MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum str. Nichols

Total Repeats: 21924

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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13502	NC_021490	CTGCA	2	10	703377	703386	20 %	20 %	20 %	40 %	512556684
13503	NC_021490	AGA	2	6	703436	703441	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512556684
13504	NC_021490	AAAC	2	8	703456	703463	75 %	0 %	0 %	25 %	512556684
13505	NC_021490	CTG	2	6	703485	703490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556684
13506	NC_021490	CACC	2	8	703526	703533	25 %	0 %	0 %	75 %	512556684
13507	NC_021490	CACT	2	8	703535	703542	25 %	25 %	0 %	50 %	512556684
13508	NC_021490	ACCGA	2	10	703594	703603	40 %	0 %	20 %	40 %	512556684
13509	NC_021490	CA	3	6	703631	703636	50 %	0 %	0 %	50 %	512556684
13510	NC_021490	GTA	2	6	703647	703652	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556684
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13512	NC_021490	CT	3	6	703744	703749	0 %	50 %	0 %	50 %	512556684
13513	NC_021490	ATGT	2	8	703787	703794	25 %	50 %	25 %	0 %	512556684
13514	NC_021490	ACG	2	6	703799	703804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556684
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13517	NC_021490	A	6	6	703975	703980	100 %	0 %	0 %	0 %	512556684
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13520	NC_021490	CGA	2	6	704096	704101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556684
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13533	NC_021490	GC	3	6	704903	704908	0 %	0 %	50 %	50 %	512556685
13534	NC_021490	GC	3	6	704910	704915	0 %	0 %	50 %	50 %	512556685
13535	NC_021490	CA	3	6	704964	704969	50 %	0 %	0 %	50 %	512556685
13536	NC_021490	CTG	2	6	704970	704975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556685
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13554	NC_021490	GATC	2	8	705973	705980	25 %	25 %	25 %	25 %	512556685
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13557	NC_021490	AT	4	8	706143	706150	50 %	50 %	0 %	0 %	512556685
13558	NC_021490	CTTT	2	8	706196	706203	0 %	75 %	0 %	25 %	512556685
13559	NC_021490	TGC	2	6	706218	706223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556685
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13602	NC_021490	TGC	2	6	709118	709123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556689
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13624	NC_021490	A	6	6	710089	710094	100 %	0 %	0 %	0 %	512556689
13625	NC_021490	AGC	2	6	710220	710225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556690
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13632	NC_021490	CTA	2	6	710725	710730	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512556690
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13636	NC_021490	AGC	2	6	710895	710900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556690
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13744	NC_021490	CAT	2	6	719767	719772	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512556696
13745	NC_021490	CT	4	8	719843	719850	0 %	50 %	0 %	50 %	512556696
13746	NC_021490	GGC	2	6	719857	719862	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512556696
13747	NC_021490	CAT	2	6	719917	719922	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512556696
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13758	NC_021490	CCTGTA	2	12	720285	720296	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	512556697
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13764	NC_021490	AG	3	6	720531	720536	50 %	0 %	50 %	0 %	512556697
13765	NC_021490	TAT	2	6	720586	720591	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512556697
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13771	NC_021490	ATG	2	6	720691	720696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556697
13772	NC_021490	TGC	2	6	720720	720725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556697
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13774	NC_021490	GCAG	2	8	720777	720784	25 %	0 %	50 %	25 %	512556697
13775	NC_021490	CGGA	2	8	720833	720840	25 %	0 %	50 %	25 %	512556697
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13866	NC_021490	CTT	2	6	725933	725938	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512556703
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13982	NC_021490	CAGCAA	2	12	731896	731907	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	512556709
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13984	NC_021490	GCA	2	6	731922	731927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556709
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