MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Taylorella equigenitalis 14/56 draft genome

Total Repeats: 29488

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021036	AAT	2	6	250	255	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479196023
2	NC_021036	TGC	2	6	264	269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479196023
3	NC_021036	AATC	2	8	351	358	50 %	25 %	0 %	25 %	479196023
4	NC_021036	AAT	2	6	380	385	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479196023
5	NC_021036	TA	3	6	403	408	50 %	50 %	0 %	0 %	479196023
6	NC_021036	A	6	6	451	456	100 %	0 %	0 %	0 %	479196023
7	NC_021036	TTG	2	6	464	469	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479196023
8	NC_021036	TTA	2	6	700	705	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479196023
9	NC_021036	T	6	6	757	762	0 %	100 %	0 %	0 %	479196023
10	NC_021036	TGATA	2	10	800	809	40 %	40 %	20 %	0 %	479196023
11	NC_021036	TCT	3	9	823	831	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479196023
12	NC_021036	TATT	2	8	860	867	25 %	75 %	0 %	0 %	479196023
13	NC_021036	A	7	7	945	951	100 %	0 %	0 %	0 %	479196023
14	NC_021036	ATA	2	6	1024	1029	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479196023
15	NC_021036	TATCG	2	10	1142	1151	20 %	40 %	20 %	20 %	479196024
16	NC_021036	TTC	2	6	1184	1189	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479196024
17	NC_021036	CAT	2	6	1219	1224	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479196024
18	NC_021036	AATT	2	8	1243	1250	50 %	50 %	0 %	0 %	479196024
19	NC_021036	TTC	2	6	1259	1264	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479196024
20	NC_021036	CATC	2	8	1294	1301	25 %	25 %	0 %	50 %	479196024
21	NC_021036	AAG	2	6	1388	1393	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479196024
22	NC_021036	ATGTA	2	10	1427	1436	40 %	40 %	20 %	0 %	479196024
23	NC_021036	CTTT	2	8	1452	1459	0 %	75 %	0 %	25 %	479196024
24	NC_021036	CTG	2	6	1483	1488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479196024
25	NC_021036	CAT	2	6	1666	1671	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479196024
26	NC_021036	CTC	2	6	1744	1749	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479196024
27	NC_021036	GCA	2	6	1770	1775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479196024
28	NC_021036	CAA	2	6	1816	1821	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479196024
29	NC_021036	TACT	2	8	1885	1892	25 %	50 %	0 %	25 %	479196024
30	NC_021036	ACT	2	6	1896	1901	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479196024
31	NC_021036	AAT	2	6	1920	1925	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479196024
32	NC_021036	GGC	2	6	1937	1942	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479196024
33	NC_021036	TCC	2	6	1955	1960	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479196024
34	NC_021036	ATT	2	6	1964	1969	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479196024
35	NC_021036	T	8	8	2001	2008	0 %	100 %	0 %	0 %	479196024
36	NC_021036	TCA	2	6	2013	2018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479196024
37	NC_021036	CT	3	6	2068	2073	0 %	50 %	0 %	50 %	479196024
38	NC_021036	ATG	2	6	2095	2100	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479196024
39	NC_021036	TTA	2	6	2107	2112	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479196024
40	NC_021036	AGC	2	6	2165	2170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479196024
41	NC_021036	CTC	2	6	2174	2179	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479196024
42	NC_021036	CTT	2	6	2209	2214	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479196024
43	NC_021036	CCAGA	2	10	2227	2236	40 %	0 %	20 %	40 %	479196024
44	NC_021036	T	7	7	2287	2293	0 %	100 %	0 %	0 %	479196024
45	NC_021036	CAAT	2	8	2313	2320	50 %	25 %	0 %	25 %	479196024
46	NC_021036	CAT	2	6	2338	2343	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479196024
47	NC_021036	CAA	2	6	2359	2364	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479196024
48	NC_021036	ATTA	2	8	2378	2385	50 %	50 %	0 %	0 %	479196024
49	NC_021036	CCA	2	6	2406	2411	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479196024
50	NC_021036	T	6	6	2502	2507	0 %	100 %	0 %	0 %	479196024
51	NC_021036	GAA	2	6	2511	2516	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479196024
52	NC_021036	TAG	2	6	2523	2528	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479196024
53	NC_021036	GTA	2	6	2529	2534	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479196024
54	NC_021036	TAA	2	6	2563	2568	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479196024
55	NC_021036	GCT	2	6	2577	2582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479196024
56	NC_021036	AGT	2	6	2639	2644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479196024
57	NC_021036	T	6	6	2650	2655	0 %	100 %	0 %	0 %	479196024
58	NC_021036	GTAA	2	8	2683	2690	50 %	25 %	25 %	0 %	479196024
59	NC_021036	CTT	2	6	2725	2730	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479196024
60	NC_021036	TA	3	6	2851	2856	50 %	50 %	0 %	0 %	479196024
61	NC_021036	TAA	2	6	2898	2903	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479196024
62	NC_021036	AGG	2	6	2932	2937	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479196024
63	NC_021036	TCC	2	6	2943	2948	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479196024
64	NC_021036	ATC	2	6	2958	2963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479196024
65	NC_021036	TTA	2	6	2964	2969	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479196024
66	NC_021036	T	8	8	3029	3036	0 %	100 %	0 %	0 %	479196024
67	NC_021036	AATTCC	2	12	3099	3110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479196024
68	NC_021036	TAT	2	6	3133	3138	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479196024
69	NC_021036	A	6	6	3202	3207	100 %	0 %	0 %	0 %	479196024
70	NC_021036	TCT	3	9	3385	3393	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479196025
71	NC_021036	AT	3	6	3394	3399	50 %	50 %	0 %	0 %	479196025
72	NC_021036	ACT	2	6	3432	3437	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479196025
73	NC_021036	CTG	2	6	3446	3451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479196025
74	NC_021036	GTAT	2	8	3486	3493	25 %	50 %	25 %	0 %	479196025
75	NC_021036	TGA	2	6	3507	3512	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479196025
76	NC_021036	TAG	2	6	3581	3586	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479196025
77	NC_021036	GTA	2	6	3682	3687	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479196025
78	NC_021036	AG	3	6	3702	3707	50 %	0 %	50 %	0 %	479196025
79	NC_021036	ATT	2	6	3801	3806	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479196025
80	NC_021036	ACG	2	6	3935	3940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479196025
81	NC_021036	TAG	2	6	3953	3958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479196025
82	NC_021036	G	6	6	4031	4036	0 %	0 %	100 %	0 %	479196025
83	NC_021036	CCA	2	6	4051	4056	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479196025
84	NC_021036	ATT	2	6	4103	4108	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479196025
85	NC_021036	GCT	2	6	4177	4182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479196025
86	NC_021036	TTA	2	6	4183	4188	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479196025
87	NC_021036	TA	4	8	4242	4249	50 %	50 %	0 %	0 %	479196025
88	NC_021036	CT	3	6	4354	4359	0 %	50 %	0 %	50 %	479196025
89	NC_021036	CAA	2	6	4468	4473	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479196025
90	NC_021036	AG	3	6	4518	4523	50 %	0 %	50 %	0 %	479196025
91	NC_021036	TTA	2	6	4555	4560	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479196026
92	NC_021036	CAT	2	6	4590	4595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479196026
93	NC_021036	TCT	2	6	4674	4679	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479196026
94	NC_021036	GAT	2	6	4713	4718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479196026
95	NC_021036	GTA	2	6	4749	4754	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479196026
96	NC_021036	AAG	2	6	4841	4846	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479196026
97	NC_021036	GGA	2	6	4914	4919	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479196026
98	NC_021036	TAA	2	6	4922	4927	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479196026
99	NC_021036	A	6	6	4955	4960	100 %	0 %	0 %	0 %	479196026
100	NC_021036	ATA	2	6	5013	5018	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479196026
101	NC_021036	ACT	2	6	5054	5059	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479196026
102	NC_021036	TAA	2	6	5062	5067	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479196026
103	NC_021036	ACT	2	6	5097	5102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479196026
104	NC_021036	ATT	2	6	5106	5111	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479196026
105	NC_021036	TC	3	6	5152	5157	0 %	50 %	0 %	50 %	479196026
106	NC_021036	AGA	2	6	5268	5273	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479196026
107	NC_021036	CGT	2	6	5331	5336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479196026
108	NC_021036	TAG	2	6	5392	5397	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479196026
109	NC_021036	CTA	2	6	5455	5460	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479196026
110	NC_021036	TAT	2	6	5486	5491	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479196026
111	NC_021036	TGC	2	6	5501	5506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479196026
112	NC_021036	TAT	2	6	5528	5533	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479196026
113	NC_021036	TGA	2	6	5621	5626	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479196026
114	NC_021036	AGTG	2	8	5661	5668	25 %	25 %	50 %	0 %	479196026
115	NC_021036	CGG	2	6	5678	5683	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479196026
116	NC_021036	A	6	6	5688	5693	100 %	0 %	0 %	0 %	479196026
117	NC_021036	T	6	6	5717	5722	0 %	100 %	0 %	0 %	479196026
118	NC_021036	AGT	2	6	5754	5759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479196026
119	NC_021036	GAGC	2	8	5772	5779	25 %	0 %	50 %	25 %	479196026
120	NC_021036	TAT	2	6	5785	5790	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479196026
121	NC_021036	GTTT	2	8	5797	5804	0 %	75 %	25 %	0 %	479196026
122	NC_021036	CTT	2	6	5910	5915	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479196026
123	NC_021036	ATG	2	6	5968	5973	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479196026
124	NC_021036	AAAG	2	8	6042	6049	75 %	0 %	25 %	0 %	479196026
125	NC_021036	TCC	2	6	6050	6055	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479196026
126	NC_021036	GAA	2	6	6144	6149	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479196026
127	NC_021036	ATT	2	6	6697	6702	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479196027
128	NC_021036	ATTG	2	8	6767	6774	25 %	50 %	25 %	0 %	479196027
129	NC_021036	CAT	2	6	6856	6861	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479196027
130	NC_021036	AAG	2	6	6889	6894	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479196027
131	NC_021036	T	7	7	6962	6968	0 %	100 %	0 %	0 %	479196027
132	NC_021036	ATT	2	6	7030	7035	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479196028
133	NC_021036	TAAA	2	8	7038	7045	75 %	25 %	0 %	0 %	479196028
134	NC_021036	CTT	2	6	7089	7094	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479196028
135	NC_021036	CCT	2	6	7142	7147	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479196028
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396	NC_021036	AAT	2	6	19969	19974	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479196040
397	NC_021036	CTT	2	6	20067	20072	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479196040
398	NC_021036	T	6	6	20103	20108	0 %	100 %	0 %	0 %	479196040
399	NC_021036	CAGTT	2	10	20305	20314	20 %	40 %	20 %	20 %	479196040
400	NC_021036	GAG	2	6	20388	20393	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479196040
401	NC_021036	ATGC	2	8	20406	20413	25 %	25 %	25 %	25 %	479196040
402	NC_021036	TCA	2	6	20573	20578	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479196040
403	NC_021036	AT	3	6	20632	20637	50 %	50 %	0 %	0 %	479196040
404	NC_021036	AC	3	6	20661	20666	50 %	0 %	0 %	50 %	479196040
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410	NC_021036	CTTT	2	8	20815	20822	0 %	75 %	0 %	25 %	479196040
411	NC_021036	TCA	2	6	20942	20947	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479196040
412	NC_021036	CCTG	2	8	20978	20985	0 %	25 %	25 %	50 %	479196040
413	NC_021036	AG	3	6	21010	21015	50 %	0 %	50 %	0 %	479196040
414	NC_021036	AAAT	2	8	21070	21077	75 %	25 %	0 %	0 %	479196040
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416	NC_021036	CTA	2	6	21351	21356	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479196040
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419	NC_021036	AAT	2	6	21549	21554	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479196041
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425	NC_021036	AAT	2	6	21918	21923	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479196041
426	NC_021036	A	6	6	22018	22023	100 %	0 %	0 %	0 %	479196041
427	NC_021036	CAT	2	6	22062	22067	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479196041
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429	NC_021036	A	6	6	22121	22126	100 %	0 %	0 %	0 %	479196041
430	NC_021036	GAT	2	6	22150	22155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479196041
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436	NC_021036	GCT	2	6	22485	22490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479196042
437	NC_021036	ATA	2	6	22537	22542	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479196042
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439	NC_021036	TGA	2	6	22697	22702	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479196042
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445	NC_021036	ATG	2	6	23103	23108	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479196042
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448	NC_021036	A	8	8	23241	23248	100 %	0 %	0 %	0 %	479196042
449	NC_021036	TGG	2	6	23342	23347	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479196042
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451	NC_021036	A	6	6	23410	23415	100 %	0 %	0 %	0 %	479196042
452	NC_021036	TAAT	2	8	23480	23487	50 %	50 %	0 %	0 %	479196042
453	NC_021036	A	7	7	23599	23605	100 %	0 %	0 %	0 %	479196043
454	NC_021036	GAT	2	6	23653	23658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479196043
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457	NC_021036	ATT	3	9	23769	23777	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479196043
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459	NC_021036	TTC	2	6	23940	23945	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479196043
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465	NC_021036	ATT	2	6	24265	24270	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479196044
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494	NC_021036	A	6	6	25841	25846	100 %	0 %	0 %	0 %	479196047
495	NC_021036	CAA	2	6	25927	25932	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479196047
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497	NC_021036	AGT	2	6	25991	25996	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479196047
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