MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermoplasmatales archaeon BRNA1

Total Repeats: 30012

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
25001	NC_020892	CCTCG	2	10	1224185	1224194	0 %	20 %	20 %	60 %	474934879
25002	NC_020892	TGA	2	6	1224235	1224240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	474934879
25003	NC_020892	CGT	2	6	1224295	1224300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474934879
25004	NC_020892	GCA	2	6	1224337	1224342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474934879
25005	NC_020892	TGA	2	6	1224418	1224423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	474934879
25006	NC_020892	CGT	2	6	1224433	1224438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474934879
25007	NC_020892	GGC	2	6	1224519	1224524	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	474934880
25008	NC_020892	TAA	2	6	1224546	1224551	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	474934880
25009	NC_020892	TTC	2	6	1224602	1224607	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	474934880
25010	NC_020892	GC	3	6	1224709	1224714	0 %	0 %	50 %	50 %	474934881
25011	NC_020892	GAC	3	9	1224744	1224752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474934881
25012	NC_020892	CATC	2	8	1224758	1224765	25 %	25 %	0 %	50 %	474934881
25013	NC_020892	AGGAGT	2	12	1224854	1224865	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	474934881
25014	NC_020892	GAT	2	6	1224882	1224887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	474934881
25015	NC_020892	CGC	2	6	1224920	1224925	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	474934881
25016	NC_020892	TC	3	6	1225055	1225060	0 %	50 %	0 %	50 %	474934881
25017	NC_020892	GAC	3	9	1225223	1225231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474934882
25018	NC_020892	GAT	2	6	1225343	1225348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	474934882
25019	NC_020892	GTT	2	6	1225352	1225357	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	474934882
25020	NC_020892	TTCC	2	8	1225413	1225420	0 %	50 %	0 %	50 %	474934882
25021	NC_020892	CCG	2	6	1225446	1225451	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	474934882
25022	NC_020892	GAC	2	6	1225544	1225549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474934882
25023	NC_020892	TTC	2	6	1225557	1225562	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	474934882
25024	NC_020892	ACG	2	6	1225581	1225586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474934882
25025	NC_020892	ATG	2	6	1225590	1225595	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	474934882
25026	NC_020892	GAT	2	6	1225655	1225660	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	474934882
25027	NC_020892	CTT	2	6	1225661	1225666	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	474934882
25028	NC_020892	ATC	2	6	1225710	1225715	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474934882
25029	NC_020892	GGA	2	6	1225727	1225732	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474934882
25030	NC_020892	CTT	2	6	1225781	1225786	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	474934882
25031	NC_020892	CCT	2	6	1225845	1225850	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	474934883
25032	NC_020892	TGT	2	6	1225851	1225856	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	474934883
25033	NC_020892	GTC	2	6	1225879	1225884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474934883
25034	NC_020892	TGA	2	6	1225899	1225904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	474934883
25035	NC_020892	GC	3	6	1225927	1225932	0 %	0 %	50 %	50 %	474934883
25036	NC_020892	TCTCC	2	10	1226034	1226043	0 %	40 %	0 %	60 %	474934883
25037	NC_020892	GAC	2	6	1226047	1226052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474934883
25038	NC_020892	CTG	2	6	1226195	1226200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474934883
25039	NC_020892	CGG	2	6	1226259	1226264	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	474934884
25040	NC_020892	CGG	2	6	1226328	1226333	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	474934884
25041	NC_020892	GAC	3	9	1226392	1226400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474934884
25042	NC_020892	CTGC	2	8	1226413	1226420	0 %	25 %	25 %	50 %	474934884
25043	NC_020892	CTT	2	6	1226437	1226442	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	474934884
25044	NC_020892	GAT	2	6	1226452	1226457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	474934884
25045	NC_020892	CCTG	2	8	1226471	1226478	0 %	25 %	25 %	50 %	474934884
25046	NC_020892	CCT	2	6	1226485	1226490	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	474934884
25047	NC_020892	GAT	2	6	1226527	1226532	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	474934884
25048	NC_020892	TGC	2	6	1226724	1226729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474934885
25049	NC_020892	GCG	2	6	1226734	1226739	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	474934885
25050	NC_020892	AGT	2	6	1226789	1226794	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	474934885
25051	NC_020892	GCG	2	6	1226917	1226922	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	474934885
25052	NC_020892	CTT	2	6	1226975	1226980	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	474934886
25053	NC_020892	CTTC	2	8	1227012	1227019	0 %	50 %	0 %	50 %	474934886
25054	NC_020892	TC	3	6	1227080	1227085	0 %	50 %	0 %	50 %	474934886
25055	NC_020892	TTC	2	6	1227114	1227119	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	474934886
25056	NC_020892	TCG	2	6	1227123	1227128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474934886
25057	NC_020892	TCA	2	6	1227199	1227204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474934886
25058	NC_020892	TCT	2	6	1227276	1227281	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	474934887
25059	NC_020892	CGTC	2	8	1227305	1227312	0 %	25 %	25 %	50 %	474934887
25060	NC_020892	GCC	2	6	1227322	1227327	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	474934887
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25064	NC_020892	CTG	2	6	1227451	1227456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474934887
25065	NC_020892	CTC	2	6	1227469	1227474	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	474934887
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25071	NC_020892	CGG	2	6	1227757	1227762	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	474934889
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25074	NC_020892	CGA	2	6	1227826	1227831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474934889
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25082	NC_020892	TCA	2	6	1228348	1228353	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474934889
25083	NC_020892	GAG	2	6	1228364	1228369	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474934889
25084	NC_020892	CGA	2	6	1228390	1228395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474934889
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25087	NC_020892	TTG	2	6	1228672	1228677	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	474934890
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25089	NC_020892	GGT	2	6	1228824	1228829	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	474934890
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25098	NC_020892	AGGT	2	8	1229163	1229170	25 %	25 %	50 %	0 %	474934891
25099	NC_020892	CCT	2	6	1229171	1229176	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	474934891
25100	NC_020892	CGGGA	2	10	1229181	1229190	20 %	0 %	60 %	20 %	474934891
25101	NC_020892	GCT	2	6	1229227	1229232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474934891
25102	NC_020892	TTC	2	6	1229265	1229270	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	474934891
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25111	NC_020892	CGA	2	6	1229595	1229600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474934892
25112	NC_020892	CGA	2	6	1229604	1229609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474934892
25113	NC_020892	CGC	2	6	1229643	1229648	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	474934892
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25115	NC_020892	CTG	2	6	1229678	1229683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474934892
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25345	NC_020892	AGG	2	6	1241096	1241101	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474934908
25346	NC_020892	CTG	2	6	1241105	1241110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474934908
25347	NC_020892	TAC	2	6	1241147	1241152	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474934908
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25459	NC_020892	GCG	2	6	1246482	1246487	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	474934912
25460	NC_020892	CAAGGC	2	12	1246522	1246533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474934912
25461	NC_020892	TGG	2	6	1246554	1246559	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	474934912
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25463	NC_020892	CAG	2	6	1246715	1246720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474934913
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25482	NC_020892	GCCATC	2	12	1247981	1247992	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	474934915
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25489	NC_020892	CGC	2	6	1248202	1248207	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	474934915
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