MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum str. Nichols

Total Repeats: 21924

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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16002	NC_021490	AGA	2	6	836688	836693	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512556805
16003	NC_021490	GC	3	6	836789	836794	0 %	0 %	50 %	50 %	512556805
16004	NC_021490	GC	3	6	836822	836827	0 %	0 %	50 %	50 %	512556805
16005	NC_021490	ATCG	2	8	836858	836865	25 %	25 %	25 %	25 %	512556805
16006	NC_021490	CCGA	2	8	836873	836880	25 %	0 %	25 %	50 %	512556805
16007	NC_021490	AGCA	2	8	836930	836937	50 %	0 %	25 %	25 %	512556805
16008	NC_021490	ACG	2	6	836940	836945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556805
16009	NC_021490	TTGC	2	8	837008	837015	0 %	50 %	25 %	25 %	512556805
16010	NC_021490	AGG	3	9	837027	837035	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512556805
16011	NC_021490	GC	3	6	837038	837043	0 %	0 %	50 %	50 %	512556805
16012	NC_021490	GCC	2	6	837047	837052	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512556805
16013	NC_021490	GAA	2	6	837068	837073	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512556805
16014	NC_021490	GAA	2	6	837101	837106	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512556805
16015	NC_021490	GGA	3	9	837118	837126	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512556805
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16017	NC_021490	GCC	2	6	837140	837145	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512556805
16018	NC_021490	GAA	2	6	837161	837166	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512556805
16019	NC_021490	GAA	2	6	837194	837199	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512556805
16020	NC_021490	GGA	3	9	837211	837219	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512556805
16021	NC_021490	GC	3	6	837224	837229	0 %	0 %	50 %	50 %	512556805
16022	NC_021490	GCC	2	6	837233	837238	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512556805
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16027	NC_021490	GAG	2	6	837482	837487	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512556805
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16029	NC_021490	TGAA	2	8	837737	837744	50 %	25 %	25 %	0 %	512556806
16030	NC_021490	GCT	2	6	837799	837804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556806
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16033	NC_021490	A	6	6	838001	838006	100 %	0 %	0 %	0 %	512556806
16034	NC_021490	AGC	2	6	838049	838054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556806
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16036	NC_021490	TAG	2	6	838085	838090	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556806
16037	NC_021490	TC	3	6	838129	838134	0 %	50 %	0 %	50 %	512556806
16038	NC_021490	TCT	2	6	838217	838222	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512556806
16039	NC_021490	ACGC	2	8	838238	838245	25 %	0 %	25 %	50 %	512556806
16040	NC_021490	GTT	2	6	838318	838323	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512556806
16041	NC_021490	GAA	2	6	838324	838329	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512556806
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16043	NC_021490	GC	3	6	838345	838350	0 %	0 %	50 %	50 %	512556806
16044	NC_021490	TGC	2	6	838515	838520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556806
16045	NC_021490	A	6	6	838553	838558	100 %	0 %	0 %	0 %	512556806
16046	NC_021490	TCG	2	6	838595	838600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556806
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16050	NC_021490	TGG	2	6	838823	838828	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512556806
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16052	NC_021490	CT	3	6	838894	838899	0 %	50 %	0 %	50 %	512556806
16053	NC_021490	GCT	2	6	838938	838943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556806
16054	NC_021490	AAG	2	6	838946	838951	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512556806
16055	NC_021490	CCG	2	6	838988	838993	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512556806
16056	NC_021490	CGC	2	6	839025	839030	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512556806
16057	NC_021490	A	8	8	839160	839167	100 %	0 %	0 %	0 %	512556806
16058	NC_021490	GC	3	6	839269	839274	0 %	0 %	50 %	50 %	512556806
16059	NC_021490	GGA	2	6	839292	839297	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512556806
16060	NC_021490	AAG	2	6	839314	839319	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512556806
16061	NC_021490	CG	3	6	839333	839338	0 %	0 %	50 %	50 %	512556806
16062	NC_021490	AAG	2	6	839467	839472	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512556806
16063	NC_021490	GGA	2	6	839487	839492	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512556806
16064	NC_021490	TTGA	2	8	839522	839529	25 %	50 %	25 %	0 %	512556806
16065	NC_021490	CACG	2	8	839612	839619	25 %	0 %	25 %	50 %	512556807
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16068	NC_021490	ATC	2	6	839832	839837	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512556807
16069	NC_021490	CA	3	6	839891	839896	50 %	0 %	0 %	50 %	512556807
16070	NC_021490	AAAG	2	8	839971	839978	75 %	0 %	25 %	0 %	512556807
16071	NC_021490	TCA	2	6	840064	840069	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512556807
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16073	NC_021490	CT	3	6	840184	840189	0 %	50 %	0 %	50 %	512556807
16074	NC_021490	CGT	2	6	840233	840238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556807
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16077	NC_021490	A	6	6	840414	840419	100 %	0 %	0 %	0 %	512556807
16078	NC_021490	A	7	7	840424	840430	100 %	0 %	0 %	0 %	512556807
16079	NC_021490	GCA	2	6	840511	840516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556807
16080	NC_021490	TGC	2	6	840552	840557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556807
16081	NC_021490	ACTCC	2	10	840563	840572	20 %	20 %	0 %	60 %	512556807
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16087	NC_021490	AGA	2	6	840772	840777	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512556807
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16089	NC_021490	A	7	7	840825	840831	100 %	0 %	0 %	0 %	512556807
16090	NC_021490	CAA	2	6	840902	840907	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512556807
16091	NC_021490	AAAG	2	8	840967	840974	75 %	0 %	25 %	0 %	512556807
16092	NC_021490	TAA	2	6	840986	840991	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512556807
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16101	NC_021490	TG	3	6	841336	841341	0 %	50 %	50 %	0 %	512556808
16102	NC_021490	CTG	2	6	841455	841460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556808
16103	NC_021490	CCT	2	6	841521	841526	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512556808
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16105	NC_021490	AGT	2	6	841758	841763	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556808
16106	NC_021490	ACT	2	6	841785	841790	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512556808
16107	NC_021490	TGA	2	6	841795	841800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556808
16108	NC_021490	TGA	2	6	841868	841873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556808
16109	NC_021490	GCT	2	6	842009	842014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556808
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16111	NC_021490	CGC	2	6	842090	842095	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512556808
16112	NC_021490	GGAAA	2	10	842103	842112	60 %	0 %	40 %	0 %	512556808
16113	NC_021490	AGG	2	6	842125	842130	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512556808
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16115	NC_021490	TGC	2	6	842239	842244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556809
16116	NC_021490	TCG	2	6	842275	842280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556809
16117	NC_021490	CTT	2	6	842286	842291	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512556809
16118	NC_021490	TCC	2	6	842293	842298	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512556809
16119	NC_021490	TAA	2	6	842308	842313	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512556809
16120	NC_021490	C	6	6	842362	842367	0 %	0 %	0 %	100 %	512556809
16121	NC_021490	GCT	2	6	842380	842385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556809
16122	NC_021490	CGT	2	6	842412	842417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556809
16123	NC_021490	CCTG	2	8	842431	842438	0 %	25 %	25 %	50 %	512556809
16124	NC_021490	AGA	2	6	842631	842636	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512556809
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16127	NC_021490	TGA	2	6	842753	842758	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556809
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16183	NC_021490	CTG	2	6	845629	845634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556812
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16229	NC_021490	CA	3	6	848047	848052	50 %	0 %	0 %	50 %	512556816
16230	NC_021490	CTG	2	6	848065	848070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556816
16231	NC_021490	A	8	8	848086	848093	100 %	0 %	0 %	0 %	512556816
16232	NC_021490	GC	3	6	848115	848120	0 %	0 %	50 %	50 %	512556816
16233	NC_021490	A	7	7	848203	848209	100 %	0 %	0 %	0 %	512556816
16234	NC_021490	ATC	2	6	848260	848265	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512556816
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16237	NC_021490	CG	3	6	848337	848342	0 %	0 %	50 %	50 %	512556816
16238	NC_021490	CA	4	8	848364	848371	50 %	0 %	0 %	50 %	512556816
16239	NC_021490	CAC	2	6	848413	848418	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512556816
16240	NC_021490	CCAA	2	8	848479	848486	50 %	0 %	0 %	50 %	512556816
16241	NC_021490	CG	3	6	848568	848573	0 %	0 %	50 %	50 %	512556816
16242	NC_021490	CTG	2	6	848602	848607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556816
16243	NC_021490	GAT	2	6	848631	848636	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556816
16244	NC_021490	GTA	2	6	848723	848728	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556816
16245	NC_021490	GA	3	6	848774	848779	50 %	0 %	50 %	0 %	512556816
16246	NC_021490	CG	5	10	848788	848797	0 %	0 %	50 %	50 %	512556816
16247	NC_021490	CCT	2	6	848828	848833	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512556816
16248	NC_021490	CAC	2	6	848842	848847	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512556816
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16250	NC_021490	A	7	7	849016	849022	100 %	0 %	0 %	0 %	512556816
16251	NC_021490	CGC	2	6	849041	849046	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512556816
16252	NC_021490	GCGTG	2	10	849048	849057	0 %	20 %	60 %	20 %	512556816
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16256	NC_021490	C	6	6	849315	849320	0 %	0 %	0 %	100 %	512556816
16257	NC_021490	TACG	2	8	849331	849338	25 %	25 %	25 %	25 %	512556816
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16273	NC_021490	CA	3	6	849964	849969	50 %	0 %	0 %	50 %	512556816
16274	NC_021490	CGTT	2	8	850030	850037	0 %	50 %	25 %	25 %	512556817
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16276	NC_021490	GACA	2	8	850160	850167	50 %	0 %	25 %	25 %	512556817
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16342	NC_021490	TACC	2	8	853350	853357	25 %	25 %	0 %	50 %	512556820
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16348	NC_021490	GC	3	6	853979	853984	0 %	0 %	50 %	50 %	512556821
16349	NC_021490	GCT	2	6	854042	854047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556821
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16351	NC_021490	TGA	2	6	854165	854170	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556821
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16354	NC_021490	GTA	2	6	854352	854357	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556821
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16356	NC_021490	ACG	2	6	854525	854530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556822
16357	NC_021490	CAG	2	6	854539	854544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556822
16358	NC_021490	A	8	8	854573	854580	100 %	0 %	0 %	0 %	512556822
16359	NC_021490	CA	3	6	854601	854606	50 %	0 %	0 %	50 %	512556822
16360	NC_021490	ATA	2	6	854654	854659	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512556822
16361	NC_021490	CA	3	6	854718	854723	50 %	0 %	0 %	50 %	512556822
16362	NC_021490	GCA	2	6	854724	854729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556822
16363	NC_021490	AC	3	6	854737	854742	50 %	0 %	0 %	50 %	512556822
16364	NC_021490	CCG	2	6	854781	854786	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512556822
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16367	NC_021490	CGG	2	6	855047	855052	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512556823
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16372	NC_021490	GCT	2	6	855240	855245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556823
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16477	NC_021490	GCCA	2	8	860066	860073	25 %	0 %	25 %	50 %	512556827
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16482	NC_021490	A	6	6	860657	860662	100 %	0 %	0 %	0 %	512556828
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16489	NC_021490	CGC	3	9	860932	860940	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512556828
16490	NC_021490	TC	3	6	861011	861016	0 %	50 %	0 %	50 %	512556828
16491	NC_021490	GCT	2	6	861070	861075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556828
16492	NC_021490	GA	3	6	861081	861086	50 %	0 %	50 %	0 %	512556828
16493	NC_021490	CAT	2	6	861109	861114	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512556828
16494	NC_021490	TCT	2	6	861140	861145	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512556828
16495	NC_021490	CA	3	6	861168	861173	50 %	0 %	0 %	50 %	512556828
16496	NC_021490	CG	3	6	861174	861179	0 %	0 %	50 %	50 %	512556828
16497	NC_021490	GAT	2	6	861350	861355	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556828
16498	NC_021490	CAG	2	6	861385	861390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556828
16499	NC_021490	TTCA	2	8	861420	861427	25 %	50 %	0 %	25 %	512556828
16500	NC_021490	TAC	2	6	861506	861511	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512556828

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