MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum str. Nichols

Total Repeats: 21924

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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12002	NC_021490	CTG	2	6	629534	629539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556626
12003	NC_021490	ACA	2	6	629651	629656	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512556626
12004	NC_021490	GCA	2	6	629659	629664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556626
12005	NC_021490	GC	3	6	629756	629761	0 %	0 %	50 %	50 %	512556626
12006	NC_021490	GC	3	6	629981	629986	0 %	0 %	50 %	50 %	512556626
12007	NC_021490	CCT	2	6	629989	629994	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512556626
12008	NC_021490	CCT	2	6	629998	630003	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512556626
12009	NC_021490	CCGG	2	8	630007	630014	0 %	0 %	50 %	50 %	512556626
12010	NC_021490	GC	3	6	630115	630120	0 %	0 %	50 %	50 %	512556626
12011	NC_021490	CG	3	6	630166	630171	0 %	0 %	50 %	50 %	512556626
12012	NC_021490	CGA	2	6	630201	630206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556626
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12014	NC_021490	GAA	2	6	630223	630228	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512556626
12015	NC_021490	ACG	2	6	630279	630284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556627
12016	NC_021490	T	6	6	630319	630324	0 %	100 %	0 %	0 %	512556627
12017	NC_021490	GC	3	6	630326	630331	0 %	0 %	50 %	50 %	512556627
12018	NC_021490	GCT	2	6	630339	630344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556627
12019	NC_021490	AG	3	6	630375	630380	50 %	0 %	50 %	0 %	512556627
12020	NC_021490	CA	3	6	630387	630392	50 %	0 %	0 %	50 %	512556627
12021	NC_021490	CGC	2	6	630402	630407	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512556627
12022	NC_021490	GC	3	6	630406	630411	0 %	0 %	50 %	50 %	512556627
12023	NC_021490	CTG	2	6	630560	630565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556627
12024	NC_021490	GCC	2	6	630616	630621	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512556627
12025	NC_021490	GCA	2	6	630637	630642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556627
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12029	NC_021490	CTG	2	6	630716	630721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556627
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12034	NC_021490	CAT	2	6	631014	631019	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512556627
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12037	NC_021490	GTTT	2	8	631098	631105	0 %	75 %	25 %	0 %	512556627
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12041	NC_021490	GC	3	6	631195	631200	0 %	0 %	50 %	50 %	512556628
12042	NC_021490	A	6	6	631249	631254	100 %	0 %	0 %	0 %	512556628
12043	NC_021490	TCC	2	6	631272	631277	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512556628
12044	NC_021490	TCA	2	6	631389	631394	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512556628
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12046	NC_021490	ACCAC	2	10	631581	631590	40 %	0 %	0 %	60 %	512556628
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12049	NC_021490	TCG	2	6	631630	631635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556628
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12051	NC_021490	ACGC	2	8	631669	631676	25 %	0 %	25 %	50 %	512556628
12052	NC_021490	ACGCGC	2	12	631690	631701	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	512556628
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12056	NC_021490	GGAA	2	8	631864	631871	50 %	0 %	50 %	0 %	512556628
12057	NC_021490	GC	4	8	631962	631969	0 %	0 %	50 %	50 %	512556629
12058	NC_021490	T	8	8	631994	632001	0 %	100 %	0 %	0 %	512556629
12059	NC_021490	CAG	2	6	632065	632070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556629
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12063	NC_021490	GTAC	2	8	632374	632381	25 %	25 %	25 %	25 %	512556629
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12067	NC_021490	T	7	7	632670	632676	0 %	100 %	0 %	0 %	512556629
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12094	NC_021490	CAG	2	6	633833	633838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556630
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12105	NC_021490	GATG	2	8	634292	634299	25 %	25 %	50 %	0 %	512556631
12106	NC_021490	G	6	6	634345	634350	0 %	0 %	100 %	0 %	512556631
12107	NC_021490	T	8	8	634374	634381	0 %	100 %	0 %	0 %	512556631
12108	NC_021490	AC	3	6	634455	634460	50 %	0 %	0 %	50 %	512556631
12109	NC_021490	AGG	2	6	634539	634544	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512556631
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12114	NC_021490	CTTT	2	8	634684	634691	0 %	75 %	0 %	25 %	512556631
12115	NC_021490	ATCG	2	8	634802	634809	25 %	25 %	25 %	25 %	512556631
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12121	NC_021490	CAT	2	6	635283	635288	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512556631
12122	NC_021490	GAA	2	6	635442	635447	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512556632
12123	NC_021490	TGC	2	6	635581	635586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556632
12124	NC_021490	T	6	6	635729	635734	0 %	100 %	0 %	0 %	512556632
12125	NC_021490	ACT	2	6	635740	635745	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512556632
12126	NC_021490	ACC	2	6	635835	635840	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512556632
12127	NC_021490	AC	3	6	635851	635856	50 %	0 %	0 %	50 %	512556632
12128	NC_021490	GCT	2	6	635892	635897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556632
12129	NC_021490	CAGCA	2	10	635963	635972	40 %	0 %	20 %	40 %	512556632
12130	NC_021490	CAA	2	6	636065	636070	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512556632
12131	NC_021490	GA	3	6	636161	636166	50 %	0 %	50 %	0 %	512556632
12132	NC_021490	TCC	2	6	636205	636210	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512556632
12133	NC_021490	GAA	2	6	636219	636224	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512556632
12134	NC_021490	TCT	2	6	636225	636230	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512556632
12135	NC_021490	TAC	2	6	636274	636279	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512556632
12136	NC_021490	GAG	2	6	636351	636356	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512556632
12137	NC_021490	GGC	2	6	636374	636379	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512556632
12138	NC_021490	CTT	2	6	636380	636385	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512556632
12139	NC_021490	GTC	3	9	636453	636461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556632
12140	NC_021490	GT	3	6	636530	636535	0 %	50 %	50 %	0 %	512556632
12141	NC_021490	AGC	2	6	636604	636609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556632
12142	NC_021490	TGA	2	6	636674	636679	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556632
12143	NC_021490	TAC	2	6	636681	636686	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512556632
12144	NC_021490	GC	3	6	636707	636712	0 %	0 %	50 %	50 %	512556632
12145	NC_021490	CAC	2	6	636749	636754	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512556632
12146	NC_021490	CGC	2	6	636862	636867	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512556633
12147	NC_021490	GTA	2	6	636880	636885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556633
12148	NC_021490	CTT	2	6	636892	636897	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512556633
12149	NC_021490	CT	3	6	636905	636910	0 %	50 %	0 %	50 %	512556633
12150	NC_021490	TTCC	2	8	636911	636918	0 %	50 %	0 %	50 %	512556633
12151	NC_021490	A	10	10	636920	636929	100 %	0 %	0 %	0 %	512556633
12152	NC_021490	CGC	2	6	636938	636943	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512556633
12153	NC_021490	GAAA	2	8	636955	636962	75 %	0 %	25 %	0 %	512556633
12154	NC_021490	CG	3	6	637019	637024	0 %	0 %	50 %	50 %	512556633
12155	NC_021490	GCT	2	6	637038	637043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556633
12156	NC_021490	TTTC	2	8	637170	637177	0 %	75 %	0 %	25 %	512556633
12157	NC_021490	GAATG	2	10	637240	637249	40 %	20 %	40 %	0 %	512556633
12158	NC_021490	T	6	6	637263	637268	0 %	100 %	0 %	0 %	512556633
12159	NC_021490	CAG	2	6	637385	637390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556633
12160	NC_021490	TTCA	2	8	637396	637403	25 %	50 %	0 %	25 %	512556633
12161	NC_021490	CAC	2	6	637414	637419	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512556633
12162	NC_021490	CCACC	2	10	637434	637443	20 %	0 %	0 %	80 %	512556633
12163	NC_021490	CG	3	6	637470	637475	0 %	0 %	50 %	50 %	512556633
12164	NC_021490	CA	3	6	637493	637498	50 %	0 %	0 %	50 %	512556633
12165	NC_021490	ACA	2	6	637536	637541	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512556633
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12170	NC_021490	TATT	2	8	637855	637862	25 %	75 %	0 %	0 %	512556633
12171	NC_021490	GTA	2	6	637912	637917	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556633
12172	NC_021490	GC	4	8	637933	637940	0 %	0 %	50 %	50 %	512556633
12173	NC_021490	CG	3	6	637942	637947	0 %	0 %	50 %	50 %	512556633
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12176	NC_021490	CTG	2	6	638254	638259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556633
12177	NC_021490	TCG	2	6	638289	638294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556633
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12188	NC_021490	CAGA	2	8	638905	638912	50 %	0 %	25 %	25 %	512556634
12189	NC_021490	GAA	2	6	639083	639088	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512556634
12190	NC_021490	TGC	2	6	639101	639106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556634
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12197	NC_021490	CAATC	2	10	639535	639544	40 %	20 %	0 %	40 %	512556634
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12199	NC_021490	GTC	2	6	639770	639775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556634
12200	NC_021490	CG	3	6	639811	639816	0 %	0 %	50 %	50 %	512556634
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12211	NC_021490	GTC	2	6	640496	640501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556634
12212	NC_021490	TGA	2	6	640507	640512	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556634
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12226	NC_021490	GCACAC	2	12	640960	640971	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	512556634
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12228	NC_021490	GTG	2	6	641036	641041	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512556634
12229	NC_021490	CCG	2	6	641124	641129	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512556634
12230	NC_021490	GCA	2	6	641152	641157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556634
12231	NC_021490	TG	3	6	641242	641247	0 %	50 %	50 %	0 %	512556635
12232	NC_021490	GTCT	2	8	641336	641343	0 %	50 %	25 %	25 %	512556635
12233	NC_021490	GC	3	6	641397	641402	0 %	0 %	50 %	50 %	512556635
12234	NC_021490	TCC	2	6	641469	641474	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512556635
12235	NC_021490	AGC	2	6	641559	641564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556635
12236	NC_021490	TCT	2	6	641634	641639	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512556635
12237	NC_021490	TG	3	6	641642	641647	0 %	50 %	50 %	0 %	512556635
12238	NC_021490	GCG	2	6	641681	641686	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512556635
12239	NC_021490	A	8	8	641696	641703	100 %	0 %	0 %	0 %	512556635
12240	NC_021490	GTT	2	6	641741	641746	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512556635
12241	NC_021490	CCA	2	6	641749	641754	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512556635
12242	NC_021490	AAG	2	6	641759	641764	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512556635
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12244	NC_021490	A	9	9	641804	641812	100 %	0 %	0 %	0 %	512556635
12245	NC_021490	T	6	6	641831	641836	0 %	100 %	0 %	0 %	512556635
12246	NC_021490	AAC	2	6	641844	641849	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512556635
12247	NC_021490	A	6	6	641854	641859	100 %	0 %	0 %	0 %	512556635
12248	NC_021490	GC	3	6	641943	641948	0 %	0 %	50 %	50 %	512556635
12249	NC_021490	GCC	2	6	641951	641956	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512556635
12250	NC_021490	CTT	2	6	641996	642001	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512556635
12251	NC_021490	CG	3	6	642141	642146	0 %	0 %	50 %	50 %	512556635
12252	NC_021490	CCT	2	6	642151	642156	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512556635
12253	NC_021490	GCA	2	6	642348	642353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556636
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12258	NC_021490	ATA	2	6	642631	642636	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512556637
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12263	NC_021490	TAG	2	6	642813	642818	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556637
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12267	NC_021490	TGA	2	6	642942	642947	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556637
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12274	NC_021490	AAAG	2	8	643211	643218	75 %	0 %	25 %	0 %	512556637
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12361	NC_021490	AATT	2	8	648009	648016	50 %	50 %	0 %	0 %	512556640
12362	NC_021490	CCA	2	6	648059	648064	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512556640
12363	NC_021490	ACCA	2	8	648112	648119	50 %	0 %	0 %	50 %	512556640
12364	NC_021490	CTT	2	6	648142	648147	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512556640
12365	NC_021490	ACC	2	6	648179	648184	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512556640
12366	NC_021490	TCA	2	6	648284	648289	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512556640
12367	NC_021490	CA	4	8	648382	648389	50 %	0 %	0 %	50 %	512556640
12368	NC_021490	GCCC	2	8	648428	648435	0 %	0 %	25 %	75 %	512556640
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12374	NC_021490	CTC	2	6	648711	648716	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512556641
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12477	NC_021490	A	6	6	653179	653184	100 %	0 %	0 %	0 %	512556645
12478	NC_021490	CGT	2	6	653189	653194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556645
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12484	NC_021490	AG	4	8	653357	653364	50 %	0 %	50 %	0 %	512556645
12485	NC_021490	A	6	6	653410	653415	100 %	0 %	0 %	0 %	512556645
12486	NC_021490	CTG	2	6	653484	653489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556645
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12488	NC_021490	A	7	7	653580	653586	100 %	0 %	0 %	0 %	512556645
12489	NC_021490	GCA	2	6	653696	653701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556645
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12492	NC_021490	AGC	2	6	653737	653742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556645
12493	NC_021490	GCA	2	6	653824	653829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556645
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