MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Treponema pallidum str. Fribourg-Blanc

Total Repeats: 22549

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_021179	CTG	2	6	631435	631440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488658000
12502	NC_021179	GC	4	8	631469	631476	0 %	0 %	50 %	50 %	488658000
12503	NC_021179	CCA	2	6	631618	631623	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	488658000
12504	NC_021179	AC	3	6	631702	631707	50 %	0 %	0 %	50 %	488658000
12505	NC_021179	T	6	6	631726	631731	0 %	100 %	0 %	0 %	488658000
12506	NC_021179	CAT	2	6	631733	631738	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488658000
12507	NC_021179	G	6	6	631774	631779	0 %	0 %	100 %	0 %	488658000
12508	NC_021179	CG	4	8	631808	631815	0 %	0 %	50 %	50 %	488658000
12509	NC_021179	GTTT	2	8	631817	631824	0 %	75 %	25 %	0 %	488658000
12510	NC_021179	GAT	2	6	631846	631851	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488658000
12511	NC_021179	CAG	2	6	631876	631881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488658001
12512	NC_021179	TG	3	6	631899	631904	0 %	50 %	50 %	0 %	488658001
12513	NC_021179	GC	3	6	631914	631919	0 %	0 %	50 %	50 %	488658001
12514	NC_021179	A	6	6	631968	631973	100 %	0 %	0 %	0 %	488658001
12515	NC_021179	TCC	2	6	631991	631996	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	488658001
12516	NC_021179	TCA	2	6	632108	632113	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488658001
12517	NC_021179	A	6	6	632289	632294	100 %	0 %	0 %	0 %	488658001
12518	NC_021179	ACCAC	2	10	632300	632309	40 %	0 %	0 %	60 %	488658001
12519	NC_021179	AC	4	8	632308	632315	50 %	0 %	0 %	50 %	488658001
12520	NC_021179	CG	4	8	632321	632328	0 %	0 %	50 %	50 %	488658001
12521	NC_021179	TCG	2	6	632349	632354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488658001
12522	NC_021179	CG	3	6	632370	632375	0 %	0 %	50 %	50 %	488658001
12523	NC_021179	ACGC	2	8	632388	632395	25 %	0 %	25 %	50 %	488658001
12524	NC_021179	ACGCGC	2	12	632409	632420	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	488658001
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12527	NC_021179	AAGG	2	8	632546	632553	50 %	0 %	50 %	0 %	488658001
12528	NC_021179	GGAA	2	8	632583	632590	50 %	0 %	50 %	0 %	488658001
12529	NC_021179	GC	4	8	632681	632688	0 %	0 %	50 %	50 %	488658002
12530	NC_021179	T	8	8	632713	632720	0 %	100 %	0 %	0 %	488658002
12531	NC_021179	CAG	2	6	632784	632789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488658002
12532	NC_021179	GGC	2	6	632877	632882	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488658002
12533	NC_021179	TAT	2	6	632934	632939	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	488658002
12534	NC_021179	GC	3	6	633078	633083	0 %	0 %	50 %	50 %	488658002
12535	NC_021179	GTAC	2	8	633093	633100	25 %	25 %	25 %	25 %	488658002
12536	NC_021179	CAC	2	6	633248	633253	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	488658002
12537	NC_021179	ACG	2	6	633264	633269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488658002
12538	NC_021179	TCTT	2	8	633328	633335	0 %	75 %	0 %	25 %	488658002
12539	NC_021179	T	7	7	633389	633395	0 %	100 %	0 %	0 %	488658002
12540	NC_021179	AGA	2	6	633412	633417	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	488658002
12541	NC_021179	CTT	2	6	633429	633434	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	488658002
12542	NC_021179	TGG	2	6	633451	633456	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	488658002
12543	NC_021179	GAA	2	6	633507	633512	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	488658002
12544	NC_021179	GTCA	2	8	633543	633550	25 %	25 %	25 %	25 %	488658002
12545	NC_021179	CT	4	8	633599	633606	0 %	50 %	0 %	50 %	488658002
12546	NC_021179	AAT	2	6	633650	633655	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	488658002
12547	NC_021179	CTG	2	6	633670	633675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488658002
12548	NC_021179	CTT	2	6	633724	633729	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	488658002
12549	NC_021179	GT	3	6	633733	633738	0 %	50 %	50 %	0 %	488658002
12550	NC_021179	AGG	2	6	633793	633798	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	488658002
12551	NC_021179	ATGA	2	8	633898	633905	50 %	25 %	25 %	0 %	488658002
12552	NC_021179	TTCT	2	8	633911	633918	0 %	75 %	0 %	25 %	488658003
12553	NC_021179	AAGT	2	8	633926	633933	50 %	25 %	25 %	0 %	488658003
12554	NC_021179	CTG	2	6	633942	633947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488658003
12555	NC_021179	ATT	2	6	634057	634062	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	488658003
12556	NC_021179	GGA	2	6	634063	634068	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	488658003
12557	NC_021179	GCAC	2	8	634131	634138	25 %	0 %	25 %	50 %	488658003
12558	NC_021179	TCA	2	6	634182	634187	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488658003
12559	NC_021179	GTGC	2	8	634261	634268	0 %	25 %	50 %	25 %	488658003
12560	NC_021179	GC	3	6	634308	634313	0 %	0 %	50 %	50 %	488658003
12561	NC_021179	CAT	2	6	634315	634320	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488658003
12562	NC_021179	AGG	2	6	634338	634343	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	488658003
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12564	NC_021179	CTG	2	6	634456	634461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488658003
12565	NC_021179	TC	3	6	634463	634468	0 %	50 %	0 %	50 %	488658003
12566	NC_021179	CAG	2	6	634552	634557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488658003
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12571	NC_021179	CAT	2	6	634802	634807	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488658004
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12587	NC_021179	ATCG	2	8	635521	635528	25 %	25 %	25 %	25 %	488658004
12588	NC_021179	GTTATT	2	12	635558	635569	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	488658004
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12590	NC_021179	TGG	2	6	635620	635625	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	488658004
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12592	NC_021179	AGG	2	6	635969	635974	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	488658004
12593	NC_021179	CAT	2	6	636002	636007	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488658004
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12595	NC_021179	TGC	2	6	636300	636305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488658005
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12597	NC_021179	ACT	2	6	636459	636464	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488658005
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12600	NC_021179	GCT	2	6	636611	636616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488658005
12601	NC_021179	CAGCA	2	10	636682	636691	40 %	0 %	20 %	40 %	488658005
12602	NC_021179	CAA	2	6	636784	636789	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	488658005
12603	NC_021179	GA	3	6	636880	636885	50 %	0 %	50 %	0 %	488658005
12604	NC_021179	TCC	2	6	636924	636929	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	488658005
12605	NC_021179	GAA	2	6	636938	636943	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	488658005
12606	NC_021179	TCT	2	6	636944	636949	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	488658005
12607	NC_021179	TAC	2	6	636993	636998	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488658005
12608	NC_021179	GAG	2	6	637070	637075	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	488658005
12609	NC_021179	CTT	2	6	637099	637104	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	488658005
12610	NC_021179	GTC	3	9	637172	637180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488658005
12611	NC_021179	GT	3	6	637249	637254	0 %	50 %	50 %	0 %	488658005
12612	NC_021179	AGC	2	6	637323	637328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488658005
12613	NC_021179	TGA	2	6	637393	637398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488658005
12614	NC_021179	TAC	2	6	637400	637405	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488658005
12615	NC_021179	GC	3	6	637426	637431	0 %	0 %	50 %	50 %	488658005
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12617	NC_021179	CGC	2	6	637581	637586	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488658006
12618	NC_021179	GTA	2	6	637599	637604	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488658006
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12620	NC_021179	CT	3	6	637624	637629	0 %	50 %	0 %	50 %	488658006
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12990	NC_021179	TGC	2	6	655424	655429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488658020
12991	NC_021179	ACGC	2	8	655447	655454	25 %	0 %	25 %	50 %	488658020
12992	NC_021179	AGG	2	6	655565	655570	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	488658020
12993	NC_021179	CAC	3	9	655688	655696	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	488658020
12994	NC_021179	A	6	6	655721	655726	100 %	0 %	0 %	0 %	488658020
12995	NC_021179	TCT	2	6	655786	655791	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	488658020
12996	NC_021179	ACC	2	6	655874	655879	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	488658020
12997	NC_021179	GC	3	6	655912	655917	0 %	0 %	50 %	50 %	488658020
12998	NC_021179	AGC	2	6	655943	655948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488658020
12999	NC_021179	TTG	2	6	655972	655977	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	488658020
13000	NC_021179	GCA	2	6	655995	656000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488658020

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