MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Treponema pallidum str. Fribourg-Blanc

Total Repeats: 22549

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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13002	NC_021179	AG	3	6	656076	656081	50 %	0 %	50 %	0 %	488658020
13003	NC_021179	CAG	2	6	656092	656097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488658020
13004	NC_021179	ACC	3	9	656115	656123	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	488658020
13005	NC_021179	GAA	2	6	656136	656141	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	488658020
13006	NC_021179	TGCG	2	8	656155	656162	0 %	25 %	50 %	25 %	488658020
13007	NC_021179	CTT	2	6	656167	656172	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	488658020
13008	NC_021179	CG	3	6	656218	656223	0 %	0 %	50 %	50 %	488658020
13009	NC_021179	CG	3	6	656232	656237	0 %	0 %	50 %	50 %	488658020
13010	NC_021179	CCA	2	6	656266	656271	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	488658020
13011	NC_021179	TGC	2	6	656309	656314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488658020
13012	NC_021179	CCGCC	2	10	656447	656456	0 %	0 %	20 %	80 %	488658021
13013	NC_021179	A	6	6	656464	656469	100 %	0 %	0 %	0 %	488658021
13014	NC_021179	TCA	2	6	656499	656504	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488658021
13015	NC_021179	CGACT	2	10	656506	656515	20 %	20 %	20 %	40 %	488658021
13016	NC_021179	CAGT	2	8	656532	656539	25 %	25 %	25 %	25 %	488658021
13017	NC_021179	AG	3	6	656575	656580	50 %	0 %	50 %	0 %	488658021
13018	NC_021179	TGT	2	6	656694	656699	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	488658021
13019	NC_021179	A	8	8	656758	656765	100 %	0 %	0 %	0 %	488658021
13020	NC_021179	A	9	9	656808	656816	100 %	0 %	0 %	0 %	488658021
13021	NC_021179	AAG	2	6	656883	656888	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	488658021
13022	NC_021179	A	7	7	656915	656921	100 %	0 %	0 %	0 %	488658021
13023	NC_021179	AGC	2	6	656930	656935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488658021
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13025	NC_021179	GCAT	2	8	657077	657084	25 %	25 %	25 %	25 %	488658021
13026	NC_021179	A	8	8	657188	657195	100 %	0 %	0 %	0 %	488658021
13027	NC_021179	GC	3	6	657271	657276	0 %	0 %	50 %	50 %	488658022
13028	NC_021179	TCT	2	6	657283	657288	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	488658022
13029	NC_021179	A	6	6	657352	657357	100 %	0 %	0 %	0 %	488658022
13030	NC_021179	TGA	2	6	657386	657391	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488658022
13031	NC_021179	GCG	2	6	657413	657418	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488658022
13032	NC_021179	CTT	2	6	657440	657445	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	488658022
13033	NC_021179	TGC	2	6	657476	657481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488658022
13034	NC_021179	T	6	6	657490	657495	0 %	100 %	0 %	0 %	488658022
13035	NC_021179	AGT	2	6	657546	657551	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488658022
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13039	NC_021179	CCG	2	6	657825	657830	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488658022
13040	NC_021179	TCCA	2	8	657879	657886	25 %	25 %	0 %	50 %	488658022
13041	NC_021179	TGA	2	6	657887	657892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488658022
13042	NC_021179	TGC	2	6	657901	657906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488658022
13043	NC_021179	CTG	2	6	658003	658008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488658023
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13045	NC_021179	CG	3	6	658096	658101	0 %	0 %	50 %	50 %	488658023
13046	NC_021179	CG	4	8	658115	658122	0 %	0 %	50 %	50 %	488658023
13047	NC_021179	CCTG	2	8	658123	658130	0 %	25 %	25 %	50 %	488658023
13048	NC_021179	TCCT	2	8	658137	658144	0 %	50 %	0 %	50 %	488658023
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13052	NC_021179	TAG	2	6	658338	658343	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488658023
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13054	NC_021179	CTT	2	6	658427	658432	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	488658023
13055	NC_021179	TCT	2	6	658435	658440	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	488658023
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13057	NC_021179	T	7	7	658648	658654	0 %	100 %	0 %	0 %	488658024
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13059	NC_021179	GCT	2	6	658685	658690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488658024
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13061	NC_021179	GCT	2	6	658799	658804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488658024
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13063	NC_021179	GC	3	6	658834	658839	0 %	0 %	50 %	50 %	488658024
13064	NC_021179	GCC	2	6	658858	658863	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488658024
13065	NC_021179	CAG	2	6	658873	658878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488658024
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13091	NC_021179	GCGCT	2	10	660150	660159	0 %	20 %	40 %	40 %	488658025
13092	NC_021179	TGC	2	6	660175	660180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488658025
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13101	NC_021179	GC	3	6	660819	660824	0 %	0 %	50 %	50 %	488658026
13102	NC_021179	CCA	2	6	660871	660876	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	488658026
13103	NC_021179	GC	3	6	660879	660884	0 %	0 %	50 %	50 %	488658026
13104	NC_021179	GA	3	6	660938	660943	50 %	0 %	50 %	0 %	488658026
13105	NC_021179	CCG	2	6	661042	661047	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488658026
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13108	NC_021179	CAG	2	6	661207	661212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488658026
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13112	NC_021179	CAC	2	6	661337	661342	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	488658026
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13126	NC_021179	TAC	2	6	662256	662261	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488658028
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13129	NC_021179	CTG	2	6	662363	662368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488658028
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13229	NC_021179	AATC	2	8	667305	667312	50 %	25 %	0 %	25 %	488658031
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13232	NC_021179	TAC	2	6	667392	667397	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488658031
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13235	NC_021179	CCA	2	6	667462	667467	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	488658031
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13237	NC_021179	TCGC	2	8	667607	667614	0 %	25 %	25 %	50 %	488658031
13238	NC_021179	A	6	6	667730	667735	100 %	0 %	0 %	0 %	488658031
13239	NC_021179	CAT	2	6	667856	667861	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488658031
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13489	NC_021179	CTG	2	6	679934	679939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488658042
13490	NC_021179	GCT	2	6	679963	679968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488658042
13491	NC_021179	GTGA	2	8	680078	680085	25 %	25 %	50 %	0 %	488658042
13492	NC_021179	CGC	2	6	680125	680130	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488658042
13493	NC_021179	A	6	6	680135	680140	100 %	0 %	0 %	0 %	488658042
13494	NC_021179	CAGG	2	8	680231	680238	25 %	0 %	50 %	25 %	488658042
13495	NC_021179	CCG	2	6	680241	680246	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488658042
13496	NC_021179	TGAG	2	8	680259	680266	25 %	25 %	50 %	0 %	488658042
13497	NC_021179	CGA	2	6	680281	680286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488658042
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