MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum str. Nichols

Total Repeats: 21924

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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14002	NC_021490	TATT	2	8	732781	732788	25 %	75 %	0 %	0 %	512556710
14003	NC_021490	TCA	2	6	732856	732861	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512556710
14004	NC_021490	ATA	2	6	732879	732884	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512556710
14005	NC_021490	TC	3	6	732912	732917	0 %	50 %	0 %	50 %	512556710
14006	NC_021490	TTC	2	6	732930	732935	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512556710
14007	NC_021490	GCTT	2	8	732990	732997	0 %	50 %	25 %	25 %	512556710
14008	NC_021490	T	6	6	733018	733023	0 %	100 %	0 %	0 %	512556710
14009	NC_021490	TCG	2	6	733045	733050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556710
14010	NC_021490	ATT	2	6	733111	733116	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512556710
14011	NC_021490	T	8	8	733123	733130	0 %	100 %	0 %	0 %	512556710
14012	NC_021490	AGG	2	6	733172	733177	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512556710
14013	NC_021490	TCA	2	6	733201	733206	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512556710
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14015	NC_021490	AATT	2	8	733376	733383	50 %	50 %	0 %	0 %	512556710
14016	NC_021490	CGG	2	6	733412	733417	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512556710
14017	NC_021490	TTA	2	6	733480	733485	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512556710
14018	NC_021490	TTTTC	2	10	733580	733589	0 %	80 %	0 %	20 %	512556710
14019	NC_021490	TTTC	2	8	733608	733615	0 %	75 %	0 %	25 %	512556710
14020	NC_021490	TATTT	2	10	733750	733759	20 %	80 %	0 %	0 %	512556710
14021	NC_021490	AT	3	6	733783	733788	50 %	50 %	0 %	0 %	512556710
14022	NC_021490	AATG	2	8	733794	733801	50 %	25 %	25 %	0 %	512556710
14023	NC_021490	TCC	2	6	733843	733848	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512556710
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14026	NC_021490	CGT	2	6	734005	734010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556710
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14029	NC_021490	ATC	2	6	734322	734327	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512556710
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14033	NC_021490	CGCA	2	8	734460	734467	25 %	0 %	25 %	50 %	512556710
14034	NC_021490	CTT	2	6	734480	734485	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512556710
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14040	NC_021490	ATCC	2	8	734712	734719	25 %	25 %	0 %	50 %	512556710
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14042	NC_021490	ACT	2	6	734770	734775	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512556710
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14045	NC_021490	AGA	2	6	734967	734972	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512556710
14046	NC_021490	TTC	3	9	735025	735033	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512556710
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14051	NC_021490	TCT	2	6	735158	735163	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512556710
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14053	NC_021490	GC	3	6	735231	735236	0 %	0 %	50 %	50 %	512556710
14054	NC_021490	TTC	2	6	735240	735245	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512556710
14055	NC_021490	CAAGA	2	10	735293	735302	60 %	0 %	20 %	20 %	512556710
14056	NC_021490	GTA	2	6	735363	735368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556710
14057	NC_021490	GGA	2	6	735390	735395	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512556710
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14059	NC_021490	CAG	2	6	735542	735547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556710
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14065	NC_021490	AGGG	2	8	735882	735889	25 %	0 %	75 %	0 %	512556711
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14073	NC_021490	CG	3	6	736267	736272	0 %	0 %	50 %	50 %	512556711
14074	NC_021490	CG	4	8	736387	736394	0 %	0 %	50 %	50 %	512556711
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14081	NC_021490	CA	3	6	736676	736681	50 %	0 %	0 %	50 %	512556711
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14086	NC_021490	ACG	2	6	736935	736940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556711
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14088	NC_021490	GC	3	6	736983	736988	0 %	0 %	50 %	50 %	512556711
14089	NC_021490	CAC	2	6	737058	737063	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512556711
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14094	NC_021490	TA	3	6	737326	737331	50 %	50 %	0 %	0 %	512556712
14095	NC_021490	AGAA	2	8	737372	737379	75 %	0 %	25 %	0 %	512556712
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14100	NC_021490	GC	3	6	737599	737604	0 %	0 %	50 %	50 %	512556712
14101	NC_021490	A	6	6	737668	737673	100 %	0 %	0 %	0 %	512556712
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14105	NC_021490	AGC	2	6	737921	737926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556712
14106	NC_021490	CAC	2	6	737977	737982	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512556712
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14108	NC_021490	GA	3	6	738186	738191	50 %	0 %	50 %	0 %	512556713
14109	NC_021490	ACCGTA	2	12	738224	738235	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	512556713
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14112	NC_021490	CGCAC	2	10	738365	738374	20 %	0 %	20 %	60 %	512556713
14113	NC_021490	T	7	7	738397	738403	0 %	100 %	0 %	0 %	512556713
14114	NC_021490	A	6	6	738413	738418	100 %	0 %	0 %	0 %	512556713
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14122	NC_021490	GCA	2	6	738812	738817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556713
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14124	NC_021490	T	6	6	738974	738979	0 %	100 %	0 %	0 %	512556713
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14126	NC_021490	CAC	2	6	739185	739190	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512556713
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14242	NC_021490	A	6	6	744860	744865	100 %	0 %	0 %	0 %	512556719
14243	NC_021490	GC	3	6	744906	744911	0 %	0 %	50 %	50 %	512556719
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14371	NC_021490	TGTC	2	8	751613	751620	0 %	50 %	25 %	25 %	512556726
14372	NC_021490	TC	3	6	751619	751624	0 %	50 %	0 %	50 %	512556726
14373	NC_021490	CGA	2	6	751683	751688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556726
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14489	NC_021490	GTA	2	6	758238	758243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556730
14490	NC_021490	CA	3	6	758254	758259	50 %	0 %	0 %	50 %	512556730
14491	NC_021490	TCA	2	6	758290	758295	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512556730
14492	NC_021490	AAC	2	6	758339	758344	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512556730
14493	NC_021490	ATC	2	6	758345	758350	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512556730
14494	NC_021490	ACCGT	2	10	758462	758471	20 %	20 %	20 %	40 %	512556730
14495	NC_021490	CCT	2	6	758488	758493	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512556730
14496	NC_021490	CTC	2	6	758494	758499	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512556730
14497	NC_021490	TTA	2	6	758508	758513	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512556730
14498	NC_021490	CCT	2	6	758560	758565	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512556730
14499	NC_021490	TCT	2	6	758568	758573	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512556730
14500	NC_021490	AAG	2	6	758600	758605	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512556730

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