MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Treponema pallidum str. Fribourg-Blanc

Total Repeats: 22549

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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11502	NC_021179	TGC	2	6	584925	584930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488657960
11503	NC_021179	CGC	2	6	584959	584964	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488657960
11504	NC_021179	CTG	2	6	584979	584984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488657960
11505	NC_021179	GA	3	6	585046	585051	50 %	0 %	50 %	0 %	488657960
11506	NC_021179	GCG	2	6	585065	585070	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488657960
11507	NC_021179	CGCA	2	8	585171	585178	25 %	0 %	25 %	50 %	488657960
11508	NC_021179	CGC	2	6	585209	585214	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488657960
11509	NC_021179	CG	3	6	585236	585241	0 %	0 %	50 %	50 %	488657960
11510	NC_021179	GAA	2	6	585286	585291	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	488657960
11511	NC_021179	CG	3	6	585329	585334	0 %	0 %	50 %	50 %	488657960
11512	NC_021179	CTC	2	6	585344	585349	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	488657960
11513	NC_021179	CA	3	6	585410	585415	50 %	0 %	0 %	50 %	488657960
11514	NC_021179	CGC	2	6	585463	585468	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488657961
11515	NC_021179	GGGC	2	8	585471	585478	0 %	0 %	75 %	25 %	488657961
11516	NC_021179	CA	4	8	585510	585517	50 %	0 %	0 %	50 %	488657961
11517	NC_021179	ATA	2	6	585529	585534	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	488657961
11518	NC_021179	CGA	2	6	585587	585592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488657961
11519	NC_021179	GA	3	6	585591	585596	50 %	0 %	50 %	0 %	488657961
11520	NC_021179	T	6	6	585635	585640	0 %	100 %	0 %	0 %	488657961
11521	NC_021179	AGA	2	6	585724	585729	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	488657961
11522	NC_021179	AGA	2	6	585779	585784	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	488657961
11523	NC_021179	AAT	2	6	585810	585815	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	488657961
11524	NC_021179	A	7	7	585859	585865	100 %	0 %	0 %	0 %	488657961
11525	NC_021179	A	6	6	585879	585884	100 %	0 %	0 %	0 %	488657961
11526	NC_021179	GTAC	2	8	585892	585899	25 %	25 %	25 %	25 %	488657961
11527	NC_021179	TG	3	6	586010	586015	0 %	50 %	50 %	0 %	488657961
11528	NC_021179	CAG	2	6	586023	586028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488657961
11529	NC_021179	AGCAGA	2	12	586051	586062	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	488657961
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11531	NC_021179	GC	3	6	586235	586240	0 %	0 %	50 %	50 %	488657961
11532	NC_021179	CA	3	6	586254	586259	50 %	0 %	0 %	50 %	488657961
11533	NC_021179	CTT	2	6	586302	586307	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	488657961
11534	NC_021179	GACA	2	8	586317	586324	50 %	0 %	25 %	25 %	488657961
11535	NC_021179	GC	3	6	586341	586346	0 %	0 %	50 %	50 %	488657961
11536	NC_021179	TAA	2	6	586386	586391	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	488657961
11537	NC_021179	CG	3	6	586422	586427	0 %	0 %	50 %	50 %	488657961
11538	NC_021179	TCA	2	6	586601	586606	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488657961
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11540	NC_021179	CGG	2	6	586659	586664	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488657961
11541	NC_021179	ACC	2	6	586870	586875	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	488657961
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11543	NC_021179	GTG	2	6	587045	587050	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	488657961
11544	NC_021179	C	6	6	587085	587090	0 %	0 %	0 %	100 %	488657961
11545	NC_021179	GAA	2	6	587091	587096	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	488657961
11546	NC_021179	AG	3	6	587139	587144	50 %	0 %	50 %	0 %	488657961
11547	NC_021179	GAT	2	6	587156	587161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488657962
11548	NC_021179	ACCGC	2	10	587190	587199	20 %	0 %	20 %	60 %	488657962
11549	NC_021179	ACTC	2	8	587212	587219	25 %	25 %	0 %	50 %	488657962
11550	NC_021179	GCA	2	6	587221	587226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488657963
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11553	NC_021179	GCA	2	6	587449	587454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488657963
11554	NC_021179	ATC	2	6	587457	587462	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488657963
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11556	NC_021179	CA	3	6	587600	587605	50 %	0 %	0 %	50 %	488657963
11557	NC_021179	GCA	2	6	587788	587793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488657963
11558	NC_021179	GCGCTC	2	12	587850	587861	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	488657963
11559	NC_021179	GCT	2	6	587995	588000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488657964
11560	NC_021179	CAG	2	6	588022	588027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488657964
11561	NC_021179	GC	3	6	588035	588040	0 %	0 %	50 %	50 %	488657964
11562	NC_021179	ACAG	2	8	588045	588052	50 %	0 %	25 %	25 %	488657964
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11565	NC_021179	GCC	2	6	588258	588263	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488657964
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11570	NC_021179	GC	3	6	588458	588463	0 %	0 %	50 %	50 %	488657964
11571	NC_021179	T	6	6	588468	588473	0 %	100 %	0 %	0 %	488657964
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11578	NC_021179	CAA	2	6	588787	588792	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	488657964
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11588	NC_021179	CCACG	2	10	589648	589657	20 %	0 %	20 %	60 %	488657964
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11591	NC_021179	CACG	2	8	589784	589791	25 %	0 %	25 %	50 %	488657964
11592	NC_021179	CA	4	8	589899	589906	50 %	0 %	0 %	50 %	488657965
11593	NC_021179	CG	3	6	589934	589939	0 %	0 %	50 %	50 %	488657965
11594	NC_021179	TGCG	2	8	589958	589965	0 %	25 %	50 %	25 %	488657965
11595	NC_021179	CAAA	2	8	590020	590027	75 %	0 %	0 %	25 %	488657965
11596	NC_021179	A	7	7	590159	590165	100 %	0 %	0 %	0 %	488657965
11597	NC_021179	GT	4	8	590243	590250	0 %	50 %	50 %	0 %	488657965
11598	NC_021179	TC	3	6	590337	590342	0 %	50 %	0 %	50 %	488657965
11599	NC_021179	AC	3	6	590351	590356	50 %	0 %	0 %	50 %	488657965
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11604	NC_021179	GC	3	6	590588	590593	0 %	0 %	50 %	50 %	488657965
11605	NC_021179	CTG	2	6	590594	590599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488657965
11606	NC_021179	GC	3	6	590618	590623	0 %	0 %	50 %	50 %	488657965
11607	NC_021179	CGC	2	6	590662	590667	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488657965
11608	NC_021179	GC	3	6	590666	590671	0 %	0 %	50 %	50 %	488657965
11609	NC_021179	T	6	6	590744	590749	0 %	100 %	0 %	0 %	488657965
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11611	NC_021179	GC	3	6	590777	590782	0 %	0 %	50 %	50 %	488657965
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11615	NC_021179	GGAT	2	8	590996	591003	25 %	25 %	50 %	0 %	488657966
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11621	NC_021179	GACG	2	8	591382	591389	25 %	0 %	50 %	25 %	488657966
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11993	NC_021179	TGA	2	6	607126	607131	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488657980
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