MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum str. Nichols

Total Repeats: 21924

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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17502	NC_021490	ACC	2	6	916654	916659	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512556875
17503	NC_021490	A	6	6	916738	916743	100 %	0 %	0 %	0 %	512556875
17504	NC_021490	CTC	2	6	916788	916793	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512556875
17505	NC_021490	TGC	2	6	916854	916859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556875
17506	NC_021490	GC	3	6	916885	916890	0 %	0 %	50 %	50 %	512556875
17507	NC_021490	CG	3	6	916892	916897	0 %	0 %	50 %	50 %	512556875
17508	NC_021490	CGGCA	2	10	916901	916910	20 %	0 %	40 %	40 %	512556875
17509	NC_021490	TTGA	2	8	917104	917111	25 %	50 %	25 %	0 %	512556875
17510	NC_021490	AGC	2	6	917118	917123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556875
17511	NC_021490	CAGG	2	8	917146	917153	25 %	0 %	50 %	25 %	512556875
17512	NC_021490	ACC	2	6	917157	917162	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512556875
17513	NC_021490	GC	3	6	917250	917255	0 %	0 %	50 %	50 %	512556875
17514	NC_021490	TCT	2	6	917456	917461	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512556876
17515	NC_021490	GC	6	12	917561	917572	0 %	0 %	50 %	50 %	512556876
17516	NC_021490	A	7	7	917655	917661	100 %	0 %	0 %	0 %	512556876
17517	NC_021490	TTC	2	6	917685	917690	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512556876
17518	NC_021490	CG	3	6	917844	917849	0 %	0 %	50 %	50 %	512556876
17519	NC_021490	CCA	2	6	917897	917902	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512556876
17520	NC_021490	CG	3	6	917977	917982	0 %	0 %	50 %	50 %	512556876
17521	NC_021490	AGG	2	6	917986	917991	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512556876
17522	NC_021490	CG	3	6	918000	918005	0 %	0 %	50 %	50 %	512556876
17523	NC_021490	AG	3	6	918018	918023	50 %	0 %	50 %	0 %	512556876
17524	NC_021490	GC	3	6	918055	918060	0 %	0 %	50 %	50 %	512556876
17525	NC_021490	CG	3	6	918062	918067	0 %	0 %	50 %	50 %	512556876
17526	NC_021490	CTT	2	6	918129	918134	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512556876
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17528	NC_021490	TAA	2	6	918193	918198	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512556876
17529	NC_021490	CAAT	2	8	918366	918373	50 %	25 %	0 %	25 %	512556877
17530	NC_021490	GGC	2	6	918448	918453	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512556877
17531	NC_021490	GC	3	6	918476	918481	0 %	0 %	50 %	50 %	512556877
17532	NC_021490	GGGC	2	8	918568	918575	0 %	0 %	75 %	25 %	512556877
17533	NC_021490	GT	3	6	918586	918591	0 %	50 %	50 %	0 %	512556877
17534	NC_021490	GGT	2	6	918646	918651	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512556877
17535	NC_021490	TCA	3	9	918720	918728	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512556877
17536	NC_021490	CTG	2	6	918807	918812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556877
17537	NC_021490	GTC	2	6	918821	918826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556877
17538	NC_021490	TGA	2	6	918909	918914	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556877
17539	NC_021490	CGCAA	2	10	918934	918943	40 %	0 %	20 %	40 %	512556877
17540	NC_021490	A	6	6	918942	918947	100 %	0 %	0 %	0 %	512556877
17541	NC_021490	CCA	2	6	919014	919019	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512556877
17542	NC_021490	TGC	2	6	919047	919052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556877
17543	NC_021490	GTG	2	6	919112	919117	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512556877
17544	NC_021490	AAG	2	6	919175	919180	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512556877
17545	NC_021490	CGA	2	6	919219	919224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556877
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17553	NC_021490	CTC	2	6	919514	919519	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512556878
17554	NC_021490	CGC	2	6	919536	919541	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512556878
17555	NC_021490	CCT	2	6	919604	919609	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512556878
17556	NC_021490	GTT	2	6	919623	919628	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512556878
17557	NC_021490	TCGC	2	8	919682	919689	0 %	25 %	25 %	50 %	512556878
17558	NC_021490	TCC	2	6	919698	919703	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512556878
17559	NC_021490	GC	3	6	919739	919744	0 %	0 %	50 %	50 %	512556878
17560	NC_021490	GAC	2	6	919781	919786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556878
17561	NC_021490	GAT	2	6	919811	919816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556878
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17563	NC_021490	GC	3	6	919925	919930	0 %	0 %	50 %	50 %	512556878
17564	NC_021490	CG	4	8	919957	919964	0 %	0 %	50 %	50 %	512556878
17565	NC_021490	CCAC	2	8	919981	919988	25 %	0 %	0 %	75 %	512556878
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17570	NC_021490	CTCTT	2	10	920149	920158	0 %	60 %	0 %	40 %	512556879
17571	NC_021490	TCT	2	6	920228	920233	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512556879
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17587	NC_021490	CGC	2	6	920953	920958	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512556881
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17592	NC_021490	CAT	2	6	921341	921346	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512556883
17593	NC_021490	GACC	2	8	921380	921387	25 %	0 %	25 %	50 %	512556883
17594	NC_021490	TGC	2	6	921394	921399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556883
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17601	NC_021490	CAAC	2	8	921801	921808	50 %	0 %	0 %	50 %	512556883
17602	NC_021490	TCC	2	6	921868	921873	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512556883
17603	NC_021490	TCA	2	6	922088	922093	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512556884
17604	NC_021490	CA	3	6	922092	922097	50 %	0 %	0 %	50 %	512556884
17605	NC_021490	AGG	2	6	922184	922189	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512556884
17606	NC_021490	ACG	2	6	922235	922240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556884
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17608	NC_021490	TCA	2	6	922282	922287	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512556884
17609	NC_021490	CCAT	2	8	922409	922416	25 %	25 %	0 %	50 %	512556884
17610	NC_021490	AT	3	6	922425	922430	50 %	50 %	0 %	0 %	512556884
17611	NC_021490	CAG	2	6	922464	922469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556884
17612	NC_021490	TGA	2	6	922473	922478	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556884
17613	NC_021490	AAG	2	6	922535	922540	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512556884
17614	NC_021490	CGGA	2	8	922578	922585	25 %	0 %	50 %	25 %	512556884
17615	NC_021490	GAT	2	6	922605	922610	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556884
17616	NC_021490	GCA	2	6	922612	922617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556884
17617	NC_021490	CAA	3	9	922684	922692	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512556884
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17988	NC_021490	AGG	2	6	940358	940363	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512556893
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17990	NC_021490	A	7	7	940429	940435	100 %	0 %	0 %	0 %	512556893
17991	NC_021490	CAA	2	6	940479	940484	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512556893
17992	NC_021490	GC	3	6	940614	940619	0 %	0 %	50 %	50 %	512556893
17993	NC_021490	GAC	2	6	940716	940721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556893
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