MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum str. Nichols

Total Repeats: 21924

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
18501	NC_021490	ACC	2	6	965599	965604	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512556918
18502	NC_021490	GCGA	2	8	965605	965612	25 %	0 %	50 %	25 %	512556918
18503	NC_021490	C	6	6	965621	965626	0 %	0 %	0 %	100 %	512556918
18504	NC_021490	GTA	2	6	965744	965749	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556918
18505	NC_021490	AAC	2	6	965770	965775	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512556918
18506	NC_021490	AAC	2	6	965782	965787	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512556918
18507	NC_021490	AGC	2	6	965814	965819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556918
18508	NC_021490	CTG	2	6	965823	965828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556918
18509	NC_021490	AGA	2	6	965952	965957	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512556918
18510	NC_021490	CA	3	6	965984	965989	50 %	0 %	0 %	50 %	512556918
18511	NC_021490	GC	3	6	966050	966055	0 %	0 %	50 %	50 %	512556918
18512	NC_021490	CAC	2	6	966086	966091	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512556918
18513	NC_021490	CCA	2	6	966095	966100	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512556918
18514	NC_021490	GGC	2	6	966144	966149	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512556918
18515	NC_021490	TAA	2	6	966173	966178	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512556918
18516	NC_021490	GCA	2	6	966211	966216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556918
18517	NC_021490	CAA	2	6	966266	966271	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512556918
18518	NC_021490	CGA	2	6	966303	966308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556918
18519	NC_021490	TC	3	6	966398	966403	0 %	50 %	0 %	50 %	512556918
18520	NC_021490	TGA	2	6	966428	966433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556918
18521	NC_021490	GCC	2	6	966435	966440	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512556918
18522	NC_021490	ATA	2	6	966459	966464	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512556918
18523	NC_021490	GGT	2	6	966620	966625	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512556918
18524	NC_021490	CGA	3	9	966880	966888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556919
18525	NC_021490	CCA	2	6	966893	966898	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512556919
18526	NC_021490	GTCA	2	8	966951	966958	25 %	25 %	25 %	25 %	512556919
18527	NC_021490	CTG	2	6	967032	967037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556919
18528	NC_021490	TTCTCC	2	12	967073	967084	0 %	50 %	0 %	50 %	512556919
18529	NC_021490	ACTCGA	2	12	967091	967102	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	512556920
18530	NC_021490	GA	3	6	967161	967166	50 %	0 %	50 %	0 %	512556920
18531	NC_021490	ACCC	2	8	967194	967201	25 %	0 %	0 %	75 %	512556920
18532	NC_021490	C	6	6	967293	967298	0 %	0 %	0 %	100 %	512556920
18533	NC_021490	CTG	2	6	967302	967307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556920
18534	NC_021490	ACGC	2	8	967337	967344	25 %	0 %	25 %	50 %	512556920
18535	NC_021490	CAG	2	6	967347	967352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556920
18536	NC_021490	CGC	2	6	967354	967359	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512556920
18537	NC_021490	GC	3	6	967358	967363	0 %	0 %	50 %	50 %	512556920
18538	NC_021490	GCGCA	2	10	967375	967384	20 %	0 %	40 %	40 %	512556920
18539	NC_021490	GAA	2	6	967575	967580	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512556920
18540	NC_021490	ACC	2	6	967584	967589	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512556920
18541	NC_021490	ACG	2	6	967627	967632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556920
18542	NC_021490	CG	3	6	967643	967648	0 %	0 %	50 %	50 %	512556920
18543	NC_021490	AAG	2	6	967697	967702	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512556920
18544	NC_021490	GGA	2	6	967720	967725	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512556920
18545	NC_021490	C	7	7	967836	967842	0 %	0 %	0 %	100 %	512556920
18546	NC_021490	TGC	2	6	967851	967856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556920
18547	NC_021490	CCT	2	6	967883	967888	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512556920
18548	NC_021490	CAT	2	6	967940	967945	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512556921
18549	NC_021490	CGC	2	6	967959	967964	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512556921
18550	NC_021490	TTA	2	6	967970	967975	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512556921
18551	NC_021490	CTGC	2	8	968156	968163	0 %	25 %	25 %	50 %	512556921
18552	NC_021490	CGC	2	6	968219	968224	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512556921
18553	NC_021490	AAGC	2	8	968257	968264	50 %	0 %	25 %	25 %	512556921
18554	NC_021490	ACGC	2	8	968276	968283	25 %	0 %	25 %	50 %	512556921
18555	NC_021490	CGAGA	2	10	968306	968315	40 %	0 %	40 %	20 %	512556921
18556	NC_021490	CGC	2	6	968322	968327	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512556921
18557	NC_021490	GCT	2	6	968398	968403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556921
18558	NC_021490	CG	3	6	968408	968413	0 %	0 %	50 %	50 %	512556921
18559	NC_021490	GCAC	2	8	968419	968426	25 %	0 %	25 %	50 %	512556921
18560	NC_021490	AAC	2	6	968441	968446	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512556921
18561	NC_021490	GTAC	2	8	968447	968454	25 %	25 %	25 %	25 %	512556921
18562	NC_021490	GCAC	2	8	968464	968471	25 %	0 %	25 %	50 %	512556921
18563	NC_021490	AGATCA	2	12	968479	968490	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	512556921
18564	NC_021490	C	6	6	968501	968506	0 %	0 %	0 %	100 %	512556921
18565	NC_021490	AC	3	6	968576	968581	50 %	0 %	0 %	50 %	512556921
18566	NC_021490	CGC	2	6	968611	968616	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512556921
18567	NC_021490	ACGC	2	8	968627	968634	25 %	0 %	25 %	50 %	512556921
18568	NC_021490	GGC	2	6	968665	968670	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512556921
18569	NC_021490	AGTGA	2	10	968688	968697	40 %	20 %	40 %	0 %	512556921
18570	NC_021490	CGCA	2	8	968706	968713	25 %	0 %	25 %	50 %	512556921
18571	NC_021490	CG	3	6	968714	968719	0 %	0 %	50 %	50 %	512556921
18572	NC_021490	TCA	2	6	968825	968830	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512556921
18573	NC_021490	CAG	2	6	968868	968873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556921
18574	NC_021490	T	6	6	968914	968919	0 %	100 %	0 %	0 %	512556921
18575	NC_021490	AGA	2	6	968926	968931	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512556921
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18578	NC_021490	C	6	6	969235	969240	0 %	0 %	0 %	100 %	512556922
18579	NC_021490	AG	3	6	969262	969267	50 %	0 %	50 %	0 %	512556922
18580	NC_021490	ATA	2	6	969305	969310	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512556922
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18586	NC_021490	CCG	2	6	969689	969694	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512556923
18587	NC_021490	GCTC	2	8	969742	969749	0 %	25 %	25 %	50 %	512556923
18588	NC_021490	TCC	2	6	969754	969759	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512556923
18589	NC_021490	CAA	2	6	969851	969856	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512556923
18590	NC_021490	CAG	2	6	969872	969877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556923
18591	NC_021490	CGA	2	6	969915	969920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556923
18592	NC_021490	ATGA	2	8	969921	969928	50 %	25 %	25 %	0 %	512556923
18593	NC_021490	TAA	3	9	970007	970015	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512556923
18594	NC_021490	GC	3	6	970086	970091	0 %	0 %	50 %	50 %	512556923
18595	NC_021490	CCT	2	6	970229	970234	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512556923
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18598	NC_021490	ACGT	2	8	970294	970301	25 %	25 %	25 %	25 %	512556923
18599	NC_021490	ACG	2	6	970323	970328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556923
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18601	NC_021490	GCA	2	6	970436	970441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556923
18602	NC_021490	CAC	2	6	970508	970513	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512556923
18603	NC_021490	CTC	2	6	970518	970523	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512556923
18604	NC_021490	TTG	2	6	970591	970596	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512556923
18605	NC_021490	CAA	2	6	970601	970606	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512556923
18606	NC_021490	TGAT	2	8	970633	970640	25 %	50 %	25 %	0 %	512556923
18607	NC_021490	CAC	2	6	970689	970694	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512556923
18608	NC_021490	CG	4	8	970717	970724	0 %	0 %	50 %	50 %	512556923
18609	NC_021490	CAT	2	6	970725	970730	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512556923
18610	NC_021490	TGC	2	6	970807	970812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556923
18611	NC_021490	CG	3	6	970841	970846	0 %	0 %	50 %	50 %	512556923
18612	NC_021490	ACT	2	6	970906	970911	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512556923
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18617	NC_021490	TTC	2	6	971214	971219	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512556923
18618	NC_021490	CTGATA	2	12	971241	971252	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	512556923
18619	NC_021490	CTG	2	6	971256	971261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556923
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18621	NC_021490	ACCC	2	8	971390	971397	25 %	0 %	0 %	75 %	512556923
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18990	NC_021490	TAC	2	6	988342	988347	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512556936
18991	NC_021490	CG	4	8	988365	988372	0 %	0 %	50 %	50 %	512556936
18992	NC_021490	GA	3	6	988377	988382	50 %	0 %	50 %	0 %	512556936
18993	NC_021490	GAA	2	6	988396	988401	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512556936
18994	NC_021490	GC	3	6	988462	988467	0 %	0 %	50 %	50 %	512556936
18995	NC_021490	GCGCG	2	10	988479	988488	0 %	0 %	60 %	40 %	512556936
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18997	NC_021490	CAG	2	6	988582	988587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556936
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18999	NC_021490	G	6	6	988648	988653	0 %	0 %	100 %	0 %	512556936
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