MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum str. Nichols

Total Repeats: 21924

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_021490	T	7	7	605838	605844	0 %	100 %	0 %	0 %	512556608
11502	NC_021490	GGC	2	6	605845	605850	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512556608
11503	NC_021490	CG	3	6	605856	605861	0 %	0 %	50 %	50 %	512556608
11504	NC_021490	TGC	2	6	605891	605896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556608
11505	NC_021490	GCC	2	6	605929	605934	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512556608
11506	NC_021490	CG	3	6	605965	605970	0 %	0 %	50 %	50 %	512556608
11507	NC_021490	TGG	2	6	605971	605976	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512556608
11508	NC_021490	T	6	6	606047	606052	0 %	100 %	0 %	0 %	512556608
11509	NC_021490	GGA	2	6	606065	606070	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512556608
11510	NC_021490	TG	3	6	606078	606083	0 %	50 %	50 %	0 %	512556608
11511	NC_021490	GCG	2	6	606112	606117	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512556608
11512	NC_021490	CA	3	6	606182	606187	50 %	0 %	0 %	50 %	512556608
11513	NC_021490	GCAC	2	8	606190	606197	25 %	0 %	25 %	50 %	512556608
11514	NC_021490	CTT	2	6	606237	606242	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512556608
11515	NC_021490	TC	4	8	606251	606258	0 %	50 %	0 %	50 %	512556608
11516	NC_021490	CGGG	2	8	606287	606294	0 %	0 %	75 %	25 %	512556608
11517	NC_021490	GC	3	6	606317	606322	0 %	0 %	50 %	50 %	512556608
11518	NC_021490	GT	3	6	606331	606336	0 %	50 %	50 %	0 %	512556608
11519	NC_021490	TTTA	2	8	606390	606397	25 %	75 %	0 %	0 %	512556608
11520	NC_021490	CTG	2	6	606404	606409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556608
11521	NC_021490	GTT	2	6	606411	606416	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512556608
11522	NC_021490	TGA	2	6	606419	606424	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556608
11523	NC_021490	T	6	6	606545	606550	0 %	100 %	0 %	0 %	512556608
11524	NC_021490	AGA	2	6	606560	606565	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512556608
11525	NC_021490	CT	3	6	606589	606594	0 %	50 %	0 %	50 %	512556608
11526	NC_021490	GTG	2	6	606728	606733	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512556609
11527	NC_021490	AAG	2	6	606779	606784	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512556609
11528	NC_021490	GCAG	2	8	606869	606876	25 %	0 %	50 %	25 %	512556609
11529	NC_021490	CCT	2	6	606897	606902	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512556609
11530	NC_021490	ACC	2	6	606914	606919	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512556609
11531	NC_021490	CTG	2	6	606941	606946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556609
11532	NC_021490	GCT	3	9	606962	606970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556609
11533	NC_021490	CGCT	2	8	607026	607033	0 %	25 %	25 %	50 %	512556609
11534	NC_021490	GC	3	6	607034	607039	0 %	0 %	50 %	50 %	512556609
11535	NC_021490	GGCGC	2	10	607066	607075	0 %	0 %	60 %	40 %	512556609
11536	NC_021490	CCA	2	6	607135	607140	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512556609
11537	NC_021490	CAT	2	6	607166	607171	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512556609
11538	NC_021490	GCGCGA	2	12	607198	607209	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	512556609
11539	NC_021490	CGG	2	6	607291	607296	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512556609
11540	NC_021490	CTGT	2	8	607351	607358	0 %	50 %	25 %	25 %	512556609
11541	NC_021490	CCT	2	6	607382	607387	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512556609
11542	NC_021490	GC	3	6	607427	607432	0 %	0 %	50 %	50 %	512556609
11543	NC_021490	GACA	2	8	607468	607475	50 %	0 %	25 %	25 %	512556609
11544	NC_021490	AC	3	6	607493	607498	50 %	0 %	0 %	50 %	512556609
11545	NC_021490	GCCCCT	2	12	607499	607510	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	512556609
11546	NC_021490	ATG	2	6	607538	607543	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556609
11547	NC_021490	GC	3	6	607573	607578	0 %	0 %	50 %	50 %	512556609
11548	NC_021490	CCGC	2	8	607675	607682	0 %	0 %	25 %	75 %	512556609
11549	NC_021490	AGA	2	6	607699	607704	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512556609
11550	NC_021490	TAT	2	6	607705	607710	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512556609
11551	NC_021490	GTAC	2	8	607731	607738	25 %	25 %	25 %	25 %	512556609
11552	NC_021490	TCCG	2	8	607749	607756	0 %	25 %	25 %	50 %	512556609
11553	NC_021490	CTG	2	6	607765	607770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556609
11554	NC_021490	AGA	2	6	607813	607818	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512556609
11555	NC_021490	AGA	2	6	607861	607866	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512556609
11556	NC_021490	ACGC	2	8	607885	607892	25 %	0 %	25 %	50 %	512556609
11557	NC_021490	ATT	2	6	608005	608010	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512556610
11558	NC_021490	CCA	2	6	608012	608017	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512556610
11559	NC_021490	CGG	2	6	608024	608029	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512556610
11560	NC_021490	CTC	2	6	608162	608167	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512556610
11561	NC_021490	CTG	2	6	608195	608200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556610
11562	NC_021490	CACACG	2	12	608232	608243	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	512556610
11563	NC_021490	CTC	2	6	608352	608357	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512556610
11564	NC_021490	AC	3	6	608424	608429	50 %	0 %	0 %	50 %	512556610
11565	NC_021490	GCA	2	6	608444	608449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556610
11566	NC_021490	TCT	2	6	608476	608481	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512556610
11567	NC_021490	CAG	2	6	608486	608491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556610
11568	NC_021490	CGCA	2	8	608517	608524	25 %	0 %	25 %	50 %	512556610
11569	NC_021490	AGCG	2	8	608529	608536	25 %	0 %	50 %	25 %	512556610
11570	NC_021490	TCT	2	6	608563	608568	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512556610
11571	NC_021490	AGT	2	6	608648	608653	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556610
11572	NC_021490	A	6	6	608657	608662	100 %	0 %	0 %	0 %	512556610
11573	NC_021490	ACGC	2	8	608681	608688	25 %	0 %	25 %	50 %	512556610
11574	NC_021490	CCG	2	6	608692	608697	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512556610
11575	NC_021490	GCC	2	6	608760	608765	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512556610
11576	NC_021490	CAGAG	2	10	608861	608870	40 %	0 %	40 %	20 %	512556610
11577	NC_021490	GACA	2	8	608933	608940	50 %	0 %	25 %	25 %	512556610
11578	NC_021490	AGCT	2	8	608946	608953	25 %	25 %	25 %	25 %	512556610
11579	NC_021490	AGC	2	6	608982	608987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556610
11580	NC_021490	A	7	7	609114	609120	100 %	0 %	0 %	0 %	512556610
11581	NC_021490	T	6	6	609148	609153	0 %	100 %	0 %	0 %	512556610
11582	NC_021490	CT	3	6	609156	609161	0 %	50 %	0 %	50 %	512556610
11583	NC_021490	CG	3	6	609196	609201	0 %	0 %	50 %	50 %	512556610
11584	NC_021490	AAT	2	6	609231	609236	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512556610
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11586	NC_021490	ATA	2	6	609295	609300	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512556610
11587	NC_021490	GCA	2	6	609326	609331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556610
11588	NC_021490	GCCA	2	8	609335	609342	25 %	0 %	25 %	50 %	512556610
11589	NC_021490	TCA	2	6	609415	609420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512556610
11590	NC_021490	A	6	6	609422	609427	100 %	0 %	0 %	0 %	512556610
11591	NC_021490	GTG	2	6	609522	609527	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512556610
11592	NC_021490	TCA	2	6	609544	609549	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512556610
11593	NC_021490	GTT	2	6	609628	609633	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512556610
11594	NC_021490	CGT	2	6	609722	609727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556610
11595	NC_021490	GCA	2	6	609745	609750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556610
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11597	NC_021490	CTG	2	6	609863	609868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556610
11598	NC_021490	CG	3	6	609948	609953	0 %	0 %	50 %	50 %	512556610
11599	NC_021490	CTT	2	6	609959	609964	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512556610
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11602	NC_021490	CTC	2	6	610138	610143	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512556611
11603	NC_021490	CGC	2	6	610200	610205	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512556611
11604	NC_021490	GAA	2	6	610214	610219	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512556611
11605	NC_021490	C	6	6	610257	610262	0 %	0 %	0 %	100 %	512556611
11606	NC_021490	A	6	6	610270	610275	100 %	0 %	0 %	0 %	512556611
11607	NC_021490	GCA	2	6	610276	610281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556611
11608	NC_021490	GAA	2	6	610283	610288	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512556611
11609	NC_021490	CTG	2	6	610364	610369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556611
11610	NC_021490	AC	3	6	610420	610425	50 %	0 %	0 %	50 %	512556611
11611	NC_021490	TGCA	2	8	610484	610491	25 %	25 %	25 %	25 %	512556611
11612	NC_021490	CG	4	8	610547	610554	0 %	0 %	50 %	50 %	512556611
11613	NC_021490	CAA	2	6	610657	610662	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512556611
11614	NC_021490	GC	3	6	610763	610768	0 %	0 %	50 %	50 %	512556611
11615	NC_021490	CCT	2	6	610801	610806	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512556611
11616	NC_021490	GCC	2	6	610821	610826	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512556611
11617	NC_021490	ACC	2	6	610833	610838	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512556611
11618	NC_021490	AG	4	8	610844	610851	50 %	0 %	50 %	0 %	512556611
11619	NC_021490	GC	3	6	610874	610879	0 %	0 %	50 %	50 %	512556611
11620	NC_021490	GCA	2	6	610887	610892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556611
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11622	NC_021490	ATAC	2	8	610905	610912	50 %	25 %	0 %	25 %	512556611
11623	NC_021490	GTT	2	6	611123	611128	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512556612
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11625	NC_021490	GCA	3	9	611227	611235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556612
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11731	NC_021490	A	8	8	616297	616304	100 %	0 %	0 %	0 %	512556616
11732	NC_021490	CA	3	6	616308	616313	50 %	0 %	0 %	50 %	512556616
11733	NC_021490	AAATAC	2	12	616352	616363	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	512556616
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11737	NC_021490	AGAA	2	8	616609	616616	75 %	0 %	25 %	0 %	512556616
11738	NC_021490	ACC	2	6	616661	616666	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512556616
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11741	NC_021490	A	7	7	616780	616786	100 %	0 %	0 %	0 %	512556616
11742	NC_021490	CT	3	6	616816	616821	0 %	50 %	0 %	50 %	512556616
11743	NC_021490	AT	3	6	616902	616907	50 %	50 %	0 %	0 %	512556616
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11867	NC_021490	TCA	2	6	622479	622484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512556621
11868	NC_021490	ACC	2	6	622527	622532	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512556621
11869	NC_021490	AC	3	6	622594	622599	50 %	0 %	0 %	50 %	512556621
11870	NC_021490	ACAA	2	8	622630	622637	75 %	0 %	0 %	25 %	512556621
11871	NC_021490	CCG	2	6	622648	622653	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512556621
11872	NC_021490	CGGTTG	2	12	622669	622680	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	512556622
11873	NC_021490	ATT	2	6	622706	622711	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512556622
11874	NC_021490	CTCA	2	8	622732	622739	25 %	25 %	0 %	50 %	512556622
11875	NC_021490	GCC	2	6	622775	622780	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512556622
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11877	NC_021490	ATC	2	6	622813	622818	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512556622
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11880	NC_021490	CCG	2	6	623049	623054	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512556622
11881	NC_021490	GCA	2	6	623106	623111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556622
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11884	NC_021490	CGGT	2	8	623181	623188	0 %	25 %	50 %	25 %	512556622
11885	NC_021490	AGG	2	6	623189	623194	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512556622
11886	NC_021490	AAAGG	2	10	623197	623206	60 %	0 %	40 %	0 %	512556622
11887	NC_021490	TCA	2	6	623316	623321	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512556622
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11889	NC_021490	CGCA	2	8	623467	623474	25 %	0 %	25 %	50 %	512556622
11890	NC_021490	GCT	2	6	623487	623492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556622
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11894	NC_021490	CAGA	2	8	623666	623673	50 %	0 %	25 %	25 %	512556622
11895	NC_021490	GC	3	6	623700	623705	0 %	0 %	50 %	50 %	512556622
11896	NC_021490	CGCA	2	8	623876	623883	25 %	0 %	25 %	50 %	512556623
11897	NC_021490	AACCT	2	10	623901	623910	40 %	20 %	0 %	40 %	512556623
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11899	NC_021490	GCA	2	6	624021	624026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556623
11900	NC_021490	TCCGCG	2	12	624039	624050	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	512556623
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11902	NC_021490	GTA	2	6	624167	624172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556623
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11907	NC_021490	TCA	2	6	624346	624351	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512556623
11908	NC_021490	TGC	2	6	624490	624495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556623
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11940	NC_021490	CGT	2	6	626452	626457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556624
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11989	NC_021490	A	7	7	628866	628872	100 %	0 %	0 %	0 %	512556626
11990	NC_021490	TTTC	2	8	628888	628895	0 %	75 %	0 %	25 %	512556626
11991	NC_021490	AGCGCG	2	12	628907	628918	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	512556626
11992	NC_021490	GAA	2	6	628933	628938	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512556626
11993	NC_021490	GC	4	8	628977	628984	0 %	0 %	50 %	50 %	512556626
11994	NC_021490	CG	3	6	629019	629024	0 %	0 %	50 %	50 %	512556626
11995	NC_021490	GCA	2	6	629038	629043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556626
11996	NC_021490	CG	4	8	629110	629117	0 %	0 %	50 %	50 %	512556626
11997	NC_021490	A	8	8	629219	629226	100 %	0 %	0 %	0 %	512556626
11998	NC_021490	TC	3	6	629281	629286	0 %	50 %	0 %	50 %	512556626
11999	NC_021490	TCC	2	6	629439	629444	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512556626
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