MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Treponema pallidum str. Fribourg-Blanc

Total Repeats: 22549

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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13502	NC_021179	GCA	2	6	680438	680443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488658042
13503	NC_021179	GATG	2	8	680446	680453	25 %	25 %	50 %	0 %	488658042
13504	NC_021179	TTG	2	6	680459	680464	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	488658042
13505	NC_021179	CA	3	6	680536	680541	50 %	0 %	0 %	50 %	488658042
13506	NC_021179	CGCC	2	8	680638	680645	0 %	0 %	25 %	75 %	488658042
13507	NC_021179	CA	3	6	680688	680693	50 %	0 %	0 %	50 %	488658042
13508	NC_021179	TCA	2	6	680724	680729	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488658042
13509	NC_021179	CCA	2	6	680733	680738	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	488658042
13510	NC_021179	GC	4	8	680758	680765	0 %	0 %	50 %	50 %	488658042
13511	NC_021179	G	6	6	680772	680777	0 %	0 %	100 %	0 %	488658042
13512	NC_021179	CGC	2	6	680859	680864	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488658042
13513	NC_021179	CG	4	8	680886	680893	0 %	0 %	50 %	50 %	488658042
13514	NC_021179	CCA	2	6	680924	680929	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	488658042
13515	NC_021179	CCG	2	6	680930	680935	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488658042
13516	NC_021179	GCG	2	6	680945	680950	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488658042
13517	NC_021179	GCA	2	6	680963	680968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488658042
13518	NC_021179	GCA	2	6	680992	680997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488658042
13519	NC_021179	CCTG	2	8	681138	681145	0 %	25 %	25 %	50 %	488658043
13520	NC_021179	TGC	2	6	681151	681156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488658043
13521	NC_021179	CT	3	6	681192	681197	0 %	50 %	0 %	50 %	488658043
13522	NC_021179	ACGC	2	8	681209	681216	25 %	0 %	25 %	50 %	488658043
13523	NC_021179	GCA	2	6	681237	681242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488658043
13524	NC_021179	TCC	3	9	681261	681269	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	488658043
13525	NC_021179	AC	3	6	681322	681327	50 %	0 %	0 %	50 %	488658043
13526	NC_021179	TGCACG	2	12	681385	681396	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	488658043
13527	NC_021179	GCCT	2	8	681402	681409	0 %	25 %	25 %	50 %	488658043
13528	NC_021179	CAG	2	6	681420	681425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488658043
13529	NC_021179	TCG	2	6	681486	681491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488658043
13530	NC_021179	A	6	6	681528	681533	100 %	0 %	0 %	0 %	488658043
13531	NC_021179	CAC	2	6	681572	681577	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	488658043
13532	NC_021179	GC	3	6	681647	681652	0 %	0 %	50 %	50 %	488658043
13533	NC_021179	CACG	2	8	681661	681668	25 %	0 %	25 %	50 %	488658043
13534	NC_021179	C	7	7	681691	681697	0 %	0 %	0 %	100 %	488658043
13535	NC_021179	GCC	2	6	681711	681716	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488658043
13536	NC_021179	GC	3	6	681740	681745	0 %	0 %	50 %	50 %	488658043
13537	NC_021179	TGTT	2	8	681794	681801	0 %	75 %	25 %	0 %	488658043
13538	NC_021179	GTG	2	6	681881	681886	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	488658043
13539	NC_021179	GC	3	6	681956	681961	0 %	0 %	50 %	50 %	488658043
13540	NC_021179	CAG	2	6	681974	681979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488658043
13541	NC_021179	GC	3	6	682025	682030	0 %	0 %	50 %	50 %	488658043
13542	NC_021179	TTGC	2	8	682046	682053	0 %	50 %	25 %	25 %	488658043
13543	NC_021179	CGA	2	6	682078	682083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488658043
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13545	NC_021179	ACG	2	6	682146	682151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488658043
13546	NC_021179	CGA	2	6	682168	682173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488658043
13547	NC_021179	CGGTGT	2	12	682183	682194	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	488658043
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13551	NC_021179	GCGCA	2	10	682403	682412	20 %	0 %	40 %	40 %	488658043
13552	NC_021179	TAC	2	6	682456	682461	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488658043
13553	NC_021179	ACGC	2	8	682502	682509	25 %	0 %	25 %	50 %	488658043
13554	NC_021179	TCG	2	6	682525	682530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488658043
13555	NC_021179	AGGA	2	8	682659	682666	50 %	0 %	50 %	0 %	488658044
13556	NC_021179	CG	3	6	682684	682689	0 %	0 %	50 %	50 %	488658044
13557	NC_021179	CAC	2	6	682733	682738	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	488658044
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13559	NC_021179	TGC	2	6	682781	682786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488658044
13560	NC_021179	ACG	2	6	682802	682807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488658044
13561	NC_021179	TAC	2	6	682834	682839	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488658044
13562	NC_021179	TA	3	6	682957	682962	50 %	50 %	0 %	0 %	488658044
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13564	NC_021179	GCAG	2	8	682981	682988	25 %	0 %	50 %	25 %	488658044
13565	NC_021179	GCCT	2	8	682994	683001	0 %	25 %	25 %	50 %	488658044
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13569	NC_021179	A	6	6	683162	683167	100 %	0 %	0 %	0 %	488658044
13570	NC_021179	AAG	2	6	683186	683191	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	488658044
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13573	NC_021179	AGAC	2	8	683231	683238	50 %	0 %	25 %	25 %	488658044
13574	NC_021179	AAG	2	6	683240	683245	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	488658044
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13576	NC_021179	GCAAA	2	10	683258	683267	60 %	0 %	20 %	20 %	488658044
13577	NC_021179	CACC	2	8	683297	683304	25 %	0 %	0 %	75 %	488658044
13578	NC_021179	CA	3	6	683319	683324	50 %	0 %	0 %	50 %	488658045
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13593	NC_021179	CCAT	2	8	684088	684095	25 %	25 %	0 %	50 %	488658045
13594	NC_021179	TA	3	6	684160	684165	50 %	50 %	0 %	0 %	488658045
13595	NC_021179	T	6	6	684197	684202	0 %	100 %	0 %	0 %	488658045
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13601	NC_021179	TGA	2	6	684413	684418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488658045
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13603	NC_021179	GT	3	6	684569	684574	0 %	50 %	50 %	0 %	488658046
13604	NC_021179	CGC	2	6	684685	684690	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488658046
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13607	NC_021179	ATGG	2	8	684831	684838	25 %	25 %	50 %	0 %	488658046
13608	NC_021179	TCT	2	6	684889	684894	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	488658046
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13610	NC_021179	TGA	2	6	684993	684998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488658046
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13612	NC_021179	A	10	10	685042	685051	100 %	0 %	0 %	0 %	488658046
13613	NC_021179	AAAC	2	8	685142	685149	75 %	0 %	0 %	25 %	488658046
13614	NC_021179	GCAC	2	8	685168	685175	25 %	0 %	25 %	50 %	488658046
13615	NC_021179	GCA	2	6	685186	685191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488658046
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13618	NC_021179	TGCG	2	8	685275	685282	0 %	25 %	50 %	25 %	488658046
13619	NC_021179	CG	3	6	685298	685303	0 %	0 %	50 %	50 %	488658046
13620	NC_021179	CG	4	8	685343	685350	0 %	0 %	50 %	50 %	488658046
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13989	NC_021179	CTG	2	6	704195	704200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488658060
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13991	NC_021179	CACT	2	8	704245	704252	25 %	25 %	0 %	50 %	488658060
13992	NC_021179	ACCGA	2	10	704304	704313	40 %	0 %	20 %	40 %	488658060
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