MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum str. Nichols

Total Repeats: 21924

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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10002	NC_021490	CTT	2	6	529960	529965	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512556547
10003	NC_021490	A	6	6	529999	530004	100 %	0 %	0 %	0 %	512556547
10004	NC_021490	GAG	2	6	530059	530064	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512556547
10005	NC_021490	AGT	2	6	530191	530196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556547
10006	NC_021490	GAA	2	6	530200	530205	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512556547
10007	NC_021490	GT	3	6	530206	530211	0 %	50 %	50 %	0 %	512556547
10008	NC_021490	AGC	2	6	530213	530218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556547
10009	NC_021490	CG	3	6	530301	530306	0 %	0 %	50 %	50 %	512556547
10010	NC_021490	GCG	2	6	530325	530330	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512556547
10011	NC_021490	TG	3	6	530369	530374	0 %	50 %	50 %	0 %	512556547
10012	NC_021490	GTCAT	2	10	530573	530582	20 %	40 %	20 %	20 %	512556547
10013	NC_021490	AAG	2	6	530587	530592	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512556547
10014	NC_021490	AAG	2	6	530644	530649	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512556547
10015	NC_021490	T	8	8	530669	530676	0 %	100 %	0 %	0 %	512556547
10016	NC_021490	GTG	2	6	530766	530771	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512556547
10017	NC_021490	GC	3	6	530809	530814	0 %	0 %	50 %	50 %	512556547
10018	NC_021490	ATAA	2	8	530848	530855	75 %	25 %	0 %	0 %	512556547
10019	NC_021490	GTT	2	6	530877	530882	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512556547
10020	NC_021490	TGA	2	6	530907	530912	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556547
10021	NC_021490	GCA	2	6	530922	530927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556547
10022	NC_021490	GC	3	6	530971	530976	0 %	0 %	50 %	50 %	512556547
10023	NC_021490	TC	3	6	530984	530989	0 %	50 %	0 %	50 %	512556547
10024	NC_021490	GAG	3	9	531007	531015	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512556547
10025	NC_021490	CTGACG	2	12	531041	531052	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	512556547
10026	NC_021490	ACT	2	6	531173	531178	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512556547
10027	NC_021490	CAG	2	6	531279	531284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556547
10028	NC_021490	GGT	2	6	531363	531368	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512556548
10029	NC_021490	AGA	2	6	531377	531382	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512556548
10030	NC_021490	AAAG	2	8	531454	531461	75 %	0 %	25 %	0 %	512556548
10031	NC_021490	GAA	2	6	531499	531504	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512556548
10032	NC_021490	ACC	2	6	531517	531522	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512556548
10033	NC_021490	GCG	2	6	531543	531548	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512556548
10034	NC_021490	ACA	2	6	531572	531577	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512556548
10035	NC_021490	AGG	2	6	531620	531625	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512556548
10036	NC_021490	AGG	2	6	531635	531640	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512556548
10037	NC_021490	GC	3	6	531661	531666	0 %	0 %	50 %	50 %	512556548
10038	NC_021490	AGA	2	6	531693	531698	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512556548
10039	NC_021490	AAG	2	6	531713	531718	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512556548
10040	NC_021490	GCA	2	6	531726	531731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556548
10041	NC_021490	AGG	2	6	531809	531814	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512556548
10042	NC_021490	GCG	2	6	531819	531824	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512556548
10043	NC_021490	TAT	2	6	531870	531875	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512556548
10044	NC_021490	GT	3	6	531919	531924	0 %	50 %	50 %	0 %	512556548
10045	NC_021490	GAG	2	6	532024	532029	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512556548
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10047	NC_021490	TGA	2	6	532056	532061	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556548
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10049	NC_021490	GGA	2	6	532108	532113	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512556548
10050	NC_021490	AG	3	6	532142	532147	50 %	0 %	50 %	0 %	512556548
10051	NC_021490	T	7	7	532502	532508	0 %	100 %	0 %	0 %	512556549
10052	NC_021490	CTA	2	6	532527	532532	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512556549
10053	NC_021490	TTC	2	6	532554	532559	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512556549
10054	NC_021490	GGA	2	6	532567	532572	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512556549
10055	NC_021490	TAC	2	6	532656	532661	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512556549
10056	NC_021490	GC	4	8	532675	532682	0 %	0 %	50 %	50 %	512556549
10057	NC_021490	GAA	2	6	532700	532705	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512556549
10058	NC_021490	GGC	2	6	532733	532738	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512556549
10059	NC_021490	TGC	2	6	532793	532798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556549
10060	NC_021490	CTA	2	6	532799	532804	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512556549
10061	NC_021490	CG	3	6	532875	532880	0 %	0 %	50 %	50 %	512556549
10062	NC_021490	CTA	2	6	532937	532942	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512556549
10063	NC_021490	TAC	2	6	532956	532961	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512556549
10064	NC_021490	CTGTAT	2	12	533178	533189	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	512556549
10065	NC_021490	TGC	2	6	533246	533251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556549
10066	NC_021490	ATC	2	6	533341	533346	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512556549
10067	NC_021490	GCGG	2	8	533387	533394	0 %	0 %	75 %	25 %	512556549
10068	NC_021490	GGC	2	6	533398	533403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512556549
10069	NC_021490	T	6	6	533478	533483	0 %	100 %	0 %	0 %	512556550
10070	NC_021490	CTG	2	6	533497	533502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556550
10071	NC_021490	GGAA	2	8	533546	533553	50 %	0 %	50 %	0 %	512556550
10072	NC_021490	GTC	2	6	533562	533567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556550
10073	NC_021490	TGG	2	6	533581	533586	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512556550
10074	NC_021490	AGT	2	6	533609	533614	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556550
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10076	NC_021490	TAC	2	6	533711	533716	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512556550
10077	NC_021490	GAT	2	6	533723	533728	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556550
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10079	NC_021490	TGC	2	6	533888	533893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556550
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10082	NC_021490	G	8	8	533952	533959	0 %	0 %	100 %	0 %	512556550
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10087	NC_021490	TCG	2	6	534310	534315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556550
10088	NC_021490	CT	3	6	534344	534349	0 %	50 %	0 %	50 %	512556550
10089	NC_021490	T	10	10	534525	534534	0 %	100 %	0 %	0 %	512556551
10090	NC_021490	TCT	2	6	534596	534601	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512556551
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10093	NC_021490	AAC	2	6	534758	534763	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512556551
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10099	NC_021490	G	6	6	535116	535121	0 %	0 %	100 %	0 %	512556551
10100	NC_021490	GAA	2	6	535152	535157	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512556551
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10102	NC_021490	GAT	2	6	535373	535378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556551
10103	NC_021490	CTTTT	2	10	535408	535417	0 %	80 %	0 %	20 %	512556552
10104	NC_021490	GTA	2	6	535488	535493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556552
10105	NC_021490	GTG	2	6	535518	535523	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512556552
10106	NC_021490	ATT	2	6	535554	535559	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512556552
10107	NC_021490	TC	3	6	535576	535581	0 %	50 %	0 %	50 %	512556552
10108	NC_021490	TTCG	2	8	535595	535602	0 %	50 %	25 %	25 %	512556552
10109	NC_021490	CAC	2	6	535607	535612	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512556552
10110	NC_021490	ATATC	2	10	535646	535655	40 %	40 %	0 %	20 %	512556552
10111	NC_021490	GAG	2	6	535729	535734	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512556552
10112	NC_021490	TTC	2	6	535871	535876	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512556552
10113	NC_021490	TC	3	6	535893	535898	0 %	50 %	0 %	50 %	512556553
10114	NC_021490	TCG	2	6	535945	535950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556553
10115	NC_021490	TGT	2	6	535963	535968	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512556553
10116	NC_021490	G	6	6	536002	536007	0 %	0 %	100 %	0 %	512556553
10117	NC_021490	A	9	9	536016	536024	100 %	0 %	0 %	0 %	512556553
10118	NC_021490	GTA	2	6	536044	536049	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556553
10119	NC_021490	G	6	6	536068	536073	0 %	0 %	100 %	0 %	512556553
10120	NC_021490	CAA	2	6	536180	536185	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512556553
10121	NC_021490	GAAA	2	8	536224	536231	75 %	0 %	25 %	0 %	512556553
10122	NC_021490	CCG	2	6	536246	536251	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512556553
10123	NC_021490	TGA	2	6	536321	536326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556553
10124	NC_021490	AGA	2	6	536423	536428	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512556553
10125	NC_021490	ACG	2	6	536500	536505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556553
10126	NC_021490	CTC	2	6	536590	536595	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512556553
10127	NC_021490	TAA	2	6	536603	536608	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512556553
10128	NC_021490	ATCG	2	8	536622	536629	25 %	25 %	25 %	25 %	512556553
10129	NC_021490	AGA	2	6	536648	536653	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512556553
10130	NC_021490	TGTCA	2	10	536864	536873	20 %	40 %	20 %	20 %	512556553
10131	NC_021490	GA	3	6	536929	536934	50 %	0 %	50 %	0 %	512556553
10132	NC_021490	CGT	2	6	537000	537005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556553
10133	NC_021490	TTA	2	6	537029	537034	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512556553
10134	NC_021490	GC	3	6	537111	537116	0 %	0 %	50 %	50 %	512556553
10135	NC_021490	TGGA	2	8	537193	537200	25 %	25 %	50 %	0 %	512556553
10136	NC_021490	GC	3	6	537413	537418	0 %	0 %	50 %	50 %	512556553
10137	NC_021490	CTC	2	6	537446	537451	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512556553
10138	NC_021490	ATC	2	6	537559	537564	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512556553
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10140	NC_021490	GGT	2	6	537581	537586	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512556553
10141	NC_021490	GAATGG	2	12	537615	537626	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	512556553
10142	NC_021490	AGCA	2	8	537685	537692	50 %	0 %	25 %	25 %	512556553
10143	NC_021490	TTC	2	6	537838	537843	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512556554
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10146	NC_021490	TGC	2	6	537996	538001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556554
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10148	NC_021490	TGC	2	6	538188	538193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556554
10149	NC_021490	GGT	2	6	538303	538308	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512556554
10150	NC_021490	TG	3	6	538310	538315	0 %	50 %	50 %	0 %	512556554
10151	NC_021490	TCC	2	6	538317	538322	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512556554
10152	NC_021490	T	7	7	538427	538433	0 %	100 %	0 %	0 %	512556554
10153	NC_021490	GGT	2	6	538459	538464	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512556554
10154	NC_021490	CT	3	6	538475	538480	0 %	50 %	0 %	50 %	512556554
10155	NC_021490	GAA	2	6	538482	538487	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512556554
10156	NC_021490	TAC	3	9	538490	538498	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512556554
10157	NC_021490	TTAC	2	8	538503	538510	25 %	50 %	0 %	25 %	512556554
10158	NC_021490	GCT	2	6	538546	538551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556554
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10161	NC_021490	TTCT	2	8	538758	538765	0 %	75 %	0 %	25 %	512556554
10162	NC_021490	TTG	2	6	538779	538784	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512556554
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10165	NC_021490	CAT	2	6	538837	538842	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512556554
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10168	NC_021490	TGG	2	6	538981	538986	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512556554
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10170	NC_021490	TGA	2	6	539025	539030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556554
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10179	NC_021490	GA	3	6	539439	539444	50 %	0 %	50 %	0 %	512556555
10180	NC_021490	AAG	2	6	539460	539465	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512556555
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10204	NC_021490	CTC	2	6	540726	540731	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512556557
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10221	NC_021490	ATTC	2	8	541299	541306	25 %	50 %	0 %	25 %	512556557
10222	NC_021490	TGAAC	2	10	541332	541341	40 %	20 %	20 %	20 %	512556557
10223	NC_021490	A	7	7	541362	541368	100 %	0 %	0 %	0 %	512556557
10224	NC_021490	AGC	2	6	541375	541380	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556557
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10226	NC_021490	AC	3	6	541465	541470	50 %	0 %	0 %	50 %	512556557
10227	NC_021490	CAG	2	6	541484	541489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556557
10228	NC_021490	TCACCG	2	12	541519	541530	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	512556557
10229	NC_021490	A	6	6	541620	541625	100 %	0 %	0 %	0 %	512556557
10230	NC_021490	GGT	2	6	541647	541652	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512556557
10231	NC_021490	TCC	2	6	541737	541742	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512556557
10232	NC_021490	G	7	7	541784	541790	0 %	0 %	100 %	0 %	512556557
10233	NC_021490	ATC	2	6	541807	541812	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512556557
10234	NC_021490	GGA	2	6	541834	541839	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512556557
10235	NC_021490	GC	3	6	541876	541881	0 %	0 %	50 %	50 %	512556557
10236	NC_021490	CGGA	2	8	541900	541907	25 %	0 %	50 %	25 %	512556557
10237	NC_021490	A	6	6	541938	541943	100 %	0 %	0 %	0 %	512556557
10238	NC_021490	CGTGTA	2	12	541960	541971	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	512556557
10239	NC_021490	A	8	8	542727	542734	100 %	0 %	0 %	0 %	512556558
10240	NC_021490	GGT	2	6	542770	542775	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512556558
10241	NC_021490	CG	4	8	542779	542786	0 %	0 %	50 %	50 %	512556558
10242	NC_021490	TTG	2	6	542814	542819	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512556558
10243	NC_021490	GCG	2	6	542921	542926	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512556558
10244	NC_021490	GGA	2	6	542947	542952	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512556558
10245	NC_021490	ACG	2	6	543063	543068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556558
10246	NC_021490	TTCC	2	8	543072	543079	0 %	50 %	0 %	50 %	512556558
10247	NC_021490	AGA	2	6	543136	543141	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512556558
10248	NC_021490	TC	3	6	543147	543152	0 %	50 %	0 %	50 %	512556558
10249	NC_021490	GC	3	6	543289	543294	0 %	0 %	50 %	50 %	512556558
10250	NC_021490	GGA	2	6	543319	543324	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512556558
10251	NC_021490	AT	3	6	543348	543353	50 %	50 %	0 %	0 %	512556558
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10256	NC_021490	CAG	2	6	543740	543745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556558
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10261	NC_021490	CTG	2	6	543825	543830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556558
10262	NC_021490	GTAC	2	8	543847	543854	25 %	25 %	25 %	25 %	512556558
10263	NC_021490	TAT	2	6	543899	543904	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512556558
10264	NC_021490	GGA	2	6	543910	543915	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512556558
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10266	NC_021490	TG	3	6	543980	543985	0 %	50 %	50 %	0 %	512556558
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10271	NC_021490	T	6	6	544111	544116	0 %	100 %	0 %	0 %	512556559
10272	NC_021490	TTG	2	6	544122	544127	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512556559
10273	NC_021490	TAT	2	6	544136	544141	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512556559
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10282	NC_021490	TG	3	6	544457	544462	0 %	50 %	50 %	0 %	512556559
10283	NC_021490	GGA	2	6	544550	544555	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512556559
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10358	NC_021490	CGTG	2	8	549347	549354	0 %	25 %	50 %	25 %	512556564
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10362	NC_021490	ACG	2	6	549574	549579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556564
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10365	NC_021490	GCT	2	6	549795	549800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556564
10366	NC_021490	TGA	2	6	549821	549826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556564
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10483	NC_021490	AGG	2	6	555871	555876	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512556567
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10485	NC_021490	ACC	2	6	555902	555907	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512556567
10486	NC_021490	CTAT	2	8	555931	555938	25 %	50 %	0 %	25 %	512556567
10487	NC_021490	TTA	2	6	555961	555966	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512556567
10488	NC_021490	TGTA	2	8	556002	556009	25 %	50 %	25 %	0 %	512556567
10489	NC_021490	ATGTGC	2	12	556011	556022	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	512556567
10490	NC_021490	T	7	7	556040	556046	0 %	100 %	0 %	0 %	512556567
10491	NC_021490	T	6	6	556054	556059	0 %	100 %	0 %	0 %	512556567
10492	NC_021490	AG	3	6	556115	556120	50 %	0 %	50 %	0 %	512556567
10493	NC_021490	AGC	2	6	556139	556144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556567
10494	NC_021490	A	8	8	556265	556272	100 %	0 %	0 %	0 %	512556567
10495	NC_021490	CTT	2	6	556294	556299	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512556567
10496	NC_021490	TC	3	6	556353	556358	0 %	50 %	0 %	50 %	512556567
10497	NC_021490	TG	3	6	556360	556365	0 %	50 %	50 %	0 %	512556567
10498	NC_021490	CAA	2	6	556382	556387	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512556567
10499	NC_021490	AGGG	2	8	556454	556461	25 %	0 %	75 %	0 %	512556567
10500	NC_021490	TCC	2	6	556465	556470	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512556567

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