MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum str. Nichols

Total Repeats: 21924

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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13002	NC_021490	CAC	2	6	679036	679041	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512556667
13003	NC_021490	GC	3	6	679047	679052	0 %	0 %	50 %	50 %	512556667
13004	NC_021490	GC	4	8	679080	679087	0 %	0 %	50 %	50 %	512556667
13005	NC_021490	CCG	2	6	679120	679125	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512556667
13006	NC_021490	GC	3	6	679154	679159	0 %	0 %	50 %	50 %	512556667
13007	NC_021490	CT	3	6	679174	679179	0 %	50 %	0 %	50 %	512556667
13008	NC_021490	GC	3	6	679196	679201	0 %	0 %	50 %	50 %	512556667
13009	NC_021490	CTG	2	6	679225	679230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556667
13010	NC_021490	GCT	2	6	679254	679259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556667
13011	NC_021490	GTGA	2	8	679369	679376	25 %	25 %	50 %	0 %	512556667
13012	NC_021490	CGC	2	6	679416	679421	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512556667
13013	NC_021490	A	6	6	679426	679431	100 %	0 %	0 %	0 %	512556667
13014	NC_021490	CAGG	2	8	679522	679529	25 %	0 %	50 %	25 %	512556667
13015	NC_021490	CCG	2	6	679532	679537	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512556667
13016	NC_021490	TGAG	2	8	679550	679557	25 %	25 %	50 %	0 %	512556667
13017	NC_021490	CGA	2	6	679572	679577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556667
13018	NC_021490	CA	3	6	679661	679666	50 %	0 %	0 %	50 %	512556667
13019	NC_021490	GAG	2	6	679672	679677	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512556667
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13021	NC_021490	CG	4	8	679697	679704	0 %	0 %	50 %	50 %	512556667
13022	NC_021490	GCA	2	6	679729	679734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556667
13023	NC_021490	GATG	2	8	679737	679744	25 %	25 %	50 %	0 %	512556667
13024	NC_021490	TTG	2	6	679750	679755	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512556667
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13026	NC_021490	CGCC	2	8	679929	679936	0 %	0 %	25 %	75 %	512556667
13027	NC_021490	CA	3	6	679979	679984	50 %	0 %	0 %	50 %	512556667
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13031	NC_021490	G	6	6	680063	680068	0 %	0 %	100 %	0 %	512556667
13032	NC_021490	CGC	2	6	680150	680155	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512556667
13033	NC_021490	CG	4	8	680177	680184	0 %	0 %	50 %	50 %	512556667
13034	NC_021490	CCA	2	6	680215	680220	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512556667
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13040	NC_021490	TGC	2	6	680442	680447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556668
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13046	NC_021490	TGCACG	2	12	680676	680687	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	512556668
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13053	NC_021490	CACG	2	8	680952	680959	25 %	0 %	25 %	50 %	512556668
13054	NC_021490	C	7	7	680982	680988	0 %	0 %	0 %	100 %	512556668
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13057	NC_021490	TGTT	2	8	681085	681092	0 %	75 %	25 %	0 %	512556668
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13060	NC_021490	CAG	2	6	681265	681270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556668
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13062	NC_021490	TTGC	2	8	681337	681344	0 %	50 %	25 %	25 %	512556668
13063	NC_021490	CGA	2	6	681369	681374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556668
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13066	NC_021490	CGA	2	6	681459	681464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556668
13067	NC_021490	CGGTGT	2	12	681474	681485	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	512556668
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13089	NC_021490	A	6	6	682453	682458	100 %	0 %	0 %	0 %	512556669
13090	NC_021490	AAG	2	6	682477	682482	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512556669
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13093	NC_021490	AGAC	2	8	682522	682529	50 %	0 %	25 %	25 %	512556669
13094	NC_021490	AAG	2	6	682531	682536	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512556669
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13105	NC_021490	AT	3	6	682832	682837	50 %	50 %	0 %	0 %	512556670
13106	NC_021490	TC	3	6	682870	682875	0 %	50 %	0 %	50 %	512556670
13107	NC_021490	AGC	2	6	682896	682901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556670
13108	NC_021490	AG	3	6	682930	682935	50 %	0 %	50 %	0 %	512556670
13109	NC_021490	TGA	2	6	683023	683028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556670
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13112	NC_021490	A	6	6	683262	683267	100 %	0 %	0 %	0 %	512556670
13113	NC_021490	CCAT	2	8	683379	683386	25 %	25 %	0 %	50 %	512556670
13114	NC_021490	TA	3	6	683451	683456	50 %	50 %	0 %	0 %	512556670
13115	NC_021490	T	6	6	683488	683493	0 %	100 %	0 %	0 %	512556670
13116	NC_021490	GACC	2	8	683506	683513	25 %	0 %	25 %	50 %	512556670
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13118	NC_021490	CTC	2	6	683617	683622	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512556670
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13239	NC_021490	T	6	6	689299	689304	0 %	100 %	0 %	0 %	512556673
13240	NC_021490	TCAC	2	8	689362	689369	25 %	25 %	0 %	50 %	512556673
13241	NC_021490	A	6	6	689572	689577	100 %	0 %	0 %	0 %	512556674
13242	NC_021490	CCCT	2	8	689755	689762	0 %	25 %	0 %	75 %	512556674
13243	NC_021490	TGCG	2	8	689765	689772	0 %	25 %	50 %	25 %	512556674
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13256	NC_021490	TTTTC	2	10	690387	690396	0 %	80 %	0 %	20 %	512556674
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13367	NC_021490	CA	4	8	696699	696706	50 %	0 %	0 %	50 %	512556679
13368	NC_021490	CG	3	6	696735	696740	0 %	0 %	50 %	50 %	512556679
13369	NC_021490	AC	3	6	696741	696746	50 %	0 %	0 %	50 %	512556679
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13486	NC_021490	GTCAG	2	10	702645	702654	20 %	20 %	40 %	20 %	512556683
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13488	NC_021490	TGC	2	6	702731	702736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556683
13489	NC_021490	GC	3	6	702773	702778	0 %	0 %	50 %	50 %	512556683
13490	NC_021490	CAC	2	6	702816	702821	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512556683
13491	NC_021490	AAG	3	9	702836	702844	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512556683
13492	NC_021490	ACA	2	6	702959	702964	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512556683
13493	NC_021490	AGG	2	6	702977	702982	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512556683
13494	NC_021490	CAG	2	6	703020	703025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556683
13495	NC_021490	GTC	2	6	703029	703034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556683
13496	NC_021490	AGA	2	6	703094	703099	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512556683
13497	NC_021490	GT	3	6	703217	703222	0 %	50 %	50 %	0 %	512556684
13498	NC_021490	GCAG	2	8	703253	703260	25 %	0 %	50 %	25 %	512556684
13499	NC_021490	TCC	2	6	703261	703266	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512556684
13500	NC_021490	CAA	2	6	703286	703291	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512556684

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