MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum str. Nichols

Total Repeats: 21924

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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9502	NC_021490	AAGAA	2	10	502900	502909	80 %	0 %	20 %	0 %	512556527
9503	NC_021490	AGGGA	2	10	502927	502936	40 %	0 %	60 %	0 %	512556527
9504	NC_021490	T	7	7	503065	503071	0 %	100 %	0 %	0 %	512556527
9505	NC_021490	GT	3	6	503076	503081	0 %	50 %	50 %	0 %	512556527
9506	NC_021490	AGC	2	6	503090	503095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556527
9507	NC_021490	GTGTT	2	10	503107	503116	0 %	60 %	40 %	0 %	512556527
9508	NC_021490	GCG	2	6	503135	503140	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512556527
9509	NC_021490	CG	3	6	503139	503144	0 %	0 %	50 %	50 %	512556527
9510	NC_021490	AAG	2	6	503187	503192	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512556527
9511	NC_021490	GA	3	6	503314	503319	50 %	0 %	50 %	0 %	512556527
9512	NC_021490	AAG	2	6	503434	503439	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512556528
9513	NC_021490	A	6	6	503506	503511	100 %	0 %	0 %	0 %	512556528
9514	NC_021490	GAG	2	6	503547	503552	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512556528
9515	NC_021490	GAG	2	6	503580	503585	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512556528
9516	NC_021490	GCA	2	6	503630	503635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556528
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9519	NC_021490	A	6	6	503838	503843	100 %	0 %	0 %	0 %	512556528
9520	NC_021490	CGG	2	6	503877	503882	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512556528
9521	NC_021490	A	6	6	503895	503900	100 %	0 %	0 %	0 %	512556528
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9553	NC_021490	CGA	2	6	505916	505921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556530
9554	NC_021490	CGT	2	6	505947	505952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556530
9555	NC_021490	CGT	2	6	506018	506023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556530
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9557	NC_021490	CCA	2	6	506128	506133	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512556530
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9561	NC_021490	CGT	2	6	506369	506374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556530
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9564	NC_021490	CAGCC	2	10	506463	506472	20 %	0 %	20 %	60 %	512556530
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9586	NC_021490	CCTG	2	8	507901	507908	0 %	25 %	25 %	50 %	512556531
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9594	NC_021490	GCACG	2	10	508420	508429	20 %	0 %	40 %	40 %	512556532
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9602	NC_021490	CGC	2	6	508765	508770	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512556532
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9871	NC_021490	TCA	2	6	522852	522857	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512556542
9872	NC_021490	TCT	2	6	522870	522875	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512556542
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9874	NC_021490	GCT	2	6	522947	522952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556542
9875	NC_021490	GTCTG	2	10	522962	522971	0 %	40 %	40 %	20 %	512556542
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9992	NC_021490	GCT	2	6	529599	529604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556547
9993	NC_021490	ATG	2	6	529607	529612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556547
9994	NC_021490	TCT	2	6	529646	529651	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512556547
9995	NC_021490	AGG	2	6	529661	529666	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512556547
9996	NC_021490	AGA	2	6	529671	529676	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512556547
9997	NC_021490	CGATGG	2	12	529713	529724	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	512556547
9998	NC_021490	GCGT	2	8	529748	529755	0 %	25 %	50 %	25 %	512556547
9999	NC_021490	CG	3	6	529806	529811	0 %	0 %	50 %	50 %	512556547
10000	NC_021490	CAT	2	6	529926	529931	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512556547

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