MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum str. Nichols

Total Repeats: 21924

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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7002	NC_021490	TGT	2	6	384209	384214	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512556421
7003	NC_021490	GCCGT	2	10	384341	384350	0 %	20 %	40 %	40 %	512556421
7004	NC_021490	GCG	2	6	384367	384372	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512556421
7005	NC_021490	GTG	2	6	384450	384455	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512556421
7006	NC_021490	CTGA	2	8	384491	384498	25 %	25 %	25 %	25 %	512556421
7007	NC_021490	TGG	2	6	384536	384541	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512556421
7008	NC_021490	GC	3	6	384558	384563	0 %	0 %	50 %	50 %	512556421
7009	NC_021490	TGA	2	6	384649	384654	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556421
7010	NC_021490	ACG	2	6	384862	384867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556421
7011	NC_021490	GA	3	6	384871	384876	50 %	0 %	50 %	0 %	512556421
7012	NC_021490	GTTG	2	8	384905	384912	0 %	50 %	50 %	0 %	512556421
7013	NC_021490	ACC	2	6	384913	384918	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512556421
7014	NC_021490	AAG	2	6	385013	385018	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512556422
7015	NC_021490	TG	3	6	385027	385032	0 %	50 %	50 %	0 %	512556422
7016	NC_021490	CAC	2	6	385074	385079	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512556422
7017	NC_021490	AGT	2	6	385118	385123	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556422
7018	NC_021490	GC	4	8	385156	385163	0 %	0 %	50 %	50 %	512556422
7019	NC_021490	GCA	2	6	385171	385176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556422
7020	NC_021490	CGC	2	6	385213	385218	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512556422
7021	NC_021490	GCG	3	9	385224	385232	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512556422
7022	NC_021490	T	6	6	385786	385791	0 %	100 %	0 %	0 %	512556423
7023	NC_021490	AGC	2	6	385815	385820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556423
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7025	NC_021490	GCG	2	6	385889	385894	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512556423
7026	NC_021490	G	6	6	385906	385911	0 %	0 %	100 %	0 %	512556423
7027	NC_021490	TGC	2	6	385912	385917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556423
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7029	NC_021490	CTG	2	6	385967	385972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556423
7030	NC_021490	CGT	2	6	386031	386036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556423
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7032	NC_021490	GGA	2	6	386089	386094	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512556423
7033	NC_021490	CTGC	2	8	386129	386136	0 %	25 %	25 %	50 %	512556423
7034	NC_021490	GCG	2	6	386156	386161	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512556423
7035	NC_021490	GCC	2	6	386257	386262	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512556423
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7037	NC_021490	TGA	2	6	386350	386355	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556423
7038	NC_021490	TGA	2	6	386364	386369	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556423
7039	NC_021490	CGG	2	6	386377	386382	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512556423
7040	NC_021490	TGT	2	6	386476	386481	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512556423
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7042	NC_021490	CT	3	6	386597	386602	0 %	50 %	0 %	50 %	512556423
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7045	NC_021490	GCG	2	6	386661	386666	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512556423
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7048	NC_021490	T	6	6	386948	386953	0 %	100 %	0 %	0 %	512556423
7049	NC_021490	CTTA	2	8	386967	386974	25 %	50 %	0 %	25 %	512556423
7050	NC_021490	GAT	2	6	387019	387024	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556423
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7052	NC_021490	TCT	2	6	387101	387106	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512556423
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7054	NC_021490	TGA	2	6	387150	387155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556423
7055	NC_021490	GTG	2	6	387203	387208	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512556423
7056	NC_021490	TC	3	6	387214	387219	0 %	50 %	0 %	50 %	512556423
7057	NC_021490	AGGAG	2	10	387256	387265	40 %	0 %	60 %	0 %	512556423
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7059	NC_021490	TC	3	6	387329	387334	0 %	50 %	0 %	50 %	512556423
7060	NC_021490	CG	4	8	387362	387369	0 %	0 %	50 %	50 %	512556423
7061	NC_021490	GC	3	6	387403	387408	0 %	0 %	50 %	50 %	512556423
7062	NC_021490	GT	3	6	387501	387506	0 %	50 %	50 %	0 %	512556423
7063	NC_021490	TCGG	2	8	387577	387584	0 %	25 %	50 %	25 %	512556423
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7090	NC_021490	GAG	2	6	388936	388941	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512556424
7091	NC_021490	TTCC	2	8	388967	388974	0 %	50 %	0 %	50 %	512556424
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7121	NC_021490	CCGT	2	8	391127	391134	0 %	25 %	25 %	50 %	512556427
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7123	NC_021490	GGA	2	6	391236	391241	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512556427
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7248	NC_021490	TGCGAA	2	12	397238	397249	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	512556432
7249	NC_021490	TG	3	6	397262	397267	0 %	50 %	50 %	0 %	512556432
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7369	NC_021490	AAC	2	6	403320	403325	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512556436
7370	NC_021490	GTG	2	6	403345	403350	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512556436
7371	NC_021490	GCACA	2	10	403352	403361	40 %	0 %	20 %	40 %	512556436
7372	NC_021490	AGC	2	6	403392	403397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556436
7373	NC_021490	AC	3	6	403425	403430	50 %	0 %	0 %	50 %	512556436
7374	NC_021490	TCTT	2	8	403458	403465	0 %	75 %	0 %	25 %	512556436
7375	NC_021490	GAA	2	6	403466	403471	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512556436
7376	NC_021490	TTCTG	2	10	403479	403488	0 %	60 %	20 %	20 %	512556436
7377	NC_021490	CAGGGG	2	12	403604	403615	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	512556437
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7379	NC_021490	GTG	2	6	403725	403730	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512556437
7380	NC_021490	GCT	2	6	403743	403748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556437
7381	NC_021490	GTC	2	6	403801	403806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556437
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7384	NC_021490	ATCG	2	8	403936	403943	25 %	25 %	25 %	25 %	512556437
7385	NC_021490	T	6	6	404018	404023	0 %	100 %	0 %	0 %	512556437
7386	NC_021490	CCAG	2	8	404071	404078	25 %	0 %	25 %	50 %	512556437
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7393	NC_021490	GC	4	8	404358	404365	0 %	0 %	50 %	50 %	512556437
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7404	NC_021490	CG	4	8	404835	404842	0 %	0 %	50 %	50 %	512556437
7405	NC_021490	CAG	2	6	404887	404892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556437
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7445	NC_021490	CCT	3	9	406588	406596	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512556438
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7481	NC_021490	A	7	7	408486	408492	100 %	0 %	0 %	0 %	512556439
7482	NC_021490	TGC	2	6	408579	408584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556439
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7487	NC_021490	CA	3	6	408899	408904	50 %	0 %	0 %	50 %	512556439
7488	NC_021490	A	7	7	408922	408928	100 %	0 %	0 %	0 %	512556439
7489	NC_021490	CG	4	8	408942	408949	0 %	0 %	50 %	50 %	512556439
7490	NC_021490	AGC	2	6	408967	408972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556439
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7493	NC_021490	CGAC	2	8	409022	409029	25 %	0 %	25 %	50 %	512556439
7494	NC_021490	GGA	2	6	409332	409337	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512556440
7495	NC_021490	GC	3	6	409399	409404	0 %	0 %	50 %	50 %	512556440
7496	NC_021490	CCTG	2	8	409457	409464	0 %	25 %	25 %	50 %	512556440
7497	NC_021490	TTC	2	6	409497	409502	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512556440
7498	NC_021490	TGC	2	6	409550	409555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556440
7499	NC_021490	AGG	2	6	409577	409582	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512556440
7500	NC_021490	CG	3	6	409594	409599	0 %	0 %	50 %	50 %	512556440

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