MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermoplasmatales archaeon BRNA1

Total Repeats: 30012

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_020892	TCC	2	6	49212	49217	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	474933653
1002	NC_020892	CGC	2	6	49229	49234	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	474933653
1003	NC_020892	GTGC	3	12	49239	49250	0 %	25 %	50 %	25 %	474933653
1004	NC_020892	CAT	2	6	49262	49267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474933653
1005	NC_020892	TTCGG	2	10	49272	49281	0 %	40 %	40 %	20 %	474933653
1006	NC_020892	GTTCC	2	10	49319	49328	0 %	40 %	20 %	40 %	474933653
1007	NC_020892	GGA	2	6	49361	49366	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474933653
1008	NC_020892	AGG	2	6	49371	49376	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474933653
1009	NC_020892	GCG	2	6	49420	49425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	474933653
1010	NC_020892	GTG	2	6	49479	49484	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	474933653
1011	NC_020892	ACG	2	6	49513	49518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474933653
1012	NC_020892	GGA	2	6	49526	49531	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474933653
1013	NC_020892	GGAT	2	8	49546	49553	25 %	25 %	50 %	0 %	474933653
1014	NC_020892	GGCG	2	8	49646	49653	0 %	0 %	75 %	25 %	474933653
1015	NC_020892	TGA	2	6	49654	49659	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	474933653
1016	NC_020892	TCC	2	6	49723	49728	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	474933653
1017	NC_020892	GTC	2	6	49785	49790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474933653
1018	NC_020892	AGGC	2	8	49856	49863	25 %	0 %	50 %	25 %	474933654
1019	NC_020892	TCA	2	6	49866	49871	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474933654
1020	NC_020892	TCT	2	6	49894	49899	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	474933654
1021	NC_020892	GAG	2	6	49994	49999	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474933654
1022	NC_020892	AGG	2	6	50110	50115	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474933654
1023	NC_020892	GAC	2	6	50144	50149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474933654
1024	NC_020892	GCC	2	6	50159	50164	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	474933654
1025	NC_020892	GAG	2	6	50207	50212	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474933654
1026	NC_020892	TCG	2	6	50219	50224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474933654
1027	NC_020892	GGA	2	6	50257	50262	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474933654
1028	NC_020892	GAG	2	6	50336	50341	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474933654
1029	NC_020892	CAT	2	6	50652	50657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474933654
1030	NC_020892	GTT	2	6	50666	50671	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	474933654
1031	NC_020892	CGT	2	6	50749	50754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474933654
1032	NC_020892	TCG	2	6	50763	50768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474933654
1033	NC_020892	TAT	2	6	50779	50784	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	474933654
1034	NC_020892	GTT	2	6	50798	50803	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	474933654
1035	NC_020892	AGGA	2	8	50857	50864	50 %	0 %	50 %	0 %	474933654
1036	NC_020892	GCG	2	6	50924	50929	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	474933655
1037	NC_020892	GA	3	6	50956	50961	50 %	0 %	50 %	0 %	474933655
1038	NC_020892	CGC	2	6	51019	51024	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	474933655
1039	NC_020892	TAC	2	6	51052	51057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474933655
1040	NC_020892	TCA	2	6	51116	51121	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474933655
1041	NC_020892	ACT	2	6	51134	51139	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474933655
1042	NC_020892	CAG	2	6	51147	51152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474933655
1043	NC_020892	ATCC	2	8	51180	51187	25 %	25 %	0 %	50 %	474933655
1044	NC_020892	TTC	2	6	51222	51227	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	474933655
1045	NC_020892	CTGG	2	8	51264	51271	0 %	25 %	50 %	25 %	474933655
1046	NC_020892	ATC	2	6	51311	51316	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474933655
1047	NC_020892	GAGG	2	8	51321	51328	25 %	0 %	75 %	0 %	474933655
1048	NC_020892	G	6	6	51342	51347	0 %	0 %	100 %	0 %	474933655
1049	NC_020892	GCA	2	6	51505	51510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474933655
1050	NC_020892	ATC	2	6	51511	51516	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474933655
1051	NC_020892	AGGG	2	8	51538	51545	25 %	0 %	75 %	0 %	474933655
1052	NC_020892	GAT	2	6	51553	51558	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	474933655
1053	NC_020892	CGA	2	6	51621	51626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474933655
1054	NC_020892	CAA	2	6	51675	51680	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	474933655
1055	NC_020892	CGA	2	6	51699	51704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474933655
1056	NC_020892	CGC	2	6	51714	51719	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	474933655
1057	NC_020892	AAG	2	6	51799	51804	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	474933655
1058	NC_020892	CGG	2	6	51806	51811	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	474933655
1059	NC_020892	TGG	2	6	51921	51926	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	474933656
1060	NC_020892	CGTT	2	8	51993	52000	0 %	50 %	25 %	25 %	474933656
1061	NC_020892	CGG	3	9	52002	52010	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	474933656
1062	NC_020892	GTC	2	6	52046	52051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474933656
1063	NC_020892	ACCA	2	8	52052	52059	50 %	0 %	0 %	50 %	474933656
1064	NC_020892	AG	3	6	52136	52141	50 %	0 %	50 %	0 %	474933656
1065	NC_020892	G	6	6	52141	52146	0 %	0 %	100 %	0 %	474933656
1066	NC_020892	CGA	2	6	52153	52158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474933656
1067	NC_020892	TTC	2	6	52163	52168	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	474933656
1068	NC_020892	AGG	2	6	52307	52312	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474933656
1069	NC_020892	TC	3	6	52375	52380	0 %	50 %	0 %	50 %	474933656
1070	NC_020892	GCATGA	2	12	52426	52437	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	474933657
1071	NC_020892	CGA	2	6	52520	52525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474933657
1072	NC_020892	AGGA	2	8	52554	52561	50 %	0 %	50 %	0 %	474933657
1073	NC_020892	GCC	2	6	52596	52601	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	474933657
1074	NC_020892	GCC	2	6	52648	52653	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	474933657
1075	NC_020892	GAA	2	6	52706	52711	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	474933657
1076	NC_020892	GAGG	2	8	52728	52735	25 %	0 %	75 %	0 %	474933657
1077	NC_020892	GCC	3	9	52764	52772	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	474933657
1078	NC_020892	ATGA	2	8	52785	52792	50 %	25 %	25 %	0 %	474933657
1079	NC_020892	GCC	2	6	52806	52811	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	474933657
1080	NC_020892	CAT	2	6	52889	52894	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474933657
1081	NC_020892	GC	3	6	52993	52998	0 %	0 %	50 %	50 %	474933657
1082	NC_020892	CCGAGA	2	12	52999	53010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474933657
1083	NC_020892	ACC	2	6	53029	53034	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	474933657
1084	NC_020892	CAA	2	6	53227	53232	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	474933658
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1086	NC_020892	G	6	6	53441	53446	0 %	0 %	100 %	0 %	474933658
1087	NC_020892	GGA	2	6	53458	53463	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474933658
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1089	NC_020892	GAC	2	6	53593	53598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474933659
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1092	NC_020892	GAG	2	6	53866	53871	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474933659
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1094	NC_020892	CAA	2	6	54102	54107	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	474933659
1095	NC_020892	CCG	2	6	54119	54124	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	474933659
1096	NC_020892	GA	3	6	54134	54139	50 %	0 %	50 %	0 %	474933659
1097	NC_020892	CGG	2	6	54176	54181	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	474933659
1098	NC_020892	TCC	2	6	54194	54199	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	474933659
1099	NC_020892	CAT	2	6	54219	54224	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474933659
1100	NC_020892	GTC	2	6	54253	54258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474933659
1101	NC_020892	CCG	2	6	54290	54295	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	474933659
1102	NC_020892	GACG	2	8	54349	54356	25 %	0 %	50 %	25 %	474933659
1103	NC_020892	GA	3	6	54380	54385	50 %	0 %	50 %	0 %	474933659
1104	NC_020892	ACG	2	6	54443	54448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474933659
1105	NC_020892	GTA	2	6	54580	54585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	474933660
1106	NC_020892	AGA	2	6	54591	54596	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	474933660
1107	NC_020892	ACC	2	6	54618	54623	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	474933660
1108	NC_020892	TGG	2	6	54629	54634	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	474933660
1109	NC_020892	ATG	2	6	54641	54646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	474933660
1110	NC_020892	CAG	2	6	54785	54790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474933660
1111	NC_020892	TGG	2	6	54852	54857	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	474933660
1112	NC_020892	GAA	2	6	54877	54882	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	474933660
1113	NC_020892	TTG	2	6	54887	54892	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	474933660
1114	NC_020892	CT	3	6	54921	54926	0 %	50 %	0 %	50 %	474933660
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1119	NC_020892	GAG	2	6	55495	55500	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474933662
1120	NC_020892	ATC	2	6	55504	55509	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474933662
1121	NC_020892	AGG	2	6	55562	55567	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474933662
1122	NC_020892	TCG	2	6	55571	55576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474933662
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1125	NC_020892	CT	3	6	55621	55626	0 %	50 %	0 %	50 %	474933662
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1251	NC_020892	CTG	2	6	62019	62024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474933668
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1500	NC_020892	AACA	2	8	74881	74888	75 %	0 %	0 %	25 %	474933680

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