MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum str. Nichols

Total Repeats: 21924

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16501	NC_021490	GTG	2	6	861519	861524	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512556828
16502	NC_021490	GC	3	6	861560	861565	0 %	0 %	50 %	50 %	512556828
16503	NC_021490	CAT	3	9	861584	861592	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512556828
16504	NC_021490	A	6	6	861602	861607	100 %	0 %	0 %	0 %	512556828
16505	NC_021490	TCT	2	6	861629	861634	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512556828
16506	NC_021490	GC	3	6	861644	861649	0 %	0 %	50 %	50 %	512556828
16507	NC_021490	CGG	2	6	861654	861659	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512556828
16508	NC_021490	AAGA	2	8	861686	861693	75 %	0 %	25 %	0 %	512556828
16509	NC_021490	CTTC	2	8	861704	861711	0 %	50 %	0 %	50 %	512556828
16510	NC_021490	A	6	6	861725	861730	100 %	0 %	0 %	0 %	512556828
16511	NC_021490	CACAA	2	10	861788	861797	60 %	0 %	0 %	40 %	512556828
16512	NC_021490	AC	3	6	861839	861844	50 %	0 %	0 %	50 %	512556828
16513	NC_021490	AGG	2	6	861891	861896	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512556828
16514	NC_021490	CA	3	6	861951	861956	50 %	0 %	0 %	50 %	512556828
16515	NC_021490	TTC	2	6	862004	862009	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512556828
16516	NC_021490	CG	4	8	862076	862083	0 %	0 %	50 %	50 %	512556828
16517	NC_021490	AGA	2	6	862096	862101	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512556828
16518	NC_021490	CAG	2	6	862172	862177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556828
16519	NC_021490	ATC	2	6	862217	862222	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512556828
16520	NC_021490	AG	3	6	862307	862312	50 %	0 %	50 %	0 %	512556829
16521	NC_021490	CA	3	6	862423	862428	50 %	0 %	0 %	50 %	512556829
16522	NC_021490	GT	3	6	862484	862489	0 %	50 %	50 %	0 %	512556829
16523	NC_021490	TG	3	6	862492	862497	0 %	50 %	50 %	0 %	512556829
16524	NC_021490	GC	4	8	862506	862513	0 %	0 %	50 %	50 %	512556829
16525	NC_021490	T	6	6	862614	862619	0 %	100 %	0 %	0 %	512556829
16526	NC_021490	CCT	2	6	862686	862691	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512556829
16527	NC_021490	GGC	2	6	862696	862701	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512556829
16528	NC_021490	GAT	2	6	862724	862729	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556829
16529	NC_021490	A	7	7	862796	862802	100 %	0 %	0 %	0 %	512556829
16530	NC_021490	TGC	2	6	862902	862907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556829
16531	NC_021490	GCA	2	6	863022	863027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556829
16532	NC_021490	GC	3	6	863044	863049	0 %	0 %	50 %	50 %	512556829
16533	NC_021490	G	6	6	863056	863061	0 %	0 %	100 %	0 %	512556829
16534	NC_021490	TGA	3	9	863187	863195	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556829
16535	NC_021490	CGCA	2	8	863356	863363	25 %	0 %	25 %	50 %	512556829
16536	NC_021490	CTCA	2	8	863444	863451	25 %	25 %	0 %	50 %	512556829
16537	NC_021490	A	6	6	863465	863470	100 %	0 %	0 %	0 %	512556829
16538	NC_021490	GCGCT	2	10	863555	863564	0 %	20 %	40 %	40 %	512556830
16539	NC_021490	CGCA	2	8	863603	863610	25 %	0 %	25 %	50 %	512556830
16540	NC_021490	CA	4	8	863616	863623	50 %	0 %	0 %	50 %	512556830
16541	NC_021490	ATG	2	6	863626	863631	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556830
16542	NC_021490	T	6	6	863649	863654	0 %	100 %	0 %	0 %	512556830
16543	NC_021490	AC	3	6	863655	863660	50 %	0 %	0 %	50 %	512556830
16544	NC_021490	CACG	2	8	863712	863719	25 %	0 %	25 %	50 %	512556831
16545	NC_021490	GC	3	6	863741	863746	0 %	0 %	50 %	50 %	512556831
16546	NC_021490	GCATCT	2	12	863849	863860	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	512556831
16547	NC_021490	GT	3	6	863900	863905	0 %	50 %	50 %	0 %	512556831
16548	NC_021490	GAT	2	6	863929	863934	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556831
16549	NC_021490	ATG	2	6	863935	863940	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556831
16550	NC_021490	CAC	2	6	863989	863994	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512556831
16551	NC_021490	ACC	2	6	864014	864019	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512556831
16552	NC_021490	CGTGC	2	10	864037	864046	0 %	20 %	40 %	40 %	512556831
16553	NC_021490	TTCCA	2	10	864065	864074	20 %	40 %	0 %	40 %	512556831
16554	NC_021490	GCT	2	6	864086	864091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556831
16555	NC_021490	TCC	2	6	864133	864138	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512556831
16556	NC_021490	GT	3	6	864260	864265	0 %	50 %	50 %	0 %	512556831
16557	NC_021490	GC	3	6	864267	864272	0 %	0 %	50 %	50 %	512556831
16558	NC_021490	GC	3	6	864287	864292	0 %	0 %	50 %	50 %	512556831
16559	NC_021490	CCT	2	6	864327	864332	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512556831
16560	NC_021490	CAG	2	6	864354	864359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556831
16561	NC_021490	A	8	8	864436	864443	100 %	0 %	0 %	0 %	512556831
16562	NC_021490	CAA	3	9	864477	864485	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512556831
16563	NC_021490	CCTG	2	8	864497	864504	0 %	25 %	25 %	50 %	512556831
16564	NC_021490	GCA	2	6	864515	864520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556831
16565	NC_021490	TCA	2	6	864530	864535	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512556831
16566	NC_021490	TGT	3	9	864560	864568	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512556831
16567	NC_021490	AGC	2	6	864569	864574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556831
16568	NC_021490	CCT	2	6	864582	864587	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512556831
16569	NC_021490	CAG	3	9	864606	864614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556831
16570	NC_021490	CG	3	6	864684	864689	0 %	0 %	50 %	50 %	512556831
16571	NC_021490	CA	3	6	864714	864719	50 %	0 %	0 %	50 %	512556831
16572	NC_021490	GAA	2	6	864832	864837	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512556832
16573	NC_021490	AGCGC	2	10	864841	864850	20 %	0 %	40 %	40 %	512556832
16574	NC_021490	CTC	2	6	864885	864890	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512556832
16575	NC_021490	TG	3	6	865001	865006	0 %	50 %	50 %	0 %	512556832
16576	NC_021490	CG	3	6	865028	865033	0 %	0 %	50 %	50 %	512556832
16577	NC_021490	AGCG	2	8	865059	865066	25 %	0 %	50 %	25 %	512556832
16578	NC_021490	CCA	2	6	865139	865144	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512556832
16579	NC_021490	GCA	2	6	865166	865171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556832
16580	NC_021490	GTG	2	6	865197	865202	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512556832
16581	NC_021490	GC	3	6	865212	865217	0 %	0 %	50 %	50 %	512556832
16582	NC_021490	C	6	6	865232	865237	0 %	0 %	0 %	100 %	512556832
16583	NC_021490	TGA	2	6	865288	865293	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556832
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16585	NC_021490	TGC	2	6	865619	865624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556832
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16587	NC_021490	A	8	8	865780	865787	100 %	0 %	0 %	0 %	512556833
16588	NC_021490	CGG	2	6	865829	865834	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512556833
16589	NC_021490	CAATT	2	10	865886	865895	40 %	40 %	0 %	20 %	512556833
16590	NC_021490	CAC	2	6	866002	866007	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512556833
16591	NC_021490	CAT	2	6	866071	866076	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512556833
16592	NC_021490	CAA	2	6	866086	866091	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512556833
16593	NC_021490	A	7	7	866161	866167	100 %	0 %	0 %	0 %	512556833
16594	NC_021490	GAGG	2	8	866190	866197	25 %	0 %	75 %	0 %	512556833
16595	NC_021490	CTC	2	6	866210	866215	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512556833
16596	NC_021490	CTT	2	6	866216	866221	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512556833
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16598	NC_021490	GTCT	2	8	866231	866238	0 %	50 %	25 %	25 %	512556833
16599	NC_021490	ATTC	2	8	866246	866253	25 %	50 %	0 %	25 %	512556833
16600	NC_021490	GCA	2	6	866331	866336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556833
16601	NC_021490	ACGG	2	8	866353	866360	25 %	0 %	50 %	25 %	512556833
16602	NC_021490	CGG	2	6	866372	866377	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512556833
16603	NC_021490	TCTT	2	8	866463	866470	0 %	75 %	0 %	25 %	512556833
16604	NC_021490	GCA	2	6	866472	866477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556833
16605	NC_021490	CA	4	8	866476	866483	50 %	0 %	0 %	50 %	512556833
16606	NC_021490	CTC	2	6	866485	866490	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512556833
16607	NC_021490	C	6	6	866490	866495	0 %	0 %	0 %	100 %	512556833
16608	NC_021490	TGC	2	6	866541	866546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556833
16609	NC_021490	A	6	6	866559	866564	100 %	0 %	0 %	0 %	512556833
16610	NC_021490	TTC	2	6	866798	866803	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512556833
16611	NC_021490	TGC	2	6	866821	866826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556833
16612	NC_021490	GC	3	6	866825	866830	0 %	0 %	50 %	50 %	512556833
16613	NC_021490	CGTA	2	8	866857	866864	25 %	25 %	25 %	25 %	512556833
16614	NC_021490	T	6	6	866968	866973	0 %	100 %	0 %	0 %	512556833
16615	NC_021490	C	6	6	867077	867082	0 %	0 %	0 %	100 %	512556833
16616	NC_021490	CTG	2	6	867221	867226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556833
16617	NC_021490	CCA	2	6	867233	867238	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512556833
16618	NC_021490	TTTC	2	8	867250	867257	0 %	75 %	0 %	25 %	512556833
16619	NC_021490	TCG	2	6	867264	867269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556833
16620	NC_021490	C	9	9	867272	867280	0 %	0 %	0 %	100 %	512556833
16621	NC_021490	CA	3	6	867348	867353	50 %	0 %	0 %	50 %	512556833
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16623	NC_021490	CG	3	6	867409	867414	0 %	0 %	50 %	50 %	512556833
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16868	NC_021490	T	7	7	879912	879918	0 %	100 %	0 %	0 %	512556844
16869	NC_021490	GGC	2	6	879934	879939	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512556844
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16871	NC_021490	GTA	2	6	880050	880055	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556844
16872	NC_021490	GTC	2	6	880070	880075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556844
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16988	NC_021490	ATGC	2	8	888472	888479	25 %	25 %	25 %	25 %	512556850
16989	NC_021490	TCAC	2	8	888484	888491	25 %	25 %	0 %	50 %	512556850
16990	NC_021490	CCT	2	6	888498	888503	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512556851
16991	NC_021490	A	8	8	888528	888535	100 %	0 %	0 %	0 %	512556851
16992	NC_021490	CT	4	8	888553	888560	0 %	50 %	0 %	50 %	512556851
16993	NC_021490	CGC	2	6	888573	888578	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512556851
16994	NC_021490	TAA	2	6	888745	888750	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512556852
16995	NC_021490	CG	3	6	888819	888824	0 %	0 %	50 %	50 %	512556852
16996	NC_021490	CTGC	2	8	888834	888841	0 %	25 %	25 %	50 %	512556852
16997	NC_021490	CTG	2	6	888864	888869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556852
16998	NC_021490	CA	4	8	888903	888910	50 %	0 %	0 %	50 %	512556852
16999	NC_021490	ACTGC	2	10	889041	889050	20 %	20 %	20 %	40 %	512556852
17000	NC_021490	CG	4	8	889108	889115	0 %	0 %	50 %	50 %	512556852

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