MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermoplasmatales archaeon BRNA1

Total Repeats: 30012

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_020892	TTC	2	6	151730	151735	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	474933767
3002	NC_020892	CGA	2	6	151756	151761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474933767
3003	NC_020892	AAG	2	6	151790	151795	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	474933767
3004	NC_020892	CCG	2	6	151993	151998	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	474933768
3005	NC_020892	ATG	2	6	152025	152030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	474933768
3006	NC_020892	CCA	2	6	152060	152065	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	474933768
3007	NC_020892	CGA	3	9	152102	152110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474933768
3008	NC_020892	TCG	2	6	152119	152124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474933768
3009	NC_020892	TCC	2	6	152140	152145	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	474933768
3010	NC_020892	GCC	2	6	152154	152159	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	474933768
3011	NC_020892	CGG	2	6	152195	152200	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	474933768
3012	NC_020892	GCC	2	6	152242	152247	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	474933768
3013	NC_020892	GAA	2	6	152261	152266	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	474933768
3014	NC_020892	CCG	2	6	152290	152295	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	474933768
3015	NC_020892	TCC	3	9	152352	152360	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	474933768
3016	NC_020892	AGG	2	6	152392	152397	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474933768
3017	NC_020892	ACC	2	6	152461	152466	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	474933768
3018	NC_020892	GTG	2	6	152493	152498	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	474933768
3019	NC_020892	TCG	3	9	152542	152550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474933768
3020	NC_020892	GAT	2	6	152561	152566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	474933768
3021	NC_020892	GAA	2	6	152627	152632	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	474933768
3022	NC_020892	CGA	2	6	152633	152638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474933768
3023	NC_020892	CAC	2	6	152651	152656	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	474933768
3024	NC_020892	C	6	6	152658	152663	0 %	0 %	0 %	100 %	474933768
3025	NC_020892	AGG	2	6	152710	152715	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474933768
3026	NC_020892	GAG	2	6	152742	152747	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474933768
3027	NC_020892	CGA	2	6	152774	152779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474933768
3028	NC_020892	GTC	2	6	152832	152837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474933768
3029	NC_020892	ATC	2	6	152874	152879	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474933768
3030	NC_020892	AAG	2	6	152922	152927	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	474933768
3031	NC_020892	GAC	2	6	152967	152972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474933768
3032	NC_020892	CAC	2	6	152987	152992	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	474933768
3033	NC_020892	GAG	2	6	153009	153014	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474933768
3034	NC_020892	ACG	2	6	153060	153065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474933769
3035	NC_020892	CGT	2	6	153097	153102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474933769
3036	NC_020892	TCG	2	6	153144	153149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474933769
3037	NC_020892	ACG	2	6	153153	153158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474933769
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3039	NC_020892	CGC	2	6	153205	153210	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	474933769
3040	NC_020892	AAG	2	6	153212	153217	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	474933769
3041	NC_020892	TCA	2	6	153291	153296	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474933769
3042	NC_020892	CGG	2	6	153327	153332	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	474933769
3043	NC_020892	ATC	2	6	153458	153463	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474933769
3044	NC_020892	GGA	2	6	153479	153484	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474933769
3045	NC_020892	TCC	2	6	153540	153545	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	474933769
3046	NC_020892	GAGG	2	8	153547	153554	25 %	0 %	75 %	0 %	474933769
3047	NC_020892	GAG	2	6	153593	153598	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474933769
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3049	NC_020892	CCA	2	6	153648	153653	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	474933769
3050	NC_020892	GAT	2	6	153682	153687	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	474933769
3051	NC_020892	CGG	2	6	153721	153726	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	474933769
3052	NC_020892	GAC	2	6	153740	153745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474933769
3053	NC_020892	ATC	2	6	153770	153775	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474933769
3054	NC_020892	CGA	2	6	153814	153819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474933769
3055	NC_020892	GAGC	2	8	153820	153827	25 %	0 %	50 %	25 %	474933769
3056	NC_020892	CTC	2	6	153833	153838	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	474933769
3057	NC_020892	CAC	2	6	153856	153861	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	474933769
3058	NC_020892	C	6	6	153861	153866	0 %	0 %	0 %	100 %	474933769
3059	NC_020892	GAG	2	6	153884	153889	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474933769
3060	NC_020892	AGG	2	6	153942	153947	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474933769
3061	NC_020892	ATC	2	6	153950	153955	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474933769
3062	NC_020892	GGC	2	6	153997	154002	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	474933769
3063	NC_020892	GCA	2	6	154056	154061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474933769
3064	NC_020892	CGG	2	6	154093	154098	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	474933769
3065	NC_020892	ACA	2	6	154113	154118	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	474933769
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3067	NC_020892	TCA	2	6	154149	154154	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474933769
3068	NC_020892	TCG	2	6	154161	154166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474933769
3069	NC_020892	CAT	2	6	154183	154188	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474933769
3070	NC_020892	GCCAAG	2	12	154205	154216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474933769
3071	NC_020892	CCG	2	6	154251	154256	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	474933769
3072	NC_020892	CCT	2	6	154302	154307	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	474933769
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3074	NC_020892	GAG	2	6	154454	154459	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474933769
3075	NC_020892	AACATC	2	12	154460	154471	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	474933769
3076	NC_020892	CAG	2	6	154472	154477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474933769
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3083	NC_020892	GAGG	2	8	154833	154840	25 %	0 %	75 %	0 %	474933770
3084	NC_020892	ACG	2	6	154853	154858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474933770
3085	NC_020892	GGA	2	6	154868	154873	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474933770
3086	NC_020892	ACT	2	6	154877	154882	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474933770
3087	NC_020892	GAA	2	6	154920	154925	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	474933770
3088	NC_020892	GGA	2	6	154941	154946	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474933770
3089	NC_020892	TGG	2	6	154981	154986	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	474933770
3090	NC_020892	TGG	2	6	155109	155114	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	474933771
3091	NC_020892	CCG	2	6	155184	155189	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	474933771
3092	NC_020892	GCA	2	6	155260	155265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474933771
3093	NC_020892	ACA	2	6	155301	155306	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	474933771
3094	NC_020892	GAG	2	6	155335	155340	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474933771
3095	NC_020892	ATG	2	6	155357	155362	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	474933771
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3098	NC_020892	CGGCC	2	10	155437	155446	0 %	0 %	40 %	60 %	474933771
3099	NC_020892	GGA	2	6	155530	155535	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474933771
3100	NC_020892	GCG	2	6	155550	155555	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	474933771
3101	NC_020892	AAG	2	6	155585	155590	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	474933771
3102	NC_020892	TTC	3	9	155630	155638	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	474933771
3103	NC_020892	CCG	2	6	155643	155648	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	474933771
3104	NC_020892	TGGAT	2	10	155664	155673	20 %	40 %	40 %	0 %	474933771
3105	NC_020892	CCG	2	6	155679	155684	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	474933771
3106	NC_020892	TGG	2	6	155694	155699	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	474933771
3107	NC_020892	ATC	2	6	155702	155707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474933771
3108	NC_020892	GC	3	6	155833	155838	0 %	0 %	50 %	50 %	474933771
3109	NC_020892	TCG	2	6	155847	155852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474933771
3110	NC_020892	GAC	2	6	155873	155878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474933771
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3115	NC_020892	CCG	2	6	156308	156313	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	474933771
3116	NC_020892	TTCG	2	8	156332	156339	0 %	50 %	25 %	25 %	474933771
3117	NC_020892	CCA	2	6	156348	156353	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	474933771
3118	NC_020892	TTC	2	6	156449	156454	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	474933771
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3120	NC_020892	CGG	2	6	156613	156618	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	474933771
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3240	NC_020892	TGA	2	6	162371	162376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	474933780
3241	NC_020892	GGA	2	6	162398	162403	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474933780
3242	NC_020892	ACGTC	2	10	162413	162422	20 %	20 %	20 %	40 %	474933780
3243	NC_020892	TCC	2	6	162436	162441	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	474933780
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3245	NC_020892	TTG	2	6	162492	162497	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	474933781
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3253	NC_020892	GAT	2	6	162833	162838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	474933781
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3263	NC_020892	TGC	2	6	163240	163245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474933781
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3342	NC_020892	CGTCAT	2	12	167223	167234	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	474933785
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3346	NC_020892	ATC	2	6	167308	167313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474933785
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3348	NC_020892	GA	3	6	167440	167445	50 %	0 %	50 %	0 %	474933786
3349	NC_020892	CTA	2	6	167462	167467	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474933786
3350	NC_020892	CGT	3	9	167507	167515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474933786
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3352	NC_020892	CGC	2	6	167621	167626	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	474933786
3353	NC_020892	GCT	2	6	167689	167694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474933786
3354	NC_020892	TCG	2	6	167743	167748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474933786
3355	NC_020892	CCAC	2	8	167749	167756	25 %	0 %	0 %	75 %	474933786
3356	NC_020892	CCA	2	6	167789	167794	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	474933786
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3358	NC_020892	ACG	2	6	167899	167904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474933786
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