MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum str. Nichols

Total Repeats: 21924

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15501	NC_021490	CA	3	6	809636	809641	50 %	0 %	0 %	50 %	512556780
15502	NC_021490	CCTT	2	8	809658	809665	0 %	50 %	0 %	50 %	512556780
15503	NC_021490	GAGCAA	2	12	809688	809699	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	512556780
15504	NC_021490	ACC	2	6	809794	809799	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512556780
15505	NC_021490	AAC	2	6	809801	809806	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512556780
15506	NC_021490	CT	3	6	809862	809867	0 %	50 %	0 %	50 %	512556780
15507	NC_021490	TAC	2	6	809877	809882	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512556780
15508	NC_021490	CA	3	6	809913	809918	50 %	0 %	0 %	50 %	512556781
15509	NC_021490	CGCA	2	8	809930	809937	25 %	0 %	25 %	50 %	512556781
15510	NC_021490	ACGT	2	8	809970	809977	25 %	25 %	25 %	25 %	512556781
15511	NC_021490	AG	3	6	810012	810017	50 %	0 %	50 %	0 %	512556781
15512	NC_021490	C	7	7	810037	810043	0 %	0 %	0 %	100 %	512556781
15513	NC_021490	GA	3	6	810053	810058	50 %	0 %	50 %	0 %	512556781
15514	NC_021490	CCG	2	6	810069	810074	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512556781
15515	NC_021490	CA	4	8	810141	810148	50 %	0 %	0 %	50 %	512556781
15516	NC_021490	GCA	2	6	810173	810178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556781
15517	NC_021490	GGT	2	6	810309	810314	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512556782
15518	NC_021490	CTT	2	6	810319	810324	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512556782
15519	NC_021490	CAC	2	6	810373	810378	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512556782
15520	NC_021490	CG	3	6	810379	810384	0 %	0 %	50 %	50 %	512556782
15521	NC_021490	CCA	2	6	810434	810439	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512556782
15522	NC_021490	ATC	2	6	810440	810445	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512556782
15523	NC_021490	CCCG	2	8	810469	810476	0 %	0 %	25 %	75 %	512556782
15524	NC_021490	TAT	2	6	810492	810497	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512556782
15525	NC_021490	TAC	3	9	810507	810515	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512556782
15526	NC_021490	GC	3	6	810678	810683	0 %	0 %	50 %	50 %	512556783
15527	NC_021490	CCTT	2	8	810732	810739	0 %	50 %	0 %	50 %	512556783
15528	NC_021490	CA	3	6	810871	810876	50 %	0 %	0 %	50 %	512556783
15529	NC_021490	CG	3	6	810943	810948	0 %	0 %	50 %	50 %	512556783
15530	NC_021490	GC	3	6	811088	811093	0 %	0 %	50 %	50 %	512556783
15531	NC_021490	GCAG	2	8	811119	811126	25 %	0 %	50 %	25 %	512556783
15532	NC_021490	CACC	2	8	811138	811145	25 %	0 %	0 %	75 %	512556783
15533	NC_021490	CCT	2	6	811156	811161	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512556783
15534	NC_021490	TCT	2	6	811306	811311	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512556783
15535	NC_021490	GC	3	6	811344	811349	0 %	0 %	50 %	50 %	512556783
15536	NC_021490	CTC	2	6	811451	811456	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512556783
15537	NC_021490	CTC	2	6	811652	811657	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512556783
15538	NC_021490	CGG	2	6	811680	811685	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512556783
15539	NC_021490	TCT	2	6	811701	811706	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512556783
15540	NC_021490	GAA	2	6	811709	811714	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512556783
15541	NC_021490	GCGAGC	2	12	811758	811769	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	512556783
15542	NC_021490	AACG	2	8	811809	811816	50 %	0 %	25 %	25 %	512556783
15543	NC_021490	GTA	2	6	811916	811921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556783
15544	NC_021490	GGAC	2	8	812004	812011	25 %	0 %	50 %	25 %	512556783
15545	NC_021490	CAA	2	6	812038	812043	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512556783
15546	NC_021490	C	7	7	812063	812069	0 %	0 %	0 %	100 %	512556783
15547	NC_021490	AGAA	2	8	812075	812082	75 %	0 %	25 %	0 %	512556783
15548	NC_021490	CACGC	2	10	812176	812185	20 %	0 %	20 %	60 %	512556783
15549	NC_021490	CCG	2	6	812224	812229	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512556783
15550	NC_021490	AAT	2	6	812243	812248	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512556783
15551	NC_021490	C	7	7	812249	812255	0 %	0 %	0 %	100 %	512556783
15552	NC_021490	CCA	2	6	812356	812361	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512556783
15553	NC_021490	AGC	2	6	812382	812387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556783
15554	NC_021490	CTTCG	2	10	812411	812420	0 %	40 %	20 %	40 %	512556783
15555	NC_021490	TC	3	6	812482	812487	0 %	50 %	0 %	50 %	512556783
15556	NC_021490	TCC	2	6	812496	812501	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512556783
15557	NC_021490	TCG	2	6	812580	812585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556783
15558	NC_021490	CTC	2	6	812591	812596	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512556783
15559	NC_021490	TCT	2	6	812617	812622	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512556783
15560	NC_021490	TCC	2	6	812727	812732	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512556783
15561	NC_021490	CAG	2	6	812741	812746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556783
15562	NC_021490	CTT	2	6	812767	812772	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512556783
15563	NC_021490	CAT	2	6	812788	812793	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512556783
15564	NC_021490	TCC	2	6	812861	812866	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512556783
15565	NC_021490	A	7	7	812871	812877	100 %	0 %	0 %	0 %	512556783
15566	NC_021490	GAA	2	6	812978	812983	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512556783
15567	NC_021490	ACC	2	6	813102	813107	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512556783
15568	NC_021490	GAG	2	6	813110	813115	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512556783
15569	NC_021490	GA	3	6	813217	813222	50 %	0 %	50 %	0 %	512556783
15570	NC_021490	GAC	2	6	813286	813291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556783
15571	NC_021490	AATG	2	8	813352	813359	50 %	25 %	25 %	0 %	512556783
15572	NC_021490	CCT	2	6	813451	813456	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512556784
15573	NC_021490	AG	3	6	813467	813472	50 %	0 %	50 %	0 %	512556784
15574	NC_021490	AG	3	6	813550	813555	50 %	0 %	50 %	0 %	512556784
15575	NC_021490	GAA	2	6	813603	813608	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512556784
15576	NC_021490	CG	3	6	813615	813620	0 %	0 %	50 %	50 %	512556784
15577	NC_021490	ATA	2	6	813633	813638	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512556784
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15580	NC_021490	CG	3	6	813744	813749	0 %	0 %	50 %	50 %	512556784
15581	NC_021490	CTT	2	6	813824	813829	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512556784
15582	NC_021490	TCA	2	6	813975	813980	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512556784
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15584	NC_021490	TTC	2	6	814065	814070	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512556784
15585	NC_021490	TGA	2	6	814101	814106	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556784
15586	NC_021490	CCTT	2	8	814177	814184	0 %	50 %	0 %	50 %	512556784
15587	NC_021490	AGC	2	6	814278	814283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556784
15588	NC_021490	TTC	2	6	814308	814313	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512556784
15589	NC_021490	TTC	3	9	814374	814382	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512556784
15590	NC_021490	CAC	2	6	814415	814420	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512556784
15591	NC_021490	GCAC	2	8	814735	814742	25 %	0 %	25 %	50 %	512556785
15592	NC_021490	ACG	3	9	814749	814757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556785
15593	NC_021490	CTT	2	6	814848	814853	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512556785
15594	NC_021490	CTC	2	6	814962	814967	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512556785
15595	NC_021490	CATA	2	8	815000	815007	50 %	25 %	0 %	25 %	512556785
15596	NC_021490	CTTC	2	8	815037	815044	0 %	50 %	0 %	50 %	512556785
15597	NC_021490	CAG	2	6	815099	815104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556785
15598	NC_021490	CTT	2	6	815181	815186	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512556785
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15602	NC_021490	GAT	2	6	815291	815296	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556785
15603	NC_021490	CTC	2	6	815343	815348	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512556785
15604	NC_021490	TCA	2	6	815395	815400	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512556785
15605	NC_021490	TCA	2	6	815422	815427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512556785
15606	NC_021490	CG	3	6	815447	815452	0 %	0 %	50 %	50 %	512556785
15607	NC_021490	T	7	7	815567	815573	0 %	100 %	0 %	0 %	512556785
15608	NC_021490	CG	3	6	815622	815627	0 %	0 %	50 %	50 %	512556785
15609	NC_021490	TCG	2	6	815701	815706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556785
15610	NC_021490	CATCTT	2	12	815721	815732	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	512556785
15611	NC_021490	GAT	2	6	815739	815744	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556785
15612	NC_021490	GAGAT	2	10	815836	815845	40 %	20 %	40 %	0 %	512556785
15613	NC_021490	TAA	2	6	815849	815854	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512556785
15614	NC_021490	CGT	2	6	815865	815870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556785
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15616	NC_021490	TC	3	6	815996	816001	0 %	50 %	0 %	50 %	512556785
15617	NC_021490	GCA	2	6	816035	816040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556785
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15622	NC_021490	CCT	2	6	816365	816370	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512556785
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15625	NC_021490	CCT	2	6	816434	816439	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512556785
15626	NC_021490	GCT	2	6	816440	816445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556785
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15631	NC_021490	T	6	6	816654	816659	0 %	100 %	0 %	0 %	512556786
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