MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermoplasmatales archaeon BRNA1

Total Repeats: 30012

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_020892	GGC	2	6	635855	635860	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	474934283
13002	NC_020892	GAA	2	6	635864	635869	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	474934283
13003	NC_020892	TCG	3	9	635871	635879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474934283
13004	NC_020892	GAT	2	6	635891	635896	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	474934283
13005	NC_020892	TCA	2	6	635899	635904	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474934283
13006	NC_020892	TTCCT	2	10	635964	635973	0 %	60 %	0 %	40 %	474934283
13007	NC_020892	CTGTTT	2	12	635987	635998	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	474934283
13008	NC_020892	CCT	2	6	636025	636030	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	474934283
13009	NC_020892	TTTC	2	8	636040	636047	0 %	75 %	0 %	25 %	474934283
13010	NC_020892	TTGG	2	8	636101	636108	0 %	50 %	50 %	0 %	474934284
13011	NC_020892	GATC	2	8	636142	636149	25 %	25 %	25 %	25 %	474934284
13012	NC_020892	CCG	2	6	636195	636200	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	474934284
13013	NC_020892	CTGA	2	8	636212	636219	25 %	25 %	25 %	25 %	474934284
13014	NC_020892	GTG	2	6	636267	636272	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	474934284
13015	NC_020892	GAC	2	6	636299	636304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474934284
13016	NC_020892	CCG	2	6	636333	636338	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	474934284
13017	NC_020892	TCG	2	6	636348	636353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474934284
13018	NC_020892	GCT	2	6	636388	636393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474934284
13019	NC_020892	GT	3	6	636394	636399	0 %	50 %	50 %	0 %	474934284
13020	NC_020892	CGT	2	6	636442	636447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474934284
13021	NC_020892	CCG	2	6	636495	636500	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	474934284
13022	NC_020892	GCCGTT	2	12	636536	636547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474934284
13023	NC_020892	GAC	2	6	636551	636556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474934284
13024	NC_020892	GGC	2	6	636563	636568	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	474934284
13025	NC_020892	TTCG	2	8	636659	636666	0 %	50 %	25 %	25 %	474934284
13026	NC_020892	GAC	2	6	636701	636706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474934284
13027	NC_020892	GACC	2	8	636736	636743	25 %	0 %	25 %	50 %	474934284
13028	NC_020892	TGGT	2	8	636750	636757	0 %	50 %	50 %	0 %	474934284
13029	NC_020892	CAAT	2	8	636823	636830	50 %	25 %	0 %	25 %	474934284
13030	NC_020892	CGCC	2	8	636856	636863	0 %	0 %	25 %	75 %	474934284
13031	NC_020892	TTC	2	6	636938	636943	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	474934284
13032	NC_020892	GCC	2	6	636983	636988	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	474934284
13033	NC_020892	ATCC	2	8	637035	637042	25 %	25 %	0 %	50 %	474934284
13034	NC_020892	TGG	2	6	637135	637140	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	474934284
13035	NC_020892	ATTCC	2	10	637156	637165	20 %	40 %	0 %	40 %	474934284
13036	NC_020892	TCT	2	6	637276	637281	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	474934284
13037	NC_020892	AG	3	6	637328	637333	50 %	0 %	50 %	0 %	474934284
13038	NC_020892	CTC	2	6	637625	637630	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	474934284
13039	NC_020892	AGT	2	6	637651	637656	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	474934284
13040	NC_020892	CTTG	2	8	637730	637737	0 %	50 %	25 %	25 %	474934284
13041	NC_020892	TGG	2	6	638029	638034	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	474934284
13042	NC_020892	GGC	2	6	638051	638056	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	474934284
13043	NC_020892	GGC	2	6	638078	638083	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	474934284
13044	NC_020892	GTC	2	6	638103	638108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474934284
13045	NC_020892	GGT	2	6	638114	638119	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	474934284
13046	NC_020892	GGT	2	6	638129	638134	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	474934284
13047	NC_020892	GGA	2	6	638150	638155	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474934284
13048	NC_020892	G	6	6	638209	638214	0 %	0 %	100 %	0 %	474934284
13049	NC_020892	GAG	2	6	638220	638225	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474934284
13050	NC_020892	GGT	2	6	638228	638233	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	474934284
13051	NC_020892	GTT	2	6	638297	638302	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	474934284
13052	NC_020892	CTG	2	6	638330	638335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474934284
13053	NC_020892	TCC	2	6	638382	638387	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	474934284
13054	NC_020892	TTCG	2	8	638621	638628	0 %	50 %	25 %	25 %	474934285
13055	NC_020892	AAGC	2	8	638679	638686	50 %	0 %	25 %	25 %	474934285
13056	NC_020892	TTC	2	6	638769	638774	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	474934285
13057	NC_020892	ATC	2	6	638986	638991	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474934286
13058	NC_020892	GAG	2	6	639017	639022	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474934286
13059	NC_020892	AGG	2	6	639057	639062	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474934286
13060	NC_020892	GGT	2	6	639128	639133	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	474934286
13061	NC_020892	GAG	2	6	639137	639142	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474934286
13062	NC_020892	TTC	2	6	639165	639170	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	474934286
13063	NC_020892	GC	3	6	639208	639213	0 %	0 %	50 %	50 %	474934286
13064	NC_020892	TTG	2	6	639222	639227	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	474934286
13065	NC_020892	CGA	2	6	639301	639306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474934286
13066	NC_020892	CCT	2	6	639343	639348	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	474934286
13067	NC_020892	CG	3	6	639374	639379	0 %	0 %	50 %	50 %	474934286
13068	NC_020892	TCA	2	6	639388	639393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474934286
13069	NC_020892	AGTAGC	2	12	639436	639447	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	474934286
13070	NC_020892	GTC	2	6	639509	639514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474934286
13071	NC_020892	GAA	2	6	639533	639538	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	474934286
13072	NC_020892	TCG	2	6	639570	639575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474934286
13073	NC_020892	CCG	2	6	639598	639603	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	474934286
13074	NC_020892	GTT	2	6	639656	639661	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	474934286
13075	NC_020892	TGA	2	6	639667	639672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	474934286
13076	NC_020892	CGA	2	6	639673	639678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474934286
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13078	NC_020892	ATC	2	6	639747	639752	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474934286
13079	NC_020892	TCCGGG	2	12	639809	639820	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	474934286
13080	NC_020892	TCG	2	6	639831	639836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474934286
13081	NC_020892	CAT	2	6	639857	639862	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474934286
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13083	NC_020892	GCCT	2	8	640014	640021	0 %	25 %	25 %	50 %	474934286
13084	NC_020892	TTG	2	6	640062	640067	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	474934286
13085	NC_020892	CG	3	6	640104	640109	0 %	0 %	50 %	50 %	474934286
13086	NC_020892	GCT	2	6	640113	640118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474934286
13087	NC_020892	GCG	2	6	640119	640124	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	474934286
13088	NC_020892	TCT	3	9	640183	640191	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	474934286
13089	NC_020892	CAT	2	6	640291	640296	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474934287
13090	NC_020892	ACC	2	6	640320	640325	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	474934287
13091	NC_020892	GAA	2	6	640363	640368	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	474934287
13092	NC_020892	C	6	6	640404	640409	0 %	0 %	0 %	100 %	474934287
13093	NC_020892	CGG	2	6	640419	640424	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	474934287
13094	NC_020892	CCCG	2	8	640428	640435	0 %	0 %	25 %	75 %	474934287
13095	NC_020892	TTCGAC	2	12	640439	640450	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	474934287
13096	NC_020892	CAT	2	6	640531	640536	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474934287
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13099	NC_020892	GTC	2	6	640589	640594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474934287
13100	NC_020892	TCA	2	6	640632	640637	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474934287
13101	NC_020892	AGGG	2	8	640681	640688	25 %	0 %	75 %	0 %	474934287
13102	NC_020892	CCG	2	6	640704	640709	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	474934287
13103	NC_020892	GTG	2	6	640751	640756	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	474934287
13104	NC_020892	CGA	2	6	640762	640767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474934287
13105	NC_020892	CCGG	2	8	640774	640781	0 %	0 %	50 %	50 %	474934287
13106	NC_020892	TCA	2	6	640791	640796	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474934287
13107	NC_020892	GAG	2	6	640907	640912	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474934287
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13110	NC_020892	GAA	2	6	641008	641013	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	474934287
13111	NC_020892	GTC	2	6	641042	641047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474934287
13112	NC_020892	CGA	2	6	641146	641151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474934287
13113	NC_020892	GAG	2	6	641204	641209	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474934287
13114	NC_020892	ACG	2	6	641220	641225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474934287
13115	NC_020892	TTC	2	6	641228	641233	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	474934287
13116	NC_020892	CCGC	2	8	641255	641262	0 %	0 %	25 %	75 %	474934287
13117	NC_020892	GGT	2	6	641274	641279	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	474934287
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13119	NC_020892	TCT	2	6	641484	641489	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	474934287
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13473	NC_020892	CATC	2	8	657172	657179	25 %	25 %	0 %	50 %	474934304
13474	NC_020892	CGA	2	6	657191	657196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474934304
13475	NC_020892	TTC	2	6	657219	657224	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	474934304
13476	NC_020892	TCT	2	6	657229	657234	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	474934304
13477	NC_020892	CGCATC	2	12	657246	657257	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	474934304
13478	NC_020892	TGCG	2	8	657285	657292	0 %	25 %	50 %	25 %	474934304
13479	NC_020892	CCA	2	6	657335	657340	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	474934304
13480	NC_020892	CGGGA	2	10	657381	657390	20 %	0 %	60 %	20 %	474934304
13481	NC_020892	GAT	2	6	657392	657397	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	474934304
13482	NC_020892	CTA	2	6	657398	657403	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474934304
13483	NC_020892	CGA	2	6	657413	657418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474934304
13484	NC_020892	TCC	2	6	657430	657435	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	474934304
13485	NC_020892	AGG	2	6	657460	657465	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474934304
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13488	NC_020892	GGA	2	6	657619	657624	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474934305
13489	NC_020892	GGA	3	9	657688	657696	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474934305
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13491	NC_020892	GAG	2	6	657707	657712	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474934305
13492	NC_020892	CCT	2	6	657769	657774	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	474934305
13493	NC_020892	CAT	2	6	657823	657828	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474934305
13494	NC_020892	TCC	2	6	657840	657845	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	474934305
13495	NC_020892	TCG	2	6	657849	657854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474934305
13496	NC_020892	TCA	2	6	657867	657872	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474934305
13497	NC_020892	CGC	2	6	657874	657879	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	474934305
13498	NC_020892	GCCATC	2	12	657944	657955	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	474934305
13499	NC_020892	AGG	2	6	658037	658042	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474934305
13500	NC_020892	CGT	2	6	658084	658089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474934305

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