MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermoplasmatales archaeon BRNA1

Total Repeats: 30012

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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29002	NC_020892	ACGT	2	8	1410756	1410763	25 %	25 %	25 %	25 %	474935073
29003	NC_020892	CCA	2	6	1410767	1410772	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	474935073
29004	NC_020892	CTCGTA	2	12	1410780	1410791	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	474935073
29005	NC_020892	TCC	2	6	1410859	1410864	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	474935073
29006	NC_020892	TG	3	6	1410876	1410881	0 %	50 %	50 %	0 %	474935073
29007	NC_020892	TGCACC	2	12	1410902	1410913	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	474935073
29008	NC_020892	GGTG	2	8	1411121	1411128	0 %	25 %	75 %	0 %	474935073
29009	NC_020892	ACC	2	6	1411135	1411140	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	474935073
29010	NC_020892	CGGA	2	8	1411167	1411174	25 %	0 %	50 %	25 %	474935073
29011	NC_020892	GGA	2	6	1411224	1411229	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474935073
29012	NC_020892	ATG	2	6	1411246	1411251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	474935073
29013	NC_020892	GGCA	2	8	1411280	1411287	25 %	0 %	50 %	25 %	474935073
29014	NC_020892	CCT	2	6	1411304	1411309	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	474935073
29015	NC_020892	TCG	3	9	1411345	1411353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474935073
29016	NC_020892	CAT	2	6	1411395	1411400	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474935073
29017	NC_020892	CTC	2	6	1411413	1411418	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	474935073
29018	NC_020892	CAC	2	6	1411515	1411520	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	474935073
29019	NC_020892	TCCC	2	8	1411589	1411596	0 %	25 %	0 %	75 %	474935073
29020	NC_020892	ATG	3	9	1411597	1411605	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	474935073
29021	NC_020892	CGT	2	6	1411622	1411627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474935073
29022	NC_020892	TCC	2	6	1411636	1411641	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	474935073
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29040	NC_020892	CGG	2	6	1412378	1412383	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	474935074
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29042	NC_020892	GTC	2	6	1412594	1412599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474935075
29043	NC_020892	GAC	2	6	1412609	1412614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474935075
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29053	NC_020892	TGA	2	6	1412893	1412898	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	474935075
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29056	NC_020892	TCG	3	9	1413009	1413017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474935075
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29058	NC_020892	CCCT	2	8	1413044	1413051	0 %	25 %	0 %	75 %	474935075
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29103	NC_020892	AGT	2	6	1415324	1415329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	474935079
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29110	NC_020892	AG	3	6	1415595	1415600	50 %	0 %	50 %	0 %	474935080
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29113	NC_020892	GTA	2	6	1415763	1415768	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	474935080
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29458	NC_020892	TCC	2	6	1435393	1435398	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	474935095
29459	NC_020892	GGA	2	6	1435401	1435406	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474935095
29460	NC_020892	TCC	2	6	1435409	1435414	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	474935095
29461	NC_020892	CTCGAA	2	12	1435452	1435463	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	474935095
29462	NC_020892	TGT	2	6	1435472	1435477	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	474935095
29463	NC_020892	GAG	2	6	1435518	1435523	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474935095
29464	NC_020892	TCC	2	6	1435534	1435539	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	474935095
29465	NC_020892	GAT	2	6	1435569	1435574	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	474935095
29466	NC_020892	ACGGGG	2	12	1435586	1435597	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	474935095
29467	NC_020892	GTC	2	6	1435680	1435685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474935095
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29469	NC_020892	CTG	2	6	1435770	1435775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474935095
29470	NC_020892	GCGG	2	8	1435827	1435834	0 %	0 %	75 %	25 %	474935095
29471	NC_020892	GGT	2	6	1435950	1435955	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	474935095
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29473	NC_020892	CGT	2	6	1436045	1436050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474935095
29474	NC_020892	CGG	2	6	1436056	1436061	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	474935095
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29476	NC_020892	TAT	2	6	1436240	1436245	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	474935095
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29478	NC_020892	CCT	2	6	1436369	1436374	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	474935095
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29483	NC_020892	GGCG	2	8	1436588	1436595	0 %	0 %	75 %	25 %	474935095
29484	NC_020892	TCG	2	6	1436599	1436604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474935095
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29490	NC_020892	GTC	2	6	1436865	1436870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474935095
29491	NC_020892	ACCGA	2	10	1436989	1436998	40 %	0 %	20 %	40 %	474935095
29492	NC_020892	GAGG	2	8	1437015	1437022	25 %	0 %	75 %	0 %	474935095
29493	NC_020892	CTT	2	6	1437051	1437056	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	474935095
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