2	6	989476	989481	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512556938
19012	NC_021490	CT	3	6	989519	989524	0 %	50 %	0 %	50 %	512556939
19013	NC_021490	AAT	2	6	989559	989564	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512556939
19014	NC_021490	GC	4	8	989566	989573	0 %	0 %	50 %	50 %	512556939
19015	NC_021490	ACAAAC	2	12	989630	989641	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512556939
19016	NC_021490	CGCCC	2	10	989649	989658	0 %	0 %	20 %	80 %	512556939
19017	NC_021490	CGT	2	6	989739	989744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556939
19018	NC_021490	GC	3	6	989785	989790	0 %	0 %	50 %	50 %	512556939
19019	NC_021490	CGA	3	9	989871	989879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556939
19020	NC_021490	TC	3	6	989901	989906	0 %	50 %	0 %	50 %	512556939
19021	NC_021490	GA	3	6	989912	989917	50 %	0 %	50 %	0 %	512556939
19022	NC_021490	CGC	2	6	989919	989924	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512556939
19023	NC_021490	TC	3	6	989980	989985	0 %	50 %	0 %	50 %	512556939
19024	NC_021490	GAG	2	6	989986	989991	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512556939
19025	NC_021490	TC	3	6	990075	990080	0 %	50 %	0 %	50 %	512556939
19026	NC_021490	CAC	2	6	990085	990090	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512556939
19027	NC_021490	GGC	2	6	990107	990112	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512556939
19028	NC_021490	GC	3	6	990115	990120	0 %	0 %	50 %	50 %	512556939
19029	NC_021490	A	6	6	990128	990133	100 %	0 %	0 %	0 %	512556939
19030	NC_021490	GACCT	2	10	990146	990155	20 %	20 %	20 %	40 %	512556939
19031	NC_021490	GCGT	2	8	990168	990175	0 %	25 %	50 %	25 %	512556939
19032	NC_021490	CTT	2	6	990205	990210	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512556939
19033	NC_021490	CAA	2	6	990242	990247	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512556939
19034	NC_021490	CAG	2	6	990257	990262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556940
19035	NC_021490	GCG	2	6	990384	990389	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512556940
19036	NC_021490	TGGAG	2	10	990430	990439	20 %	20 %	60 %	0 %	512556940
19037	NC_021490	C	6	6	990459	990464	0 %	0 %	0 %	100 %	512556940
19038	NC_021490	GTA	2	6	990482	990487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556940
19039	NC_021490	CG	3	6	990506	990511	0 %	0 %	50 %	50 %	512556940
19040	NC_021490	A	6	6	990531	990536	100 %	0 %	0 %	0 %	512556940
19041	NC_021490	GCC	2	6	990545	990550	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512556940
19042	NC_021490	GTA	2	6	990610	990615	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556941
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19044	NC_021490	CACG	2	8	990684	990691	25 %	0 %	25 %	50 %	512556941
19045	NC_021490	GC	4	8	990729	990736	0 %	0 %	50 %	50 %	512556941
19046	NC_021490	GC	3	6	990777	990782	0 %	0 %	50 %	50 %	512556941
19047	NC_021490	CG	3	6	990790	990795	0 %	0 %	50 %	50 %	512556941
19048	NC_021490	CTC	2	6	990830	990835	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512556941
19049	NC_021490	CTG	2	6	990839	990844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556941
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19051	NC_021490	TTTC	2	8	990881	990888	0 %	75 %	0 %	25 %	512556941
19052	NC_021490	TC	3	6	990887	990892	0 %	50 %	0 %	50 %	512556941
19053	NC_021490	TG	4	8	990929	990936	0 %	50 %	50 %	0 %	512556941
19054	NC_021490	A	6	6	990978	990983	100 %	0 %	0 %	0 %	512556941
19055	NC_021490	A	6	6	990995	991000	100 %	0 %	0 %	0 %	512556941
19056	NC_021490	CGC	2	6	991008	991013	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512556941
19057	NC_021490	CCG	2	6	991068	991073	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512556941
19058	NC_021490	CA	3	6	991153	991158	50 %	0 %	0 %	50 %	512556941
19059	NC_021490	CTT	2	6	991180	991185	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512556941
19060	NC_021490	GCG	2	6	991197	991202	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512556941
19061	NC_021490	GC	3	6	991205	991210	0 %	0 %	50 %	50 %	512556941
19062	NC_021490	CT	3	6	991229	991234	0 %	50 %	0 %	50 %	512556941
19063	NC_021490	TTA	2	6	991240	991245	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512556941
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19065	NC_021490	CGTG	2	8	991282	991289	0 %	25 %	50 %	25 %	512556941
19066	NC_021490	TCT	2	6	991310	991315	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512556941
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19068	NC_021490	TG	3	6	991400	991405	0 %	50 %	50 %	0 %	512556941
19069	NC_021490	CCT	2	6	991407	991412	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512556941
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19071	NC_021490	CCA	2	6	991529	991534	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512556942
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19075	NC_021490	TTG	2	6	991634	991639	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512556942
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19077	NC_021490	TCTG	2	8	991695	991702	0 %	50 %	25 %	25 %	512556942
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19079	NC_021490	TG	4	8	991795	991802	0 %	50 %	50 %	0 %	512556943
19080	NC_021490	A	6	6	991877	991882	100 %	0 %	0 %	0 %	512556943
19081	NC_021490	AAG	2	6	991901	991906	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512556943
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19085	NC_021490	GCTG	2	8	992043	992050	0 %	25 %	50 %	25 %	512556943
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19089	NC_021490	TCCT	2	8	992195	992202	0 %	50 %	0 %	50 %	512556943
19090	NC_021490	GT	3	6	992206	992211	0 %	50 %	50 %	0 %	512556943
19091	NC_021490	GAA	2	6	992230	992235	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512556943
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19093	NC_021490	GCA	2	6	992454	992459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556943
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19102	NC_021490	CCACGG	2	12	992960	992971	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	512556943
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19105	NC_021490	GAC	2	6	993028	993033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556943
19106	NC_021490	GCG	2	6	993149	993154	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512556944
19107	NC_021490	CG	3	6	993168	993173	0 %	0 %	50 %	50 %	512556944
19108	NC_021490	AT	3	6	993175	993180	50 %	50 %	0 %	0 %	512556944
19109	NC_021490	ATC	2	6	993182	993187	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512556944
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19111	NC_021490	GCA	2	6	993232	993237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556944
19112	NC_021490	ATT	2	6	993302	993307	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512556944
19113	NC_021490	TG	3	6	993384	993389	0 %	50 %	50 %	0 %	512556944
19114	NC_021490	TGC	2	6	993408	993413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556944
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19119	NC_021490	TG	3	6	993833	993838	0 %	50 %	50 %	0 %	512556945
19120	NC_021490	T	6	6	993844	993849	0 %	100 %	0 %	0 %	512556945
19121	NC_021490	ACC	2	6	993941	993946	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512556945
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19123	NC_021490	CTG	2	6	993992	993997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556945
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19363	NC_021490	CGTC	2	8	1005272	1005279	0 %	25 %	25 %	50 %	512556954
19364	NC_021490	G	6	6	1005350	1005355	0 %	0 %	100 %	0 %	512556954
19365	NC_021490	CGC	2	6	1005399	1005404	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512556954
19366	NC_021490	CAA	2	6	1005435	1005440	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512556954
19367	NC_021490	ATC	2	6	1005446	1005451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512556954
19368	NC_021490	GTG	2	6	1005472	1005477	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512556954
19369	NC_021490	CG	3	6	1005605	1005610	0 %	0 %	50 %	50 %	512556954
19370	NC_021490	AT	3	6	1005694	1005699	50 %	50 %	0 %	0 %	512556954
19371	NC_021490	CGC	2	6	1005723	1005728	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512556954
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19376	NC_021490	GTG	2	6	1005938	1005943	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512556954
19377	NC_021490	A	7	7	1006043	1006049	100 %	0 %	0 %	0 %	512556954
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19379	NC_021490	GTA	2	6	1006072	1006077	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556954
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19383	NC_021490	A	6	6	1006247	1006252	100 %	0 %	0 %	0 %	512556954
19384	NC_021490	GC	3	6	1006365	1006370	0 %	0 %	50 %	50 %	512556954
19385	NC_021490	AGCGC	2	10	1006384	1006393	20 %	0 %	40 %	40 %	512556954
19386	NC_021490	CAGT	2	8	1006421	1006428	25 %	25 %	25 %	25 %	512556954
19387	NC_021490	CG	3	6	1006481	1006486	0 %	0 %	50 %	50 %	512556954
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19391	NC_021490	A	6	6	1006672	1006677	100 %	0 %	0 %	0 %	512556954
19392	NC_021490	AGGT	2	8	1006682	1006689	25 %	25 %	50 %	0 %	512556954
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19396	NC_021490	GC	3	6	1006845	1006850	0 %	0 %	50 %	50 %	512556954
19397	NC_021490	CG	3	6	1006890	1006895	0 %	0 %	50 %	50 %	512556954
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19456	NC_021490	T	6	6	1010393	1010398	0 %	100 %	0 %	0 %	512556958
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19464	NC_021490	TACT	2	8	1010619	1010626	25 %	50 %	0 %	25 %	512556958
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19468	NC_021490	CGT	2	6	1010820	1010825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556958
19469	NC_021490	CTC	2	6	1010922	1010927	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512556958
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19471	NC_021490	GCACG	2	10	1010945	1010954	20 %	0 %	40 %	40 %	512556958
19472	NC_021490	CCA	2	6	1011005	1011010	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512556958
19473	NC_021490	CGG	2	6	1011110	1011115	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512556958
19474	NC_021490	GCA	2	6	1011205	1011210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556958
19475	NC_021490	CA	3	6	1011230	1011235	50 %	0 %	0 %	50 %	512556958
19476	NC_021490	GAG	2	6	1011274	1011279	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512556958
19477	NC_021490	CCG	3	9	1011323	1011331	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512556958
19478	NC_021490	C	6	6	1011426	1011431	0 %	0 %	0 %	100 %	512556958
19479	NC_021490	T	7	7	1011460	1011466	0 %	100 %	0 %	0 %	512556958
19480	NC_021490	GTA	2	6	1011526	1011531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556958
19481	NC_021490	CTA	2	6	1011578	1011583	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512556958
19482	NC_021490	GCT	2	6	1011639	1011644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556958
19483	NC_021490	GCGT	2	8	1011805	1011812	0 %	25 %	50 %	25 %	512556959
19484	NC_021490	CGC	2	6	1011832	1011837	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512556959
19485	NC_021490	ACCT	2	8	1011882	1011889	25 %	25 %	0 %	50 %	512556959
19486	NC_021490	GC	3	6	1011923	1011928	0 %	0 %	50 %	50 %	512556959
19487	NC_021490	GC	3	6	1011933	1011938	0 %	0 %	50 %	50 %	512556959
19488	NC_021490	GC	3	6	1011973	1011978	0 %	0 %	50 %	50 %	512556959
19489	NC_021490	CTT	2	6	1012005	1012010	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512556959
19490	NC_021490	CCT	2	6	1012020	1012025	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512556959
19491	NC_021490	GCA	2	6	1012079	1012084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556959
19492	NC_021490	CA	4	8	1012133	1012140	50 %	0 %	0 %	50 %	512556959
19493	NC_021490	TGC	2	6	1012150	1012155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556959
19494	NC_021490	AGGA	2	8	1012316	1012323	50 %	0 %	50 %	0 %	512556959
19495	NC_021490	GC	3	6	1012329	1012334	0 %	0 %	50 %	50 %	512556959
19496	NC_021490	AT	3	6	1012336	1012341	50 %	50 %	0 %	0 %	512556959
19497	NC_021490	ACC	2	6	1012384	1012389	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512556959
19498	NC_021490	TGCC	2	8	1012448	1012455	0 %	25 %	25 %	50 %	512556959
19499	NC_021490	TTA	2	6	1012554	1012559	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512556959
19500	NC_021490	GTGCG	2	10	1012645	1012654	0 %	20 %	60 %	20 %	512556959

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