MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum str. Nichols

Total Repeats: 21924

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7501	NC_021490	CCTT	2	8	409618	409625	0 %	50 %	0 %	50 %	512556440
7502	NC_021490	GCC	2	6	409636	409641	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512556440
7503	NC_021490	CG	4	8	409696	409703	0 %	0 %	50 %	50 %	512556440
7504	NC_021490	CA	3	6	409797	409802	50 %	0 %	0 %	50 %	512556441
7505	NC_021490	AGG	2	6	409807	409812	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512556441
7506	NC_021490	GTT	2	6	409892	409897	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512556441
7507	NC_021490	GA	3	6	409940	409945	50 %	0 %	50 %	0 %	512556441
7508	NC_021490	GGGGCG	2	12	409947	409958	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	512556441
7509	NC_021490	T	6	6	409959	409964	0 %	100 %	0 %	0 %	512556441
7510	NC_021490	AC	4	8	409991	409998	50 %	0 %	0 %	50 %	512556441
7511	NC_021490	GC	3	6	410076	410081	0 %	0 %	50 %	50 %	512556441
7512	NC_021490	GGT	2	6	410119	410124	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512556441
7513	NC_021490	T	6	6	410133	410138	0 %	100 %	0 %	0 %	512556441
7514	NC_021490	GCAG	2	8	410228	410235	25 %	0 %	50 %	25 %	512556441
7515	NC_021490	T	6	6	410258	410263	0 %	100 %	0 %	0 %	512556441
7516	NC_021490	G	6	6	410272	410277	0 %	0 %	100 %	0 %	512556441
7517	NC_021490	AGA	2	6	410300	410305	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512556441
7518	NC_021490	CCT	2	6	410357	410362	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512556441
7519	NC_021490	T	6	6	410397	410402	0 %	100 %	0 %	0 %	512556441
7520	NC_021490	CG	3	6	410423	410428	0 %	0 %	50 %	50 %	512556441
7521	NC_021490	GC	3	6	410449	410454	0 %	0 %	50 %	50 %	512556441
7522	NC_021490	GC	4	8	410481	410488	0 %	0 %	50 %	50 %	512556441
7523	NC_021490	GC	3	6	410505	410510	0 %	0 %	50 %	50 %	512556441
7524	NC_021490	GTG	2	6	410511	410516	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512556441
7525	NC_021490	CCG	2	6	410517	410522	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512556441
7526	NC_021490	GCG	2	6	410546	410551	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512556441
7527	NC_021490	CTT	2	6	410649	410654	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512556441
7528	NC_021490	TTA	2	6	410698	410703	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512556441
7529	NC_021490	AGGAT	2	10	410719	410728	40 %	20 %	40 %	0 %	512556441
7530	NC_021490	GCG	2	6	410797	410802	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512556441
7531	NC_021490	AAG	2	6	410829	410834	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512556441
7532	NC_021490	GT	3	6	410849	410854	0 %	50 %	50 %	0 %	512556441
7533	NC_021490	TGC	2	6	410861	410866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556441
7534	NC_021490	GA	3	6	410948	410953	50 %	0 %	50 %	0 %	512556442
7535	NC_021490	AGC	2	6	410956	410961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556442
7536	NC_021490	GTT	2	6	411014	411019	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512556442
7537	NC_021490	TG	3	6	411046	411051	0 %	50 %	50 %	0 %	512556442
7538	NC_021490	GTG	2	6	411093	411098	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512556442
7539	NC_021490	ACG	2	6	411106	411111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556442
7540	NC_021490	TAT	2	6	411125	411130	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512556442
7541	NC_021490	CTC	2	6	411275	411280	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512556442
7542	NC_021490	TGA	2	6	411300	411305	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556442
7543	NC_021490	GC	3	6	411352	411357	0 %	0 %	50 %	50 %	512556443
7544	NC_021490	GTG	2	6	411422	411427	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512556443
7545	NC_021490	GAA	2	6	411454	411459	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512556443
7546	NC_021490	CCT	2	6	411596	411601	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512556443
7547	NC_021490	TTA	2	6	411626	411631	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512556443
7548	NC_021490	CG	3	6	411682	411687	0 %	0 %	50 %	50 %	512556443
7549	NC_021490	GGT	2	6	411708	411713	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512556443
7550	NC_021490	T	6	6	411763	411768	0 %	100 %	0 %	0 %	512556443
7551	NC_021490	GTGC	2	8	411769	411776	0 %	25 %	50 %	25 %	512556443
7552	NC_021490	TCG	2	6	411813	411818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556443
7553	NC_021490	G	6	6	411818	411823	0 %	0 %	100 %	0 %	512556443
7554	NC_021490	CGCT	2	8	411833	411840	0 %	25 %	25 %	50 %	512556443
7555	NC_021490	GCA	2	6	411909	411914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556443
7556	NC_021490	A	6	6	411931	411936	100 %	0 %	0 %	0 %	512556443
7557	NC_021490	T	6	6	411941	411946	0 %	100 %	0 %	0 %	512556443
7558	NC_021490	CGA	2	6	411981	411986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556443
7559	NC_021490	G	7	7	412044	412050	0 %	0 %	100 %	0 %	512556443
7560	NC_021490	CTG	2	6	412199	412204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556443
7561	NC_021490	GT	3	6	412261	412266	0 %	50 %	50 %	0 %	512556443
7562	NC_021490	GCG	2	6	412321	412326	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512556443
7563	NC_021490	TG	3	6	412334	412339	0 %	50 %	50 %	0 %	512556443
7564	NC_021490	GT	4	8	412423	412430	0 %	50 %	50 %	0 %	512556443
7565	NC_021490	CG	3	6	412449	412454	0 %	0 %	50 %	50 %	512556443
7566	NC_021490	GGA	2	6	412511	412516	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512556443
7567	NC_021490	CGG	2	6	412582	412587	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512556443
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7570	NC_021490	T	6	6	412817	412822	0 %	100 %	0 %	0 %	512556444
7571	NC_021490	GAGT	2	8	412834	412841	25 %	25 %	50 %	0 %	512556444
7572	NC_021490	TG	3	6	412856	412861	0 %	50 %	50 %	0 %	512556444
7573	NC_021490	T	6	6	412869	412874	0 %	100 %	0 %	0 %	512556444
7574	NC_021490	CTT	2	6	412891	412896	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512556444
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7576	NC_021490	T	6	6	413070	413075	0 %	100 %	0 %	0 %	512556444
7577	NC_021490	TCC	2	6	413120	413125	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512556444
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7579	NC_021490	AGT	2	6	413153	413158	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556444
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7581	NC_021490	TTC	2	6	413217	413222	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512556444
7582	NC_021490	TGG	2	6	413241	413246	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512556444
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7584	NC_021490	GATG	2	8	413396	413403	25 %	25 %	50 %	0 %	512556444
7585	NC_021490	ATTTT	2	10	413473	413482	20 %	80 %	0 %	0 %	512556444
7586	NC_021490	GT	4	8	413515	413522	0 %	50 %	50 %	0 %	512556444
7587	NC_021490	TGT	3	9	413533	413541	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512556444
7588	NC_021490	T	6	6	413600	413605	0 %	100 %	0 %	0 %	512556444
7589	NC_021490	CGG	2	6	413620	413625	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512556444
7590	NC_021490	GTG	2	6	413658	413663	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512556444
7591	NC_021490	T	7	7	413700	413706	0 %	100 %	0 %	0 %	512556444
7592	NC_021490	AGG	2	6	413711	413716	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512556444
7593	NC_021490	CTTT	2	8	413736	413743	0 %	75 %	0 %	25 %	512556444
7594	NC_021490	ATC	2	6	413754	413759	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512556444
7595	NC_021490	AGG	2	6	413784	413789	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512556444
7596	NC_021490	GAA	2	6	413796	413801	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512556444
7597	NC_021490	GGT	2	6	413886	413891	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512556445
7598	NC_021490	TGC	2	6	413903	413908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556445
7599	NC_021490	TG	4	8	413915	413922	0 %	50 %	50 %	0 %	512556445
7600	NC_021490	TGT	2	6	413943	413948	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512556445
7601	NC_021490	CTT	2	6	413957	413962	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512556445
7602	NC_021490	TGA	2	6	414011	414016	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556445
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7604	NC_021490	CG	3	6	414305	414310	0 %	0 %	50 %	50 %	512556445
7605	NC_021490	A	6	6	414419	414424	100 %	0 %	0 %	0 %	512556445
7606	NC_021490	GTGC	2	8	414457	414464	0 %	25 %	50 %	25 %	512556445
7607	NC_021490	GAA	2	6	414499	414504	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512556445
7608	NC_021490	CGG	2	6	414593	414598	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512556445
7609	NC_021490	AGA	2	6	414608	414613	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512556445
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7611	NC_021490	TGTAGG	2	12	414711	414722	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	512556446
7612	NC_021490	GTA	2	6	414754	414759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556446
7613	NC_021490	CCA	2	6	414789	414794	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512556446
7614	NC_021490	GAT	2	6	414813	414818	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556446
7615	NC_021490	AAGGGG	2	12	414910	414921	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512556446
7616	NC_021490	TCC	2	6	414984	414989	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512556446
7617	NC_021490	TTC	2	6	415001	415006	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512556446
7618	NC_021490	GAT	2	6	415033	415038	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556446
7619	NC_021490	T	6	6	415170	415175	0 %	100 %	0 %	0 %	512556446
7620	NC_021490	GCT	2	6	415192	415197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556446
7621	NC_021490	GTTC	2	8	415198	415205	0 %	50 %	25 %	25 %	512556446
7622	NC_021490	GT	3	6	415236	415241	0 %	50 %	50 %	0 %	512556446
7623	NC_021490	TGG	2	6	415254	415259	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512556446
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7625	NC_021490	ATTAAA	2	12	415390	415401	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512556446
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7998	NC_021490	ACAGA	2	10	434072	434081	60 %	0 %	20 %	20 %	512556465
7999	NC_021490	GAA	2	6	434090	434095	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512556465
8000	NC_021490	GCA	2	6	434152	434157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556465

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