MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum str. Nichols

Total Repeats: 21924

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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15002	NC_021490	CAA	2	6	786033	786038	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512556753
15003	NC_021490	A	6	6	786082	786087	100 %	0 %	0 %	0 %	512556753
15004	NC_021490	TGGA	2	8	786101	786108	25 %	25 %	50 %	0 %	512556753
15005	NC_021490	GTA	2	6	786113	786118	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556753
15006	NC_021490	CT	3	6	786154	786159	0 %	50 %	0 %	50 %	512556753
15007	NC_021490	GCAA	2	8	786173	786180	50 %	0 %	25 %	25 %	512556753
15008	NC_021490	CTT	2	6	786249	786254	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512556753
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15010	NC_021490	CTT	2	6	786360	786365	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512556753
15011	NC_021490	GCT	2	6	786401	786406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556754
15012	NC_021490	AAAC	2	8	786437	786444	75 %	0 %	0 %	25 %	512556754
15013	NC_021490	GAA	2	6	786461	786466	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512556754
15014	NC_021490	AAAC	2	8	786479	786486	75 %	0 %	0 %	25 %	512556754
15015	NC_021490	AG	3	6	786516	786521	50 %	0 %	50 %	0 %	512556754
15016	NC_021490	TAA	2	6	786549	786554	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512556754
15017	NC_021490	A	7	7	786619	786625	100 %	0 %	0 %	0 %	512556754
15018	NC_021490	A	6	6	786645	786650	100 %	0 %	0 %	0 %	512556754
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15021	NC_021490	CCT	2	6	786718	786723	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512556754
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15023	NC_021490	A	7	7	786860	786866	100 %	0 %	0 %	0 %	512556754
15024	NC_021490	TAA	2	6	786902	786907	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512556754
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15026	NC_021490	CAA	2	6	786945	786950	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512556754
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15033	NC_021490	GAG	2	6	787269	787274	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512556755
15034	NC_021490	ACC	2	6	787411	787416	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512556755
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15037	NC_021490	CTAT	2	8	787507	787514	25 %	50 %	0 %	25 %	512556756
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15044	NC_021490	GGC	2	6	787972	787977	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512556756
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15057	NC_021490	CG	4	8	788413	788420	0 %	0 %	50 %	50 %	512556757
15058	NC_021490	GC	3	6	788429	788434	0 %	0 %	50 %	50 %	512556757
15059	NC_021490	TCA	2	6	788475	788480	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512556757
15060	NC_021490	CGA	2	6	788482	788487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556757
15061	NC_021490	GC	3	6	788568	788573	0 %	0 %	50 %	50 %	512556757
15062	NC_021490	GC	3	6	788598	788603	0 %	0 %	50 %	50 %	512556757
15063	NC_021490	GC	3	6	788650	788655	0 %	0 %	50 %	50 %	512556757
15064	NC_021490	AGAA	2	8	788657	788664	75 %	0 %	25 %	0 %	512556757
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15070	NC_021490	GCT	2	6	788866	788871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556757
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15082	NC_021490	GCT	2	6	789449	789454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556758
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15106	NC_021490	AGC	2	6	791054	791059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556759
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15109	NC_021490	A	6	6	791273	791278	100 %	0 %	0 %	0 %	512556760
15110	NC_021490	CCA	2	6	791289	791294	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512556760
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15112	NC_021490	CTG	2	6	791311	791316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556760
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15120	NC_021490	GT	3	6	791860	791865	0 %	50 %	50 %	0 %	512556761
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15240	NC_021490	GCC	2	6	797643	797648	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512556767
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15242	NC_021490	ACCGC	2	10	797671	797680	20 %	0 %	20 %	60 %	512556767
15243	NC_021490	GCA	2	6	797889	797894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556767
15244	NC_021490	TAC	2	6	797931	797936	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512556767
15245	NC_021490	GTG	2	6	797946	797951	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512556767
15246	NC_021490	ATC	2	6	797973	797978	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512556767
15247	NC_021490	TG	3	6	798009	798014	0 %	50 %	50 %	0 %	512556767
15248	NC_021490	G	6	6	798053	798058	0 %	0 %	100 %	0 %	512556767
15249	NC_021490	CTG	2	6	798114	798119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556767
15250	NC_021490	GCG	2	6	798142	798147	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512556767
15251	NC_021490	CG	3	6	798146	798151	0 %	0 %	50 %	50 %	512556767
15252	NC_021490	T	6	6	798153	798158	0 %	100 %	0 %	0 %	512556767
15253	NC_021490	AC	3	6	798284	798289	50 %	0 %	0 %	50 %	512556768
15254	NC_021490	GAAG	2	8	798334	798341	50 %	0 %	50 %	0 %	512556768
15255	NC_021490	AGG	2	6	798371	798376	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512556768
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15257	NC_021490	GCC	2	6	798431	798436	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512556768
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15282	NC_021490	GC	3	6	799250	799255	0 %	0 %	50 %	50 %	512556769
15283	NC_021490	TGC	2	6	799265	799270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556769
15284	NC_021490	CTGC	2	8	799282	799289	0 %	25 %	25 %	50 %	512556769
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15315	NC_021490	GGT	2	6	800774	800779	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512556771
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15353	NC_021490	GGC	2	6	802825	802830	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512556772
15354	NC_021490	GCATAC	2	12	802832	802843	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	512556772
15355	NC_021490	TGCG	2	8	802858	802865	0 %	25 %	50 %	25 %	512556772
15356	NC_021490	CTT	2	6	802916	802921	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512556772
15357	NC_021490	GTGC	2	8	802931	802938	0 %	25 %	50 %	25 %	512556772
15358	NC_021490	TACG	2	8	802945	802952	25 %	25 %	25 %	25 %	512556772
15359	NC_021490	TACC	2	8	803024	803031	25 %	25 %	0 %	50 %	512556772
15360	NC_021490	GTG	2	6	803039	803044	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512556773
15361	NC_021490	CAG	2	6	803055	803060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556773
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15363	NC_021490	CAT	2	6	803105	803110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512556773
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15486	NC_021490	CG	3	6	808943	808948	0 %	0 %	50 %	50 %	512556779
15487	NC_021490	A	7	7	808954	808960	100 %	0 %	0 %	0 %	512556779
15488	NC_021490	AGA	2	6	808969	808974	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512556779
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15490	NC_021490	GC	3	6	809067	809072	0 %	0 %	50 %	50 %	512556779
15491	NC_021490	CTG	2	6	809083	809088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556779
15492	NC_021490	ACC	2	6	809119	809124	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512556779
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