MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermoplasmatales archaeon BRNA1

Total Repeats: 30012

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_020892	CAA	2	6	538869	538874	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	474934180
11002	NC_020892	TAC	2	6	538876	538881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474934180
11003	NC_020892	CCA	2	6	538907	538912	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	474934180
11004	NC_020892	AAG	2	6	538951	538956	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	474934180
11005	NC_020892	TCC	2	6	538976	538981	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	474934180
11006	NC_020892	CCG	2	6	539006	539011	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	474934180
11007	NC_020892	GAGTAC	2	12	539032	539043	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	474934180
11008	NC_020892	GAG	2	6	539047	539052	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474934180
11009	NC_020892	GAG	2	6	539077	539082	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474934180
11010	NC_020892	GGA	2	6	539112	539117	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474934180
11011	NC_020892	GAC	2	6	539209	539214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474934181
11012	NC_020892	GCG	2	6	539294	539299	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	474934181
11013	NC_020892	CCA	2	6	539344	539349	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	474934181
11014	NC_020892	CCG	2	6	539367	539372	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	474934181
11015	NC_020892	GGGA	2	8	539409	539416	25 %	0 %	75 %	0 %	474934181
11016	NC_020892	ACT	2	6	539424	539429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474934181
11017	NC_020892	C	6	6	539494	539499	0 %	0 %	0 %	100 %	474934181
11018	NC_020892	CAA	2	6	539518	539523	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	474934181
11019	NC_020892	AGG	3	9	539615	539623	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474934181
11020	NC_020892	TGG	2	6	539625	539630	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	474934181
11021	NC_020892	GTC	2	6	539742	539747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474934182
11022	NC_020892	TCC	2	6	539863	539868	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	474934182
11023	NC_020892	AGG	2	6	539912	539917	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474934182
11024	NC_020892	TTC	2	6	540012	540017	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	474934182
11025	NC_020892	GA	3	6	540118	540123	50 %	0 %	50 %	0 %	474934182
11026	NC_020892	CGA	2	6	540153	540158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474934182
11027	NC_020892	GGA	2	6	540177	540182	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474934182
11028	NC_020892	TCC	2	6	540211	540216	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	474934182
11029	NC_020892	AGA	2	6	540270	540275	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	474934183
11030	NC_020892	CGA	3	9	540310	540318	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474934183
11031	NC_020892	ATC	2	6	540365	540370	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474934183
11032	NC_020892	GA	3	6	540393	540398	50 %	0 %	50 %	0 %	474934183
11033	NC_020892	AAGG	2	8	540440	540447	50 %	0 %	50 %	0 %	474934183
11034	NC_020892	CAA	2	6	540451	540456	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	474934183
11035	NC_020892	TCA	2	6	540510	540515	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474934183
11036	NC_020892	ACT	2	6	540519	540524	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474934183
11037	NC_020892	ACC	2	6	540542	540547	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	474934183
11038	NC_020892	ATC	2	6	540569	540574	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474934183
11039	NC_020892	CGC	2	6	540586	540591	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	474934183
11040	NC_020892	CTC	2	6	540599	540604	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	474934183
11041	NC_020892	CCG	2	6	540630	540635	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	474934183
11042	NC_020892	AGC	2	6	540636	540641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474934183
11043	NC_020892	TCG	2	6	540696	540701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474934183
11044	NC_020892	ACC	2	6	540707	540712	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	474934183
11045	NC_020892	GAG	2	6	540719	540724	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474934183
11046	NC_020892	ACC	2	6	540740	540745	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	474934183
11047	NC_020892	ACG	2	6	540786	540791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474934183
11048	NC_020892	ACC	2	6	540803	540808	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	474934183
11049	NC_020892	CGA	2	6	540817	540822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474934183
11050	NC_020892	AAT	2	6	540823	540828	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	474934183
11051	NC_020892	GGC	2	6	540838	540843	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	474934183
11052	NC_020892	GAA	2	6	540871	540876	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	474934183
11053	NC_020892	GTC	2	6	540911	540916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474934183
11054	NC_020892	CGA	2	6	540934	540939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474934183
11055	NC_020892	TGG	2	6	540947	540952	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	474934183
11056	NC_020892	GAG	2	6	540959	540964	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474934183
11057	NC_020892	TCG	2	6	540981	540986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474934183
11058	NC_020892	TAC	2	6	541013	541018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474934183
11059	NC_020892	ACG	2	6	541047	541052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474934183
11060	NC_020892	AATCC	2	10	541298	541307	40 %	20 %	0 %	40 %	474934184
11061	NC_020892	GTC	2	6	541312	541317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474934184
11062	NC_020892	TCG	2	6	541328	541333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474934184
11063	NC_020892	GAT	2	6	541345	541350	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	474934184
11064	NC_020892	GCA	2	6	541411	541416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474934184
11065	NC_020892	CTC	2	6	541524	541529	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	474934184
11066	NC_020892	GTC	2	6	541555	541560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474934184
11067	NC_020892	AAG	2	6	541643	541648	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	474934184
11068	NC_020892	GAT	2	6	541684	541689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	474934184
11069	NC_020892	GAT	2	6	541705	541710	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	474934184
11070	NC_020892	TCT	2	6	542013	542018	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	474934185
11071	NC_020892	GAG	2	6	542029	542034	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474934185
11072	NC_020892	TCC	2	6	542054	542059	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	474934185
11073	NC_020892	CTT	2	6	542152	542157	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	474934185
11074	NC_020892	CGG	2	6	542163	542168	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	474934185
11075	NC_020892	TGG	2	6	542228	542233	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	474934185
11076	NC_020892	TGC	2	6	542265	542270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474934185
11077	NC_020892	GTG	2	6	542417	542422	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	474934186
11078	NC_020892	GGC	2	6	542437	542442	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	474934186
11079	NC_020892	TCCT	2	8	542483	542490	0 %	50 %	0 %	50 %	474934186
11080	NC_020892	CGC	2	6	542500	542505	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	474934186
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11082	NC_020892	TCT	2	6	542571	542576	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	474934186
11083	NC_020892	TCA	2	6	542622	542627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474934186
11084	NC_020892	CGC	2	6	542640	542645	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	474934186
11085	NC_020892	GCT	2	6	542665	542670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474934186
11086	NC_020892	TGG	2	6	542718	542723	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	474934186
11087	NC_020892	GAT	2	6	542764	542769	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	474934186
11088	NC_020892	CTC	2	6	542794	542799	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	474934186
11089	NC_020892	TGA	2	6	542811	542816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	474934186
11090	NC_020892	AGT	2	6	542847	542852	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	474934186
11091	NC_020892	GT	3	6	542859	542864	0 %	50 %	50 %	0 %	474934186
11092	NC_020892	CTC	2	6	542881	542886	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	474934186
11093	NC_020892	TCC	2	6	542895	542900	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	474934186
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11097	NC_020892	CTCC	2	8	543167	543174	0 %	25 %	0 %	75 %	474934186
11098	NC_020892	GCG	2	6	543215	543220	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	474934186
11099	NC_020892	TCA	2	6	543236	543241	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474934186
11100	NC_020892	CGA	2	6	543255	543260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474934186
11101	NC_020892	TCT	2	6	543327	543332	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	474934186
11102	NC_020892	GAT	2	6	543343	543348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	474934186
11103	NC_020892	TTC	2	6	543353	543358	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	474934186
11104	NC_020892	GAC	2	6	543415	543420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474934186
11105	NC_020892	GAC	2	6	543715	543720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474934187
11106	NC_020892	TAC	2	6	543733	543738	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474934187
11107	NC_020892	CCT	2	6	543759	543764	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	474934187
11108	NC_020892	TCC	2	6	543799	543804	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	474934187
11109	NC_020892	TTC	2	6	543838	543843	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	474934187
11110	NC_020892	CGC	2	6	543870	543875	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	474934187
11111	NC_020892	GAT	2	6	543879	543884	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	474934187
11112	NC_020892	GCG	2	6	543887	543892	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	474934187
11113	NC_020892	GAG	2	6	544009	544014	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474934187
11114	NC_020892	GCC	2	6	544018	544023	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	474934187
11115	NC_020892	TCA	2	6	544164	544169	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474934188
11116	NC_020892	ACG	3	9	544194	544202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474934188
11117	NC_020892	TCC	2	6	544254	544259	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	474934188
11118	NC_020892	TCC	2	6	544323	544328	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	474934188
11119	NC_020892	CGT	2	6	544333	544338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474934188
11120	NC_020892	CGA	2	6	544465	544470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474934188
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11236	NC_020892	TGA	3	9	550576	550584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	474934195
11237	NC_020892	CGT	2	6	550585	550590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474934195
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11239	NC_020892	GTC	2	6	550874	550879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474934196
11240	NC_020892	GGA	2	6	550985	550990	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474934196
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11242	NC_020892	GGT	2	6	551306	551311	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	474934196
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11264	NC_020892	CCG	2	6	552355	552360	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	474934197
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11348	NC_020892	CCCT	2	8	556288	556295	0 %	25 %	0 %	75 %	474934201
11349	NC_020892	AGA	2	6	556298	556303	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	474934201
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11351	NC_020892	CGT	2	6	556347	556352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474934201
11352	NC_020892	CCT	2	6	556389	556394	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	474934201
11353	NC_020892	TCG	2	6	556460	556465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474934201
11354	NC_020892	CGA	2	6	556503	556508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474934201
11355	NC_020892	TGT	2	6	556518	556523	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	474934201
11356	NC_020892	TCC	2	6	556526	556531	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	474934201
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11463	NC_020892	CTC	2	6	561270	561275	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	474934205
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11468	NC_020892	GAC	2	6	561465	561470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474934205
11469	NC_020892	GGATTT	2	12	561486	561497	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	474934205
11470	NC_020892	GCCC	2	8	562027	562034	0 %	0 %	25 %	75 %	474934206
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11472	NC_020892	TGG	2	6	562203	562208	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	474934206
11473	NC_020892	TCG	2	6	562290	562295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474934206
11474	NC_020892	CAC	2	6	562346	562351	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	474934206
11475	NC_020892	GCG	2	6	562359	562364	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	474934206
11476	NC_020892	GCCACC	2	12	562392	562403	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	474934206
11477	NC_020892	ATC	2	6	562493	562498	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474934206
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