MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermoplasmatales archaeon BRNA1

Total Repeats: 30012

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8501	NC_020892	TC	3	6	424786	424791	0 %	50 %	0 %	50 %	474934054
8502	NC_020892	CGC	2	6	425002	425007	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	474934055
8503	NC_020892	CGT	2	6	425062	425067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474934055
8504	NC_020892	TGA	2	6	425068	425073	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	474934055
8505	NC_020892	TCCC	2	8	425126	425133	0 %	25 %	0 %	75 %	474934055
8506	NC_020892	CCA	2	6	425140	425145	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	474934055
8507	NC_020892	GGA	2	6	425305	425310	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474934055
8508	NC_020892	TCCT	2	8	425328	425335	0 %	50 %	0 %	50 %	474934055
8509	NC_020892	GAT	2	6	425375	425380	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	474934055
8510	NC_020892	GTG	2	6	425442	425447	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	474934055
8511	NC_020892	GAA	2	6	425489	425494	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	474934055
8512	NC_020892	GCAG	2	8	425509	425516	25 %	0 %	50 %	25 %	474934055
8513	NC_020892	GGGA	2	8	425703	425710	25 %	0 %	75 %	0 %	474934056
8514	NC_020892	GGAC	2	8	425762	425769	25 %	0 %	50 %	25 %	474934056
8515	NC_020892	GTC	2	6	425781	425786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474934056
8516	NC_020892	GTA	2	6	425796	425801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	474934056
8517	NC_020892	TCA	2	6	425807	425812	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474934056
8518	NC_020892	GGTG	2	8	425823	425830	0 %	25 %	75 %	0 %	474934056
8519	NC_020892	CCG	2	6	425914	425919	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	474934056
8520	NC_020892	GAC	2	6	425964	425969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474934056
8521	NC_020892	GTC	2	6	425970	425975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474934056
8522	NC_020892	CGG	2	6	426063	426068	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	474934056
8523	NC_020892	GAT	2	6	426099	426104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	474934056
8524	NC_020892	GTGCTC	2	12	426105	426116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474934056
8525	NC_020892	GCC	2	6	426156	426161	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	474934056
8526	NC_020892	TCC	3	9	426178	426186	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	474934056
8527	NC_020892	GAC	2	6	426231	426236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474934056
8528	NC_020892	GTCC	2	8	426275	426282	0 %	25 %	25 %	50 %	474934056
8529	NC_020892	GTT	3	9	426297	426305	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	474934056
8530	NC_020892	TCG	2	6	426370	426375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474934057
8531	NC_020892	TTG	2	6	426397	426402	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	474934057
8532	NC_020892	ACG	2	6	426427	426432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474934057
8533	NC_020892	GGC	2	6	426438	426443	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	474934057
8534	NC_020892	TGT	2	6	426452	426457	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	474934057
8535	NC_020892	GCG	2	6	426467	426472	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	474934057
8536	NC_020892	TGG	2	6	426524	426529	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	474934057
8537	NC_020892	CCT	2	6	426545	426550	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	474934057
8538	NC_020892	GGA	2	6	426702	426707	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474934057
8539	NC_020892	CCTCC	2	10	426713	426722	0 %	20 %	0 %	80 %	474934057
8540	NC_020892	CCG	2	6	426742	426747	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	474934057
8541	NC_020892	CGG	2	6	426761	426766	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	474934057
8542	NC_020892	CTCC	2	8	426773	426780	0 %	25 %	0 %	75 %	474934057
8543	NC_020892	CGG	2	6	426800	426805	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	474934057
8544	NC_020892	GAT	3	9	426810	426818	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	474934057
8545	NC_020892	GTT	2	6	426828	426833	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	474934057
8546	NC_020892	GGT	2	6	426927	426932	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	474934057
8547	NC_020892	CTC	2	6	426969	426974	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	474934057
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8549	NC_020892	ATA	2	6	427053	427058	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	474934057
8550	NC_020892	CTT	2	6	427092	427097	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	474934057
8551	NC_020892	TTC	2	6	427123	427128	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	474934057
8552	NC_020892	GAA	2	6	427154	427159	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	474934057
8553	NC_020892	AGT	2	6	427198	427203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	474934057
8554	NC_020892	TCC	2	6	427217	427222	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	474934057
8555	NC_020892	CCA	2	6	427481	427486	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	474934058
8556	NC_020892	TCA	2	6	427505	427510	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474934058
8557	NC_020892	CAC	2	6	427566	427571	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	474934058
8558	NC_020892	ATC	2	6	427588	427593	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474934058
8559	NC_020892	TCC	3	9	427628	427636	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	474934058
8560	NC_020892	GCT	2	6	427700	427705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474934058
8561	NC_020892	GCG	3	9	427757	427765	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	474934058
8562	NC_020892	ACT	2	6	427787	427792	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474934058
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8564	NC_020892	CAT	2	6	427845	427850	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474934058
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8567	NC_020892	GAA	2	6	428052	428057	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	474934058
8568	NC_020892	TTC	2	6	428065	428070	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	474934058
8569	NC_020892	CGA	2	6	428076	428081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474934058
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8571	NC_020892	ATC	2	6	428116	428121	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474934058
8572	NC_020892	GCCA	2	8	428173	428180	25 %	0 %	25 %	50 %	474934058
8573	NC_020892	GGAGG	2	10	428230	428239	20 %	0 %	80 %	0 %	474934058
8574	NC_020892	ACGTCG	2	12	428315	428326	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	474934058
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8579	NC_020892	CAT	2	6	428442	428447	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474934058
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8581	NC_020892	GAT	2	6	428484	428489	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	474934058
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8584	NC_020892	TCC	2	6	428606	428611	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	474934058
8585	NC_020892	CAC	2	6	428658	428663	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	474934058
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8588	NC_020892	CGA	2	6	428853	428858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474934058
8589	NC_020892	TCG	2	6	428894	428899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474934058
8590	NC_020892	GTCC	2	8	428904	428911	0 %	25 %	25 %	50 %	474934058
8591	NC_020892	GTC	2	6	428947	428952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474934058
8592	NC_020892	CTG	2	6	428979	428984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474934058
8593	NC_020892	CGG	2	6	429035	429040	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	474934058
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8603	NC_020892	GGGA	2	8	429244	429251	25 %	0 %	75 %	0 %	474934059
8604	NC_020892	TCG	2	6	429353	429358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474934059
8605	NC_020892	TCATCC	2	12	429461	429472	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	474934059
8606	NC_020892	CAT	2	6	429495	429500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474934059
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8610	NC_020892	G	6	6	429677	429682	0 %	0 %	100 %	0 %	474934059
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