MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum str. Nichols

Total Repeats: 21924

< Previous12...32333435363738394041424344Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
18001	NC_021490	CTT	2	6	941376	941381	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512556894
18002	NC_021490	CCT	2	6	941408	941413	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512556894
18003	NC_021490	TTC	2	6	941419	941424	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512556894
18004	NC_021490	ACGC	2	8	941453	941460	25 %	0 %	25 %	50 %	512556894
18005	NC_021490	ACTG	2	8	941508	941515	25 %	25 %	25 %	25 %	512556894
18006	NC_021490	TCT	2	6	941516	941521	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512556894
18007	NC_021490	CTT	2	6	941613	941618	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512556894
18008	NC_021490	GCG	2	6	941624	941629	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512556894
18009	NC_021490	TCT	2	6	941630	941635	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512556894
18010	NC_021490	GCTCCT	2	12	941639	941650	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	512556894
18011	NC_021490	CAG	2	6	941675	941680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556894
18012	NC_021490	CTT	2	6	941688	941693	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512556894
18013	NC_021490	A	6	6	941744	941749	100 %	0 %	0 %	0 %	512556894
18014	NC_021490	AC	3	6	941784	941789	50 %	0 %	0 %	50 %	512556894
18015	NC_021490	CTT	2	6	941798	941803	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512556894
18016	NC_021490	T	6	6	941802	941807	0 %	100 %	0 %	0 %	512556894
18017	NC_021490	GCT	2	6	941978	941983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556895
18018	NC_021490	CT	3	6	942030	942035	0 %	50 %	0 %	50 %	512556895
18019	NC_021490	CTG	2	6	942048	942053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556895
18020	NC_021490	GC	3	6	942074	942079	0 %	0 %	50 %	50 %	512556895
18021	NC_021490	AC	3	6	942100	942105	50 %	0 %	0 %	50 %	512556895
18022	NC_021490	CCT	2	6	942181	942186	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512556895
18023	NC_021490	CGC	2	6	942484	942489	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512556895
18024	NC_021490	AAC	2	6	942560	942565	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512556895
18025	NC_021490	ACC	2	6	942577	942582	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512556895
18026	NC_021490	CG	3	6	942608	942613	0 %	0 %	50 %	50 %	512556895
18027	NC_021490	CAC	2	6	942654	942659	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512556895
18028	NC_021490	GCC	2	6	942732	942737	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512556895
18029	NC_021490	GCGCTC	2	12	942761	942772	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	512556895
18030	NC_021490	TGCG	2	8	942779	942786	0 %	25 %	50 %	25 %	512556895
18031	NC_021490	CTT	2	6	942796	942801	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512556895
18032	NC_021490	AGA	2	6	942952	942957	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512556895
18033	NC_021490	TC	3	6	942969	942974	0 %	50 %	0 %	50 %	512556895
18034	NC_021490	CTG	2	6	942985	942990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556895
18035	NC_021490	GCG	2	6	943008	943013	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512556895
18036	NC_021490	GT	3	6	943044	943049	0 %	50 %	50 %	0 %	512556895
18037	NC_021490	CTGC	2	8	943065	943072	0 %	25 %	25 %	50 %	512556895
18038	NC_021490	AAAG	2	8	943078	943085	75 %	0 %	25 %	0 %	512556895
18039	NC_021490	CG	3	6	943137	943142	0 %	0 %	50 %	50 %	512556895
18040	NC_021490	TGC	2	6	943146	943151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556895
18041	NC_021490	CA	3	6	943167	943172	50 %	0 %	0 %	50 %	512556895
18042	NC_021490	CCG	2	6	943176	943181	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512556895
18043	NC_021490	CTG	2	6	943217	943222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556895
18044	NC_021490	ACC	2	6	943321	943326	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512556896
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18046	NC_021490	GTC	2	6	943399	943404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556896
18047	NC_021490	CCG	2	6	943474	943479	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512556896
18048	NC_021490	GAT	2	6	943485	943490	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556896
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18050	NC_021490	TCAAA	2	10	943694	943703	60 %	20 %	0 %	20 %	512556896
18051	NC_021490	AAAC	2	8	943728	943735	75 %	0 %	0 %	25 %	512556896
18052	NC_021490	GACT	2	8	943757	943764	25 %	25 %	25 %	25 %	512556896
18053	NC_021490	TCCA	2	8	943857	943864	25 %	25 %	0 %	50 %	512556896
18054	NC_021490	GC	3	6	943902	943907	0 %	0 %	50 %	50 %	512556896
18055	NC_021490	CAG	2	6	943929	943934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556896
18056	NC_021490	GC	3	6	943957	943962	0 %	0 %	50 %	50 %	512556896
18057	NC_021490	TACG	2	8	943991	943998	25 %	25 %	25 %	25 %	512556896
18058	NC_021490	CGC	2	6	944066	944071	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512556896
18059	NC_021490	CG	3	6	944075	944080	0 %	0 %	50 %	50 %	512556896
18060	NC_021490	CCT	2	6	944087	944092	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512556896
18061	NC_021490	ACG	2	6	944109	944114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556896
18062	NC_021490	CTGT	2	8	944134	944141	0 %	50 %	25 %	25 %	512556896
18063	NC_021490	AGC	2	6	944221	944226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556896
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18065	NC_021490	CGC	2	6	944238	944243	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512556896
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18072	NC_021490	C	6	6	944373	944378	0 %	0 %	0 %	100 %	512556896
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18088	NC_021490	GCAGGA	2	12	945359	945370	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	512556897
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18093	NC_021490	CAC	3	9	945666	945674	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512556897
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18100	NC_021490	CGC	2	6	945818	945823	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512556897
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18102	NC_021490	TG	3	6	945921	945926	0 %	50 %	50 %	0 %	512556897
18103	NC_021490	GATT	2	8	945928	945935	25 %	50 %	25 %	0 %	512556897
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18106	NC_021490	A	7	7	946005	946011	100 %	0 %	0 %	0 %	512556897
18107	NC_021490	GCC	2	6	946062	946067	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512556897
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18122	NC_021490	GGC	2	6	946894	946899	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512556898
18123	NC_021490	TGC	2	6	946996	947001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556898
18124	NC_021490	TGC	2	6	947066	947071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556898
18125	NC_021490	GACT	2	8	947084	947091	25 %	25 %	25 %	25 %	512556898
18126	NC_021490	AAG	2	6	947164	947169	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512556898
18127	NC_021490	ATT	2	6	947227	947232	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512556898
18128	NC_021490	GCG	2	6	947255	947260	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512556898
18129	NC_021490	CGG	2	6	947268	947273	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512556898
18130	NC_021490	CGC	2	6	947275	947280	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512556898
18131	NC_021490	GAG	2	6	947310	947315	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512556898
18132	NC_021490	AGA	2	6	947374	947379	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512556898
18133	NC_021490	GAT	2	6	947438	947443	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556898
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18136	NC_021490	TGC	2	6	947542	947547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556898
18137	NC_021490	GC	4	8	947652	947659	0 %	0 %	50 %	50 %	512556898
18138	NC_021490	TC	3	6	947663	947668	0 %	50 %	0 %	50 %	512556898
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18141	NC_021490	CCCA	2	8	947837	947844	25 %	0 %	0 %	75 %	512556898
18142	NC_021490	GCG	2	6	947861	947866	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512556898
18143	NC_021490	AGCT	2	8	947883	947890	25 %	25 %	25 %	25 %	512556898
18144	NC_021490	GGCA	2	8	947894	947901	25 %	0 %	50 %	25 %	512556898
18145	NC_021490	GC	3	6	948002	948007	0 %	0 %	50 %	50 %	512556898
18146	NC_021490	CTG	2	6	948023	948028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556898
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18148	NC_021490	CG	3	6	948113	948118	0 %	0 %	50 %	50 %	512556898
18149	NC_021490	CAC	2	6	948119	948124	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512556898
18150	NC_021490	CCTT	2	8	948211	948218	0 %	50 %	0 %	50 %	512556898
18151	NC_021490	TGA	2	6	948242	948247	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556898
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18227	NC_021490	CA	3	6	952789	952794	50 %	0 %	0 %	50 %	512556904
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18232	NC_021490	ATGG	2	8	953136	953143	25 %	25 %	50 %	0 %	512556904
18233	NC_021490	A	6	6	953277	953282	100 %	0 %	0 %	0 %	512556905
18234	NC_021490	A	6	6	953321	953326	100 %	0 %	0 %	0 %	512556905
18235	NC_021490	AAAC	2	8	953330	953337	75 %	0 %	0 %	25 %	512556905
18236	NC_021490	CGG	2	6	953343	953348	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512556905
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18238	NC_021490	CGTG	2	8	953455	953462	0 %	25 %	50 %	25 %	512556905
18239	NC_021490	GCAC	2	8	953495	953502	25 %	0 %	25 %	50 %	512556905
18240	NC_021490	AG	3	6	953551	953556	50 %	0 %	50 %	0 %	512556905
18241	NC_021490	CT	3	6	953583	953588	0 %	50 %	0 %	50 %	512556905
18242	NC_021490	CT	3	6	953613	953618	0 %	50 %	0 %	50 %	512556905
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18244	NC_021490	GTT	2	6	953777	953782	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512556905
18245	NC_021490	CTA	2	6	953886	953891	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512556906
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18276	NC_021490	AT	3	6	955721	955726	50 %	50 %	0 %	0 %	512556909
18277	NC_021490	GCA	2	6	955760	955765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556909
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18352	NC_021490	TCGT	2	8	959247	959254	0 %	50 %	25 %	25 %	512556912
18353	NC_021490	GAAAA	2	10	959265	959274	80 %	0 %	20 %	0 %	512556912
18354	NC_021490	A	6	6	959271	959276	100 %	0 %	0 %	0 %	512556912
18355	NC_021490	CAG	2	6	959326	959331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556912
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18358	NC_021490	AGT	2	6	959447	959452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556912
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18361	NC_021490	GCA	2	6	959541	959546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556913
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18363	NC_021490	TGCA	2	8	959702	959709	25 %	25 %	25 %	25 %	512556913
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18473	NC_021490	TCC	2	6	964450	964455	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512556917
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18485	NC_021490	T	6	6	964970	964975	0 %	100 %	0 %	0 %	512556918
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18487	NC_021490	AGAA	2	8	965058	965065	75 %	0 %	25 %	0 %	512556918
18488	NC_021490	CCTA	2	8	965073	965080	25 %	25 %	0 %	50 %	512556918
18489	NC_021490	TGC	2	6	965089	965094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556918
18490	NC_021490	CCT	2	6	965099	965104	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512556918
18491	NC_021490	TCA	2	6	965105	965110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512556918
18492	NC_021490	CATC	2	8	965138	965145	25 %	25 %	0 %	50 %	512556918
18493	NC_021490	TCC	2	6	965206	965211	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512556918
18494	NC_021490	TGA	2	6	965255	965260	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556918
18495	NC_021490	GAGAA	2	10	965310	965319	60 %	0 %	40 %	0 %	512556918
18496	NC_021490	CA	3	6	965332	965337	50 %	0 %	0 %	50 %	512556918
18497	NC_021490	GGA	2	6	965346	965351	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512556918
18498	NC_021490	CACG	2	8	965384	965391	25 %	0 %	25 %	50 %	512556918
18499	NC_021490	AGG	2	6	965508	965513	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512556918
18500	NC_021490	GTC	2	6	965559	965564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556918

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