MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermoplasmatales archaeon BRNA1

Total Repeats: 30012

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_020892	CTT	2	6	197237	197242	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	474933817
4002	NC_020892	GGA	2	6	197244	197249	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474933817
4003	NC_020892	CGA	2	6	197309	197314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474933817
4004	NC_020892	GCG	2	6	197395	197400	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	474933817
4005	NC_020892	TCA	2	6	197404	197409	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474933817
4006	NC_020892	AGG	2	6	197412	197417	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474933817
4007	NC_020892	TCC	2	6	197560	197565	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	474933817
4008	NC_020892	TCG	2	6	197566	197571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474933817
4009	NC_020892	TCCA	2	8	197580	197587	25 %	25 %	0 %	50 %	474933817
4010	NC_020892	CAT	2	6	197600	197605	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474933817
4011	NC_020892	AAG	2	6	197625	197630	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	474933817
4012	NC_020892	AAG	2	6	197660	197665	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	474933818
4013	NC_020892	GGA	2	6	197671	197676	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474933818
4014	NC_020892	AGC	2	6	197726	197731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474933818
4015	NC_020892	TAC	2	6	197732	197737	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474933818
4016	NC_020892	AAG	2	6	197747	197752	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	474933818
4017	NC_020892	GTC	2	6	197846	197851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474933818
4018	NC_020892	ATCC	2	8	197857	197864	25 %	25 %	0 %	50 %	474933818
4019	NC_020892	CTC	2	6	197903	197908	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	474933818
4020	NC_020892	AGGA	2	8	197915	197922	50 %	0 %	50 %	0 %	474933818
4021	NC_020892	AGGA	2	8	197924	197931	50 %	0 %	50 %	0 %	474933818
4022	NC_020892	GGAG	2	8	197953	197960	25 %	0 %	75 %	0 %	474933818
4023	NC_020892	GAC	2	6	197975	197980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474933818
4024	NC_020892	TCA	2	6	198000	198005	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474933818
4025	NC_020892	CCG	2	6	198009	198014	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	474933818
4026	NC_020892	CGC	2	6	198034	198039	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	474933818
4027	NC_020892	GAG	2	6	198047	198052	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474933818
4028	NC_020892	TCT	2	6	198072	198077	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	474933818
4029	NC_020892	GAGG	2	8	198092	198099	25 %	0 %	75 %	0 %	474933818
4030	NC_020892	CAA	2	6	198357	198362	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	474933819
4031	NC_020892	GGA	2	6	198369	198374	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474933819
4032	NC_020892	TGA	2	6	198398	198403	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	474933819
4033	NC_020892	GGA	2	6	198453	198458	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474933819
4034	NC_020892	GCC	2	6	198463	198468	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	474933819
4035	NC_020892	CCA	2	6	198497	198502	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	474933819
4036	NC_020892	TCG	2	6	198512	198517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474933819
4037	NC_020892	GCA	2	6	198588	198593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474933819
4038	NC_020892	CGG	2	6	198603	198608	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	474933819
4039	NC_020892	AGC	2	6	198674	198679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474933819
4040	NC_020892	AGG	2	6	198704	198709	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474933819
4041	NC_020892	TTCC	2	8	198712	198719	0 %	50 %	0 %	50 %	474933819
4042	NC_020892	ATCCC	2	10	198769	198778	20 %	20 %	0 %	60 %	474933820
4043	NC_020892	CAA	2	6	198839	198844	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	474933820
4044	NC_020892	CTC	2	6	198845	198850	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	474933820
4045	NC_020892	TTC	2	6	198864	198869	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	474933820
4046	NC_020892	GCC	2	6	198870	198875	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	474933820
4047	NC_020892	CGA	3	9	198905	198913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474933820
4048	NC_020892	CCA	2	6	198934	198939	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	474933820
4049	NC_020892	GT	3	6	198999	199004	0 %	50 %	50 %	0 %	474933820
4050	NC_020892	CTG	2	6	199062	199067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474933820
4051	NC_020892	ACC	2	6	199077	199082	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	474933820
4052	NC_020892	ACG	2	6	199102	199107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474933820
4053	NC_020892	GAC	2	6	199155	199160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474933820
4054	NC_020892	TCA	2	6	199204	199209	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474933820
4055	NC_020892	GGA	2	6	199307	199312	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474933820
4056	NC_020892	ATCC	2	8	199376	199383	25 %	25 %	0 %	50 %	474933820
4057	NC_020892	TCC	2	6	199422	199427	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	474933820
4058	NC_020892	CTC	2	6	199575	199580	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	474933821
4059	NC_020892	CG	3	6	199620	199625	0 %	0 %	50 %	50 %	474933821
4060	NC_020892	CTG	2	6	199671	199676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474933821
4061	NC_020892	GCC	2	6	199764	199769	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	474933821
4062	NC_020892	TCG	2	6	199798	199803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474933821
4063	NC_020892	ATCGCG	2	12	199848	199859	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	474933821
4064	NC_020892	CGC	2	6	199898	199903	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	474933821
4065	NC_020892	TCC	2	6	199939	199944	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	474933821
4066	NC_020892	CAT	2	6	199949	199954	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474933821
4067	NC_020892	TCCT	2	8	199956	199963	0 %	50 %	0 %	50 %	474933821
4068	NC_020892	TCA	2	6	199969	199974	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474933821
4069	NC_020892	GCA	2	6	199992	199997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474933821
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4071	NC_020892	CCT	2	6	200252	200257	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	474933822
4072	NC_020892	ACG	2	6	200266	200271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474933822
4073	NC_020892	GTG	2	6	200424	200429	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	474933822
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4075	NC_020892	ATCGGC	2	12	200466	200477	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	474933822
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4078	NC_020892	ACAGGA	2	12	200741	200752	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	474933823
4079	NC_020892	TCC	2	6	200759	200764	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	474933823
4080	NC_020892	TTG	2	6	200765	200770	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	474933823
4081	NC_020892	GAT	2	6	200772	200777	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	474933823
4082	NC_020892	GCG	2	6	200785	200790	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	474933823
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4084	NC_020892	ACC	2	6	200947	200952	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	474933823
4085	NC_020892	TCA	2	6	200963	200968	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474933823
4086	NC_020892	CTA	2	6	201012	201017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474933823
4087	NC_020892	CAG	2	6	201027	201032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474933823
4088	NC_020892	ACT	2	6	201041	201046	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474933823
4089	NC_020892	CGA	2	6	201075	201080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474933823
4090	NC_020892	TC	3	6	201100	201105	0 %	50 %	0 %	50 %	474933823
4091	NC_020892	CCTG	2	8	201296	201303	0 %	25 %	25 %	50 %	474933824
4092	NC_020892	GAG	2	6	201309	201314	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474933824
4093	NC_020892	ATG	2	6	201607	201612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	474933825
4094	NC_020892	GCGAT	2	10	201665	201674	20 %	20 %	40 %	20 %	474933825
4095	NC_020892	GTTC	2	8	201678	201685	0 %	50 %	25 %	25 %	474933825
4096	NC_020892	GGA	2	6	201745	201750	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474933825
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4099	NC_020892	CGA	2	6	201828	201833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474933825
4100	NC_020892	CTT	2	6	201894	201899	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	474933825
4101	NC_020892	ACA	2	6	201974	201979	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	474933825
4102	NC_020892	GCA	2	6	201984	201989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474933825
4103	NC_020892	GAG	3	9	202029	202037	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474933825
4104	NC_020892	CGAGAA	2	12	202092	202103	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	474933825
4105	NC_020892	GGA	2	6	202104	202109	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474933825
4106	NC_020892	ACG	2	6	202319	202324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474933825
4107	NC_020892	CGA	2	6	202326	202331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474933825
4108	NC_020892	AAG	3	9	202339	202347	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	474933825
4109	NC_020892	GCG	2	6	202348	202353	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	474933825
4110	NC_020892	AGGAGA	2	12	202397	202408	50 %	0 %	50 %	0 %	474933825
4111	NC_020892	CAGG	2	8	202434	202441	25 %	0 %	50 %	25 %	474933825
4112	NC_020892	ACG	2	6	202448	202453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474933825
4113	NC_020892	GAG	2	6	202456	202461	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474933825
4114	NC_020892	CAAGGT	2	12	202464	202475	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	474933825
4115	NC_020892	AAGG	2	8	202491	202498	50 %	0 %	50 %	0 %	474933825
4116	NC_020892	CTC	2	6	202507	202512	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	474933825
4117	NC_020892	AGA	2	6	202526	202531	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	474933825
4118	NC_020892	AGA	2	6	202640	202645	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	474933825
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4120	NC_020892	GCCA	2	8	202687	202694	25 %	0 %	25 %	50 %	474933825
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4236	NC_020892	GCCTCG	2	12	207214	207225	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	474933828
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4361	NC_020892	GGA	2	6	212349	212354	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474933833
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4478	NC_020892	CCT	2	6	217837	217842	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	474933840
4479	NC_020892	GAC	2	6	217870	217875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474933840
4480	NC_020892	GTC	2	6	217939	217944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474933840
4481	NC_020892	TCC	2	6	218006	218011	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	474933840
4482	NC_020892	ATC	2	6	218041	218046	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474933840
4483	NC_020892	CGA	2	6	218067	218072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474933840
4484	NC_020892	TCG	2	6	218120	218125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474933840
4485	NC_020892	TCCGG	2	10	218150	218159	0 %	20 %	40 %	40 %	474933840
4486	NC_020892	CGG	2	6	218172	218177	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	474933840
4487	NC_020892	CGT	2	6	218258	218263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474933841
4488	NC_020892	TGCT	2	8	218329	218336	0 %	50 %	25 %	25 %	474933841
4489	NC_020892	CGG	2	6	218399	218404	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	474933841
4490	NC_020892	TGC	2	6	218420	218425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474933841
4491	NC_020892	GGA	2	6	218441	218446	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474933841
4492	NC_020892	TGG	2	6	218473	218478	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	474933841
4493	NC_020892	CTCGAT	2	12	218586	218597	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	474933841
4494	NC_020892	CCT	2	6	218619	218624	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	474933841
4495	NC_020892	CATC	2	8	218630	218637	25 %	25 %	0 %	50 %	474933841
4496	NC_020892	GGTCGA	2	12	218711	218722	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	474933841
4497	NC_020892	CCG	2	6	218770	218775	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	474933841
4498	NC_020892	GAT	2	6	218796	218801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	474933841
4499	NC_020892	TCA	2	6	218831	218836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474933841
4500	NC_020892	TGT	2	6	218852	218857	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	474933841

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