MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum str. Nichols

Total Repeats: 21924

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_021490	GCG	2	6	654445	654450	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512556645
12502	NC_021490	ACA	2	6	654473	654478	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512556645
12503	NC_021490	CAC	2	6	654492	654497	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512556645
12504	NC_021490	AAT	2	6	654504	654509	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512556645
12505	NC_021490	CT	4	8	654522	654529	0 %	50 %	0 %	50 %	512556646
12506	NC_021490	CA	3	6	654556	654561	50 %	0 %	0 %	50 %	512556646
12507	NC_021490	CTT	2	6	654589	654594	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512556646
12508	NC_021490	GC	3	6	654612	654617	0 %	0 %	50 %	50 %	512556646
12509	NC_021490	TCT	2	6	654621	654626	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512556646
12510	NC_021490	ACGC	2	8	654685	654692	25 %	0 %	25 %	50 %	512556646
12511	NC_021490	CCT	2	6	654697	654702	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512556646
12512	NC_021490	TGC	2	6	654707	654712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556646
12513	NC_021490	ACGC	2	8	654730	654737	25 %	0 %	25 %	50 %	512556646
12514	NC_021490	AGG	2	6	654848	654853	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512556646
12515	NC_021490	CAC	3	9	654971	654979	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512556646
12516	NC_021490	A	6	6	655004	655009	100 %	0 %	0 %	0 %	512556646
12517	NC_021490	TCT	2	6	655069	655074	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512556646
12518	NC_021490	ACC	2	6	655157	655162	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512556646
12519	NC_021490	GC	3	6	655195	655200	0 %	0 %	50 %	50 %	512556646
12520	NC_021490	AGC	2	6	655226	655231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556646
12521	NC_021490	TTG	2	6	655255	655260	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512556646
12522	NC_021490	GCA	2	6	655278	655283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556646
12523	NC_021490	CTTT	2	8	655311	655318	0 %	75 %	0 %	25 %	512556646
12524	NC_021490	AG	3	6	655359	655364	50 %	0 %	50 %	0 %	512556646
12525	NC_021490	CAG	2	6	655375	655380	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556646
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12528	NC_021490	TGCG	2	8	655438	655445	0 %	25 %	50 %	25 %	512556646
12529	NC_021490	CTT	2	6	655450	655455	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512556646
12530	NC_021490	CG	3	6	655501	655506	0 %	0 %	50 %	50 %	512556646
12531	NC_021490	CG	3	6	655515	655520	0 %	0 %	50 %	50 %	512556646
12532	NC_021490	CCA	2	6	655549	655554	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512556646
12533	NC_021490	TGC	2	6	655592	655597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556646
12534	NC_021490	CCGCC	2	10	655730	655739	0 %	0 %	20 %	80 %	512556647
12535	NC_021490	A	6	6	655747	655752	100 %	0 %	0 %	0 %	512556647
12536	NC_021490	TCA	2	6	655782	655787	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512556647
12537	NC_021490	CGACT	2	10	655789	655798	20 %	20 %	20 %	40 %	512556647
12538	NC_021490	CAGT	2	8	655815	655822	25 %	25 %	25 %	25 %	512556647
12539	NC_021490	AG	3	6	655858	655863	50 %	0 %	50 %	0 %	512556647
12540	NC_021490	TGT	2	6	655977	655982	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512556647
12541	NC_021490	A	8	8	656041	656048	100 %	0 %	0 %	0 %	512556647
12542	NC_021490	A	9	9	656091	656099	100 %	0 %	0 %	0 %	512556647
12543	NC_021490	AAG	2	6	656166	656171	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512556647
12544	NC_021490	A	7	7	656198	656204	100 %	0 %	0 %	0 %	512556647
12545	NC_021490	AGC	2	6	656213	656218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556647
12546	NC_021490	CAA	2	6	656317	656322	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512556647
12547	NC_021490	GCAT	2	8	656360	656367	25 %	25 %	25 %	25 %	512556647
12548	NC_021490	A	8	8	656471	656478	100 %	0 %	0 %	0 %	512556647
12549	NC_021490	GC	3	6	656554	656559	0 %	0 %	50 %	50 %	512556648
12550	NC_021490	TCT	2	6	656566	656571	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512556648
12551	NC_021490	A	6	6	656635	656640	100 %	0 %	0 %	0 %	512556648
12552	NC_021490	TGA	2	6	656669	656674	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556648
12553	NC_021490	GCG	2	6	656696	656701	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512556648
12554	NC_021490	CTT	2	6	656723	656728	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512556648
12555	NC_021490	TGC	2	6	656759	656764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556648
12556	NC_021490	T	6	6	656773	656778	0 %	100 %	0 %	0 %	512556648
12557	NC_021490	AGT	2	6	656829	656834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556648
12558	NC_021490	ACC	2	6	656969	656974	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512556648
12559	NC_021490	TCA	2	6	656984	656989	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512556648
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12561	NC_021490	CCG	2	6	657108	657113	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512556648
12562	NC_021490	TCCA	2	8	657162	657169	25 %	25 %	0 %	50 %	512556648
12563	NC_021490	TGA	2	6	657170	657175	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556648
12564	NC_021490	TGC	2	6	657184	657189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556648
12565	NC_021490	CTG	2	6	657286	657291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556649
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12567	NC_021490	CG	3	6	657379	657384	0 %	0 %	50 %	50 %	512556649
12568	NC_021490	CG	4	8	657398	657405	0 %	0 %	50 %	50 %	512556649
12569	NC_021490	CCTG	2	8	657406	657413	0 %	25 %	25 %	50 %	512556649
12570	NC_021490	TCCT	2	8	657420	657427	0 %	50 %	0 %	50 %	512556649
12571	NC_021490	GGA	2	6	657444	657449	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512556649
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12574	NC_021490	TAG	2	6	657621	657626	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556649
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12578	NC_021490	CACT	2	8	657849	657856	25 %	25 %	0 %	50 %	512556650
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12588	NC_021490	GGA	2	6	658212	658217	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512556650
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12590	NC_021490	CG	3	6	658337	658342	0 %	0 %	50 %	50 %	512556650
12591	NC_021490	CCA	3	9	658352	658360	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512556650
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12594	NC_021490	CAG	2	6	658553	658558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556650
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12601	NC_021490	CTC	2	6	658884	658889	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512556651
12602	NC_021490	AGG	2	6	658890	658895	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512556651
12603	NC_021490	CTC	2	6	658971	658976	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512556651
12604	NC_021490	CCA	2	6	659129	659134	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512556651
12605	NC_021490	CAA	2	6	659138	659143	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512556651
12606	NC_021490	CTCGC	2	10	659156	659165	0 %	20 %	20 %	60 %	512556651
12607	NC_021490	GCC	2	6	659241	659246	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512556651
12608	NC_021490	CCT	2	6	659291	659296	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512556651
12609	NC_021490	AG	3	6	659301	659306	50 %	0 %	50 %	0 %	512556651
12610	NC_021490	TCT	2	6	659342	659347	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512556651
12611	NC_021490	TGG	2	6	659372	659377	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512556651
12612	NC_021490	GCC	2	6	659394	659399	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512556651
12613	NC_021490	GCGCT	2	10	659433	659442	0 %	20 %	40 %	40 %	512556651
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12616	NC_021490	CAAA	2	8	659483	659490	75 %	0 %	0 %	25 %	512556651
12617	NC_021490	ATG	2	6	659569	659574	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556651
12618	NC_021490	CCTGA	2	10	659628	659637	20 %	20 %	20 %	40 %	512556651
12619	NC_021490	CAC	2	6	659679	659684	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512556651
12620	NC_021490	GCC	2	6	660062	660067	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512556652
12621	NC_021490	CAC	2	6	660083	660088	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512556652
12622	NC_021490	GC	3	6	660094	660099	0 %	0 %	50 %	50 %	512556652
12623	NC_021490	GC	3	6	660102	660107	0 %	0 %	50 %	50 %	512556652
12624	NC_021490	CCA	2	6	660154	660159	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512556652
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12626	NC_021490	GA	3	6	660221	660226	50 %	0 %	50 %	0 %	512556652
12627	NC_021490	CCG	2	6	660325	660330	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512556652
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12630	NC_021490	CAG	2	6	660490	660495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556652
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12634	NC_021490	CAC	2	6	660620	660625	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512556652
12635	NC_021490	TCA	2	6	660661	660666	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512556652
12636	NC_021490	CTG	2	6	660716	660721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556652
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12651	NC_021490	GC	3	6	661611	661616	0 %	0 %	50 %	50 %	512556653
12652	NC_021490	CTG	2	6	661646	661651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556653
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12659	NC_021490	GGCA	2	8	661920	661927	25 %	0 %	50 %	25 %	512556653
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12662	NC_021490	GC	3	6	661972	661977	0 %	0 %	50 %	50 %	512556653
12663	NC_021490	GCC	2	6	662078	662083	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512556653
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12675	NC_021490	CG	3	6	662347	662352	0 %	0 %	50 %	50 %	512556653
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12688	NC_021490	GTC	2	6	663027	663032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556654
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12714	NC_021490	CTTG	2	8	664254	664261	0 %	50 %	25 %	25 %	512556654
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12717	NC_021490	CA	4	8	664416	664423	50 %	0 %	0 %	50 %	512556654
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12729	NC_021490	ACG	2	6	665279	665284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556655
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12731	NC_021490	CGG	2	6	665305	665310	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512556655
12732	NC_021490	TC	3	6	665319	665324	0 %	50 %	0 %	50 %	512556655
12733	NC_021490	GAG	2	6	665362	665367	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512556655
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12735	NC_021490	TGCG	2	8	665435	665442	0 %	25 %	50 %	25 %	512556655
12736	NC_021490	CG	3	6	665480	665485	0 %	0 %	50 %	50 %	512556655
12737	NC_021490	GA	3	6	665510	665515	50 %	0 %	50 %	0 %	512556655
12738	NC_021490	A	8	8	665515	665522	100 %	0 %	0 %	0 %	512556655
12739	NC_021490	ATC	2	6	665662	665667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512556655
12740	NC_021490	GTG	2	6	665707	665712	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512556655
12741	NC_021490	TCG	2	6	665720	665725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556655
12742	NC_021490	AGG	2	6	665820	665825	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512556655
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12744	NC_021490	ACCTAC	2	12	666024	666035	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	512556656
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