MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum str. Nichols

Total Repeats: 21924

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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10502	NC_021490	GAA	2	6	556547	556552	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512556567
10503	NC_021490	CGT	2	6	556559	556564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556567
10504	NC_021490	AAAGGT	2	12	556613	556624	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	512556567
10505	NC_021490	GAG	2	6	556719	556724	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512556567
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10509	NC_021490	CAAAA	2	10	556833	556842	80 %	0 %	0 %	20 %	512556567
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10512	NC_021490	TGC	2	6	557023	557028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556567
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10517	NC_021490	TCTT	2	8	557293	557300	0 %	75 %	0 %	25 %	512556567
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10553	NC_021490	AAT	2	6	559126	559131	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512556568
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10593	NC_021490	GA	3	6	560974	560979	50 %	0 %	50 %	0 %	512556571
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10604	NC_021490	TACT	2	8	561383	561390	25 %	50 %	0 %	25 %	512556571
10605	NC_021490	TCA	2	6	561400	561405	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512556571
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10608	NC_021490	GGC	2	6	561642	561647	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512556571
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10611	NC_021490	A	6	6	561826	561831	100 %	0 %	0 %	0 %	512556571
10612	NC_021490	AAT	2	6	561891	561896	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512556571
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10616	NC_021490	CAT	2	6	562097	562102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512556571
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10620	NC_021490	TG	3	6	563427	563432	0 %	50 %	50 %	0 %	512556572
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10622	NC_021490	A	7	7	563507	563513	100 %	0 %	0 %	0 %	512556572
10623	NC_021490	A	6	6	563546	563551	100 %	0 %	0 %	0 %	512556572
10624	NC_021490	TACC	2	8	563604	563611	25 %	25 %	0 %	50 %	512556572
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10991	NC_021490	ACT	2	6	580818	580823	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512556587
10992	NC_021490	CA	3	6	580890	580895	50 %	0 %	0 %	50 %	512556587
10993	NC_021490	CA	3	6	580933	580938	50 %	0 %	0 %	50 %	512556587
10994	NC_021490	GC	3	6	580953	580958	0 %	0 %	50 %	50 %	512556587
10995	NC_021490	TGAT	2	8	581067	581074	25 %	50 %	25 %	0 %	512556587
10996	NC_021490	C	6	6	581182	581187	0 %	0 %	0 %	100 %	512556587
10997	NC_021490	ACT	2	6	581195	581200	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512556587
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10999	NC_021490	AAG	2	6	581216	581221	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512556587
11000	NC_021490	ATGT	2	8	581283	581290	25 %	50 %	25 %	0 %	512556587

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