MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum str. Nichols

Total Repeats: 21924

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_021490	ACC	2	6	581297	581302	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512556587
11002	NC_021490	C	6	6	581610	581615	0 %	0 %	0 %	100 %	512556588
11003	NC_021490	CTG	2	6	581659	581664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556588
11004	NC_021490	TCC	2	6	581675	581680	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512556588
11005	NC_021490	ACC	2	6	581952	581957	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512556588
11006	NC_021490	AC	3	6	581959	581964	50 %	0 %	0 %	50 %	512556588
11007	NC_021490	TCC	2	6	582015	582020	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512556588
11008	NC_021490	TCCC	2	8	582073	582080	0 %	25 %	0 %	75 %	512556588
11009	NC_021490	GAT	2	6	582083	582088	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556588
11010	NC_021490	AGA	2	6	582134	582139	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512556588
11011	NC_021490	CAC	2	6	582148	582153	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512556588
11012	NC_021490	CCA	2	6	582163	582168	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512556588
11013	NC_021490	ACC	2	6	582264	582269	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512556588
11014	NC_021490	CAT	2	6	582304	582309	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512556588
11015	NC_021490	CTT	2	6	582494	582499	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512556588
11016	NC_021490	AATG	2	8	582542	582549	50 %	25 %	25 %	0 %	512556588
11017	NC_021490	TCTT	2	8	582573	582580	0 %	75 %	0 %	25 %	512556588
11018	NC_021490	GAT	2	6	582662	582667	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556588
11019	NC_021490	CTG	2	6	582685	582690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556588
11020	NC_021490	CG	3	6	582697	582702	0 %	0 %	50 %	50 %	512556588
11021	NC_021490	GTC	2	6	582704	582709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556588
11022	NC_021490	ACCAT	2	10	582714	582723	40 %	20 %	0 %	40 %	512556588
11023	NC_021490	ACA	2	6	582756	582761	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512556588
11024	NC_021490	CAT	2	6	582800	582805	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512556588
11025	NC_021490	CTC	2	6	582806	582811	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512556589
11026	NC_021490	A	7	7	582872	582878	100 %	0 %	0 %	0 %	512556589
11027	NC_021490	TCGG	2	8	582894	582901	0 %	25 %	50 %	25 %	512556589
11028	NC_021490	CCTG	2	8	582922	582929	0 %	25 %	25 %	50 %	512556589
11029	NC_021490	TTG	2	6	582973	582978	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512556589
11030	NC_021490	GTT	2	6	583386	583391	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512556590
11031	NC_021490	ATCT	2	8	583468	583475	25 %	50 %	0 %	25 %	512556590
11032	NC_021490	CTT	2	6	583506	583511	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512556590
11033	NC_021490	AAAG	2	8	583536	583543	75 %	0 %	25 %	0 %	512556590
11034	NC_021490	GCT	2	6	583560	583565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556590
11035	NC_021490	ATT	2	6	583568	583573	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512556590
11036	NC_021490	CCG	2	6	583627	583632	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512556590
11037	NC_021490	ACGG	2	8	583786	583793	25 %	0 %	50 %	25 %	512556591
11038	NC_021490	AAG	2	6	583803	583808	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512556591
11039	NC_021490	TGT	2	6	584057	584062	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512556591
11040	NC_021490	TAG	2	6	584066	584071	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556591
11041	NC_021490	GAA	3	9	584092	584100	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512556591
11042	NC_021490	TTGC	2	8	584116	584123	0 %	50 %	25 %	25 %	512556591
11043	NC_021490	A	6	6	584132	584137	100 %	0 %	0 %	0 %	512556591
11044	NC_021490	CG	3	6	584138	584143	0 %	0 %	50 %	50 %	512556591
11045	NC_021490	TTGC	2	8	584146	584153	0 %	50 %	25 %	25 %	512556591
11046	NC_021490	CGA	2	6	584193	584198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556591
11047	NC_021490	AGGCA	2	10	584215	584224	40 %	0 %	40 %	20 %	512556591
11048	NC_021490	TGC	2	6	584228	584233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556591
11049	NC_021490	CGC	2	6	584262	584267	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512556591
11050	NC_021490	CTG	2	6	584282	584287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556591
11051	NC_021490	GA	3	6	584349	584354	50 %	0 %	50 %	0 %	512556591
11052	NC_021490	GCG	2	6	584368	584373	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512556591
11053	NC_021490	CGCA	2	8	584474	584481	25 %	0 %	25 %	50 %	512556591
11054	NC_021490	GAA	2	6	584589	584594	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512556591
11055	NC_021490	CG	3	6	584632	584637	0 %	0 %	50 %	50 %	512556591
11056	NC_021490	CTC	2	6	584647	584652	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512556591
11057	NC_021490	CA	3	6	584713	584718	50 %	0 %	0 %	50 %	512556591
11058	NC_021490	CGC	2	6	584766	584771	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512556592
11059	NC_021490	GGGC	2	8	584774	584781	0 %	0 %	75 %	25 %	512556592
11060	NC_021490	CA	4	8	584813	584820	50 %	0 %	0 %	50 %	512556592
11061	NC_021490	ATA	2	6	584832	584837	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512556592
11062	NC_021490	CGA	2	6	584890	584895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556592
11063	NC_021490	GA	3	6	584894	584899	50 %	0 %	50 %	0 %	512556592
11064	NC_021490	T	6	6	584938	584943	0 %	100 %	0 %	0 %	512556592
11065	NC_021490	AGA	2	6	585027	585032	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512556592
11066	NC_021490	AGA	2	6	585082	585087	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512556592
11067	NC_021490	AAT	2	6	585113	585118	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512556592
11068	NC_021490	A	7	7	585162	585168	100 %	0 %	0 %	0 %	512556592
11069	NC_021490	A	6	6	585182	585187	100 %	0 %	0 %	0 %	512556592
11070	NC_021490	GTAC	2	8	585195	585202	25 %	25 %	25 %	25 %	512556592
11071	NC_021490	TG	3	6	585313	585318	0 %	50 %	50 %	0 %	512556592
11072	NC_021490	CAG	2	6	585326	585331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556592
11073	NC_021490	AGCAGA	2	12	585354	585365	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	512556592
11074	NC_021490	GC	3	6	585425	585430	0 %	0 %	50 %	50 %	512556592
11075	NC_021490	GC	3	6	585538	585543	0 %	0 %	50 %	50 %	512556592
11076	NC_021490	CA	3	6	585557	585562	50 %	0 %	0 %	50 %	512556592
11077	NC_021490	CTT	2	6	585605	585610	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512556592
11078	NC_021490	GACA	2	8	585620	585627	50 %	0 %	25 %	25 %	512556592
11079	NC_021490	GC	3	6	585644	585649	0 %	0 %	50 %	50 %	512556592
11080	NC_021490	TAA	2	6	585689	585694	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512556592
11081	NC_021490	CG	3	6	585725	585730	0 %	0 %	50 %	50 %	512556592
11082	NC_021490	TCA	2	6	585904	585909	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512556592
11083	NC_021490	CCT	2	6	585910	585915	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512556592
11084	NC_021490	CGG	2	6	585962	585967	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512556592
11085	NC_021490	ACC	2	6	586173	586178	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512556592
11086	NC_021490	AG	3	6	586315	586320	50 %	0 %	50 %	0 %	512556592
11087	NC_021490	GTG	2	6	586348	586353	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512556592
11088	NC_021490	C	6	6	586388	586393	0 %	0 %	0 %	100 %	512556592
11089	NC_021490	GAA	2	6	586394	586399	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512556592
11090	NC_021490	AG	3	6	586442	586447	50 %	0 %	50 %	0 %	512556592
11091	NC_021490	ACTC	2	8	586515	586522	25 %	25 %	0 %	50 %	512556593
11092	NC_021490	GCA	2	6	586524	586529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556593
11093	NC_021490	CTT	3	9	586591	586599	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512556593
11094	NC_021490	CCG	2	6	586654	586659	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512556593
11095	NC_021490	GCA	2	6	586752	586757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556593
11096	NC_021490	ATC	2	6	586760	586765	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512556593
11097	NC_021490	T	6	6	586845	586850	0 %	100 %	0 %	0 %	512556593
11098	NC_021490	CA	3	6	586903	586908	50 %	0 %	0 %	50 %	512556593
11099	NC_021490	GCA	2	6	587091	587096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556593
11100	NC_021490	GCGCTC	2	12	587153	587164	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	512556593
11101	NC_021490	GCT	2	6	587298	587303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556594
11102	NC_021490	CAG	2	6	587325	587330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556594
11103	NC_021490	GC	3	6	587338	587343	0 %	0 %	50 %	50 %	512556594
11104	NC_021490	ACAG	2	8	587348	587355	50 %	0 %	25 %	25 %	512556594
11105	NC_021490	CCA	3	9	587499	587507	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512556594
11106	NC_021490	GCA	2	6	587537	587542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556594
11107	NC_021490	GCC	2	6	587561	587566	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512556594
11108	NC_021490	GAA	2	6	587642	587647	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512556594
11109	NC_021490	CAA	2	6	587664	587669	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512556594
11110	NC_021490	CCA	2	6	587712	587717	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512556594
11111	NC_021490	GT	3	6	587727	587732	0 %	50 %	50 %	0 %	512556594
11112	NC_021490	GC	3	6	587761	587766	0 %	0 %	50 %	50 %	512556594
11113	NC_021490	T	6	6	587771	587776	0 %	100 %	0 %	0 %	512556594
11114	NC_021490	CGGTA	2	10	587865	587874	20 %	20 %	40 %	20 %	512556594
11115	NC_021490	AAC	2	6	587880	587885	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512556594
11116	NC_021490	TCC	2	6	587896	587901	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512556594
11117	NC_021490	TGA	2	6	588047	588052	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556594
11118	NC_021490	T	7	7	588055	588061	0 %	100 %	0 %	0 %	512556594
11119	NC_021490	CAA	2	6	588084	588089	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512556594
11120	NC_021490	CG	3	6	588141	588146	0 %	0 %	50 %	50 %	512556594
11121	NC_021490	AGA	2	6	588304	588309	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512556594
11122	NC_021490	CAC	2	6	588328	588333	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512556594
11123	NC_021490	AGG	2	6	588361	588366	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512556594
11124	NC_021490	AGGAC	2	10	588422	588431	40 %	0 %	40 %	20 %	512556594
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11135	NC_021490	TGCG	2	8	589255	589262	0 %	25 %	50 %	25 %	512556595
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11226	NC_021490	CTTCT	2	10	593701	593710	0 %	60 %	0 %	40 %	512556598
11227	NC_021490	CTT	2	6	593728	593733	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512556598
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11231	NC_021490	AAAC	2	8	594024	594031	75 %	0 %	0 %	25 %	512556598
11232	NC_021490	CCGG	2	8	594082	594089	0 %	0 %	50 %	50 %	512556598
11233	NC_021490	GCA	2	6	594118	594123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556598
11234	NC_021490	T	7	7	594170	594176	0 %	100 %	0 %	0 %	512556598
11235	NC_021490	CTC	2	6	594194	594199	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512556598
11236	NC_021490	CTG	2	6	594204	594209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556598
11237	NC_021490	AGG	2	6	594217	594222	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512556598
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11239	NC_021490	GCC	2	6	594308	594313	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512556598
11240	NC_021490	CAC	2	6	594320	594325	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512556598
11241	NC_021490	CGG	2	6	594358	594363	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512556598
11242	NC_021490	GCG	2	6	594430	594435	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512556598
11243	NC_021490	AAG	2	6	594441	594446	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512556598
11244	NC_021490	GCT	2	6	594497	594502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556598
11245	NC_021490	GC	3	6	594514	594519	0 %	0 %	50 %	50 %	512556598
11246	NC_021490	ACG	2	6	594520	594525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556598
11247	NC_021490	TC	3	6	594551	594556	0 %	50 %	0 %	50 %	512556598
11248	NC_021490	GCA	2	6	594951	594956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556599
11249	NC_021490	GAG	2	6	595023	595028	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512556599
11250	NC_021490	CT	3	6	595036	595041	0 %	50 %	0 %	50 %	512556599
11251	NC_021490	CTCG	2	8	595067	595074	0 %	25 %	25 %	50 %	512556599
11252	NC_021490	CCTCA	2	10	595102	595111	20 %	20 %	0 %	60 %	512556599
11253	NC_021490	ACC	2	6	595119	595124	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512556599
11254	NC_021490	CG	5	10	595188	595197	0 %	0 %	50 %	50 %	512556599
11255	NC_021490	A	6	6	595271	595276	100 %	0 %	0 %	0 %	512556599
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11257	NC_021490	CTG	2	6	595371	595376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556599
11258	NC_021490	CGT	2	6	595385	595390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556599
11259	NC_021490	GCC	2	6	595404	595409	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512556599
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11265	NC_021490	AGG	2	6	595532	595537	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512556599
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11272	NC_021490	ACGA	2	8	595744	595751	50 %	0 %	25 %	25 %	512556599
11273	NC_021490	A	6	6	595786	595791	100 %	0 %	0 %	0 %	512556599
11274	NC_021490	TTG	2	6	595792	595797	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512556599
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11277	NC_021490	GC	3	6	595955	595960	0 %	0 %	50 %	50 %	512556599
11278	NC_021490	GC	5	10	595980	595989	0 %	0 %	50 %	50 %	512556599
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11284	NC_021490	CG	4	8	596222	596229	0 %	0 %	50 %	50 %	512556599
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11302	NC_021490	GC	4	8	597055	597062	0 %	0 %	50 %	50 %	512556599
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11330	NC_021490	CTG	2	6	598159	598164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556600
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11340	NC_021490	A	7	7	598518	598524	100 %	0 %	0 %	0 %	512556600
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11351	NC_021490	CAC	2	6	598870	598875	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512556601
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11353	NC_021490	AGC	2	6	598897	598902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556601
11354	NC_021490	CGC	2	6	598914	598919	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512556601
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11356	NC_021490	CAC	2	6	599041	599046	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512556601
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11358	NC_021490	GC	4	8	599124	599131	0 %	0 %	50 %	50 %	512556601
11359	NC_021490	GC	3	6	599148	599153	0 %	0 %	50 %	50 %	512556601
11360	NC_021490	AACC	2	8	599171	599178	50 %	0 %	0 %	50 %	512556601
11361	NC_021490	AAG	2	6	599179	599184	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512556601
11362	NC_021490	AC	3	6	599214	599219	50 %	0 %	0 %	50 %	512556601
11363	NC_021490	CGCC	2	8	599250	599257	0 %	0 %	25 %	75 %	512556601
11364	NC_021490	GC	3	6	599275	599280	0 %	0 %	50 %	50 %	512556601
11365	NC_021490	GAC	2	6	599306	599311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556601
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11490	NC_021490	GCA	2	6	605374	605379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556607
11491	NC_021490	GTCA	2	8	605387	605394	25 %	25 %	25 %	25 %	512556607
11492	NC_021490	TG	3	6	605554	605559	0 %	50 %	50 %	0 %	512556607
11493	NC_021490	GC	3	6	605567	605572	0 %	0 %	50 %	50 %	512556607
11494	NC_021490	TTG	2	6	605592	605597	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512556607
11495	NC_021490	AACCG	2	10	605600	605609	40 %	0 %	20 %	40 %	512556607
11496	NC_021490	TAC	2	6	605618	605623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512556607
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11499	NC_021490	CG	3	6	605782	605787	0 %	0 %	50 %	50 %	512556608
11500	NC_021490	GC	3	6	605798	605803	0 %	0 %	50 %	50 %	512556608

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