MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermoplasmatales archaeon BRNA1

Total Repeats: 30012

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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17002	NC_020892	CGA	2	6	830897	830902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474934498
17003	NC_020892	GGC	2	6	831071	831076	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	474934499
17004	NC_020892	GAT	2	6	831107	831112	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	474934499
17005	NC_020892	TCG	2	6	831121	831126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474934499
17006	NC_020892	ATC	2	6	831315	831320	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474934499
17007	NC_020892	GCT	2	6	831340	831345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474934499
17008	NC_020892	GCG	2	6	831428	831433	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	474934499
17009	NC_020892	CTC	2	6	831434	831439	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	474934499
17010	NC_020892	TGC	2	6	831478	831483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474934499
17011	NC_020892	GGT	2	6	831545	831550	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	474934499
17012	NC_020892	GGA	2	6	831613	831618	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474934499
17013	NC_020892	TGG	2	6	831619	831624	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	474934499
17014	NC_020892	CTT	2	6	831668	831673	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	474934499
17015	NC_020892	GTCCAG	2	12	831677	831688	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	474934499
17016	NC_020892	TCCTTG	2	12	831708	831719	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	474934499
17017	NC_020892	TCG	2	6	831789	831794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474934499
17018	NC_020892	CGTC	2	8	831853	831860	0 %	25 %	25 %	50 %	474934499
17019	NC_020892	CATC	2	8	831864	831871	25 %	25 %	0 %	50 %	474934500
17020	NC_020892	GGT	2	6	831916	831921	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	474934500
17021	NC_020892	CGATGA	2	12	831939	831950	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	474934500
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17023	NC_020892	GCT	2	6	832020	832025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474934500
17024	NC_020892	CGG	2	6	832038	832043	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	474934500
17025	NC_020892	CGA	2	6	832044	832049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474934500
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17027	NC_020892	GACC	2	8	832071	832078	25 %	0 %	25 %	50 %	474934500
17028	NC_020892	GCTG	2	8	832140	832147	0 %	25 %	50 %	25 %	474934500
17029	NC_020892	GAT	2	6	832204	832209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	474934500
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17031	NC_020892	CGA	2	6	832242	832247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474934500
17032	NC_020892	GAT	2	6	832279	832284	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	474934500
17033	NC_020892	AGC	2	6	832373	832378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474934500
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17035	NC_020892	GTG	2	6	832465	832470	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	474934500
17036	NC_020892	ACC	2	6	832566	832571	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	474934500
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17039	NC_020892	CGA	2	6	832757	832762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474934501
17040	NC_020892	GTA	2	6	832821	832826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	474934501
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17042	NC_020892	GTA	2	6	832977	832982	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	474934501
17043	NC_020892	GGT	2	6	832989	832994	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	474934501
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17050	NC_020892	G	6	6	833175	833180	0 %	0 %	100 %	0 %	474934501
17051	NC_020892	TCC	2	6	833238	833243	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	474934501
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17053	NC_020892	TGG	2	6	833320	833325	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	474934501
17054	NC_020892	GGC	2	6	833340	833345	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	474934501
17055	NC_020892	GTC	2	6	833412	833417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474934501
17056	NC_020892	GCG	2	6	833437	833442	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	474934501
17057	NC_020892	CTT	2	6	833604	833609	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	474934501
17058	NC_020892	TCG	2	6	833614	833619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474934501
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17060	NC_020892	GCT	2	6	833682	833687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474934501
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17062	NC_020892	TCGAG	2	10	833765	833774	20 %	20 %	40 %	20 %	474934501
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17069	NC_020892	GAT	2	6	834296	834301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	474934502
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17071	NC_020892	GCA	2	6	834339	834344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474934502
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17075	NC_020892	CGA	2	6	834440	834445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474934502
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17088	NC_020892	TCA	2	6	835075	835080	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474934502
17089	NC_020892	CGC	2	6	835085	835090	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	474934502
17090	NC_020892	TGA	2	6	835171	835176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	474934502
17091	NC_020892	GAT	2	6	835193	835198	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	474934502
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17098	NC_020892	ATC	2	6	835398	835403	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474934502
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17100	NC_020892	TCG	2	6	835432	835437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474934502
17101	NC_020892	ACG	2	6	835456	835461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474934502
17102	NC_020892	TGG	2	6	835480	835485	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	474934502
17103	NC_020892	CGTC	2	8	835496	835503	0 %	25 %	25 %	50 %	474934502
17104	NC_020892	GAG	2	6	835515	835520	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474934502
17105	NC_020892	GAG	2	6	835523	835528	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474934502
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17107	NC_020892	GAA	2	6	835613	835618	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	474934502
17108	NC_020892	GAC	2	6	835623	835628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474934502
17109	NC_020892	GC	3	6	835634	835639	0 %	0 %	50 %	50 %	474934502
17110	NC_020892	CCT	2	6	835787	835792	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	474934502
17111	NC_020892	GAC	2	6	835794	835799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474934502
17112	NC_020892	GGAC	2	8	835822	835829	25 %	0 %	50 %	25 %	474934502
17113	NC_020892	AGG	2	6	835851	835856	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474934502
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17115	NC_020892	TCG	2	6	835924	835929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474934502
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17117	NC_020892	CGC	2	6	836046	836051	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	474934503
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17355	NC_020892	CGT	2	6	848626	848631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474934520
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17469	NC_020892	TCGA	2	8	853565	853572	25 %	25 %	25 %	25 %	474934528
17470	NC_020892	CGAGG	2	10	853633	853642	20 %	0 %	60 %	20 %	474934528
17471	NC_020892	GGC	2	6	853714	853719	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	474934528
17472	NC_020892	GAC	2	6	853730	853735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474934528
17473	NC_020892	CAC	2	6	853784	853789	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	474934528
17474	NC_020892	CGA	2	6	853849	853854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474934528
17475	NC_020892	CGA	2	6	853888	853893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474934528
17476	NC_020892	CATCGA	2	12	853912	853923	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	474934528
17477	NC_020892	CAC	3	9	853934	853942	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	474934528
17478	NC_020892	CACCAT	2	12	853946	853957	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	474934528
17479	NC_020892	GAG	2	6	853961	853966	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474934528
17480	NC_020892	CCA	3	9	853978	853986	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	474934528
17481	NC_020892	CAC	2	6	854030	854035	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	474934528
17482	NC_020892	CAT	2	6	854069	854074	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474934528
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17485	NC_020892	CAC	2	6	854126	854131	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	474934528
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17491	NC_020892	TCCGCA	2	12	854297	854308	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	474934529
17492	NC_020892	CTC	2	6	854356	854361	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	474934529
17493	NC_020892	TCC	2	6	854420	854425	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	474934529
17494	NC_020892	TCCTCG	2	12	854456	854467	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	474934529
17495	NC_020892	CTG	2	6	854501	854506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474934529
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17499	NC_020892	TGT	2	6	854673	854678	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	474934529
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