MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Treponema pallidum str. Fribourg-Blanc

Total Repeats: 22549

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_021179	GCAGAC	2	12	238872	238883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488657651
4502	NC_021179	TCG	2	6	238888	238893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488657651
4503	NC_021179	GAA	2	6	238914	238919	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	488657651
4504	NC_021179	GTC	2	6	238930	238935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488657651
4505	NC_021179	GCG	2	6	238977	238982	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488657651
4506	NC_021179	GCCG	2	8	239032	239039	0 %	0 %	50 %	50 %	488657651
4507	NC_021179	TCC	2	6	239089	239094	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	488657651
4508	NC_021179	GCACA	2	10	239151	239160	40 %	0 %	20 %	40 %	488657651
4509	NC_021179	AAC	2	6	239168	239173	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	488657651
4510	NC_021179	T	6	6	239202	239207	0 %	100 %	0 %	0 %	488657651
4511	NC_021179	GTT	2	6	239252	239257	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	488657651
4512	NC_021179	GGA	2	6	239288	239293	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	488657651
4513	NC_021179	TGC	2	6	239317	239322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488657651
4514	NC_021179	CA	3	6	239338	239343	50 %	0 %	0 %	50 %	488657651
4515	NC_021179	CGTG	2	8	239416	239423	0 %	25 %	50 %	25 %	488657652
4516	NC_021179	TGC	2	6	239424	239429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488657652
4517	NC_021179	TTC	2	6	239517	239522	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	488657652
4518	NC_021179	CTG	2	6	239525	239530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488657652
4519	NC_021179	GGT	2	6	239536	239541	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	488657652
4520	NC_021179	ATC	2	6	239563	239568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488657652
4521	NC_021179	TG	3	6	239642	239647	0 %	50 %	50 %	0 %	488657652
4522	NC_021179	TG	3	6	239663	239668	0 %	50 %	50 %	0 %	488657652
4523	NC_021179	GGT	2	6	239670	239675	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	488657652
4524	NC_021179	TCT	2	6	239704	239709	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	488657652
4525	NC_021179	CTT	2	6	239714	239719	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	488657652
4526	NC_021179	GC	3	6	239803	239808	0 %	0 %	50 %	50 %	488657652
4527	NC_021179	GC	3	6	239859	239864	0 %	0 %	50 %	50 %	488657652
4528	NC_021179	TATC	2	8	239898	239905	25 %	50 %	0 %	25 %	488657652
4529	NC_021179	CTCA	2	8	239923	239930	25 %	25 %	0 %	50 %	488657652
4530	NC_021179	AGG	2	6	239942	239947	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	488657652
4531	NC_021179	GGC	2	6	239970	239975	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488657652
4532	NC_021179	GGC	2	6	240020	240025	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488657652
4533	NC_021179	GAA	2	6	240115	240120	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	488657652
4534	NC_021179	TGC	2	6	240254	240259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488657652
4535	NC_021179	G	6	6	240260	240265	0 %	0 %	100 %	0 %	488657652
4536	NC_021179	CGT	2	6	240271	240276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488657652
4537	NC_021179	G	8	8	240300	240307	0 %	0 %	100 %	0 %	488657652
4538	NC_021179	CCG	2	6	240310	240315	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488657652
4539	NC_021179	GGT	2	6	240324	240329	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	488657652
4540	NC_021179	CT	3	6	240355	240360	0 %	50 %	0 %	50 %	488657652
4541	NC_021179	TGG	2	6	240368	240373	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	488657652
4542	NC_021179	AGG	2	6	240392	240397	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	488657652
4543	NC_021179	TCG	2	6	240426	240431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488657652
4544	NC_021179	GCAAT	2	10	240526	240535	40 %	20 %	20 %	20 %	488657652
4545	NC_021179	GGCA	2	8	240547	240554	25 %	0 %	50 %	25 %	488657652
4546	NC_021179	GCC	2	6	240561	240566	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488657652
4547	NC_021179	TCAT	2	8	240585	240592	25 %	50 %	0 %	25 %	488657652
4548	NC_021179	CGG	2	6	240606	240611	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488657652
4549	NC_021179	TGCGC	2	10	240687	240696	0 %	20 %	40 %	40 %	488657652
4550	NC_021179	GCA	2	6	240708	240713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488657652
4551	NC_021179	CG	3	6	240730	240735	0 %	0 %	50 %	50 %	488657652
4552	NC_021179	CGC	2	6	240852	240857	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488657652
4553	NC_021179	TGA	2	6	240875	240880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488657652
4554	NC_021179	TCA	2	6	240926	240931	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488657652
4555	NC_021179	GGT	2	6	240960	240965	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	488657652
4556	NC_021179	GT	3	6	240964	240969	0 %	50 %	50 %	0 %	488657652
4557	NC_021179	GCA	2	6	240972	240977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488657652
4558	NC_021179	GTTT	2	8	241059	241066	0 %	75 %	25 %	0 %	488657652
4559	NC_021179	GCA	2	6	241070	241075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488657652
4560	NC_021179	CGC	2	6	241098	241103	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488657652
4561	NC_021179	GT	3	6	241170	241175	0 %	50 %	50 %	0 %	488657652
4562	NC_021179	GGCA	2	8	241188	241195	25 %	0 %	50 %	25 %	488657652
4563	NC_021179	CTG	2	6	241213	241218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488657652
4564	NC_021179	CAT	2	6	241226	241231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488657652
4565	NC_021179	GTG	2	6	241237	241242	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	488657652
4566	NC_021179	CAG	2	6	241243	241248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488657652
4567	NC_021179	GC	3	6	241252	241257	0 %	0 %	50 %	50 %	488657652
4568	NC_021179	CGG	2	6	241283	241288	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488657652
4569	NC_021179	ATT	2	6	241445	241450	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	488657653
4570	NC_021179	GGT	2	6	241465	241470	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	488657653
4571	NC_021179	GCGGGT	2	12	241513	241524	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	488657653
4572	NC_021179	TGC	2	6	241605	241610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488657653
4573	NC_021179	GCT	2	6	241634	241639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488657653
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4576	NC_021179	GCA	2	6	241754	241759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488657653
4577	NC_021179	GGC	2	6	241761	241766	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488657653
4578	NC_021179	GT	3	6	241800	241805	0 %	50 %	50 %	0 %	488657653
4579	NC_021179	TGCG	2	8	241806	241813	0 %	25 %	50 %	25 %	488657653
4580	NC_021179	CATA	2	8	241823	241830	50 %	25 %	0 %	25 %	488657653
4581	NC_021179	CG	3	6	241930	241935	0 %	0 %	50 %	50 %	488657653
4582	NC_021179	CGTG	2	8	241952	241959	0 %	25 %	50 %	25 %	488657653
4583	NC_021179	CA	3	6	241986	241991	50 %	0 %	0 %	50 %	488657653
4584	NC_021179	TGT	2	6	242338	242343	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	488657654
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4587	NC_021179	T	6	6	242462	242467	0 %	100 %	0 %	0 %	488657654
4588	NC_021179	GTATT	2	10	242508	242517	20 %	60 %	20 %	0 %	488657654
4589	NC_021179	TCC	2	6	242543	242548	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	488657654
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4591	NC_021179	AAG	2	6	242780	242785	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	488657654
4592	NC_021179	GTT	2	6	242814	242819	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	488657654
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4594	NC_021179	CGG	2	6	243124	243129	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488657655
4595	NC_021179	GCG	2	6	243164	243169	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488657655
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4601	NC_021179	TCT	3	9	243600	243608	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	488657656
4602	NC_021179	CA	3	6	243644	243649	50 %	0 %	0 %	50 %	488657657
4603	NC_021179	AACG	2	8	243715	243722	50 %	0 %	25 %	25 %	488657657
4604	NC_021179	AAG	2	6	243776	243781	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	488657657
4605	NC_021179	GGT	2	6	243784	243789	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	488657657
4606	NC_021179	TTG	2	6	243815	243820	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	488657657
4607	NC_021179	GGA	2	6	243849	243854	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	488657657
4608	NC_021179	GT	3	6	243857	243862	0 %	50 %	50 %	0 %	488657657
4609	NC_021179	T	6	6	243895	243900	0 %	100 %	0 %	0 %	488657657
4610	NC_021179	TTC	2	6	243904	243909	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	488657657
4611	NC_021179	CTC	2	6	243993	243998	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	488657657
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4613	NC_021179	ACA	2	6	244024	244029	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	488657657
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4621	NC_021179	CGC	2	6	244507	244512	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488657658
4622	NC_021179	TTA	2	6	244525	244530	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	488657658
4623	NC_021179	CGA	2	6	244558	244563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488657658
4624	NC_021179	GC	3	6	244584	244589	0 %	0 %	50 %	50 %	488657658
4625	NC_021179	TGC	2	6	244658	244663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488657658
4626	NC_021179	ATC	2	6	244671	244676	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488657658
4627	NC_021179	GCA	2	6	244690	244695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488657658
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4631	NC_021179	TGC	2	6	244972	244977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488657659
4632	NC_021179	TGC	2	6	244981	244986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488657659
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4636	NC_021179	GCT	2	6	245159	245164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488657659
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4645	NC_021179	CGTG	2	8	245560	245567	0 %	25 %	50 %	25 %	488657660
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4649	NC_021179	TGCC	2	8	245722	245729	0 %	25 %	25 %	50 %	488657660
4650	NC_021179	GTG	2	6	245733	245738	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	488657660
4651	NC_021179	GAAA	2	8	245806	245813	75 %	0 %	25 %	0 %	488657660
4652	NC_021179	ACG	2	6	245850	245855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488657660
4653	NC_021179	GTG	2	6	245919	245924	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	488657660
4654	NC_021179	ATA	2	6	246049	246054	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	488657661
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4660	NC_021179	TGT	2	6	246236	246241	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	488657661
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4662	NC_021179	TTA	2	6	246280	246285	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	488657661
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4664	NC_021179	TGG	2	6	246337	246342	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	488657661
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4688	NC_021179	ACT	2	6	247861	247866	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488657663
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4729	NC_021179	CGGCG	2	10	249990	249999	0 %	0 %	60 %	40 %	488657663
4730	NC_021179	GAT	2	6	250033	250038	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488657663
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4733	NC_021179	T	6	6	250391	250396	0 %	100 %	0 %	0 %	488657664
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4737	NC_021179	A	6	6	250686	250691	100 %	0 %	0 %	0 %	488657664
4738	NC_021179	GGC	2	6	250744	250749	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488657664
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4740	NC_021179	ACCTTG	2	12	250796	250807	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	488657664
4741	NC_021179	TTG	2	6	250814	250819	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	488657664
4742	NC_021179	GAT	2	6	250836	250841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488657664
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4744	NC_021179	GAT	2	6	250929	250934	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488657664
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4992	NC_021179	TTC	2	6	262813	262818	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	488657671
4993	NC_021179	CG	3	6	262819	262824	0 %	0 %	50 %	50 %	488657671
4994	NC_021179	TGC	2	6	262840	262845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488657671
4995	NC_021179	GTT	2	6	262921	262926	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	488657671
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4998	NC_021179	TGA	2	6	263160	263165	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488657671
4999	NC_021179	CGT	2	6	263320	263325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488657671
5000	NC_021179	GCG	2	6	263473	263478	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488657671

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