MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermoplasmatales archaeon BRNA1

Total Repeats: 30012

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_020892	AGG	3	9	23171	23179	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474933619
502	NC_020892	TCT	2	6	23192	23197	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	474933619
503	NC_020892	CAT	2	6	23205	23210	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474933619
504	NC_020892	GAG	2	6	23251	23256	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474933619
505	NC_020892	TCG	2	6	23270	23275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474933619
506	NC_020892	GGA	2	6	23358	23363	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474933619
507	NC_020892	CAACGC	2	12	23418	23429	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	474933619
508	NC_020892	CAC	2	6	23445	23450	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	474933619
509	NC_020892	ACC	2	6	23515	23520	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	474933619
510	NC_020892	CAT	2	6	23568	23573	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474933619
511	NC_020892	GGA	2	6	23627	23632	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474933619
512	NC_020892	CA	3	6	23716	23721	50 %	0 %	0 %	50 %	474933619
513	NC_020892	CCA	2	6	23760	23765	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	474933619
514	NC_020892	CTC	2	6	23788	23793	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	474933619
515	NC_020892	TCA	2	6	23879	23884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474933619
516	NC_020892	ATC	2	6	23920	23925	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474933619
517	NC_020892	CCCT	2	8	23947	23954	0 %	25 %	0 %	75 %	474933619
518	NC_020892	CGACTA	2	12	23970	23981	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	474933619
519	NC_020892	ATG	3	9	24010	24018	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	474933619
520	NC_020892	TCCA	2	8	24049	24056	25 %	25 %	0 %	50 %	474933619
521	NC_020892	CCG	2	6	24098	24103	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	474933619
522	NC_020892	CCT	2	6	24131	24136	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	474933619
523	NC_020892	GCT	2	6	24165	24170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474933619
524	NC_020892	ATC	2	6	24190	24195	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474933619
525	NC_020892	GAG	2	6	24265	24270	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474933619
526	NC_020892	TCC	2	6	24352	24357	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	474933619
527	NC_020892	GAA	2	6	24363	24368	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	474933619
528	NC_020892	TTG	2	6	24603	24608	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	474933620
529	NC_020892	ACG	3	9	24645	24653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474933620
530	NC_020892	GCA	2	6	24710	24715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474933620
531	NC_020892	ACT	2	6	24732	24737	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474933620
532	NC_020892	CCA	2	6	24768	24773	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	474933620
533	NC_020892	GAA	2	6	24805	24810	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	474933620
534	NC_020892	CCT	2	6	24912	24917	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	474933620
535	NC_020892	TTC	2	6	25022	25027	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	474933620
536	NC_020892	ATG	2	6	25130	25135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	474933620
537	NC_020892	ACC	2	6	25151	25156	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	474933620
538	NC_020892	CTC	2	6	25315	25320	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	474933620
539	NC_020892	GAA	2	6	25333	25338	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	474933620
540	NC_020892	CCG	2	6	25479	25484	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	474933620
541	NC_020892	GAC	2	6	25493	25498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474933620
542	NC_020892	AAG	2	6	25559	25564	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	474933620
543	NC_020892	GAC	3	9	25577	25585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474933620
544	NC_020892	CCA	2	6	25722	25727	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	474933620
545	NC_020892	GAT	2	6	25823	25828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	474933620
546	NC_020892	CGG	2	6	25858	25863	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	474933620
547	NC_020892	CGT	2	6	25867	25872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474933620
548	NC_020892	CGA	2	6	25873	25878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474933620
549	NC_020892	CAC	2	6	25903	25908	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	474933620
550	NC_020892	TTC	2	6	25940	25945	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	474933620
551	NC_020892	ACG	2	6	25971	25976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474933620
552	NC_020892	GCCAAG	2	12	26006	26017	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474933620
553	NC_020892	CGTC	2	8	26088	26095	0 %	25 %	25 %	50 %	474933620
554	NC_020892	ACT	2	6	26130	26135	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474933620
555	NC_020892	CT	3	6	26134	26139	0 %	50 %	0 %	50 %	474933620
556	NC_020892	GCA	2	6	26142	26147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474933620
557	NC_020892	TCG	2	6	26160	26165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474933620
558	NC_020892	CGA	2	6	26184	26189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474933620
559	NC_020892	GA	3	6	26238	26243	50 %	0 %	50 %	0 %	474933620
560	NC_020892	CCA	3	9	26364	26372	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	474933620
561	NC_020892	TCC	2	6	26387	26392	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	474933620
562	NC_020892	GAA	2	6	26416	26421	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	474933620
563	NC_020892	TAC	2	6	26459	26464	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474933620
564	NC_020892	AGC	2	6	26467	26472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474933620
565	NC_020892	GTC	2	6	26507	26512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474933620
566	NC_020892	CAG	2	6	26569	26574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474933620
567	NC_020892	ATG	2	6	26625	26630	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	474933620
568	NC_020892	ACC	3	9	26642	26650	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	474933620
569	NC_020892	TCT	2	6	26673	26678	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	474933620
570	NC_020892	ACG	2	6	26682	26687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474933620
571	NC_020892	CGA	2	6	26734	26739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474933620
572	NC_020892	CGAGAA	2	12	26743	26754	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	474933620
573	NC_020892	TCG	2	6	26757	26762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474933620
574	NC_020892	CTG	2	6	26774	26779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474933620
575	NC_020892	CGC	2	6	26854	26859	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	474933620
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577	NC_020892	CTC	2	6	26923	26928	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	474933620
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579	NC_020892	TCCT	2	8	27242	27249	0 %	50 %	0 %	50 %	474933620
580	NC_020892	TCG	2	6	27270	27275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474933620
581	NC_020892	ACC	2	6	27290	27295	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	474933620
582	NC_020892	CGA	2	6	27424	27429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474933620
583	NC_020892	CGA	2	6	27487	27492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474933620
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587	NC_020892	ACC	2	6	27596	27601	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	474933620
588	NC_020892	TCG	2	6	27684	27689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474933620
589	NC_020892	CGA	2	6	27724	27729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474933620
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591	NC_020892	CCA	2	6	27747	27752	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	474933620
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593	NC_020892	CGA	2	6	27778	27783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474933620
594	NC_020892	GCA	2	6	27786	27791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474933620
595	NC_020892	CCT	3	9	27793	27801	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	474933620
596	NC_020892	CGT	2	6	27823	27828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474933620
597	NC_020892	ATC	2	6	27830	27835	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474933620
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599	NC_020892	TCT	2	6	27925	27930	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	474933621
600	NC_020892	GGA	2	6	28004	28009	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474933621
601	NC_020892	GCG	2	6	28027	28032	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	474933621
602	NC_020892	GACG	2	8	28098	28105	25 %	0 %	50 %	25 %	474933621
603	NC_020892	GCC	2	6	28131	28136	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	474933621
604	NC_020892	TTCC	2	8	28284	28291	0 %	50 %	0 %	50 %	474933621
605	NC_020892	AGCC	2	8	28484	28491	25 %	0 %	25 %	50 %	474933622
606	NC_020892	GCT	2	6	28507	28512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474933622
607	NC_020892	G	6	6	28530	28535	0 %	0 %	100 %	0 %	474933622
608	NC_020892	AAG	3	9	28605	28613	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	474933622
609	NC_020892	C	6	6	28778	28783	0 %	0 %	0 %	100 %	474933622
610	NC_020892	GT	3	6	28794	28799	0 %	50 %	50 %	0 %	474933622
611	NC_020892	CCA	2	6	28819	28824	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	474933622
612	NC_020892	TCCGAG	2	12	28851	28862	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	474933622
613	NC_020892	CTC	2	6	28878	28883	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	474933622
614	NC_020892	CGA	2	6	28895	28900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474933622
615	NC_020892	CTA	2	6	28916	28921	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474933622
616	NC_020892	TTC	2	6	28929	28934	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	474933622
617	NC_020892	GAA	2	6	28967	28972	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	474933622
618	NC_020892	ATA	2	6	29004	29009	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	474933622
619	NC_020892	CGA	2	6	29018	29023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474933622
620	NC_020892	GAG	2	6	29046	29051	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474933622
621	NC_020892	CTT	2	6	29054	29059	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	474933622
622	NC_020892	CA	3	6	29118	29123	50 %	0 %	0 %	50 %	474933622
623	NC_020892	AAG	2	6	29190	29195	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	474933622
624	NC_020892	CTA	2	6	29228	29233	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474933622
625	NC_020892	GTC	2	6	29256	29261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474933622
626	NC_020892	CGA	2	6	29312	29317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474933622
627	NC_020892	CGG	2	6	29402	29407	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	474933622
628	NC_020892	TTCC	2	8	29465	29472	0 %	50 %	0 %	50 %	474933622
629	NC_020892	GGA	2	6	29493	29498	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474933623
630	NC_020892	ATCTC	2	10	29502	29511	20 %	40 %	0 %	40 %	474933623
631	NC_020892	ATG	2	6	29693	29698	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	474933623
632	NC_020892	CCAT	2	8	29739	29746	25 %	25 %	0 %	50 %	474933623
633	NC_020892	GCAG	2	8	29756	29763	25 %	0 %	50 %	25 %	474933623
634	NC_020892	TTCGA	2	10	29801	29810	20 %	40 %	20 %	20 %	474933623
635	NC_020892	TC	3	6	29901	29906	0 %	50 %	0 %	50 %	474933623
636	NC_020892	GTC	2	6	29953	29958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474933623
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639	NC_020892	GGA	2	6	30205	30210	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474933624
640	NC_020892	CGC	2	6	30220	30225	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	474933624
641	NC_020892	GGC	2	6	30226	30231	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	474933624
642	NC_020892	TCCT	2	8	30422	30429	0 %	50 %	0 %	50 %	474933624
643	NC_020892	GCT	2	6	30439	30444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474933624
644	NC_020892	TCG	2	6	30455	30460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474933624
645	NC_020892	CTGC	2	8	30481	30488	0 %	25 %	25 %	50 %	474933624
646	NC_020892	CGA	2	6	30510	30515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474933624
647	NC_020892	TGA	2	6	30537	30542	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	474933624
648	NC_020892	TTG	2	6	30548	30553	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	474933624
649	NC_020892	GGC	2	6	30574	30579	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	474933624
650	NC_020892	TGG	2	6	30726	30731	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	474933624
651	NC_020892	TTC	2	6	30758	30763	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	474933624
652	NC_020892	GTC	2	6	30889	30894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474933624
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656	NC_020892	CAT	2	6	31012	31017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474933624
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658	NC_020892	CAT	2	6	31584	31589	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474933625
659	NC_020892	GAT	2	6	31605	31610	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	474933625
660	NC_020892	CGC	2	6	31674	31679	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	474933625
661	NC_020892	TCT	2	6	31700	31705	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	474933625
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664	NC_020892	TCA	2	6	31844	31849	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474933625
665	NC_020892	TCA	3	9	31971	31979	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474933626
666	NC_020892	AAG	2	6	32030	32035	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	474933626
667	NC_020892	TCC	2	6	32063	32068	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	474933626
668	NC_020892	GCACC	2	10	32071	32080	20 %	0 %	20 %	60 %	474933626
669	NC_020892	CTTC	2	8	32172	32179	0 %	50 %	0 %	50 %	474933626
670	NC_020892	ACA	2	6	32180	32185	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	474933626
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673	NC_020892	AGG	2	6	32364	32369	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474933626
674	NC_020892	CTCCGT	2	12	32404	32415	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	474933626
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676	NC_020892	TTC	2	6	32454	32459	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	474933627
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681	NC_020892	ATC	2	6	32529	32534	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474933627
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683	NC_020892	CTC	2	6	32601	32606	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	474933627
684	NC_020892	GAG	2	6	32649	32654	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474933627
685	NC_020892	ATG	2	6	32664	32669	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	474933627
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702	NC_020892	TCA	2	6	33840	33845	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474933628
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733	NC_020892	CAT	2	6	35577	35582	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474933632
734	NC_020892	ACCT	2	8	35593	35600	25 %	25 %	0 %	50 %	474933632
735	NC_020892	ACT	2	6	35606	35611	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474933632
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740	NC_020892	TCGG	2	8	35813	35820	0 %	25 %	50 %	25 %	474933633
741	NC_020892	CTG	2	6	35891	35896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474933633
742	NC_020892	ACG	2	6	35931	35936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474933633
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744	NC_020892	GTC	2	6	36053	36058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474933633
745	NC_020892	GA	3	6	36090	36095	50 %	0 %	50 %	0 %	474933633
746	NC_020892	TCG	2	6	36144	36149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474933633
747	NC_020892	ACCG	2	8	36161	36168	25 %	0 %	25 %	50 %	474933633
748	NC_020892	CGA	2	6	36349	36354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474933633
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750	NC_020892	TCG	2	6	36381	36386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474933633
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